Protein–RNA interactions for Protein: Q53HL2

CDCA8, Borealin, humanhuman

Predictions only

Length 280 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CDCA8Q53HL2 HMCES-203ENST00000417226 1490 ntTSL 1 (best) BASIC29.93■■■□□ 2.38
CDCA8Q53HL2 TPST2-203ENST00000403880 2084 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC29.92■■■□□ 2.38
CDCA8Q53HL2 TOP1MT-201ENST00000329245 1958 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.92■■■□□ 2.38
CDCA8Q53HL2 SPI1-201ENST00000227163 1168 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC29.92■■■□□ 2.38
CDCA8Q53HL2 WDR86-201ENST00000334493 2023 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC29.92■■■□□ 2.38
CDCA8Q53HL2 ALDH6A1-201ENST00000350259 1869 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC29.92■■■□□ 2.38
CDCA8Q53HL2 BRD2-214ENST00000496118 735 ntTSL 1 (best) BASIC29.92■■■□□ 2.38
CDCA8Q53HL2 DMRT2-209ENST00000635183 2190 ntTSL 5 BASIC29.92■■■□□ 2.38
CDCA8Q53HL2 RASGRP2-207ENST00000377497 2221 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC29.92■■■□□ 2.38
CDCA8Q53HL2 KLC1-205ENST00000380038 2322 ntTSL 2 BASIC29.91■■■□□ 2.38
CDCA8Q53HL2 ERGIC1-202ENST00000393784 2881 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.91■■■□□ 2.38
CDCA8Q53HL2 SIMC1-202ENST00000341199 2056 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC29.91■■■□□ 2.38
CDCA8Q53HL2 GP9-201ENST00000307395 889 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.91■■■□□ 2.38
CDCA8Q53HL2 LGALS9B-201ENST00000324290 1243 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC29.91■■■□□ 2.38
CDCA8Q53HL2 RORB-AS1-201ENST00000417576 1178 ntTSL 5 BASIC29.91■■■□□ 2.38
CDCA8Q53HL2 ANKRD63-201ENST00000434396 1143 ntAPPRIS P1 BASIC29.91■■■□□ 2.38
CDCA8Q53HL2 AC092468.1-201ENST00000491321 562 ntTSL 4 BASIC29.91■■■□□ 2.38
CDCA8Q53HL2 CHTF8-210ENST00000523421 766 ntTSL 3 BASIC29.91■■■□□ 2.38
CDCA8Q53HL2 RPLP2-207ENST00000530797 637 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.91■■■□□ 2.38
CDCA8Q53HL2 SLC35A2-212ENST00000634665 486 ntTSL 4 BASIC29.91■■■□□ 2.38
CDCA8Q53HL2 TPM1-204ENST00000334895 1637 ntTSL 1 (best) BASIC29.91■■■□□ 2.38
CDCA8Q53HL2 IGFBP1-202ENST00000457280 1601 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC29.91■■■□□ 2.38
CDCA8Q53HL2 HOXD1-201ENST00000331462 1975 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.91■■■□□ 2.38
CDCA8Q53HL2 ZDHHC7-203ENST00000564466 1488 ntTSL 5 BASIC29.91■■■□□ 2.38
CDCA8Q53HL2 CREB1-205ENST00000430624 2005 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC29.91■■■□□ 2.38
CDCA8Q53HL2 PPP2R2D-201ENST00000455566 5738 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.91■■■□□ 2.38
CDCA8Q53HL2 LYPLA1-201ENST00000316963 2585 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.91■■■□□ 2.38
CDCA8Q53HL2 LTB4R-201ENST00000345363 1616 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.9■■■□□ 2.38
CDCA8Q53HL2 ARHGEF9-204ENST00000374878 2217 ntTSL 1 (best) BASIC29.9■■■□□ 2.38
CDCA8Q53HL2 SLAIN1-213ENST00000466548 2637 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC29.9■■■□□ 2.38
CDCA8Q53HL2 RASGRP2-203ENST00000377486 667 ntTSL 3 BASIC29.9■■■□□ 2.38
CDCA8Q53HL2 CENPVL3-201ENST00000417339 864 ntAPPRIS P1 BASIC29.9■■■□□ 2.38
CDCA8Q53HL2 NTF6G-201ENST00000591094 616 ntBASIC29.9■■■□□ 2.38
CDCA8Q53HL2 KCNMA1-224ENST00000618048 1269 ntTSL 1 (best) BASIC29.9■■■□□ 2.38
CDCA8Q53HL2 AL133516.1-201ENST00000633012 540 ntTSL 5 BASIC29.9■■■□□ 2.38
CDCA8Q53HL2 TMEM5-201ENST00000261234 1918 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.9■■■□□ 2.38
CDCA8Q53HL2 TRABD2A-203ENST00000409520 1975 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.9■■■□□ 2.38
CDCA8Q53HL2 ABHD6-201ENST00000295962 2393 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.89■■■□□ 2.38
CDCA8Q53HL2 NPAS3-206ENST00000548645 2926 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC29.89■■■□□ 2.38
CDCA8Q53HL2 C21orf2-202ENST00000339818 2233 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC29.89■■■□□ 2.38
CDCA8Q53HL2 LRIG1-202ENST00000383703 5283 ntTSL 1 (best) BASIC29.89■■■□□ 2.38
CDCA8Q53HL2 ATAD3A-203ENST00000378756 2492 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.89■■■□□ 2.38
CDCA8Q53HL2 GDI1-204ENST00000447750 2474 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.89■■■□□ 2.38
CDCA8Q53HL2 UHRF1BP1L-202ENST00000356828 2023 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC29.89■■■□□ 2.38
CDCA8Q53HL2 UCK2-201ENST00000367879 1375 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.89■■■□□ 2.37
CDCA8Q53HL2 KLF3-203ENST00000514033 1871 ntTSL 1 (best) BASIC29.89■■■□□ 2.37
CDCA8Q53HL2 ANXA8-204ENST00000583911 1874 ntTSL 2 BASIC29.89■■■□□ 2.37
CDCA8Q53HL2 ELOA3B-201ENST00000611323 1641 ntAPPRIS P1 BASIC29.89■■■□□ 2.37
CDCA8Q53HL2 ELOA3D-201ENST00000620881 1641 ntAPPRIS P1 BASIC29.89■■■□□ 2.37
CDCA8Q53HL2 C14orf80-201ENST00000329886 1947 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC29.88■■■□□ 2.37
CDCA8Q53HL2 RGS7-204ENST00000366565 2494 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC29.88■■■□□ 2.37
CDCA8Q53HL2 PCSK6-218ENST00000619160 3093 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC29.88■■■□□ 2.37
CDCA8Q53HL2 UBE2D3-201ENST00000321805 1087 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC29.88■■■□□ 2.37
CDCA8Q53HL2 TNFRSF11A-207ENST00000639222 855 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC29.88■■■□□ 2.37
CDCA8Q53HL2 TMEM182-210ENST00000639249 1025 ntTSL 5 BASIC29.88■■■□□ 2.37
CDCA8Q53HL2 PLPP5-209ENST00000529359 2185 ntTSL 1 (best) BASIC29.88■■■□□ 2.37
CDCA8Q53HL2 FHL3-201ENST00000373016 1647 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.88■■■□□ 2.37
CDCA8Q53HL2 SLC22A31-201ENST00000562855 1909 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC29.88■■■□□ 2.37
CDCA8Q53HL2 LINGO3-201ENST00000585527 2241 ntAPPRIS P1 BASIC29.88■■■□□ 2.37
CDCA8Q53HL2 AC055733.4-201ENST00000638462 1354 ntBASIC29.88■■■□□ 2.37
CDCA8Q53HL2 CBWD6-201ENST00000377391 1792 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.87■■■□□ 2.37
CDCA8Q53HL2 IRF2BP1-201ENST00000302165 2564 ntAPPRIS P1 BASIC29.87■■■□□ 2.37
CDCA8Q53HL2 DUSP9-202ENST00000370167 2289 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.87■■■□□ 2.37
CDCA8Q53HL2 SLC26A5-209ENST00000393735 1947 ntTSL 1 (best) BASIC29.87■■■□□ 2.37
CDCA8Q53HL2 TCTEX1D4-201ENST00000339355 763 ntAPPRIS P1 BASIC29.87■■■□□ 2.37
CDCA8Q53HL2 AP002748.1-201ENST00000504911 580 ntTSL 3 BASIC29.87■■■□□ 2.37
CDCA8Q53HL2 AC079140.4-201ENST00000507448 529 ntBASIC29.87■■■□□ 2.37
CDCA8Q53HL2 TRAPPC6A-205ENST00000592647 514 ntTSL 2 BASIC29.87■■■□□ 2.37
CDCA8Q53HL2 DONSON-202ENST00000303113 2028 ntTSL 5 BASIC29.87■■■□□ 2.37
CDCA8Q53HL2 SLC52A2-211ENST00000532887 2147 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC29.87■■■□□ 2.37
CDCA8Q53HL2 SNX21-212ENST00000491381 1607 ntTSL 1 (best) BASIC29.86■■■□□ 2.37
CDCA8Q53HL2 A1BG-201ENST00000263100 1722 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.86■■■□□ 2.37
CDCA8Q53HL2 LY6E-201ENST00000292494 1181 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC29.86■■■□□ 2.37
CDCA8Q53HL2 UCN-201ENST00000296099 795 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.86■■■□□ 2.37
CDCA8Q53HL2 YJEFN3-203ENST00000514277 995 ntTSL 1 (best) BASIC29.86■■■□□ 2.37
CDCA8Q53HL2 CD6-203ENST00000352009 1809 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC29.86■■■□□ 2.37
CDCA8Q53HL2 PXK-203ENST00000383715 1756 ntTSL 5 BASIC29.85■■■□□ 2.37
CDCA8Q53HL2 MIR222HG-202ENST00000602507 1758 ntTSL 5 BASIC29.85■■■□□ 2.37
CDCA8Q53HL2 DUSP26-201ENST00000256261 1835 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.85■■■□□ 2.37
CDCA8Q53HL2 GLI3-203ENST00000437480 451 ntTSL 2 BASIC29.85■■■□□ 2.37
CDCA8Q53HL2 TSEN15-207ENST00000533373 618 ntTSL 2 BASIC29.85■■■□□ 2.37
CDCA8Q53HL2 CERKL-204ENST00000374970 1392 ntTSL 1 (best) BASIC29.85■■■□□ 2.37
CDCA8Q53HL2 EFCC1-201ENST00000436022 2691 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC29.85■■■□□ 2.37
CDCA8Q53HL2 BTBD7-205ENST00000554565 2697 ntTSL 1 (best) BASIC29.85■■■□□ 2.37
CDCA8Q53HL2 FASTK-212ENST00000482571 1764 ntTSL 1 (best) BASIC29.85■■■□□ 2.37
CDCA8Q53HL2 HEXB-201ENST00000261416 1901 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.84■■■□□ 2.37
CDCA8Q53HL2 TBC1D22A-206ENST00000407381 1949 ntTSL 5 BASIC29.84■■■□□ 2.37
CDCA8Q53HL2 WRNIP1-205ENST00000618555 2651 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.84■■■□□ 2.37
CDCA8Q53HL2 COX20-201ENST00000366528 568 ntTSL 2 BASIC29.84■■■□□ 2.37
CDCA8Q53HL2 BCKDHB-203ENST00000369760 743 ntTSL 3 BASIC29.84■■■□□ 2.37
CDCA8Q53HL2 FDX2-202ENST00000393708 1012 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.84■■■□□ 2.37
CDCA8Q53HL2 FAXDC2-211ENST00000520968 558 ntTSL 4 BASIC29.84■■■□□ 2.37
CDCA8Q53HL2 SFTPC-205ENST00000521315 1046 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC29.84■■■□□ 2.37
CDCA8Q53HL2 CCM2-206ENST00000474617 1532 ntTSL 5 BASIC29.84■■■□□ 2.37
CDCA8Q53HL2 SLC41A3-202ENST00000346785 1705 ntTSL 2 BASIC29.84■■■□□ 2.37
CDCA8Q53HL2 SOX18-201ENST00000340356 1864 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.84■■■□□ 2.37
CDCA8Q53HL2 ST7L-201ENST00000343210 1866 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.84■■■□□ 2.37
CDCA8Q53HL2 KCNMA1-283ENST00000640523 5425 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC29.84■■■□□ 2.37
CDCA8Q53HL2 BFSP1-202ENST00000377873 2207 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.83■■■□□ 2.37
CDCA8Q53HL2 H2AFY2-201ENST00000373255 1980 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.83■■■□□ 2.37
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 98 ms