Protein–RNA interactions for Protein: Q4LDE5

SVEP1, Sushi, von Willebrand factor type A, EGF and pentraxin domain-containing protein 1, humanhuman

Predictions only

Length 3,571 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SVEP1Q4LDE5 FIZ1-205ENST00000592585 489 ntTSL 5 BASIC17.82■□□□□ 0.44
SVEP1Q4LDE5 MDK-213ENST00000617138 635 ntTSL 2 BASIC17.82■□□□□ 0.44
SVEP1Q4LDE5 CPNE2-202ENST00000535318 2316 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.82■□□□□ 0.44
SVEP1Q4LDE5 ZFAND4-205ENST00000374371 2283 ntTSL 5 BASIC17.82■□□□□ 0.44
SVEP1Q4LDE5 C7orf26-202ENST00000359073 1762 ntTSL 1 (best) BASIC17.82■□□□□ 0.44
SVEP1Q4LDE5 RDX-204ENST00000528498 2511 ntTSL 1 (best) BASIC17.82■□□□□ 0.44
SVEP1Q4LDE5 NCK2-201ENST00000233154 2683 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.82■□□□□ 0.44
SVEP1Q4LDE5 NUDT8-202ENST00000376693 728 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.82■□□□□ 0.44
SVEP1Q4LDE5 METTL26-203ENST00000397664 604 ntTSL 2 BASIC17.82■□□□□ 0.44
SVEP1Q4LDE5 AC093627.4-202ENST00000479592 591 ntTSL 4 BASIC17.82■□□□□ 0.44
SVEP1Q4LDE5 FAXDC2-211ENST00000520968 558 ntTSL 4 BASIC17.81■□□□□ 0.44
SVEP1Q4LDE5 PLEKHB1-201ENST00000227214 2016 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.81■□□□□ 0.44
SVEP1Q4LDE5 CTSF-201ENST00000310325 2035 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.81■□□□□ 0.44
SVEP1Q4LDE5 HYAL2-207ENST00000442581 2318 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.81■□□□□ 0.44
SVEP1Q4LDE5 SERBP1-202ENST00000370990 1621 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.81■□□□□ 0.44
SVEP1Q4LDE5 C5AR2-202ENST00000600626 1287 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.81■□□□□ 0.44
SVEP1Q4LDE5 ZFYVE28-202ENST00000503000 1874 ntTSL 1 (best) BASIC17.81■□□□□ 0.44
SVEP1Q4LDE5 TRABD2A-203ENST00000409520 1975 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.81■□□□□ 0.44
SVEP1Q4LDE5 AP000282.1-201ENST00000454622 682 ntTSL 2 BASIC17.81■□□□□ 0.44
SVEP1Q4LDE5 RGS6-209ENST00000553525 2005 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC17.8■□□□□ 0.44
SVEP1Q4LDE5 METTL15-202ENST00000403099 795 ntTSL 5 BASIC17.8■□□□□ 0.44
SVEP1Q4LDE5 AC069152.1-201ENST00000438030 544 ntBASIC17.8■□□□□ 0.44
SVEP1Q4LDE5 ATPIF1-204ENST00000497986 599 ntTSL 2 BASIC17.8■□□□□ 0.44
SVEP1Q4LDE5 PUS1-203ENST00000443358 1664 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.8■□□□□ 0.44
SVEP1Q4LDE5 NFKBID-201ENST00000396901 1834 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.8■□□□□ 0.44
SVEP1Q4LDE5 NFKBID-211ENST00000641389 1834 ntAPPRIS ALT2 BASIC17.8■□□□□ 0.44
SVEP1Q4LDE5 RAP1B-202ENST00000341355 714 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC17.8■□□□□ 0.44
SVEP1Q4LDE5 AL645608.9-201ENST00000442292 829 ntTSL 1 (best) BASIC17.8■□□□□ 0.44
SVEP1Q4LDE5 CTAG1A-201ENST00000593606 993 ntTSL 5 BASIC17.8■□□□□ 0.44
SVEP1Q4LDE5 TMEM230-205ENST00000379279 1636 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.8■□□□□ 0.44
SVEP1Q4LDE5 C7orf25-203ENST00000431882 1645 ntTSL 2 BASIC17.8■□□□□ 0.44
SVEP1Q4LDE5 ABHD12B-201ENST00000337334 1708 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.8■□□□□ 0.44
SVEP1Q4LDE5 AP002748.1-201ENST00000504911 580 ntTSL 3 BASIC17.8■□□□□ 0.44
SVEP1Q4LDE5 ADD3-AS1-204ENST00000627565 388 ntTSL 3 BASIC17.8■□□□□ 0.44
SVEP1Q4LDE5 OSCAR-201ENST00000284648 2055 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.79■□□□□ 0.44
SVEP1Q4LDE5 PROSER2-205ENST00000622831 1646 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.79■□□□□ 0.44
SVEP1Q4LDE5 ATAD3A-203ENST00000378756 2492 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.79■□□□□ 0.44
SVEP1Q4LDE5 FADS3-204ENST00000525588 1254 ntTSL 5 BASIC17.79■□□□□ 0.44
SVEP1Q4LDE5 KLF13-207ENST00000560473 489 ntTSL 3 BASIC17.79■□□□□ 0.44
SVEP1Q4LDE5 AC092143.4-201ENST00000570217 559 ntTSL 4 BASIC17.79■□□□□ 0.44
SVEP1Q4LDE5 HSD17B14-204ENST00000599157 991 ntTSL 3 BASIC17.79■□□□□ 0.44
SVEP1Q4LDE5 IRX4-202ENST00000505790 2538 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.79■□□□□ 0.44
SVEP1Q4LDE5 PRR35-201ENST00000409413 2216 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.79■□□□□ 0.44
SVEP1Q4LDE5 ASCC1-204ENST00000394915 1510 ntTSL 5 BASIC17.79■□□□□ 0.44
SVEP1Q4LDE5 TTLL11-202ENST00000373776 2012 ntTSL 1 (best) BASIC17.79■□□□□ 0.44
SVEP1Q4LDE5 PRR7-201ENST00000323249 1480 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.79■□□□□ 0.44
SVEP1Q4LDE5 AL591684.2-201ENST00000605970 1594 ntTSL 5 BASIC17.79■□□□□ 0.44
SVEP1Q4LDE5 BARX2-201ENST00000281437 1813 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.79■□□□□ 0.44
SVEP1Q4LDE5 DAZAP1-201ENST00000233078 2160 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.79■□□□□ 0.44
SVEP1Q4LDE5 HAGH-201ENST00000397353 1257 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC17.79■□□□□ 0.44
SVEP1Q4LDE5 CNN2P6-201ENST00000439038 900 ntBASIC17.79■□□□□ 0.44
SVEP1Q4LDE5 ST8SIA6-201ENST00000377602 2276 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.79■□□□□ 0.44
SVEP1Q4LDE5 SNX24-211ENST00000513881 1563 ntTSL 1 (best) BASIC17.79■□□□□ 0.44
SVEP1Q4LDE5 RNF149-201ENST00000295317 2458 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.79■□□□□ 0.44
SVEP1Q4LDE5 AC073210.2-201ENST00000430369 194 ntBASIC17.79■□□□□ 0.44
SVEP1Q4LDE5 WWTR1-AS1-203ENST00000495094 975 ntTSL 1 (best) BASIC17.79■□□□□ 0.44
SVEP1Q4LDE5 CD99P1-205ENST00000527459 561 ntBASIC17.79■□□□□ 0.44
SVEP1Q4LDE5 TRAP1-202ENST00000538171 2052 ntTSL 2 BASIC17.79■□□□□ 0.44
SVEP1Q4LDE5 CYP2A13-201ENST00000330436 1739 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.79■□□□□ 0.44
SVEP1Q4LDE5 BIN1-210ENST00000393041 2272 ntTSL 1 (best) BASIC17.79■□□□□ 0.44
SVEP1Q4LDE5 DCPS-201ENST00000263579 1479 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.79■□□□□ 0.44
SVEP1Q4LDE5 TRIM28-201ENST00000253024 2960 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.78■□□□□ 0.44
SVEP1Q4LDE5 TMEM218-201ENST00000279968 1034 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.78■□□□□ 0.44
SVEP1Q4LDE5 TRIQK-221ENST00000524107 737 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC17.78■□□□□ 0.44
SVEP1Q4LDE5 FOXA2-201ENST00000377115 2401 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.78■□□□□ 0.44
SVEP1Q4LDE5 MPND-202ENST00000359935 1475 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.78■□□□□ 0.44
SVEP1Q4LDE5 KCNIP2-206ENST00000356640 1989 ntTSL 1 (best) BASIC17.78■□□□□ 0.44
SVEP1Q4LDE5 RGS7-204ENST00000366565 2494 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.78■□□□□ 0.44
SVEP1Q4LDE5 UNC119-202ENST00000335765 1424 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.78■□□□□ 0.44
SVEP1Q4LDE5 AC138649.1-201ENST00000619611 1449 ntTSL 1 (best) BASIC17.78■□□□□ 0.44
SVEP1Q4LDE5 NABP2-203ENST00000380198 1775 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.78■□□□□ 0.44
SVEP1Q4LDE5 MLF2-206ENST00000539187 1110 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.78■□□□□ 0.44
SVEP1Q4LDE5 DUX4L16-201ENST00000555130 1264 ntBASIC17.78■□□□□ 0.44
SVEP1Q4LDE5 AP000802.1-201ENST00000500537 1934 ntTSL 1 (best) BASIC17.78■□□□□ 0.44
SVEP1Q4LDE5 HMGA2-206ENST00000536545 1788 ntTSL 1 (best) BASIC17.78■□□□□ 0.44
SVEP1Q4LDE5 LOXL1-201ENST00000261921 2351 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.78■□□□□ 0.44
SVEP1Q4LDE5 CHPF-202ENST00000373891 1079 ntTSL 2 BASIC17.78■□□□□ 0.44
SVEP1Q4LDE5 AC108693.2-201ENST00000492981 303 ntTSL 3 BASIC17.78■□□□□ 0.44
SVEP1Q4LDE5 AC008687.6-201ENST00000596318 630 ntBASIC17.78■□□□□ 0.44
SVEP1Q4LDE5 AC098590.1-201ENST00000468126 897 ntBASIC17.77■□□□□ 0.44
SVEP1Q4LDE5 TMEM5-201ENST00000261234 1918 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.77■□□□□ 0.44
SVEP1Q4LDE5 KLC3-202ENST00000470402 1820 ntTSL 1 (best) BASIC17.77■□□□□ 0.44
SVEP1Q4LDE5 DYRK3-203ENST00000367109 2163 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.77■□□□□ 0.44
SVEP1Q4LDE5 COX6C-208ENST00000522940 694 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC17.77■□□□□ 0.43
SVEP1Q4LDE5 VSX1-205ENST00000429762 1977 ntTSL 1 (best) BASIC17.77■□□□□ 0.43
SVEP1Q4LDE5 SPOCK3-222ENST00000512681 1457 ntTSL 2 BASIC17.77■□□□□ 0.43
SVEP1Q4LDE5 NOCT-201ENST00000280614 1952 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.77■□□□□ 0.43
SVEP1Q4LDE5 SUMF1-201ENST00000272902 2159 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.76■□□□□ 0.43
SVEP1Q4LDE5 UCHL1-201ENST00000284440 1172 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.76■□□□□ 0.43
SVEP1Q4LDE5 KRTAP17-1-201ENST00000334202 779 ntAPPRIS P1 BASIC17.76■□□□□ 0.43
SVEP1Q4LDE5 TESC-201ENST00000335209 1041 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.76■□□□□ 0.43
SVEP1Q4LDE5 ALDH6A1-201ENST00000350259 1869 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.76■□□□□ 0.43
SVEP1Q4LDE5 ARL5A-202ENST00000428992 747 ntTSL 2 BASIC17.76■□□□□ 0.43
SVEP1Q4LDE5 RPL29-204ENST00000479017 670 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC17.76■□□□□ 0.43
SVEP1Q4LDE5 UCHL1-210ENST00000512788 785 ntTSL 3 BASIC17.76■□□□□ 0.43
SVEP1Q4LDE5 DDN-AS1-201ENST00000547395 858 ntTSL 2 BASIC17.76■□□□□ 0.43
SVEP1Q4LDE5 SUGCT-209ENST00000628514 1591 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC17.76■□□□□ 0.43
SVEP1Q4LDE5 TBCB-214ENST00000629269 413 ntTSL 5 BASIC17.76■□□□□ 0.43
SVEP1Q4LDE5 FAHD1-201ENST00000382666 1964 ntTSL 2 BASIC17.76■□□□□ 0.43
SVEP1Q4LDE5 ADAMTS13-204ENST00000371911 1155 ntTSL 1 (best) BASIC17.76■□□□□ 0.43
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 19.8 ms