Protein–RNA interactions for Protein: Q496J9

SV2C, Synaptic vesicle glycoprotein 2C, humanhuman

Predictions only

Length 727 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SV2CQ496J9 ILKAP-211ENST00000612675 1335 ntTSL 1 (best) BASIC23.11■■□□□ 1.29
SV2CQ496J9 KREMEN2-203ENST00000571007 1877 ntTSL 2 BASIC23.11■■□□□ 1.29
SV2CQ496J9 NRL-203ENST00000397002 1976 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.11■■□□□ 1.29
SV2CQ496J9 AC139530.1-201ENST00000575312 1977 ntBASIC23.11■■□□□ 1.29
SV2CQ496J9 GUK1-207ENST00000366726 873 ntAPPRIS P3 TSL 3 BASIC23.11■■□□□ 1.29
SV2CQ496J9 ANKRD63-201ENST00000434396 1143 ntAPPRIS P1 BASIC23.11■■□□□ 1.29
SV2CQ496J9 BRD2-214ENST00000496118 735 ntTSL 1 (best) BASIC23.11■■□□□ 1.29
SV2CQ496J9 AC108002.2-201ENST00000519782 340 ntTSL 4 BASIC23.11■■□□□ 1.29
SV2CQ496J9 MCRIP1-204ENST00000570507 765 ntTSL 2 BASIC23.11■■□□□ 1.29
SV2CQ496J9 MCRIP1-208ENST00000575061 618 ntTSL 5 BASIC23.11■■□□□ 1.29
SV2CQ496J9 AL133516.1-201ENST00000633012 540 ntTSL 5 BASIC23.11■■□□□ 1.29
SV2CQ496J9 ARHGAP27-207ENST00000528273 2319 ntTSL 1 (best) BASIC23.11■■□□□ 1.29
SV2CQ496J9 STOML1-201ENST00000316900 2169 ntTSL 2 BASIC23.11■■□□□ 1.29
SV2CQ496J9 CADM1-201ENST00000331581 1766 ntTSL 1 (best) BASIC23.11■■□□□ 1.29
SV2CQ496J9 CDK5-204ENST00000485972 1758 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.11■■□□□ 1.29
SV2CQ496J9 CREB1-205ENST00000430624 2005 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.11■■□□□ 1.29
SV2CQ496J9 SERBP1-202ENST00000370990 1621 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.11■■□□□ 1.29
SV2CQ496J9 NOXA1-202ENST00000392815 1464 ntTSL 1 (best) BASIC23.11■■□□□ 1.29
SV2CQ496J9 TMEM198B-205ENST00000487582 1581 ntTSL 1 (best) BASIC23.1■■□□□ 1.29
SV2CQ496J9 CADPS-203ENST00000383710 5471 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.1■■□□□ 1.29
SV2CQ496J9 SAMD4B-208ENST00000598913 2877 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.1■■□□□ 1.29
SV2CQ496J9 ACYP2-201ENST00000303536 789 ntTSL 2 BASIC23.1■■□□□ 1.29
SV2CQ496J9 LRRC3C-201ENST00000377924 891 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC23.1■■□□□ 1.29
SV2CQ496J9 AC073343.2-201ENST00000413182 548 ntTSL 4 BASIC23.1■■□□□ 1.29
SV2CQ496J9 AP003071.3-201ENST00000562506 366 ntTSL 3 BASIC23.1■■□□□ 1.29
SV2CQ496J9 H2AFB3-201ENST00000615853 591 ntAPPRIS P1 BASIC23.1■■□□□ 1.29
SV2CQ496J9 KCNMA1-224ENST00000618048 1269 ntTSL 1 (best) BASIC23.1■■□□□ 1.29
SV2CQ496J9 CPT2-209ENST00000636935 803 ntTSL 5 BASIC23.1■■□□□ 1.29
SV2CQ496J9 AQP6-201ENST00000315520 1398 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.1■■□□□ 1.29
SV2CQ496J9 RPS6-203ENST00000380384 1355 ntTSL 1 (best) BASIC23.1■■□□□ 1.29
SV2CQ496J9 SDR39U1-208ENST00000554698 1364 ntTSL 1 (best) BASIC23.1■■□□□ 1.29
SV2CQ496J9 KLC1-205ENST00000380038 2322 ntTSL 2 BASIC23.1■■□□□ 1.29
SV2CQ496J9 WRNIP1-205ENST00000618555 2651 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.1■■□□□ 1.29
SV2CQ496J9 HMCES-203ENST00000417226 1490 ntTSL 1 (best) BASIC23.1■■□□□ 1.29
SV2CQ496J9 AC074143.1-203ENST00000518227 1473 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.1■■□□□ 1.29
SV2CQ496J9 ZDHHC7-203ENST00000564466 1488 ntTSL 5 BASIC23.1■■□□□ 1.29
SV2CQ496J9 DPP7-201ENST00000371579 1590 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.1■■□□□ 1.29
SV2CQ496J9 WDR86-201ENST00000334493 2023 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.09■■□□□ 1.29
SV2CQ496J9 STX5-201ENST00000294179 1794 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.09■■□□□ 1.29
SV2CQ496J9 C21orf2-202ENST00000339818 2233 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.09■■□□□ 1.29
SV2CQ496J9 AC138649.1-201ENST00000619611 1449 ntTSL 1 (best) BASIC23.09■■□□□ 1.29
SV2CQ496J9 PRR16-202ENST00000407149 1747 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.09■■□□□ 1.29
SV2CQ496J9 LY6E-201ENST00000292494 1181 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.09■■□□□ 1.29
SV2CQ496J9 GP9-201ENST00000307395 889 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.09■■□□□ 1.29
SV2CQ496J9 TCTEX1D4-201ENST00000339355 763 ntAPPRIS P1 BASIC23.09■■□□□ 1.29
SV2CQ496J9 NDUFB2-207ENST00000465506 1101 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.09■■□□□ 1.29
SV2CQ496J9 NPAS3-206ENST00000548645 2926 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.09■■□□□ 1.29
SV2CQ496J9 AC127496.7-201ENST00000625110 1798 ntBASIC23.09■■□□□ 1.29
SV2CQ496J9 ALDH6A1-201ENST00000350259 1869 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.09■■□□□ 1.29
SV2CQ496J9 NKX2-1-201ENST00000354822 2191 ntTSL 1 (best) BASIC23.08■■□□□ 1.29
SV2CQ496J9 RHCE-204ENST00000349320 1810 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.08■■□□□ 1.29
SV2CQ496J9 RASGRP2-207ENST00000377497 2221 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.08■■□□□ 1.29
SV2CQ496J9 AL137002.2-201ENST00000639766 2238 ntTSL 5 BASIC23.08■■□□□ 1.29
SV2CQ496J9 UCN-201ENST00000296099 795 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.08■■□□□ 1.29
SV2CQ496J9 TSEN15-207ENST00000533373 618 ntTSL 2 BASIC23.08■■□□□ 1.29
SV2CQ496J9 NTF6G-201ENST00000591094 616 ntBASIC23.08■■□□□ 1.29
SV2CQ496J9 TNFRSF11A-207ENST00000639222 855 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.08■■□□□ 1.29
SV2CQ496J9 TOP1MT-201ENST00000329245 1958 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.08■■□□□ 1.29
SV2CQ496J9 TPST2-203ENST00000403880 2084 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.08■■□□□ 1.29
SV2CQ496J9 DMRT2-209ENST00000635183 2190 ntTSL 5 BASIC23.08■■□□□ 1.29
SV2CQ496J9 TOP2B-204ENST00000435706 5389 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.08■■□□□ 1.28
SV2CQ496J9 TMEM5-201ENST00000261234 1918 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.08■■□□□ 1.28
SV2CQ496J9 RNF166-202ENST00000537718 1525 ntTSL 2 BASIC23.08■■□□□ 1.28
SV2CQ496J9 WDR86-207ENST00000621812 1542 ntTSL 5 BASIC23.08■■□□□ 1.28
SV2CQ496J9 MME-202ENST00000382989 1319 ntTSL 1 (best) BASIC23.08■■□□□ 1.28
SV2CQ496J9 SIMC1-202ENST00000341199 2056 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC23.07■■□□□ 1.28
SV2CQ496J9 KPTN-201ENST00000338134 1691 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.07■■□□□ 1.28
SV2CQ496J9 RAB28-208ENST00000630951 1679 ntTSL 5 BASIC23.07■■□□□ 1.28
SV2CQ496J9 LGALS9B-201ENST00000324290 1243 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC23.07■■□□□ 1.28
SV2CQ496J9 RASGRP2-203ENST00000377486 667 ntTSL 3 BASIC23.07■■□□□ 1.28
SV2CQ496J9 DONSON-202ENST00000303113 2028 ntTSL 5 BASIC23.07■■□□□ 1.28
SV2CQ496J9 RNF19B-203ENST00000373456 2560 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.07■■□□□ 1.28
SV2CQ496J9 ABHD6-201ENST00000295962 2393 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.07■■□□□ 1.28
SV2CQ496J9 AC092490.1-203ENST00000514568 1972 ntTSL 1 (best) BASIC23.07■■□□□ 1.28
SV2CQ496J9 DSG2-201ENST00000261590 5831 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.07■■□□□ 1.28
SV2CQ496J9 TARSL2-207ENST00000615656 2356 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.06■■□□□ 1.28
SV2CQ496J9 UCK2-201ENST00000367879 1375 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.06■■□□□ 1.28
SV2CQ496J9 AC079140.4-201ENST00000507448 529 ntBASIC23.06■■□□□ 1.28
SV2CQ496J9 YJEFN3-203ENST00000514277 995 ntTSL 1 (best) BASIC23.06■■□□□ 1.28
SV2CQ496J9 CHTF8-210ENST00000523421 766 ntTSL 3 BASIC23.06■■□□□ 1.28
SV2CQ496J9 TRAPPC6A-205ENST00000592647 514 ntTSL 2 BASIC23.06■■□□□ 1.28
SV2CQ496J9 AC092666.2-201ENST00000613287 246 ntBASIC23.06■■□□□ 1.28
SV2CQ496J9 EFCC1-201ENST00000436022 2691 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.06■■□□□ 1.28
SV2CQ496J9 KLF3-203ENST00000514033 1871 ntTSL 1 (best) BASIC23.06■■□□□ 1.28
SV2CQ496J9 PXK-203ENST00000383715 1756 ntTSL 5 BASIC23.06■■□□□ 1.28
SV2CQ496J9 DUSP9-202ENST00000370167 2289 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.06■■□□□ 1.28
SV2CQ496J9 AKT1-201ENST00000349310 2866 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.06■■□□□ 1.28
SV2CQ496J9 HOXD1-201ENST00000331462 1975 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.05■■□□□ 1.28
SV2CQ496J9 TRABD2A-203ENST00000409520 1975 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.05■■□□□ 1.28
SV2CQ496J9 ARHGEF9-204ENST00000374878 2217 ntTSL 1 (best) BASIC23.05■■□□□ 1.28
SV2CQ496J9 AKR7A2-201ENST00000235835 1362 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.05■■□□□ 1.28
SV2CQ496J9 TPM1-204ENST00000334895 1637 ntTSL 1 (best) BASIC23.05■■□□□ 1.28
SV2CQ496J9 IGFBP1-202ENST00000457280 1601 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.05■■□□□ 1.28
SV2CQ496J9 SLC52A2-211ENST00000532887 2147 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.05■■□□□ 1.28
SV2CQ496J9 UHRF1BP1L-202ENST00000356828 2023 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.05■■□□□ 1.28
SV2CQ496J9 GLI3-203ENST00000437480 451 ntTSL 2 BASIC23.05■■□□□ 1.28
SV2CQ496J9 SNRK-203ENST00000437827 1995 ntTSL 2 BASIC23.05■■□□□ 1.28
SV2CQ496J9 NRG2-201ENST00000289409 2535 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.05■■□□□ 1.28
SV2CQ496J9 LHX2-201ENST00000373615 2554 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.04■■□□□ 1.28
SV2CQ496J9 C14orf80-201ENST00000329886 1947 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.04■■□□□ 1.28
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 16.3 ms