Protein–RNA interactions for Protein: Q3SY56

SP6, Transcription factor Sp6, humanhuman

Predictions only

Length 376 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SP6Q3SY56 MAFF-204ENST00000426621 2216 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC17.87■□□□□ 0.45
SP6Q3SY56 UBA5-208ENST00000473651 1513 ntTSL 5 BASIC17.87■□□□□ 0.45
SP6Q3SY56 AC090377.1-201ENST00000585691 1762 ntTSL 3 BASIC17.86■□□□□ 0.45
SP6Q3SY56 CNTD2-202ENST00000430325 1817 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC17.86■□□□□ 0.45
SP6Q3SY56 DTNBP1-201ENST00000338950 1880 ntTSL 1 (best) BASIC17.86■□□□□ 0.45
SP6Q3SY56 BAZ1B-202ENST00000404251 5428 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.86■□□□□ 0.45
SP6Q3SY56 ACHE-203ENST00000411582 2179 ntTSL 1 (best) BASIC17.86■□□□□ 0.45
SP6Q3SY56 PHACTR2-203ENST00000367584 2490 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.86■□□□□ 0.45
SP6Q3SY56 E4F1-204ENST00000564139 2493 ntTSL 1 (best) BASIC17.86■□□□□ 0.45
SP6Q3SY56 EIF3J-203ENST00000535391 925 ntTSL 2 BASIC17.86■□□□□ 0.45
SP6Q3SY56 RAB4B-203ENST00000594800 1173 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.86■□□□□ 0.45
SP6Q3SY56 CA15P2-201ENST00000611168 834 ntBASIC17.86■□□□□ 0.45
SP6Q3SY56 AC005703.6-201ENST00000623265 1329 ntBASIC17.86■□□□□ 0.45
SP6Q3SY56 SMIM10L2B-201ENST00000433425 2737 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.86■□□□□ 0.45
SP6Q3SY56 CFP-202ENST00000377005 1435 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.86■□□□□ 0.45
SP6Q3SY56 SHOX2-203ENST00000441443 3038 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.86■□□□□ 0.45
SP6Q3SY56 HOXB3-202ENST00000460160 1525 ntTSL 5 BASIC17.86■□□□□ 0.45
SP6Q3SY56 SNX21-212ENST00000491381 1607 ntTSL 1 (best) BASIC17.86■□□□□ 0.45
SP6Q3SY56 NAE1-204ENST00000394074 1654 ntTSL 5 BASIC17.86■□□□□ 0.45
SP6Q3SY56 CERS4-205ENST00000558331 1803 ntTSL 5 BASIC17.86■□□□□ 0.45
SP6Q3SY56 C20orf27-202ENST00000379772 1886 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.86■□□□□ 0.45
SP6Q3SY56 CFAP99-206ENST00000616117 1941 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.86■□□□□ 0.45
SP6Q3SY56 FBXL14-201ENST00000339235 2111 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.86■□□□□ 0.45
SP6Q3SY56 FAM72B-202ENST00000369390 2396 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.86■□□□□ 0.45
SP6Q3SY56 MAG-201ENST00000361922 2426 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.86■□□□□ 0.45
SP6Q3SY56 MTMR9LP-204ENST00000441044 2624 ntTSL 1 (best) BASIC17.85■□□□□ 0.45
SP6Q3SY56 IGFBP1-201ENST00000275525 1653 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.85■□□□□ 0.45
SP6Q3SY56 RASGRP2-207ENST00000377497 2221 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.85■□□□□ 0.45
SP6Q3SY56 SENP5-202ENST00000419026 973 ntTSL 3 BASIC17.85■□□□□ 0.45
SP6Q3SY56 MARK3-206ENST00000440884 2643 ntTSL 1 (best) BASIC17.85■□□□□ 0.45
SP6Q3SY56 FEM1AP4-201ENST00000443167 1987 ntBASIC17.85■□□□□ 0.45
SP6Q3SY56 NPNT-204ENST00000453617 2419 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC17.85■□□□□ 0.45
SP6Q3SY56 TPTEP1-205ENST00000558085 1738 ntTSL 2 BASIC17.85■□□□□ 0.45
SP6Q3SY56 PCSK6-214ENST00000611716 4409 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC17.85■□□□□ 0.45
SP6Q3SY56 ZBTB7A-201ENST00000322357 5422 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.85■□□□□ 0.45
SP6Q3SY56 PPP4R2-201ENST00000356692 4984 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.85■□□□□ 0.45
SP6Q3SY56 KLF14-201ENST00000583337 2827 ntAPPRIS P1 BASIC17.85■□□□□ 0.45
SP6Q3SY56 JADE2-204ENST00000402835 2797 ntTSL 5 BASIC17.85■□□□□ 0.45
SP6Q3SY56 RELT-202ENST00000393580 2669 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.85■□□□□ 0.45
SP6Q3SY56 DLX2-201ENST00000234198 2453 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.84■□□□□ 0.45
SP6Q3SY56 EFHD2-201ENST00000375980 2419 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.84■□□□□ 0.45
SP6Q3SY56 MSANTD1-204ENST00000510580 2039 ntTSL 5 BASIC17.84■□□□□ 0.45
SP6Q3SY56 SOX18-201ENST00000340356 1864 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.84■□□□□ 0.45
SP6Q3SY56 TUB-203ENST00000534099 1759 ntTSL 2 BASIC17.84■□□□□ 0.45
SP6Q3SY56 SMIM10L2A-201ENST00000417443 5230 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.84■□□□□ 0.45
SP6Q3SY56 DOK3-202ENST00000357198 1729 ntTSL 2 BASIC17.84■□□□□ 0.45
SP6Q3SY56 HOXA4-201ENST00000360046 1747 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.84■□□□□ 0.45
SP6Q3SY56 RNASEH2B-201ENST00000336617 1629 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.84■□□□□ 0.45
SP6Q3SY56 MDFI-203ENST00000373051 1622 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.84■□□□□ 0.45
SP6Q3SY56 SH3RF3-AS1-201ENST00000567491 1604 ntBASIC17.84■□□□□ 0.45
SP6Q3SY56 DPP7-201ENST00000371579 1590 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.84■□□□□ 0.45
SP6Q3SY56 PELI3-202ENST00000349459 2783 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.84■□□□□ 0.45
SP6Q3SY56 CLN5-201ENST00000377453 2629 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.84■□□□□ 0.45
SP6Q3SY56 BRI3-201ENST00000297290 780 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.84■□□□□ 0.45
SP6Q3SY56 RASGRP2-204ENST00000377487 642 ntTSL 2 BASIC17.84■□□□□ 0.45
SP6Q3SY56 ABHD17AP5-201ENST00000580133 923 ntBASIC17.84■□□□□ 0.45
SP6Q3SY56 FUBP3-201ENST00000319725 3124 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.84■□□□□ 0.45
SP6Q3SY56 ALG9-215ENST00000616540 2069 ntTSL 1 (best) BASIC17.84■□□□□ 0.45
SP6Q3SY56 RBBP7-202ENST00000380084 2036 ntTSL 2 BASIC17.84■□□□□ 0.45
SP6Q3SY56 KLHL17-205ENST00000622660 1950 ntTSL 5 BASIC17.84■□□□□ 0.45
SP6Q3SY56 ZNF446-208ENST00000622313 1884 ntTSL 1 (best) BASIC17.84■□□□□ 0.45
SP6Q3SY56 ACAA1-202ENST00000333167 1785 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.84■□□□□ 0.45
SP6Q3SY56 TCP11-202ENST00000311875 2166 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.83■□□□□ 0.45
SP6Q3SY56 TMEM129-206ENST00000536901 2172 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.83■□□□□ 0.45
SP6Q3SY56 PPP1R3F-201ENST00000055335 3421 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.83■□□□□ 0.45
SP6Q3SY56 DNAAF4-201ENST00000321149 1993 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.83■□□□□ 0.44
SP6Q3SY56 NSUN2-206ENST00000506139 2619 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.83■□□□□ 0.44
SP6Q3SY56 RARA-201ENST00000254066 2414 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.83■□□□□ 0.44
SP6Q3SY56 AL353743.1-201ENST00000637846 1769 ntTSL 5 BASIC17.83■□□□□ 0.44
SP6Q3SY56 SGTA-201ENST00000221566 2330 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.83■□□□□ 0.44
SP6Q3SY56 TSPAN3-202ENST00000346495 1647 ntTSL 2 BASIC17.83■□□□□ 0.44
SP6Q3SY56 SLC35A2-210ENST00000616181 1614 ntTSL 2 BASIC17.83■□□□□ 0.44
SP6Q3SY56 SOX3-201ENST00000370536 2132 ntAPPRIS P1 BASIC17.83■□□□□ 0.44
SP6Q3SY56 KMT2B-201ENST00000420124 8469 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.83■□□□□ 0.44
SP6Q3SY56 ARID1B-220ENST00000636930 8246 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.83■□□□□ 0.44
SP6Q3SY56 H1FX-201ENST00000333762 1507 ntAPPRIS P1 BASIC17.82■□□□□ 0.44
SP6Q3SY56 FLT1-204ENST00000541932 2969 ntTSL 1 (best) BASIC17.82■□□□□ 0.44
SP6Q3SY56 UBR2-203ENST00000372903 2423 ntTSL 1 (best) BASIC17.82■□□□□ 0.44
SP6Q3SY56 SLC35A3-208ENST00000638336 2438 ntTSL 1 (best) BASIC17.82■□□□□ 0.44
SP6Q3SY56 AQP6-201ENST00000315520 1398 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.82■□□□□ 0.44
SP6Q3SY56 CHN1-203ENST00000409156 1761 ntTSL 2 BASIC17.82■□□□□ 0.44
SP6Q3SY56 C8orf82-201ENST00000313465 2186 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.82■□□□□ 0.44
SP6Q3SY56 C1orf174-201ENST00000361605 1666 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.82■□□□□ 0.44
SP6Q3SY56 UBAP1L-203ENST00000559089 1694 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.82■□□□□ 0.44
SP6Q3SY56 NEK3-208ENST00000618534 2414 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC17.82■□□□□ 0.44
SP6Q3SY56 PSIP1-201ENST00000380715 1966 ntTSL 1 (best) BASIC17.82■□□□□ 0.44
SP6Q3SY56 TMEM161A-202ENST00000450333 1930 ntTSL 2 BASIC17.82■□□□□ 0.44
SP6Q3SY56 ARHGEF4-202ENST00000355771 1872 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.82■□□□□ 0.44
SP6Q3SY56 PLEKHH3-201ENST00000293349 2987 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC17.82■□□□□ 0.44
SP6Q3SY56 BARX2-201ENST00000281437 1813 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.82■□□□□ 0.44
SP6Q3SY56 GRTP1-202ENST00000375430 1834 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.82■□□□□ 0.44
SP6Q3SY56 KCNQ1-202ENST00000335475 2159 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.81■□□□□ 0.44
SP6Q3SY56 DMRTA2-202ENST00000418121 2840 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.81■□□□□ 0.44
SP6Q3SY56 SLC13A3-204ENST00000413164 2008 ntTSL 2 BASIC17.81■□□□□ 0.44
SP6Q3SY56 FNDC4-201ENST00000264703 1657 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.81■□□□□ 0.44
SP6Q3SY56 KLHDC9-203ENST00000392192 1333 ntTSL 1 (best) BASIC17.81■□□□□ 0.44
SP6Q3SY56 DMRT2-203ENST00000358146 1965 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.81■□□□□ 0.44
SP6Q3SY56 PMPCA-203ENST00000399219 1987 ntTSL 2 BASIC17.81■□□□□ 0.44
SP6Q3SY56 PRMT5-201ENST00000216350 2271 ntTSL 2 BASIC17.81■□□□□ 0.44
SP6Q3SY56 SIMC1-204ENST00000430704 1925 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC17.81■□□□□ 0.44
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 47.7 ms