Protein–RNA interactions for Protein: Q3E811

RRT15, Regulator of rDNA transcription protein 15, yeastyeast

Predictions only

Length 62 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (RIP-Chip)
Gene UniProt Accession Gene Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score Detected Interaction
RRT15Q3E811 ARG5,6YER069W 2592 nt2.27□□□□□ -2.05
RRT15Q3E811 TGL3YMR313C 1929 nt2.27□□□□□ -2.05
RRT15Q3E811 KAP104YBR017C 2757 nt2.27□□□□□ -2.05
RRT15Q3E811 EXO70YJL085W 1872 nt2.26□□□□□ -2.05
RRT15Q3E811 PRR2YDL214C 2100 nt2.26□□□□□ -2.05
RRT15Q3E811 RPS23AYGR118W 438 nt2.26□□□□□ -2.05
RRT15Q3E811 PHD1YKL043W 1101 nt2.26□□□□□ -2.05
RRT15Q3E811 YNL228WYNL228W 777 nt2.26□□□□□ -2.05
RRT15Q3E811 RPS23BYPR132W 438 nt2.26□□□□□ -2.05
RRT15Q3E811 YPR150WYPR150W 522 nt2.26□□□□□ -2.05
RRT15Q3E811 CHA4YLR098C 1947 nt2.26□□□□□ -2.05
RRT15Q3E811 OAF3YKR064W 2592 nt2.26□□□□□ -2.05
RRT15Q3E811 PRP8YHR165C 7242 nt2.26□□□□□ -2.05
RRT15Q3E811 FUN30YAL019W 3396 nt2.26□□□□□ -2.05
RRT15Q3E811 CBP2YHL038C 1893 nt2.25□□□□□ -2.05
RRT15Q3E811 YDL176WYDL176W 2127 nt2.25□□□□□ -2.05
RRT15Q3E811 OSW5YMR148W 447 nt2.25□□□□□ -2.05
RRT15Q3E811 RUF5-1RUF5-1 710 nt2.25□□□□□ -2.05
RRT15Q3E811 RUF5-2RUF5-2 710 nt2.25□□□□□ -2.05
RRT15Q3E811 BDP1YNL039W 1785 nt2.25□□□□□ -2.05
RRT15Q3E811 MMR1YLR190W 1476 nt2.25□□□□□ -2.05
RRT15Q3E811 PHO12YHR215W 1404 nt2.25□□□□□ -2.05
RRT15Q3E811 PHO11YAR071W 1404 nt2.25□□□□□ -2.05
RRT15Q3E811 MDV1YJL112W 2145 nt2.24□□□□□ -2.05
RRT15Q3E811 VPS27YNR006W 1869 nt2.24□□□□□ -2.05
RRT15Q3E811 UBC6YER100W 753 nt2.24□□□□□ -2.05
RRT15Q3E811 YGL063C-AYGL063C-A 150 nt2.24□□□□□ -2.05
RRT15Q3E811 REV7YIL139C 738 nt2.24□□□□□ -2.05
RRT15Q3E811 MRS3YJL133W 945 nt2.24□□□□□ -2.05
RRT15Q3E811 NIP7YPL211W 546 nt2.24□□□□□ -2.05
RRT15Q3E811 GGA1YDR358W 1674 nt2.24□□□□□ -2.05
RRT15Q3E811 MIH1YMR036C 1665 nt2.24□□□□□ -2.05
RRT15Q3E811 MSM1YGR171C 1728 nt2.23□□□□□ -2.05
RRT15Q3E811 MDM38YOL027C 1722 nt2.23□□□□□ -2.05
RRT15Q3E811 NOP4YPL043W 2058 nt2.23□□□□□ -2.05
RRT15Q3E811 ULP1YPL020C 1866 nt2.23□□□□□ -2.05
RRT15Q3E811 MTM1YGR257C 1101 nt2.23□□□□□ -2.05
RRT15Q3E811 VMA22YHR060W 546 nt2.23□□□□□ -2.05
RRT15Q3E811 YPT35YHR105W 645 nt2.23□□□□□ -2.05
RRT15Q3E811 RPA43YOR340C 981 nt2.23□□□□□ -2.05
RRT15Q3E811 snR42snR42 351 nt2.23□□□□□ -2.05
RRT15Q3E811 YPR022CYPR022C 3402 nt2.23□□□□□ -2.05
RRT15Q3E811 LAP2YNL045W 2016 nt2.23□□□□□ -2.05
RRT15Q3E811 IOC4YMR044W 1428 nt2.23□□□□□ -2.05
RRT15Q3E811 WHI4YDL224C 1950 nt2.23□□□□□ -2.05
RRT15Q3E811 PUF6YDR496C 1971 nt2.23□□□□□ -2.05
RRT15Q3E811 SPS2YDR522C 1509 nt2.22□□□□□ -2.05
RRT15Q3E811 DBP7YKR024C 2229 nt2.22□□□□□ -2.05
RRT15Q3E811 BUD6YLR319C 2367 nt2.22□□□□□ -2.05
RRT15Q3E811 ARP4YJL081C 1470 nt2.22□□□□□ -2.05
RRT15Q3E811 ADY4YLR227C 1482 nt2.22□□□□□ -2.05
RRT15Q3E811 YGL193CYGL193C 312 nt2.22□□□□□ -2.05
RRT15Q3E811 SCM4YGR049W 564 nt2.22□□□□□ -2.05
RRT15Q3E811 AGE2YIL044C 897 nt2.22□□□□□ -2.05
RRT15Q3E811 SWD2YKL018W 990 nt2.22□□□□□ -2.05
RRT15Q3E811 PSR1YLL010C 1284 nt2.22□□□□□ -2.05
RRT15Q3E811 STP1YDR463W 1560 nt2.22□□□□□ -2.05
RRT15Q3E811 MIG1YGL035C 1515 nt2.22□□□□□ -2.05
RRT15Q3E811 KRE2YDR483W 1329 nt2.21□□□□□ -2.06
RRT15Q3E811 PCL10YGL134W 1302 nt2.21□□□□□ -2.06
RRT15Q3E811 SOK1YDR006C 2706 nt2.21□□□□□ -2.06
RRT15Q3E811 DTD1YDL219W 453 nt2.21□□□□□ -2.06
RRT15Q3E811 OKP1YGR179C 1221 nt2.21□□□□□ -2.06
RRT15Q3E811 DOG2YHR043C 741 nt2.21□□□□□ -2.06
RRT15Q3E811 SDP1YIL113W 630 nt2.21□□□□□ -2.06
RRT15Q3E811 UBP8YMR223W 1416 nt2.21□□□□□ -2.06
RRT15Q3E811 VPS21YOR089C 633 nt2.21□□□□□ -2.06
RRT15Q3E811 RKM3YBR030W 1659 nt2.21□□□□□ -2.06
RRT15Q3E811 SSM4YIL030C 3960 nt2.21□□□□□ -2.06
RRT15Q3E811 YGR237CYGR237C 2358 nt2.21□□□□□ -2.06
RRT15Q3E811 YPS6YIR039C 1614 nt2.2□□□□□ -2.06
RRT15Q3E811 PRM15YMR278W 1869 nt2.2□□□□□ -2.06
RRT15Q3E811 YSP2YDR326C 4317 nt2.2□□□□□ -2.06
RRT15Q3E811 MRS2YOR334W 1413 nt2.2□□□□□ -2.06
RRT15Q3E811 RTT103YDR289C 1230 nt2.2□□□□□ -2.06
RRT15Q3E811 FRQ1YDR373W 573 nt2.2□□□□□ -2.06
RRT15Q3E811 YHR086W-AYHR086W-A 162 nt2.2□□□□□ -2.06
RRT15Q3E811 THP2YHR167W 786 nt2.2□□□□□ -2.06
RRT15Q3E811 CPR7YJR032W 1182 nt2.2□□□□□ -2.06
RRT15Q3E811 SEC65YML105C 822 nt2.2□□□□□ -2.06
RRT15Q3E811 OCA2YNL056W 594 nt2.2□□□□□ -2.06
RRT15Q3E811 SKT5YBL061C 2091 nt2.2□□□□□ -2.06
RRT15Q3E811 DAP2YHR028C 2457 nt2.2□□□□□ -2.06
RRT15Q3E811 UBP12YJL197W 3765 nt2.2□□□□□ -2.06
RRT15Q3E811 ESL1YIL151C 3357 nt2.19□□□□□ -2.06
RRT15Q3E811 SUP45YBR143C 1314 nt2.19□□□□□ -2.06
RRT15Q3E811 NDC80YIL144W 2076 nt2.19□□□□□ -2.06
RRT15Q3E811 KIN82YCR091W 2163 nt2.19□□□□□ -2.06
RRT15Q3E811 RPL30YGL030W 318 nt2.19□□□□□ -2.06
RRT15Q3E811 PAN5YHR063C 1140 nt2.19□□□□□ -2.06
RRT15Q3E811 COX23YHR116W 456 nt2.19□□□□□ -2.06
RRT15Q3E811 GTT1YIR038C 705 nt2.19□□□□□ -2.06
RRT15Q3E811 RPL17AYKL180W 555 nt2.19□□□□□ -2.06
RRT15Q3E811 DIB1YPR082C 432 nt2.19□□□□□ -2.06
RRT15Q3E811 CMD1YBR109C 444 nt2.19□□□□□ -2.06
RRT15Q3E811 ATP25YMR098C 1839 nt2.19□□□□□ -2.06
RRT15Q3E811 CDC55YGL190C 1581 nt2.19□□□□□ -2.06
RRT15Q3E811 TPD3YAL016W 1908 nt2.19□□□□□ -2.06
RRT15Q3E811 RAX2YLR084C 3663 nt2.19□□□□□ -2.06
RRT15Q3E811 SMP3YOR149C 1551 nt2.19□□□□□ -2.06
Retrieved 100 of 7,029 protein–RNA pairs in 23.9 ms