Protein–RNA interactions for Protein: Q2WEN9

CEACAM16, Carcinoembryonic antigen-related cell adhesion molecule 16, humanhuman

Predictions only

Length 425 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CEACAM16Q2WEN9 GLTPD2-201ENST00000331264 1023 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.06■□□□□ 0.64
CEACAM16Q2WEN9 CROT-202ENST00000412227 1213 ntTSL 1 (best) BASIC19.06■□□□□ 0.64
CEACAM16Q2WEN9 RHOF-204ENST00000537265 699 ntTSL 2 BASIC19.06■□□□□ 0.64
CEACAM16Q2WEN9 AC105233.4-201ENST00000642045 216 ntBASIC19.06■□□□□ 0.64
CEACAM16Q2WEN9 G6PD-202ENST00000393562 2631 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.06■□□□□ 0.64
CEACAM16Q2WEN9 FAM107B-211ENST00000468747 2633 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.06■□□□□ 0.64
CEACAM16Q2WEN9 G6PD-211ENST00000621232 2631 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.06■□□□□ 0.64
CEACAM16Q2WEN9 SCRT2-201ENST00000246104 3577 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.06■□□□□ 0.64
CEACAM16Q2WEN9 NR0B1-202ENST00000378970 2021 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.06■□□□□ 0.64
CEACAM16Q2WEN9 ONECUT3-201ENST00000382349 8318 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.06■□□□□ 0.64
CEACAM16Q2WEN9 RBM38-203ENST00000356208 2382 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.06■□□□□ 0.64
CEACAM16Q2WEN9 CXCL14-201ENST00000337225 1971 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.06■□□□□ 0.64
CEACAM16Q2WEN9 C22orf34-203ENST00000405854 1593 ntTSL 5 BASIC19.06■□□□□ 0.64
CEACAM16Q2WEN9 CPE-201ENST00000402744 2421 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.05■□□□□ 0.64
CEACAM16Q2WEN9 TRADD-202ENST00000486556 1833 ntTSL 2 BASIC19.05■□□□□ 0.64
CEACAM16Q2WEN9 TMCC2-209ENST00000637895 1455 ntTSL 1 (best) BASIC19.05■□□□□ 0.64
CEACAM16Q2WEN9 MAGI2-202ENST00000419488 6800 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.05■□□□□ 0.64
CEACAM16Q2WEN9 NINJ1-201ENST00000375446 1281 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.05■□□□□ 0.64
CEACAM16Q2WEN9 RASGEF1B-208ENST00000510780 539 ntTSL 3 BASIC19.05■□□□□ 0.64
CEACAM16Q2WEN9 RASGEF1B-209ENST00000512343 498 ntTSL 3 BASIC19.05■□□□□ 0.64
CEACAM16Q2WEN9 BAZ1A-201ENST00000358716 5920 ntTSL 1 (best) BASIC19.05■□□□□ 0.64
CEACAM16Q2WEN9 HIRA-201ENST00000263208 4053 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.05■□□□□ 0.64
CEACAM16Q2WEN9 EEFSEC-201ENST00000254730 2232 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.05■□□□□ 0.64
CEACAM16Q2WEN9 NRXN1-205ENST00000401710 2873 ntTSL 5 BASIC19.05■□□□□ 0.64
CEACAM16Q2WEN9 ZNF410-206ENST00000540593 1722 ntTSL 2 BASIC19.05■□□□□ 0.64
CEACAM16Q2WEN9 ANKHD1-204ENST00000394722 2035 ntTSL 1 (best) BASIC19.05■□□□□ 0.64
CEACAM16Q2WEN9 LMF1-202ENST00000543238 2103 ntTSL 2 BASIC19.04■□□□□ 0.64
CEACAM16Q2WEN9 HSPB2-201ENST00000304298 1335 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.04■□□□□ 0.64
CEACAM16Q2WEN9 FHL3-201ENST00000373016 1647 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.04■□□□□ 0.64
CEACAM16Q2WEN9 MIR222HG-202ENST00000602507 1758 ntTSL 5 BASIC19.04■□□□□ 0.64
CEACAM16Q2WEN9 IRS3P-201ENST00000223076 1006 ntBASIC19.04■□□□□ 0.64
CEACAM16Q2WEN9 CYHR1-201ENST00000306145 1409 ntTSL 1 (best) BASIC19.04■□□□□ 0.64
CEACAM16Q2WEN9 WDR86-201ENST00000334493 2023 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.04■□□□□ 0.64
CEACAM16Q2WEN9 SOX18-201ENST00000340356 1864 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.04■□□□□ 0.64
CEACAM16Q2WEN9 CLN3-207ENST00000395653 1430 ntTSL 5 BASIC19.04■□□□□ 0.64
CEACAM16Q2WEN9 AC079305.3-201ENST00000455416 218 ntTSL 5 BASIC19.04■□□□□ 0.64
CEACAM16Q2WEN9 TUSC3-209ENST00000509380 1266 ntTSL 5 BASIC19.04■□□□□ 0.64
CEACAM16Q2WEN9 SMUG1P1-201ENST00000590640 811 ntBASIC19.04■□□□□ 0.64
CEACAM16Q2WEN9 ANKRD11-217ENST00000613312 1584 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.04■□□□□ 0.64
CEACAM16Q2WEN9 KCNQ5-205ENST00000370398 6345 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.04■□□□□ 0.64
CEACAM16Q2WEN9 UCHL5-205ENST00000367454 1815 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC19.04■□□□□ 0.64
CEACAM16Q2WEN9 HTATSF1-201ENST00000218364 2775 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.04■□□□□ 0.64
CEACAM16Q2WEN9 CEBPB-AS1-201ENST00000613921 2648 ntTSL 3 BASIC19.04■□□□□ 0.64
CEACAM16Q2WEN9 SEC22C-207ENST00000423701 1458 ntTSL 1 (best) BASIC19.03■□□□□ 0.64
CEACAM16Q2WEN9 AC074143.1-203ENST00000518227 1473 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.03■□□□□ 0.64
CEACAM16Q2WEN9 RAB24-201ENST00000303251 1311 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.03■□□□□ 0.64
CEACAM16Q2WEN9 TATDN2-201ENST00000287652 5342 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.03■□□□□ 0.64
CEACAM16Q2WEN9 SLC41A3-202ENST00000346785 1705 ntTSL 2 BASIC19.03■□□□□ 0.64
CEACAM16Q2WEN9 PRDX4-202ENST00000379341 1005 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.03■□□□□ 0.64
CEACAM16Q2WEN9 RNF208-201ENST00000391553 1077 ntAPPRIS P1 BASIC19.03■□□□□ 0.64
CEACAM16Q2WEN9 ZFAS1-206ENST00000450535 1075 ntTSL 3 BASIC19.03■□□□□ 0.64
CEACAM16Q2WEN9 CTAG1A-201ENST00000593606 993 ntTSL 5 BASIC19.03■□□□□ 0.64
CEACAM16Q2WEN9 ITM2C-202ENST00000326427 2078 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.03■□□□□ 0.64
CEACAM16Q2WEN9 SMOX-212ENST00000621355 2322 ntTSL 1 (best) BASIC19.03■□□□□ 0.64
CEACAM16Q2WEN9 FASTK-212ENST00000482571 1764 ntTSL 1 (best) BASIC19.03■□□□□ 0.64
CEACAM16Q2WEN9 NOX4-209ENST00000527626 1774 ntTSL 2 BASIC19.03■□□□□ 0.64
CEACAM16Q2WEN9 FIZ1-201ENST00000221665 2660 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.03■□□□□ 0.64
CEACAM16Q2WEN9 IGFBP1-202ENST00000457280 1601 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.03■□□□□ 0.64
CEACAM16Q2WEN9 TLX2-201ENST00000233638 2136 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.03■□□□□ 0.64
CEACAM16Q2WEN9 SPHK1-201ENST00000323374 2138 ntTSL 1 (best) BASIC19.03■□□□□ 0.64
CEACAM16Q2WEN9 LSR-203ENST00000360798 1963 ntTSL 2 BASIC19.02■□□□□ 0.64
CEACAM16Q2WEN9 DMRT1-201ENST00000382276 2222 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.02■□□□□ 0.64
CEACAM16Q2WEN9 AC092053.2-201ENST00000640557 1818 ntBASIC19.02■□□□□ 0.64
CEACAM16Q2WEN9 REPIN1-214ENST00000489432 2058 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC19.02■□□□□ 0.64
CEACAM16Q2WEN9 GRAMD1A-201ENST00000317991 2695 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.02■□□□□ 0.64
CEACAM16Q2WEN9 ZFAND2B-202ENST00000409097 1765 ntTSL 2 BASIC19.02■□□□□ 0.64
CEACAM16Q2WEN9 LGALS9B-201ENST00000324290 1243 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC19.02■□□□□ 0.64
CEACAM16Q2WEN9 ZNRF2P3-201ENST00000424200 374 ntBASIC19.02■□□□□ 0.64
CEACAM16Q2WEN9 MED14OS-201ENST00000456333 900 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.02■□□□□ 0.64
CEACAM16Q2WEN9 SLC39A3-203ENST00000545664 1219 ntTSL 2 BASIC19.02■□□□□ 0.64
CEACAM16Q2WEN9 ATP10A-207ENST00000619904 988 ntTSL 5 BASIC19.02■□□□□ 0.64
CEACAM16Q2WEN9 ALDH6A1-201ENST00000350259 1869 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC19.02■□□□□ 0.64
CEACAM16Q2WEN9 EYA2-203ENST00000357410 2465 ntTSL 1 (best) BASIC19.02■□□□□ 0.64
CEACAM16Q2WEN9 NEURL3-201ENST00000310865 1710 ntTSL 1 (best) BASIC19.02■□□□□ 0.63
CEACAM16Q2WEN9 BIN1-203ENST00000346226 2401 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.02■□□□□ 0.63
CEACAM16Q2WEN9 TMEM165-201ENST00000381334 1928 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.02■□□□□ 0.63
CEACAM16Q2WEN9 MCMBP-202ENST00000369077 2465 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC19.01■□□□□ 0.63
CEACAM16Q2WEN9 AC133065.2-201ENST00000573379 2147 ntTSL 2 BASIC19.01■□□□□ 0.63
CEACAM16Q2WEN9 SNRK-203ENST00000437827 1995 ntTSL 2 BASIC19.01■□□□□ 0.63
CEACAM16Q2WEN9 POTED-202ENST00000620442 1988 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.01■□□□□ 0.63
CEACAM16Q2WEN9 EP400NL-214ENST00000641289 2402 ntBASIC19.01■□□□□ 0.63
CEACAM16Q2WEN9 SNX21-212ENST00000491381 1607 ntTSL 1 (best) BASIC19.01■□□□□ 0.63
CEACAM16Q2WEN9 ZNF584-203ENST00000593920 2187 ntTSL 2 BASIC19.01■□□□□ 0.63
CEACAM16Q2WEN9 PRKCZ-AS1-201ENST00000333854 1253 ntTSL 2 BASIC19.01■□□□□ 0.63
CEACAM16Q2WEN9 TESC-201ENST00000335209 1041 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.01■□□□□ 0.63
CEACAM16Q2WEN9 PRSS22-203ENST00000571228 1037 ntTSL 2 BASIC19.01■□□□□ 0.63
CEACAM16Q2WEN9 DUSP26-201ENST00000256261 1835 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.01■□□□□ 0.63
CEACAM16Q2WEN9 CD6-203ENST00000352009 1809 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.01■□□□□ 0.63
CEACAM16Q2WEN9 CBWD6-213ENST00000613716 1820 ntTSL 1 (best) BASIC19.01■□□□□ 0.63
CEACAM16Q2WEN9 SHMT1-201ENST00000316694 2464 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.01■□□□□ 0.63
CEACAM16Q2WEN9 PRKAA1-202ENST00000354209 1918 ntTSL 1 (best) BASIC19.01■□□□□ 0.63
CEACAM16Q2WEN9 TSSK1B-201ENST00000390666 2478 ntAPPRIS P1 BASIC19.01■□□□□ 0.63
CEACAM16Q2WEN9 SH2D5-202ENST00000444387 1934 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.01■□□□□ 0.63
CEACAM16Q2WEN9 ZNF568-208ENST00000586353 1902 ntTSL 1 (best) BASIC19.01■□□□□ 0.63
CEACAM16Q2WEN9 CFAP99-206ENST00000616117 1941 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.01■□□□□ 0.63
CEACAM16Q2WEN9 IKBKG-212ENST00000617207 1949 ntAPPRIS ALT1 TSL 3 BASIC19.01■□□□□ 0.63
CEACAM16Q2WEN9 ARL13B-205ENST00000471138 2206 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.01■□□□□ 0.63
CEACAM16Q2WEN9 ST7-201ENST00000265437 2899 ntTSL 1 (best) BASIC19.01■□□□□ 0.63
CEACAM16Q2WEN9 KLF9-201ENST00000377126 5175 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.01■□□□□ 0.63
CEACAM16Q2WEN9 DGKQ-201ENST00000273814 4636 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.01■□□□□ 0.63
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 21 ms