Protein–RNA interactions for Protein: Q1MSJ5

CSPP1, Centrosome and spindle pole-associated protein 1, humanhuman

Predictions only

Length 1,256 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CSPP1Q1MSJ5 CHTF8-208ENST00000522091 863 ntTSL 2 BASIC25.27■■□□□ 1.64
CSPP1Q1MSJ5 FGF22-201ENST00000215530 1311 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.27■■□□□ 1.64
CSPP1Q1MSJ5 CTCF-202ENST00000401394 2978 ntTSL 1 (best) BASIC25.27■■□□□ 1.64
CSPP1Q1MSJ5 CNNM4-201ENST00000377075 4800 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.27■■□□□ 1.64
CSPP1Q1MSJ5 MAP7D1-201ENST00000316156 3456 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.27■■□□□ 1.64
CSPP1Q1MSJ5 FAM19A4-201ENST00000295569 2292 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.26■■□□□ 1.63
CSPP1Q1MSJ5 TFPT-201ENST00000391757 774 ntTSL 5 BASIC25.26■■□□□ 1.63
CSPP1Q1MSJ5 TFPT-202ENST00000391758 804 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.26■■□□□ 1.63
CSPP1Q1MSJ5 AC105935.1-201ENST00000424174 422 ntTSL 3 BASIC25.26■■□□□ 1.63
CSPP1Q1MSJ5 MYL5-208ENST00000511290 781 ntTSL 1 (best) BASIC25.26■■□□□ 1.63
CSPP1Q1MSJ5 AL512631.2-201ENST00000604634 923 ntBASIC25.26■■□□□ 1.63
CSPP1Q1MSJ5 LY6H-205ENST00000615409 980 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.26■■□□□ 1.63
CSPP1Q1MSJ5 CTU2-201ENST00000312060 1672 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC25.26■■□□□ 1.63
CSPP1Q1MSJ5 TBC1D22A-206ENST00000407381 1949 ntTSL 5 BASIC25.25■■□□□ 1.63
CSPP1Q1MSJ5 TFG-201ENST00000240851 1978 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.25■■□□□ 1.63
CSPP1Q1MSJ5 CLPB-202ENST00000340729 2071 ntTSL 2 BASIC25.25■■□□□ 1.63
CSPP1Q1MSJ5 AC005703.6-201ENST00000623265 1329 ntBASIC25.25■■□□□ 1.63
CSPP1Q1MSJ5 AC011498.4-201ENST00000586020 1803 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.25■■□□□ 1.63
CSPP1Q1MSJ5 DENND2D-202ENST00000369752 1894 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC25.25■■□□□ 1.63
CSPP1Q1MSJ5 MAG-202ENST00000392213 2390 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC25.25■■□□□ 1.63
CSPP1Q1MSJ5 EML6-201ENST00000356458 8320 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.24■■□□□ 1.63
CSPP1Q1MSJ5 MXRA8-203ENST00000445648 2001 ntTSL 2 BASIC25.24■■□□□ 1.63
CSPP1Q1MSJ5 SPN-202ENST00000395389 1935 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.24■■□□□ 1.63
CSPP1Q1MSJ5 ARL6IP4-201ENST00000315580 1644 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.24■■□□□ 1.63
CSPP1Q1MSJ5 LINC01116-201ENST00000295549 1407 ntTSL 2 BASIC25.24■■□□□ 1.63
CSPP1Q1MSJ5 SURF2-201ENST00000371964 842 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.24■■□□□ 1.63
CSPP1Q1MSJ5 SUSD3-202ENST00000375472 1195 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.24■■□□□ 1.63
CSPP1Q1MSJ5 HUNK-201ENST00000270112 7385 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.24■■□□□ 1.63
CSPP1Q1MSJ5 FAM53B-201ENST00000280780 1568 ntTSL 1 (best) BASIC25.23■■□□□ 1.63
CSPP1Q1MSJ5 AC119427.1-201ENST00000633182 556 ntTSL 4 BASIC25.23■■□□□ 1.63
CSPP1Q1MSJ5 GTPBP6-201ENST00000326153 1907 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.23■■□□□ 1.63
CSPP1Q1MSJ5 AC010542.4-201ENST00000563151 1910 ntBASIC25.23■■□□□ 1.63
CSPP1Q1MSJ5 CCDC130-201ENST00000221554 1792 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.23■■□□□ 1.63
CSPP1Q1MSJ5 PPP1R12B-202ENST00000356764 1687 ntTSL 1 (best) BASIC25.23■■□□□ 1.63
CSPP1Q1MSJ5 PHACTR3-202ENST00000359926 2252 ntTSL 2 BASIC25.23■■□□□ 1.63
CSPP1Q1MSJ5 EEF1D-203ENST00000419152 1452 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.22■■□□□ 1.63
CSPP1Q1MSJ5 ERRFI1-204ENST00000474874 479 ntTSL 3 BASIC25.22■■□□□ 1.63
CSPP1Q1MSJ5 POLR2F-211ENST00000488684 564 ntTSL 2 BASIC25.22■■□□□ 1.63
CSPP1Q1MSJ5 QDPR-206ENST00000508623 601 ntTSL 3 BASIC25.22■■□□□ 1.63
CSPP1Q1MSJ5 ZNF584-205ENST00000596281 575 ntTSL 2 BASIC25.22■■□□□ 1.63
CSPP1Q1MSJ5 MIR5787-201ENST00000611784 55 ntBASIC25.22■■□□□ 1.63
CSPP1Q1MSJ5 EIF2B4-211ENST00000616081 1754 ntTSL 5 BASIC25.22■■□□□ 1.63
CSPP1Q1MSJ5 KIF12-207ENST00000640217 2194 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC25.22■■□□□ 1.63
CSPP1Q1MSJ5 ZXDC-201ENST00000336332 2579 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.22■■□□□ 1.63
CSPP1Q1MSJ5 AC092490.1-203ENST00000514568 1972 ntTSL 1 (best) BASIC25.22■■□□□ 1.63
CSPP1Q1MSJ5 FAM99A-202ENST00000538190 1989 ntBASIC25.22■■□□□ 1.63
CSPP1Q1MSJ5 UBE2J2-201ENST00000347370 2387 ntTSL 3 BASIC25.22■■□□□ 1.63
CSPP1Q1MSJ5 CHST7-201ENST00000276055 2289 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.21■■□□□ 1.63
CSPP1Q1MSJ5 ATP8A1-207ENST00000510289 2238 ntTSL 1 (best) BASIC25.21■■□□□ 1.63
CSPP1Q1MSJ5 ARHGEF25-201ENST00000286494 2552 ntTSL 1 (best) BASIC25.21■■□□□ 1.63
CSPP1Q1MSJ5 CBWD1-203ENST00000377400 1792 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.21■■□□□ 1.63
CSPP1Q1MSJ5 SLAIN1-206ENST00000418532 2855 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.21■■□□□ 1.63
CSPP1Q1MSJ5 AP2S1-201ENST00000263270 935 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.21■■□□□ 1.63
CSPP1Q1MSJ5 DUX4L4-201ENST00000566884 1269 ntBASIC25.21■■□□□ 1.63
CSPP1Q1MSJ5 MIR6722-201ENST00000617286 78 ntBASIC25.21■■□□□ 1.63
CSPP1Q1MSJ5 GPX4-213ENST00000622390 1002 ntTSL 5 BASIC25.21■■□□□ 1.63
CSPP1Q1MSJ5 TRIM28-201ENST00000253024 2960 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.21■■□□□ 1.63
CSPP1Q1MSJ5 TEAD2-201ENST00000311227 2164 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.21■■□□□ 1.63
CSPP1Q1MSJ5 ARHGAP5-203ENST00000396582 5786 ntTSL 1 (best) BASIC25.21■■□□□ 1.63
CSPP1Q1MSJ5 KLC3-204ENST00000585434 1764 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC25.21■■□□□ 1.63
CSPP1Q1MSJ5 AC026310.3-201ENST00000625186 2373 ntBASIC25.2■■□□□ 1.63
CSPP1Q1MSJ5 HADH-201ENST00000309522 1912 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.2■■□□□ 1.62
CSPP1Q1MSJ5 C7orf25-201ENST00000350427 2451 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.2■■□□□ 1.62
CSPP1Q1MSJ5 ARHGEF4-202ENST00000355771 1872 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.2■■□□□ 1.62
CSPP1Q1MSJ5 EBPL-204ENST00000378272 766 ntTSL 3 BASIC25.2■■□□□ 1.62
CSPP1Q1MSJ5 NAGPA-202ENST00000381955 2100 ntTSL 5 BASIC25.2■■□□□ 1.62
CSPP1Q1MSJ5 MIR17HG-201ENST00000400282 931 ntTSL 1 (best) BASIC25.2■■□□□ 1.62
CSPP1Q1MSJ5 ERRFI1-203ENST00000469499 995 ntTSL 3 BASIC25.2■■□□□ 1.62
CSPP1Q1MSJ5 TMEM240-203ENST00000624426 796 ntTSL 3 BASIC25.2■■□□□ 1.62
CSPP1Q1MSJ5 AL391650.1-201ENST00000448923 1468 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.2■■□□□ 1.62
CSPP1Q1MSJ5 AP005233.1-201ENST00000562341 2424 ntTSL 2 BASIC25.2■■□□□ 1.62
CSPP1Q1MSJ5 CIZ1-204ENST00000372938 2984 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.19■■□□□ 1.62
CSPP1Q1MSJ5 MIR222HG-202ENST00000602507 1758 ntTSL 5 BASIC25.19■■□□□ 1.62
CSPP1Q1MSJ5 CCSAP-203ENST00000366687 5089 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.19■■□□□ 1.62
CSPP1Q1MSJ5 FBXO27-202ENST00000509137 2130 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.19■■□□□ 1.62
CSPP1Q1MSJ5 PLEKHG4-201ENST00000360461 6782 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC25.19■■□□□ 1.62
CSPP1Q1MSJ5 EFHD1-201ENST00000264059 2259 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.19■■□□□ 1.62
CSPP1Q1MSJ5 TRAPPC5-204ENST00000596148 5498 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.18■■□□□ 1.62
CSPP1Q1MSJ5 ANKRD19P-205ENST00000473204 2370 ntTSL 1 (best) BASIC25.18■■□□□ 1.62
CSPP1Q1MSJ5 PHF7-201ENST00000327906 2130 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.18■■□□□ 1.62
CSPP1Q1MSJ5 PALM-202ENST00000338448 2725 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC25.18■■□□□ 1.62
CSPP1Q1MSJ5 LINC00472-204ENST00000436803 667 ntTSL 5 BASIC25.18■■□□□ 1.62
CSPP1Q1MSJ5 SSR2-210ENST00000480567 895 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.18■■□□□ 1.62
CSPP1Q1MSJ5 ZNF331-202ENST00000411977 2248 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.18■■□□□ 1.62
CSPP1Q1MSJ5 SNUPN-207ENST00000567134 1641 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.18■■□□□ 1.62
CSPP1Q1MSJ5 MGAT5B-209ENST00000569840 4492 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC25.18■■□□□ 1.62
CSPP1Q1MSJ5 AC080112.2-201ENST00000578774 2094 ntTSL 4 BASIC25.17■■□□□ 1.62
CSPP1Q1MSJ5 CPEB1-218ENST00000620182 2422 ntTSL 2 BASIC25.17■■□□□ 1.62
CSPP1Q1MSJ5 AC096677.1-201ENST00000454651 1516 ntTSL 2 BASIC25.17■■□□□ 1.62
CSPP1Q1MSJ5 TEX22-201ENST00000451127 2571 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.17■■□□□ 1.62
CSPP1Q1MSJ5 LOXL1-AS1-210ENST00000567257 2358 ntTSL 2 BASIC25.17■■□□□ 1.62
CSPP1Q1MSJ5 COL23A1-201ENST00000390654 3061 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC25.17■■□□□ 1.62
CSPP1Q1MSJ5 BICDL2-201ENST00000389347 1811 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.17■■□□□ 1.62
CSPP1Q1MSJ5 DCTPP1-201ENST00000319285 1222 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.17■■□□□ 1.62
CSPP1Q1MSJ5 AC243829.1-202ENST00000618848 486 ntTSL 3 BASIC25.17■■□□□ 1.62
CSPP1Q1MSJ5 CBWD5-207ENST00000382405 1791 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.17■■□□□ 1.62
CSPP1Q1MSJ5 NKX6-1-202ENST00000515820 2194 ntTSL 3 BASIC25.17■■□□□ 1.62
CSPP1Q1MSJ5 RBMS1-205ENST00000409972 1815 ntTSL 5 BASIC25.16■■□□□ 1.62
CSPP1Q1MSJ5 GPR6-202ENST00000414000 1945 ntTSL 2 BASIC25.16■■□□□ 1.62
CSPP1Q1MSJ5 PABPC1L2A-201ENST00000373519 2237 ntAPPRIS P1 BASIC25.16■■□□□ 1.62
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