Protein–RNA interactions for Protein: Q16831

UPP1, Uridine phosphorylase 1, humanhuman

Predictions only

Length 310 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
UPP1Q16831 FGF12-AS2-201ENST00000443165 580 ntTSL 4 BASIC23.14■■□□□ 1.29
UPP1Q16831 ATPIF1-204ENST00000497986 599 ntTSL 2 BASIC23.14■■□□□ 1.29
UPP1Q16831 SFTPC-205ENST00000521315 1046 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.14■■□□□ 1.29
UPP1Q16831 TMEM218-207ENST00000528724 1117 ntTSL 5 BASIC23.14■■□□□ 1.29
UPP1Q16831 TMEM218-214ENST00000532156 954 ntTSL 1 (best) BASIC23.14■■□□□ 1.29
UPP1Q16831 BTBD2-201ENST00000255608 2649 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.14■■□□□ 1.29
UPP1Q16831 ESRRA-203ENST00000406310 2218 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.14■■□□□ 1.29
UPP1Q16831 RGS6-209ENST00000553525 2005 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC23.14■■□□□ 1.29
UPP1Q16831 VPS53-211ENST00000571805 2356 ntTSL 1 (best) BASIC23.14■■□□□ 1.29
UPP1Q16831 PREB-201ENST00000260643 2166 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.14■■□□□ 1.29
UPP1Q16831 MAPK12-211ENST00000622558 1779 ntTSL 1 (best) BASIC23.14■■□□□ 1.29
UPP1Q16831 TANGO2-201ENST00000327374 2273 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.13■■□□□ 1.29
UPP1Q16831 AL359710.1-201ENST00000427039 1544 ntTSL 2 BASIC23.13■■□□□ 1.29
UPP1Q16831 GATS-205ENST00000436886 2726 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.13■■□□□ 1.29
UPP1Q16831 HOXA10-206ENST00000613671 2175 ntTSL 5 BASIC23.13■■□□□ 1.29
UPP1Q16831 SOCS1-201ENST00000332029 1225 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.13■■□□□ 1.29
UPP1Q16831 DCTN3-202ENST00000341694 899 ntTSL 1 (best) BASIC23.13■■□□□ 1.29
UPP1Q16831 OLFM1-206ENST00000371799 961 ntTSL 1 (best) BASIC23.13■■□□□ 1.29
UPP1Q16831 DCTN3-205ENST00000378916 773 ntTSL 2 BASIC23.13■■□□□ 1.29
UPP1Q16831 AC016769.1-201ENST00000409132 1010 ntBASIC23.13■■□□□ 1.29
UPP1Q16831 EXD3-208ENST00000479452 962 ntTSL 1 (best) BASIC23.13■■□□□ 1.29
UPP1Q16831 AC093627.4-202ENST00000479592 591 ntTSL 4 BASIC23.13■■□□□ 1.29
UPP1Q16831 PRELID2-204ENST00000505416 738 ntAPPRIS P2 TSL 3 BASIC23.13■■□□□ 1.29
UPP1Q16831 AP001363.2-201ENST00000538101 391 ntTSL 3 BASIC23.13■■□□□ 1.29
UPP1Q16831 SEC11A-208ENST00000559729 1256 ntTSL 2 BASIC23.13■■□□□ 1.29
UPP1Q16831 MCRIP1-204ENST00000570507 765 ntTSL 2 BASIC23.13■■□□□ 1.29
UPP1Q16831 MCRIP1-208ENST00000575061 618 ntTSL 5 BASIC23.13■■□□□ 1.29
UPP1Q16831 TRAPPC6A-205ENST00000592647 514 ntTSL 2 BASIC23.13■■□□□ 1.29
UPP1Q16831 RNASEH2B-206ENST00000611510 1257 ntTSL 5 BASIC23.13■■□□□ 1.29
UPP1Q16831 TMEM230-210ENST00000612323 1231 ntTSL 1 (best) BASIC23.13■■□□□ 1.29
UPP1Q16831 COMT-203ENST00000403184 2217 ntTSL 2 BASIC23.13■■□□□ 1.29
UPP1Q16831 SPRED3-202ENST00000586301 1366 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.13■■□□□ 1.29
UPP1Q16831 NHLH1-201ENST00000302101 2563 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.12■■□□□ 1.29
UPP1Q16831 RAB1A-202ENST00000409751 1333 ntTSL 5 BASIC23.12■■□□□ 1.29
UPP1Q16831 KRT87P-202ENST00000534226 1464 ntBASIC23.12■■□□□ 1.29
UPP1Q16831 CCNE1-201ENST00000262643 2043 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.12■■□□□ 1.29
UPP1Q16831 PTRH1-201ENST00000335223 759 ntTSL 1 (best) BASIC23.12■■□□□ 1.29
UPP1Q16831 SMIM12-202ENST00000423898 897 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.12■■□□□ 1.29
UPP1Q16831 EPM2A-209ENST00000638262 2679 ntTSL 1 (best) BASIC23.12■■□□□ 1.29
UPP1Q16831 CACNG2-201ENST00000300105 2384 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.12■■□□□ 1.29
UPP1Q16831 GNPTAB-201ENST00000299314 5701 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.11■■□□□ 1.29
UPP1Q16831 TRABD2A-203ENST00000409520 1975 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.11■■□□□ 1.29
UPP1Q16831 PACS2-201ENST00000325438 3708 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.11■■□□□ 1.29
UPP1Q16831 RASGRP2-207ENST00000377497 2221 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.11■■□□□ 1.29
UPP1Q16831 LARP6-202ENST00000344870 527 ntTSL 1 (best) BASIC23.11■■□□□ 1.29
UPP1Q16831 AC093762.3-201ENST00000641918 318 ntAPPRIS P1 BASIC23.11■■□□□ 1.29
UPP1Q16831 ABHD6-205ENST00000478253 2482 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.11■■□□□ 1.29
UPP1Q16831 TPM1-204ENST00000334895 1637 ntTSL 1 (best) BASIC23.11■■□□□ 1.29
UPP1Q16831 TOX2-201ENST00000341197 1880 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.11■■□□□ 1.29
UPP1Q16831 PRR16-202ENST00000407149 1747 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.11■■□□□ 1.29
UPP1Q16831 TMEM5-201ENST00000261234 1918 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.1■■□□□ 1.29
UPP1Q16831 GMPPA-201ENST00000313597 1544 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.1■■□□□ 1.29
UPP1Q16831 NEDD8-201ENST00000250495 708 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.1■■□□□ 1.29
UPP1Q16831 CBR1-201ENST00000290349 1293 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.1■■□□□ 1.29
UPP1Q16831 AIDA-202ENST00000355727 1072 ntTSL 5 BASIC23.1■■□□□ 1.29
UPP1Q16831 IZUMO4-203ENST00000395307 944 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.1■■□□□ 1.29
UPP1Q16831 RAMP1-203ENST00000404910 857 ntTSL 2 BASIC23.1■■□□□ 1.29
UPP1Q16831 AP006621.1-202ENST00000528982 464 ntTSL 2 BASIC23.1■■□□□ 1.29
UPP1Q16831 IGFALS-203ENST00000568221 730 ntTSL 4 BASIC23.1■■□□□ 1.29
UPP1Q16831 COG8-201ENST00000562081 1731 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.1■■□□□ 1.29
UPP1Q16831 PWWP2A-205ENST00000523662 1819 ntTSL 1 (best) BASIC23.1■■□□□ 1.29
UPP1Q16831 FMR1-AS1-202ENST00000596112 1845 ntTSL 1 (best) BASIC23.1■■□□□ 1.29
UPP1Q16831 DUSP9-202ENST00000370167 2289 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.1■■□□□ 1.29
UPP1Q16831 ANTXR2-202ENST00000346652 1343 ntTSL 1 (best) BASIC23.09■■□□□ 1.29
UPP1Q16831 GPR143-203ENST00000467482 1762 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.09■■□□□ 1.29
UPP1Q16831 TMEM150C-201ENST00000449862 1990 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.09■■□□□ 1.29
UPP1Q16831 DACT2-203ENST00000607983 1620 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.09■■□□□ 1.29
UPP1Q16831 HCFC1R1-201ENST00000248089 965 ntTSL 1 (best) BASIC23.09■■□□□ 1.29
UPP1Q16831 ZNF292-204ENST00000392985 1096 ntTSL 1 (best) BASIC23.09■■□□□ 1.29
UPP1Q16831 RASGRP2-209ENST00000394429 453 ntTSL 3 BASIC23.09■■□□□ 1.29
UPP1Q16831 HCFC1R1-207ENST00000574980 845 ntTSL 5 BASIC23.09■■□□□ 1.29
UPP1Q16831 WWOX-218ENST00000627394 894 ntTSL 5 BASIC23.09■■□□□ 1.29
UPP1Q16831 RBMS1-205ENST00000409972 1815 ntTSL 5 BASIC23.09■■□□□ 1.29
UPP1Q16831 CTBP1-203ENST00000382952 2467 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.09■■□□□ 1.29
UPP1Q16831 GAS2L1P2-201ENST00000436355 1356 ntBASIC23.09■■□□□ 1.29
UPP1Q16831 PEX10-204ENST00000507596 1941 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC23.09■■□□□ 1.29
UPP1Q16831 SLC22A31-201ENST00000562855 1909 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.09■■□□□ 1.29
UPP1Q16831 CBWD6-201ENST00000377391 1792 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.09■■□□□ 1.29
UPP1Q16831 MAPK9-206ENST00000425491 2266 ntTSL 5 BASIC23.08■■□□□ 1.29
UPP1Q16831 FJX1-201ENST00000317811 2450 ntAPPRIS P1 BASIC23.08■■□□□ 1.29
UPP1Q16831 MFF-207ENST00000409565 1548 ntTSL 2 BASIC23.08■■□□□ 1.29
UPP1Q16831 ESRRAP2-201ENST00000418437 1549 ntBASIC23.08■■□□□ 1.29
UPP1Q16831 RNF19B-202ENST00000356990 2598 ntTSL 1 (best) BASIC23.08■■□□□ 1.29
UPP1Q16831 TULP1-202ENST00000322263 1941 ntTSL 1 (best) BASIC23.08■■□□□ 1.29
UPP1Q16831 PRR35-201ENST00000409413 2216 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.08■■□□□ 1.29
UPP1Q16831 TNFRSF18-203ENST00000379268 1179 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.08■■□□□ 1.29
UPP1Q16831 AC104187.1-201ENST00000607510 612 ntBASIC23.08■■□□□ 1.29
UPP1Q16831 AC080038.1-201ENST00000611274 1154 ntBASIC23.08■■□□□ 1.29
UPP1Q16831 AC074143.1-203ENST00000518227 1473 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.08■■□□□ 1.29
UPP1Q16831 AC080112.2-201ENST00000578774 2094 ntTSL 4 BASIC23.08■■□□□ 1.29
UPP1Q16831 PEX5-205ENST00000420616 2477 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.08■■□□□ 1.29
UPP1Q16831 HYAL2-207ENST00000442581 2318 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.08■■□□□ 1.28
UPP1Q16831 EPHA8-202ENST00000374644 1802 ntTSL 1 (best) BASIC23.08■■□□□ 1.28
UPP1Q16831 RNF166-202ENST00000537718 1525 ntTSL 2 BASIC23.08■■□□□ 1.28
UPP1Q16831 AKR7A2-201ENST00000235835 1362 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.07■■□□□ 1.28
UPP1Q16831 STYXL1-204ENST00000360591 1127 ntTSL 5 BASIC23.07■■□□□ 1.28
UPP1Q16831 AL034346.1-201ENST00000568244 1277 ntBASIC23.07■■□□□ 1.28
UPP1Q16831 PRMT1-221ENST00000610806 1192 ntTSL 3 BASIC23.07■■□□□ 1.28
UPP1Q16831 DOHH-201ENST00000427575 2031 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.07■■□□□ 1.28
UPP1Q16831 SLC26A5-209ENST00000393735 1947 ntTSL 1 (best) BASIC23.07■■□□□ 1.28
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 29.3 ms