Protein–RNA interactions for Protein: Q16827

PTPRO, Receptor-type tyrosine-protein phosphatase O, humanhuman

Predictions only

Length 1,216 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PTPROQ16827 NELFCD-213ENST00000602795 2305 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.86■■□□□ 1.41
PTPROQ16827 SLC26A1-203ENST00000398520 1111 ntTSL 1 (best) BASIC23.86■■□□□ 1.41
PTPROQ16827 AP005435.1-201ENST00000529293 1178 ntBASIC23.86■■□□□ 1.41
PTPROQ16827 AC145207.2-202ENST00000576554 565 ntTSL 5 BASIC23.86■■□□□ 1.41
PTPROQ16827 RNASEH2B-206ENST00000611510 1257 ntTSL 5 BASIC23.86■■□□□ 1.41
PTPROQ16827 AC073111.5-205ENST00000641717 521 ntBASIC23.86■■□□□ 1.41
PTPROQ16827 STK32C-201ENST00000298630 2086 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.86■■□□□ 1.41
PTPROQ16827 NEURL4-201ENST00000315614 5182 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.86■■□□□ 1.41
PTPROQ16827 IRX2-202ENST00000382611 2630 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.86■■□□□ 1.41
PTPROQ16827 TBR1-202ENST00000410035 1454 ntTSL 2 BASIC23.86■■□□□ 1.41
PTPROQ16827 HAGHL-212ENST00000564537 1667 ntTSL 2 BASIC23.86■■□□□ 1.41
PTPROQ16827 RAB28-208ENST00000630951 1679 ntTSL 5 BASIC23.86■■□□□ 1.41
PTPROQ16827 RHBDL3-204ENST00000538145 1338 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.85■■□□□ 1.41
PTPROQ16827 C2orf82-201ENST00000331342 465 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.85■■□□□ 1.41
PTPROQ16827 GALNS-211ENST00000568311 703 ntTSL 1 (best) BASIC23.85■■□□□ 1.41
PTPROQ16827 NDUFV2-AS1-201ENST00000582375 770 ntTSL 2 BASIC23.85■■□□□ 1.41
PTPROQ16827 AC010525.1-201ENST00000585559 441 ntBASIC23.85■■□□□ 1.41
PTPROQ16827 RAP2CP1-201ENST00000605103 478 ntBASIC23.85■■□□□ 1.41
PTPROQ16827 RAP1B-207ENST00000450214 1466 ntTSL 2 BASIC23.85■■□□□ 1.41
PTPROQ16827 PLPP1-201ENST00000264775 1550 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC23.85■■□□□ 1.41
PTPROQ16827 TRIM28-201ENST00000253024 2960 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.85■■□□□ 1.41
PTPROQ16827 SEPT8-207ENST00000378719 2889 ntTSL 1 (best) BASIC23.84■■□□□ 1.41
PTPROQ16827 WRNIP1-204ENST00000380773 2670 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.84■■□□□ 1.41
PTPROQ16827 SNHG7-201ENST00000414282 2357 ntTSL 2 BASIC23.84■■□□□ 1.41
PTPROQ16827 GPR35-204ENST00000430267 1399 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.84■■□□□ 1.41
PTPROQ16827 PRKCZ-AS1-201ENST00000333854 1253 ntTSL 2 BASIC23.84■■□□□ 1.41
PTPROQ16827 YIF1B-202ENST00000337679 1257 ntTSL 1 (best) BASIC23.84■■□□□ 1.41
PTPROQ16827 PRMT2-204ENST00000397628 954 ntTSL 2 BASIC23.84■■□□□ 1.41
PTPROQ16827 PGAP3-204ENST00000429199 970 ntTSL 2 BASIC23.84■■□□□ 1.41
PTPROQ16827 CDCA4P2-201ENST00000441182 718 ntBASIC23.84■■□□□ 1.41
PTPROQ16827 AC026185.1-201ENST00000445748 174 ntBASIC23.84■■□□□ 1.41
PTPROQ16827 SEC11A-208ENST00000559729 1256 ntTSL 2 BASIC23.84■■□□□ 1.41
PTPROQ16827 GALNS-213ENST00000569433 723 ntTSL 3 BASIC23.84■■□□□ 1.41
PTPROQ16827 TMEM230-210ENST00000612323 1231 ntTSL 1 (best) BASIC23.84■■□□□ 1.41
PTPROQ16827 CNPY3-201ENST00000372836 1704 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.84■■□□□ 1.41
PTPROQ16827 NKX6-2-201ENST00000368592 2673 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.84■■□□□ 1.41
PTPROQ16827 MME-202ENST00000382989 1319 ntTSL 1 (best) BASIC23.84■■□□□ 1.41
PTPROQ16827 UBALD1-208ENST00000591401 1305 ntTSL 5 BASIC23.84■■□□□ 1.41
PTPROQ16827 SRPK3-203ENST00000370104 1753 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.83■■□□□ 1.41
PTPROQ16827 IRF3-201ENST00000309877 1691 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.83■■□□□ 1.41
PTPROQ16827 PHLDA3-201ENST00000367309 896 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.83■■□□□ 1.41
PTPROQ16827 AC099681.3-201ENST00000421500 939 ntTSL 4 BASIC23.83■■□□□ 1.41
PTPROQ16827 ABHD14A-202ENST00000458031 1113 ntTSL 5 BASIC23.83■■□□□ 1.41
PTPROQ16827 POU5F1-209ENST00000638788 369 ntTSL 5 BASIC23.83■■□□□ 1.41
PTPROQ16827 MOGS-202ENST00000409065 2668 ntTSL 5 BASIC23.82■■□□□ 1.4
PTPROQ16827 ARHGEF9-204ENST00000374878 2217 ntTSL 1 (best) BASIC23.82■■□□□ 1.4
PTPROQ16827 ACSF2-207ENST00000504392 1881 ntTSL 2 BASIC23.82■■□□□ 1.4
PTPROQ16827 POLE4-205ENST00000483063 1248 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.82■■□□□ 1.4
PTPROQ16827 ZNF696-205ENST00000521537 705 ntTSL 2 BASIC23.82■■□□□ 1.4
PTPROQ16827 TMEM182-210ENST00000639249 1025 ntTSL 5 BASIC23.82■■□□□ 1.4
PTPROQ16827 CDIPT-201ENST00000219789 2353 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.82■■□□□ 1.4
PTPROQ16827 MAPK12-211ENST00000622558 1779 ntTSL 1 (best) BASIC23.82■■□□□ 1.4
PTPROQ16827 CLN3-207ENST00000395653 1430 ntTSL 5 BASIC23.82■■□□□ 1.4
PTPROQ16827 SHMT1-203ENST00000354098 1656 ntTSL 1 (best) BASIC23.82■■□□□ 1.4
PTPROQ16827 FAM136A-201ENST00000037869 1810 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.82■■□□□ 1.4
PTPROQ16827 DOK1-203ENST00000409429 1955 ntTSL 1 (best) BASIC23.82■■□□□ 1.4
PTPROQ16827 MRPL37-202ENST00000360840 1483 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.81■■□□□ 1.4
PTPROQ16827 HAS1-202ENST00000540069 2110 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.81■■□□□ 1.4
PTPROQ16827 C7orf26-202ENST00000359073 1762 ntTSL 1 (best) BASIC23.81■■□□□ 1.4
PTPROQ16827 PPP2R3B-202ENST00000390665 2151 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.81■■□□□ 1.4
PTPROQ16827 PAXBP1-201ENST00000290178 2564 ntTSL 1 (best) BASIC23.81■■□□□ 1.4
PTPROQ16827 SIMC1-204ENST00000430704 1925 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC23.81■■□□□ 1.4
PTPROQ16827 XBP1-202ENST00000344347 1131 ntTSL 5 BASIC23.81■■□□□ 1.4
PTPROQ16827 MFF-208ENST00000409616 1247 ntTSL 5 BASIC23.81■■□□□ 1.4
PTPROQ16827 SDHAP3-201ENST00000436493 736 ntTSL 1 (best) BASIC23.81■■□□□ 1.4
PTPROQ16827 PDE5A-201ENST00000264805 3020 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.81■■□□□ 1.4
PTPROQ16827 ARF1-213ENST00000540651 1972 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.81■■□□□ 1.4
PTPROQ16827 KDELR1-203ENST00000597017 1594 ntTSL 2 BASIC23.81■■□□□ 1.4
PTPROQ16827 ANXA8-204ENST00000583911 1874 ntTSL 2 BASIC23.81■■□□□ 1.4
PTPROQ16827 EYA2-203ENST00000357410 2465 ntTSL 1 (best) BASIC23.81■■□□□ 1.4
PTPROQ16827 AL121749.1-201ENST00000635993 1768 ntTSL 5 BASIC23.8■■□□□ 1.4
PTPROQ16827 KCNQ4-204ENST00000509682 1926 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.8■■□□□ 1.4
PTPROQ16827 LTK-202ENST00000355166 2940 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.8■■□□□ 1.4
PTPROQ16827 ABHD17AP1-201ENST00000358206 933 ntBASIC23.8■■□□□ 1.4
PTPROQ16827 MYD88-205ENST00000424893 1279 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.8■■□□□ 1.4
PTPROQ16827 ZFAS1-206ENST00000450535 1075 ntTSL 3 BASIC23.8■■□□□ 1.4
PTPROQ16827 AC104771.1-201ENST00000603335 964 ntBASIC23.8■■□□□ 1.4
PTPROQ16827 EXOSC6-201ENST00000435634 5153 ntAPPRIS P1 BASIC23.8■■□□□ 1.4
PTPROQ16827 SETD9-211ENST00000628593 1306 ntTSL 1 (best) BASIC23.8■■□□□ 1.4
PTPROQ16827 KAT5-201ENST00000341318 2296 ntTSL 1 (best) BASIC23.8■■□□□ 1.4
PTPROQ16827 SOHLH1-201ENST00000298466 1987 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.8■■□□□ 1.4
PTPROQ16827 TMEM121-201ENST00000392519 1532 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.79■■□□□ 1.4
PTPROQ16827 OSCAR-211ENST00000617140 1547 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.79■■□□□ 1.4
PTPROQ16827 CACNA1H-210ENST00000638323 8048 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.79■■□□□ 1.4
PTPROQ16827 CRTC2-203ENST00000368633 2644 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.79■■□□□ 1.4
PTPROQ16827 IZUMO4-203ENST00000395307 944 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.79■■□□□ 1.4
PTPROQ16827 HSCB-202ENST00000398941 955 ntTSL 2 BASIC23.79■■□□□ 1.4
PTPROQ16827 AC006970.2-201ENST00000450065 779 ntBASIC23.79■■□□□ 1.4
PTPROQ16827 PPP1R14BP3-201ENST00000509033 445 ntBASIC23.79■■□□□ 1.4
PTPROQ16827 AC012414.4-201ENST00000560839 1074 ntTSL 5 BASIC23.79■■□□□ 1.4
PTPROQ16827 SEPT4-215ENST00000580809 952 ntTSL 1 (best) BASIC23.79■■□□□ 1.4
PTPROQ16827 RPS15-210ENST00000592623 873 ntTSL 1 (best) BASIC23.79■■□□□ 1.4
PTPROQ16827 SCUBE1-208ENST00000615096 1119 ntTSL 2 BASIC23.79■■□□□ 1.4
PTPROQ16827 BID-214ENST00000617586 542 ntTSL 5 BASIC23.79■■□□□ 1.4
PTPROQ16827 AC060814.5-201ENST00000630916 1074 ntTSL 2 BASIC23.79■■□□□ 1.4
PTPROQ16827 C3orf58-207ENST00000495414 1876 ntTSL 2 BASIC23.79■■□□□ 1.4
PTPROQ16827 TMEM235-205ENST00000586400 2272 ntTSL 1 (best) BASIC23.79■■□□□ 1.4
PTPROQ16827 PDE10A-205ENST00000616273 2118 ntTSL 2 BASIC23.78■■□□□ 1.4
PTPROQ16827 WRNIP1-203ENST00000380771 2595 ntTSL 1 (best) BASIC23.78■■□□□ 1.4
PTPROQ16827 AC079630.1-202ENST00000618127 1840 ntBASIC23.78■■□□□ 1.4
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