Protein–RNA interactions for Protein: Q16656

NRF1, Nuclear respiratory factor 1, humanhuman

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
NRF1Q16656 JADE2-204ENST00000402835 2797 ntTSL 5 BASIC20.55■□□□□ 0.88
NRF1Q16656 MATR3-206ENST00000503811 2518 ntTSL 2 BASIC20.55■□□□□ 0.88
NRF1Q16656 AC009041.2-204ENST00000568394 3343 ntTSL 1 (best) BASIC20.55■□□□□ 0.88
NRF1Q16656 EYA2-202ENST00000327619 2702 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.55■□□□□ 0.88
NRF1Q16656 COL8A2-203ENST00000481785 2036 ntTSL 1 (best) BASIC20.54■□□□□ 0.88
NRF1Q16656 NRG2-204ENST00000358522 2559 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC20.54■□□□□ 0.88
NRF1Q16656 MAFF-204ENST00000426621 2216 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC20.54■□□□□ 0.88
NRF1Q16656 XBP1-201ENST00000216037 1850 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.54■□□□□ 0.88
NRF1Q16656 ZC3H14-223ENST00000557607 1983 ntTSL 5 BASIC20.54■□□□□ 0.88
NRF1Q16656 RNF165-205ENST00000588679 2904 ntBASIC20.54■□□□□ 0.88
NRF1Q16656 UTS2R-201ENST00000313135 1357 ntAPPRIS P1 BASIC20.54■□□□□ 0.88
NRF1Q16656 AC021242.3-201ENST00000607598 1377 ntBASIC20.54■□□□□ 0.88
NRF1Q16656 CACTIN-202ENST00000248420 2671 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.54■□□□□ 0.88
NRF1Q16656 BOD1-202ENST00000311086 1562 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.54■□□□□ 0.88
NRF1Q16656 DNAAF4-201ENST00000321149 1993 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.54■□□□□ 0.88
NRF1Q16656 AGAP4-207ENST00000616763 2784 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.53■□□□□ 0.88
NRF1Q16656 SUSD3-202ENST00000375472 1195 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.53■□□□□ 0.88
NRF1Q16656 IGFBP7-203ENST00000514062 1251 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC20.53■□□□□ 0.88
NRF1Q16656 PRTG-204ENST00000561292 833 ntTSL 3 BASIC20.53■□□□□ 0.88
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NRF1Q16656 MIR222HG-201ENST00000602461 1379 ntTSL 5 BASIC20.53■□□□□ 0.88
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NRF1Q16656 CACNA1B-202ENST00000277551 7158 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.53■□□□□ 0.88
NRF1Q16656 JAGN1-201ENST00000307768 1693 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.53■□□□□ 0.88
NRF1Q16656 SNX3-201ENST00000230085 1755 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.53■□□□□ 0.88
NRF1Q16656 SH2B2-202ENST00000536178 2113 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.53■□□□□ 0.88
NRF1Q16656 CD7-207ENST00000584284 2021 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.53■□□□□ 0.88
NRF1Q16656 NCKAP1-201ENST00000360982 4989 ntTSL 1 (best) BASIC20.53■□□□□ 0.88
NRF1Q16656 BLOC1S4-201ENST00000320776 1617 ntAPPRIS P1 BASIC20.53■□□□□ 0.88
NRF1Q16656 GABRA2-214ENST00000515082 2366 ntTSL 1 (best) BASIC20.52■□□□□ 0.88
NRF1Q16656 C7orf26-201ENST00000344417 2182 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.52■□□□□ 0.88
NRF1Q16656 ALG9-215ENST00000616540 2069 ntTSL 1 (best) BASIC20.52■□□□□ 0.88
NRF1Q16656 ZNF652-202ENST00000430262 4701 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.52■□□□□ 0.88
NRF1Q16656 TMEM198B-205ENST00000487582 1581 ntTSL 1 (best) BASIC20.52■□□□□ 0.88
NRF1Q16656 NPW-201ENST00000329610 498 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.52■□□□□ 0.88
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NRF1Q16656 OR2A1-AS1-204ENST00000470435 602 ntBASIC20.52■□□□□ 0.88
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NRF1Q16656 SESN3-202ENST00000416495 1408 ntTSL 1 (best) BASIC20.52■□□□□ 0.87
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NRF1Q16656 PRMT8-202ENST00000382622 2366 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.51■□□□□ 0.87
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NRF1Q16656 KRT18P55-201ENST00000577198 1950 ntTSL 1 (best) BASIC20.48■□□□□ 0.87
NRF1Q16656 SPPL2B-212ENST00000618220 2459 ntTSL 1 (best) BASIC20.48■□□□□ 0.87
NRF1Q16656 DENND6A-201ENST00000311128 4655 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.48■□□□□ 0.87
NRF1Q16656 DTX4-201ENST00000227451 5642 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.47■□□□□ 0.87
NRF1Q16656 AC244015.2-201ENST00000616358 1861 ntBASIC20.47■□□□□ 0.87
NRF1Q16656 LINC01116-201ENST00000295549 1407 ntTSL 2 BASIC20.47■□□□□ 0.87
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NRF1Q16656 KCNQ1-202ENST00000335475 2159 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.47■□□□□ 0.87
NRF1Q16656 BX664725.1-201ENST00000438252 379 ntBASIC20.47■□□□□ 0.87
NRF1Q16656 RNF146-205ENST00000477776 762 ntTSL 3 BASIC20.47■□□□□ 0.87
NRF1Q16656 LAT-217ENST00000630764 610 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.47■□□□□ 0.87
NRF1Q16656 AF106564.1-201ENST00000607058 2553 ntBASIC20.47■□□□□ 0.87
NRF1Q16656 TBC1D22A-206ENST00000407381 1949 ntTSL 5 BASIC20.47■□□□□ 0.87
NRF1Q16656 SNRK-203ENST00000437827 1995 ntTSL 2 BASIC20.46■□□□□ 0.87
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