Protein–RNA interactions for Protein: Q16595

FXN, Frataxin, mitochondrial, humanhuman

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
FXNQ16595 ATMIN-201ENST00000299575 4884 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.28■□□□□ 0.84
FXNQ16595 STARD3-202ENST00000394250 1949 ntTSL 2 BASIC20.28■□□□□ 0.84
FXNQ16595 AL499627.2-201ENST00000606283 725 ntBASIC20.28■□□□□ 0.84
FXNQ16595 IDH2-202ENST00000540499 1453 ntTSL 2 BASIC20.28■□□□□ 0.84
FXNQ16595 AP002761.3-201ENST00000546324 1695 ntTSL 2 BASIC20.28■□□□□ 0.84
FXNQ16595 METTL1-202ENST00000324871 2066 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.28■□□□□ 0.84
FXNQ16595 BID-215ENST00000622694 2199 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.28■□□□□ 0.84
FXNQ16595 AP000662.2-202ENST00000530595 2790 ntTSL 2 BASIC20.28■□□□□ 0.84
FXNQ16595 JDP2-201ENST00000267569 1700 ntTSL 1 (best) BASIC20.27■□□□□ 0.84
FXNQ16595 TMEM51-203ENST00000400796 1842 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.27■□□□□ 0.84
FXNQ16595 WNT10B-202ENST00000403957 1817 ntTSL 5 BASIC20.27■□□□□ 0.84
FXNQ16595 UNC93B1-201ENST00000227471 2316 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.27■□□□□ 0.84
FXNQ16595 ZNF584-201ENST00000306910 2332 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.27■□□□□ 0.84
FXNQ16595 RITA1-201ENST00000548278 2053 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.27■□□□□ 0.84
FXNQ16595 CHRAC1-203ENST00000519533 1678 ntTSL 1 (best) BASIC20.27■□□□□ 0.84
FXNQ16595 HOXB7-201ENST00000239165 1371 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.27■□□□□ 0.84
FXNQ16595 TK2-216ENST00000564917 1156 ntTSL 3 BASIC20.27■□□□□ 0.84
FXNQ16595 MAG-201ENST00000361922 2426 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.27■□□□□ 0.84
FXNQ16595 CD7-207ENST00000584284 2021 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.27■□□□□ 0.84
FXNQ16595 EPDR1-201ENST00000199448 2599 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.27■□□□□ 0.83
FXNQ16595 AL157384.1-201ENST00000445995 2473 ntBASIC20.27■□□□□ 0.83
FXNQ16595 BASP1-201ENST00000322611 1878 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.26■□□□□ 0.83
FXNQ16595 PPP1R3F-203ENST00000466508 1885 ntTSL 2 BASIC20.26■□□□□ 0.83
FXNQ16595 FAM3A-208ENST00000419205 1763 ntTSL 2 BASIC20.26■□□□□ 0.83
FXNQ16595 FASTK-212ENST00000482571 1764 ntTSL 1 (best) BASIC20.26■□□□□ 0.83
FXNQ16595 TPST1-201ENST00000304842 2116 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.26■□□□□ 0.83
FXNQ16595 STX4-201ENST00000313843 1481 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.26■□□□□ 0.83
FXNQ16595 DNAJC7-203ENST00000457167 2022 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.26■□□□□ 0.83
FXNQ16595 RASSF1-203ENST00000359365 1923 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC20.26■□□□□ 0.83
FXNQ16595 AC073111.5-204ENST00000498682 1167 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.26■□□□□ 0.83
FXNQ16595 TEAD2-210ENST00000601519 2167 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC20.26■□□□□ 0.83
FXNQ16595 CLK3-202ENST00000395066 2621 ntTSL 1 (best) BASIC20.26■□□□□ 0.83
FXNQ16595 VGF-203ENST00000611537 1622 ntTSL 5 BASIC20.26■□□□□ 0.83
FXNQ16595 SPOP-206ENST00000504102 1865 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.26■□□□□ 0.83
FXNQ16595 KCTD15-202ENST00000430256 2555 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.26■□□□□ 0.83
FXNQ16595 NAA35-202ENST00000376040 1797 ntTSL 2 BASIC20.26■□□□□ 0.83
FXNQ16595 FAM19A4-201ENST00000295569 2292 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.25■□□□□ 0.83
FXNQ16595 SDC3-202ENST00000339394 1580 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.25■□□□□ 0.83
FXNQ16595 AC026471.6-201ENST00000622954 1905 ntBASIC20.25■□□□□ 0.83
FXNQ16595 CFAP97-205ENST00000514798 2895 ntTSL 1 (best) BASIC20.25■□□□□ 0.83
FXNQ16595 NUDT18-201ENST00000611621 1497 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.25■□□□□ 0.83
FXNQ16595 FNDC10-201ENST00000422725 2085 ntAPPRIS P1 BASIC20.25■□□□□ 0.83
FXNQ16595 MFF-203ENST00000349901 1716 ntTSL 2 BASIC20.25■□□□□ 0.83
FXNQ16595 VEGFA-204ENST00000372064 2909 ntTSL 1 (best) BASIC20.25■□□□□ 0.83
FXNQ16595 HFE2-202ENST00000357836 2123 ntTSL 1 (best) BASIC20.25■□□□□ 0.83
FXNQ16595 AC092849.1-201ENST00000475250 303 ntTSL 4 BASIC20.25■□□□□ 0.83
FXNQ16595 NAA30-202ENST00000554703 795 ntTSL 1 (best) BASIC20.25■□□□□ 0.83
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FXNQ16595 AL031602.1-201ENST00000633169 911 ntBASIC20.25■□□□□ 0.83
FXNQ16595 PRKG2-207ENST00000628926 2623 ntTSL 2 BASIC20.25■□□□□ 0.83
FXNQ16595 XBP1-207ENST00000611155 1794 ntTSL 5 BASIC20.25■□□□□ 0.83
FXNQ16595 P2RX4-202ENST00000337233 2032 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.25■□□□□ 0.83
FXNQ16595 SLC12A2-201ENST00000262461 6885 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.25■□□□□ 0.83
FXNQ16595 NANOS2-201ENST00000341294 1657 ntAPPRIS P1 BASIC20.25■□□□□ 0.83
FXNQ16595 DNAJB5-203ENST00000453597 2589 ntTSL 2 BASIC20.25■□□□□ 0.83
FXNQ16595 AC110285.2-201ENST00000571724 1565 ntTSL 2 BASIC20.25■□□□□ 0.83
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FXNQ16595 KIRREL2-201ENST00000262625 1969 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.25■□□□□ 0.83
FXNQ16595 HOMER1-202ENST00000334082 5881 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.24■□□□□ 0.83
FXNQ16595 HSF2BP-201ENST00000291560 1899 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.24■□□□□ 0.83
FXNQ16595 OTOP1-201ENST00000296358 1864 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.24■□□□□ 0.83
FXNQ16595 HNRNPLL-203ENST00000378915 2523 ntTSL 5 BASIC20.24■□□□□ 0.83
FXNQ16595 CPNE9-203ENST00000383832 2068 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.24■□□□□ 0.83
FXNQ16595 ST3GAL6-AS1-203ENST00000488132 769 ntTSL 3 BASIC20.24■□□□□ 0.83
FXNQ16595 PRTG-204ENST00000561292 833 ntTSL 3 BASIC20.24■□□□□ 0.83
FXNQ16595 LSM7-204ENST00000587502 575 ntTSL 1 (best) BASIC20.24■□□□□ 0.83
FXNQ16595 RAET1E-AS1-203ENST00000606915 1210 ntTSL 1 (best) BASIC20.24■□□□□ 0.83
FXNQ16595 MAPRE3-203ENST00000405074 1801 ntTSL 3 BASIC20.24■□□□□ 0.83
FXNQ16595 SOHLH1-202ENST00000425225 1411 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.24■□□□□ 0.83
FXNQ16595 GAS2-202ENST00000454584 2286 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.24■□□□□ 0.83
FXNQ16595 TTC39C-202ENST00000317571 2442 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.24■□□□□ 0.83
FXNQ16595 RABL2B-206ENST00000395598 2169 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.24■□□□□ 0.83
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FXNQ16595 MYL12B-203ENST00000581193 1249 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC20.23■□□□□ 0.83
FXNQ16595 RASGEF1C-201ENST00000361132 2243 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.23■□□□□ 0.83
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FXNQ16595 UNKL-205ENST00000397464 2180 ntTSL 2 BASIC20.22■□□□□ 0.83
FXNQ16595 STK19-202ENST00000375333 1557 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.22■□□□□ 0.83
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FXNQ16595 AC009299.2-201ENST00000482477 511 ntBASIC20.22■□□□□ 0.83
FXNQ16595 TOP2B-204ENST00000435706 5389 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.22■□□□□ 0.83
FXNQ16595 RBM42-206ENST00000592202 1469 ntTSL 5 BASIC20.22■□□□□ 0.83
FXNQ16595 WDR86-203ENST00000469830 1691 ntTSL 2 BASIC20.22■□□□□ 0.83
FXNQ16595 VRK2-201ENST00000340157 1888 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.22■□□□□ 0.83
FXNQ16595 NSUN2-206ENST00000506139 2619 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC20.22■□□□□ 0.83
FXNQ16595 C22orf34-203ENST00000405854 1593 ntTSL 5 BASIC20.21■□□□□ 0.83
FXNQ16595 PAQR6-215ENST00000623241 1961 ntTSL 1 (best) BASIC20.21■□□□□ 0.83
FXNQ16595 MTMR9LP-204ENST00000441044 2624 ntTSL 1 (best) BASIC20.21■□□□□ 0.83
FXNQ16595 CTAG1B-201ENST00000328435 748 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.21■□□□□ 0.83
FXNQ16595 AC090587.2-201ENST00000430222 527 ntTSL 2 BASIC20.21■□□□□ 0.83
FXNQ16595 AC079089.2-201ENST00000531211 1277 ntBASIC20.21■□□□□ 0.83
FXNQ16595 CTAG1A-202ENST00000599837 748 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.21■□□□□ 0.83
FXNQ16595 AC018553.2-201ENST00000637770 1064 ntTSL 1 (best) BASIC20.21■□□□□ 0.83
FXNQ16595 MAIP1-201ENST00000295079 1495 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC20.21■□□□□ 0.83
FXNQ16595 CAMK2B-216ENST00000440254 2097 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC20.21■□□□□ 0.83
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