Protein–RNA interactions for Protein: Q16594

TAF9, Transcription initiation factor TFIID subunit 9, humanhuman

Predictions only

Length 264 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
TAF9Q16594 KPTN-201ENST00000338134 1691 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.5■□□□□ 0.55
TAF9Q16594 AC080112.2-201ENST00000578774 2094 ntTSL 4 BASIC18.5■□□□□ 0.55
TAF9Q16594 MADCAM1-205ENST00000613880 1509 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.49■□□□□ 0.55
TAF9Q16594 GSX2-201ENST00000326902 1812 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.49■□□□□ 0.55
TAF9Q16594 RUNDC3B-207ENST00000493037 2020 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.49■□□□□ 0.55
TAF9Q16594 TEAD1-206ENST00000527636 2544 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.49■□□□□ 0.55
TAF9Q16594 CPNE2-201ENST00000290776 2645 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.49■□□□□ 0.55
TAF9Q16594 BSN-AS2-201ENST00000421598 2603 ntTSL 2 BASIC18.49■□□□□ 0.55
TAF9Q16594 TMEM80-201ENST00000397510 1094 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC18.49■□□□□ 0.55
TAF9Q16594 AL357078.1-201ENST00000448344 310 ntTSL 4 BASIC18.49■□□□□ 0.55
TAF9Q16594 FEZ1-205ENST00000524435 750 ntTSL 2 BASIC18.49■□□□□ 0.55
TAF9Q16594 LY6H-205ENST00000615409 980 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.49■□□□□ 0.55
TAF9Q16594 CCNG2-204ENST00000502280 1459 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.49■□□□□ 0.55
TAF9Q16594 TRH-201ENST00000302649 1978 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.49■□□□□ 0.55
TAF9Q16594 CHST7-201ENST00000276055 2289 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.49■□□□□ 0.55
TAF9Q16594 NCKAP1-201ENST00000360982 4989 ntTSL 1 (best) BASIC18.49■□□□□ 0.55
TAF9Q16594 HABP4-201ENST00000375249 2615 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.49■□□□□ 0.55
TAF9Q16594 HOXD4-201ENST00000306324 1464 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.48■□□□□ 0.55
TAF9Q16594 IDH2-202ENST00000540499 1453 ntTSL 2 BASIC18.48■□□□□ 0.55
TAF9Q16594 TOLLIP-208ENST00000527938 549 ntTSL 4 BASIC18.48■□□□□ 0.55
TAF9Q16594 AC136475.3-202ENST00000534742 812 ntTSL 2 BASIC18.48■□□□□ 0.55
TAF9Q16594 PICSAR-201ENST00000615826 733 ntTSL 1 (best) BASIC18.48■□□□□ 0.55
TAF9Q16594 GTPBP6-201ENST00000326153 1907 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.48■□□□□ 0.55
TAF9Q16594 HOXA4-201ENST00000360046 1747 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.48■□□□□ 0.55
TAF9Q16594 ITPKC-201ENST00000263370 3385 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.48■□□□□ 0.55
TAF9Q16594 CCNYL1-202ENST00000339882 2619 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.48■□□□□ 0.55
TAF9Q16594 PEX10-202ENST00000447513 1997 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.48■□□□□ 0.55
TAF9Q16594 HES5-201ENST00000378453 1306 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.48■□□□□ 0.55
TAF9Q16594 SLC22A31-201ENST00000562855 1909 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.47■□□□□ 0.55
TAF9Q16594 TLX3-201ENST00000296921 1493 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.47■□□□□ 0.55
TAF9Q16594 JUNB-201ENST00000302754 1820 ntAPPRIS P1 BASIC18.47■□□□□ 0.55
TAF9Q16594 CA15P2-201ENST00000611168 834 ntBASIC18.47■□□□□ 0.55
TAF9Q16594 HNRNPAB-201ENST00000355836 1602 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.47■□□□□ 0.55
TAF9Q16594 PLEKHG4-201ENST00000360461 6782 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC18.47■□□□□ 0.55
TAF9Q16594 ILDR2-204ENST00000525740 2242 ntTSL 5 BASIC18.47■□□□□ 0.55
TAF9Q16594 PAQR6-202ENST00000335852 2117 ntTSL 2 BASIC18.47■□□□□ 0.55
TAF9Q16594 VPS9D1-AS1-202ENST00000562866 1753 ntTSL 2 BASIC18.47■□□□□ 0.55
TAF9Q16594 MIR222HG-202ENST00000602507 1758 ntTSL 5 BASIC18.47■□□□□ 0.55
TAF9Q16594 AP002761.3-201ENST00000546324 1695 ntTSL 2 BASIC18.47■□□□□ 0.55
TAF9Q16594 HAGHL-212ENST00000564537 1667 ntTSL 2 BASIC18.47■□□□□ 0.55
TAF9Q16594 AC010542.4-201ENST00000563151 1910 ntBASIC18.47■□□□□ 0.55
TAF9Q16594 KIF12-202ENST00000468460 2162 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.47■□□□□ 0.55
TAF9Q16594 GMPPB-202ENST00000308388 1582 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.47■□□□□ 0.55
TAF9Q16594 SDC3-202ENST00000339394 1580 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.47■□□□□ 0.55
TAF9Q16594 TMEM9B-205ENST00000534025 2083 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.46■□□□□ 0.55
TAF9Q16594 SYNGR2-201ENST00000225777 2325 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.46■□□□□ 0.55
TAF9Q16594 NUDT18-201ENST00000611621 1497 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.46■□□□□ 0.55
TAF9Q16594 EPCAM-202ENST00000405271 1530 ntTSL 5 BASIC18.46■□□□□ 0.55
TAF9Q16594 LY6K-201ENST00000292430 2671 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.46■□□□□ 0.55
TAF9Q16594 OSBPL5-208ENST00000478260 2653 ntTSL 2 BASIC18.46■□□□□ 0.55
TAF9Q16594 CLYBL-202ENST00000376354 1127 ntTSL 5 BASIC18.46■□□□□ 0.55
TAF9Q16594 SSR2-210ENST00000480567 895 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.46■□□□□ 0.55
TAF9Q16594 SDSL-202ENST00000403593 1449 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.46■□□□□ 0.55
TAF9Q16594 LTK-201ENST00000263800 3046 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC18.46■□□□□ 0.55
TAF9Q16594 SOHLH1-201ENST00000298466 1987 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.46■□□□□ 0.55
TAF9Q16594 FAM99A-202ENST00000538190 1989 ntBASIC18.46■□□□□ 0.55
TAF9Q16594 MSL1-204ENST00000578648 2267 ntTSL 5 BASIC18.46■□□□□ 0.54
TAF9Q16594 KCNMB4-201ENST00000258111 4731 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.45■□□□□ 0.54
TAF9Q16594 NOX4-209ENST00000527626 1774 ntTSL 2 BASIC18.45■□□□□ 0.54
TAF9Q16594 IRX2-201ENST00000302057 2456 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.45■□□□□ 0.54
TAF9Q16594 AC092384.1-201ENST00000378347 1812 ntTSL 2 BASIC18.45■□□□□ 0.54
TAF9Q16594 NAGPA-202ENST00000381955 2100 ntTSL 5 BASIC18.45■□□□□ 0.54
TAF9Q16594 AC096631.2-201ENST00000436136 790 ntBASIC18.45■□□□□ 0.54
TAF9Q16594 PRELID1-203ENST00000503216 1171 ntTSL 1 (best) BASIC18.45■□□□□ 0.54
TAF9Q16594 CHTF8-208ENST00000522091 863 ntTSL 2 BASIC18.45■□□□□ 0.54
TAF9Q16594 PPP1R14A-205ENST00000591585 949 ntTSL 2 BASIC18.45■□□□□ 0.54
TAF9Q16594 AC110285.6-201ENST00000617652 491 ntBASIC18.45■□□□□ 0.54
TAF9Q16594 SUMF1-202ENST00000383843 1447 ntTSL 2 BASIC18.45■□□□□ 0.54
TAF9Q16594 AL024507.2-201ENST00000606070 2574 ntBASIC18.45■□□□□ 0.54
TAF9Q16594 FBXW11-203ENST00000393802 2181 ntTSL 1 (best) BASIC18.45■□□□□ 0.54
TAF9Q16594 NKIRAS2-204ENST00000393880 1644 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.45■□□□□ 0.54
TAF9Q16594 LCK-214ENST00000619559 2099 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.45■□□□□ 0.54
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TAF9Q16594 LENG1-201ENST00000222224 1542 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.44■□□□□ 0.54
TAF9Q16594 SPIRE2-202ENST00000393062 2172 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.44■□□□□ 0.54
TAF9Q16594 ICAM5-201ENST00000221980 3000 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.44■□□□□ 0.54
TAF9Q16594 HES4-201ENST00000304952 899 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.44■□□□□ 0.54
TAF9Q16594 AL499627.2-201ENST00000606283 725 ntBASIC18.44■□□□□ 0.54
TAF9Q16594 EIF2B4-211ENST00000616081 1754 ntTSL 5 BASIC18.44■□□□□ 0.54
TAF9Q16594 ABHD16B-201ENST00000369916 1491 ntAPPRIS P1 BASIC18.44■□□□□ 0.54
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TAF9Q16594 UCHL5-205ENST00000367454 1815 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.44■□□□□ 0.54
TAF9Q16594 BICDL2-201ENST00000389347 1811 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.44■□□□□ 0.54
TAF9Q16594 FADS6-204ENST00000614223 2044 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.44■□□□□ 0.54
TAF9Q16594 WDR86-207ENST00000621812 1542 ntTSL 5 BASIC18.44■□□□□ 0.54
TAF9Q16594 SH2D5-202ENST00000444387 1934 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.43■□□□□ 0.54
TAF9Q16594 TNFAIP2-209ENST00000560869 4683 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.43■□□□□ 0.54
TAF9Q16594 AFDN-202ENST00000351017 5823 ntTSL 5 BASIC18.43■□□□□ 0.54
TAF9Q16594 PYCARD-202ENST00000350605 696 ntTSL 1 (best) BASIC18.43■□□□□ 0.54
TAF9Q16594 KDELR3-202ENST00000409006 931 ntTSL 1 (best) BASIC18.43■□□□□ 0.54
TAF9Q16594 PABPN1-207ENST00000556821 1220 ntTSL 2 BASIC18.43■□□□□ 0.54
TAF9Q16594 PEX7-201ENST00000318471 1464 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.43■□□□□ 0.54
TAF9Q16594 AC009126.1-201ENST00000501338 2245 ntTSL 2 BASIC18.43■□□□□ 0.54
TAF9Q16594 TMEM9B-201ENST00000309134 1659 ntTSL 1 (best) BASIC18.43■□□□□ 0.54
TAF9Q16594 KCNN1-204ENST00000615435 1691 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC18.43■□□□□ 0.54
TAF9Q16594 PDXK-205ENST00000398081 2251 ntTSL 2 BASIC18.43■□□□□ 0.54
TAF9Q16594 C7orf25-201ENST00000350427 2451 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.43■□□□□ 0.54
TAF9Q16594 SELENOO-201ENST00000380903 2315 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.43■□□□□ 0.54
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