Protein–RNA interactions for Protein: Q16473

TNXA, Putative tenascin-XA, humanhuman

Predictions only

Length 311 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
TNXAQ16473 FAM167A-204ENST00000528897 1620 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.39■□□□□ 0.37
TNXAQ16473 AC137767.1-201ENST00000602918 1920 ntBASIC17.39■□□□□ 0.37
TNXAQ16473 AFDN-202ENST00000351017 5823 ntTSL 5 BASIC17.39■□□□□ 0.37
TNXAQ16473 NUDT16L1-204ENST00000586536 1406 ntTSL 2 BASIC17.38■□□□□ 0.37
TNXAQ16473 REPIN1-214ENST00000489432 2058 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.38■□□□□ 0.37
TNXAQ16473 FDFT1-201ENST00000220584 2176 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.38■□□□□ 0.37
TNXAQ16473 DBP-201ENST00000222122 2229 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.38■□□□□ 0.37
TNXAQ16473 EEFSEC-201ENST00000254730 2232 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.38■□□□□ 0.37
TNXAQ16473 YIF1A-201ENST00000359461 943 ntTSL 2 BASIC17.38■□□□□ 0.37
TNXAQ16473 CARD19-201ENST00000375464 855 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.38■□□□□ 0.37
TNXAQ16473 YIF1A-203ENST00000376901 1124 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.38■□□□□ 0.37
TNXAQ16473 ACYP1-205ENST00000555463 789 ntTSL 2 BASIC17.38■□□□□ 0.37
TNXAQ16473 AC131212.1-201ENST00000613771 668 ntBASIC17.38■□□□□ 0.37
TNXAQ16473 AC091982.4-201ENST00000623943 726 ntTSL 2 BASIC17.38■□□□□ 0.37
TNXAQ16473 Z98883.1-202ENST00000635107 1289 ntTSL 5 BASIC17.38■□□□□ 0.37
TNXAQ16473 PRPSAP2-201ENST00000268835 1910 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.38■□□□□ 0.37
TNXAQ16473 TIMM50-201ENST00000314349 1612 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.38■□□□□ 0.37
TNXAQ16473 PYCR1-203ENST00000402252 1346 ntTSL 2 BASIC17.38■□□□□ 0.37
TNXAQ16473 ZNF410-206ENST00000540593 1722 ntTSL 2 BASIC17.38■□□□□ 0.37
TNXAQ16473 NIPA2-205ENST00000539711 1412 ntTSL 2 BASIC17.38■□□□□ 0.37
TNXAQ16473 TEAD1-206ENST00000527636 2544 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.38■□□□□ 0.37
TNXAQ16473 TRIM67-203ENST00000449018 2166 ntTSL 1 (best) BASIC17.38■□□□□ 0.37
TNXAQ16473 DAZAP1-211ENST00000592522 2157 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC17.38■□□□□ 0.37
TNXAQ16473 NIPA2-203ENST00000398013 2280 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.37■□□□□ 0.37
TNXAQ16473 PRKACA-201ENST00000308677 2677 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.37■□□□□ 0.37
TNXAQ16473 TBC1D22A-206ENST00000407381 1949 ntTSL 5 BASIC17.37■□□□□ 0.37
TNXAQ16473 TOP1MT-201ENST00000329245 1958 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.37■□□□□ 0.37
TNXAQ16473 MYB-221ENST00000527615 2381 ntTSL 5 BASIC17.37■□□□□ 0.37
TNXAQ16473 WISP2-203ENST00000372868 1600 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC17.37■□□□□ 0.37
TNXAQ16473 DIAPH1-203ENST00000389057 5762 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.37■□□□□ 0.37
TNXAQ16473 DUX4L19-201ENST00000557448 1267 ntBASIC17.37■□□□□ 0.37
TNXAQ16473 PLEKHA8-208ENST00000622102 2140 ntTSL 5 BASIC17.37■□□□□ 0.37
TNXAQ16473 ZNF584-203ENST00000593920 2187 ntTSL 2 BASIC17.37■□□□□ 0.37
TNXAQ16473 FOXJ1-201ENST00000322957 2641 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.37■□□□□ 0.37
TNXAQ16473 AL121749.1-201ENST00000635993 1768 ntTSL 5 BASIC17.37■□□□□ 0.37
TNXAQ16473 RBMS1-205ENST00000409972 1815 ntTSL 5 BASIC17.37■□□□□ 0.37
TNXAQ16473 C11orf96-202ENST00000528572 1834 ntBASIC17.37■□□□□ 0.37
TNXAQ16473 AF117829.1-201ENST00000519655 1398 ntTSL 5 BASIC17.37■□□□□ 0.37
TNXAQ16473 RBM38-203ENST00000356208 2382 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.37■□□□□ 0.37
TNXAQ16473 MAPT-210ENST00000535772 5718 ntTSL 5 BASIC17.37■□□□□ 0.37
TNXAQ16473 PLK5-202ENST00000454744 1930 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC17.37■□□□□ 0.37
TNXAQ16473 TBX1-203ENST00000359500 1538 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.37■□□□□ 0.37
TNXAQ16473 STAP2-206ENST00000600324 1508 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC17.37■□□□□ 0.37
TNXAQ16473 ANKHD1-205ENST00000394723 2135 ntTSL 1 (best) BASIC17.36■□□□□ 0.37
TNXAQ16473 ERI3-201ENST00000372257 1684 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.36■□□□□ 0.37
TNXAQ16473 PTP4A3-204ENST00000521578 1717 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.36■□□□□ 0.37
TNXAQ16473 SMOX-212ENST00000621355 2322 ntTSL 1 (best) BASIC17.36■□□□□ 0.37
TNXAQ16473 AKT1S1-206ENST00000391834 1849 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.36■□□□□ 0.37
TNXAQ16473 ALDH16A1-202ENST00000455361 2470 ntTSL 2 BASIC17.36■□□□□ 0.37
TNXAQ16473 TMEM80-201ENST00000397510 1094 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC17.36■□□□□ 0.37
TNXAQ16473 AL445237.1-202ENST00000604581 425 ntTSL 5 BASIC17.36■□□□□ 0.37
TNXAQ16473 CA15P2-201ENST00000611168 834 ntBASIC17.36■□□□□ 0.37
TNXAQ16473 UCHL5-201ENST00000367448 1534 ntTSL 1 (best) BASIC17.36■□□□□ 0.37
TNXAQ16473 KHDRBS2-201ENST00000281156 2332 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.36■□□□□ 0.37
TNXAQ16473 SSUH2-217ENST00000544814 1636 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.36■□□□□ 0.37
TNXAQ16473 ST3GAL5-222ENST00000638572 4431 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.35■□□□□ 0.37
TNXAQ16473 NEIL1-206ENST00000564784 2019 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.35■□□□□ 0.37
TNXAQ16473 USP21-202ENST00000368001 2095 ntTSL 1 (best) BASIC17.35■□□□□ 0.37
TNXAQ16473 NELFCD-213ENST00000602795 2305 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.35■□□□□ 0.37
TNXAQ16473 KMT5B-201ENST00000304363 5837 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.35■□□□□ 0.37
TNXAQ16473 CLTB-201ENST00000310418 1215 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC17.35■□□□□ 0.37
TNXAQ16473 CLTB-202ENST00000345807 1161 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.35■□□□□ 0.37
TNXAQ16473 SERBP1P1-201ENST00000396021 1160 ntBASIC17.35■□□□□ 0.37
TNXAQ16473 AL136116.3-201ENST00000402907 1138 ntBASIC17.35■□□□□ 0.37
TNXAQ16473 MAST4-206ENST00000406374 1066 ntTSL 1 (best) BASIC17.35■□□□□ 0.37
TNXAQ16473 HES6-206ENST00000409574 738 ntTSL 2 BASIC17.35■□□□□ 0.37
TNXAQ16473 ZNF419-210ENST00000520540 568 ntTSL 4 BASIC17.35■□□□□ 0.37
TNXAQ16473 EEF1D-201ENST00000317198 1458 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.35■□□□□ 0.37
TNXAQ16473 GNB1-209ENST00000610897 3145 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.35■□□□□ 0.37
TNXAQ16473 WTAP-201ENST00000337387 1622 ntTSL 1 (best) BASIC17.35■□□□□ 0.37
TNXAQ16473 SLC41A3-202ENST00000346785 1705 ntTSL 2 BASIC17.35■□□□□ 0.37
TNXAQ16473 ST7L-221ENST00000490067 1780 ntTSL 1 (best) BASIC17.35■□□□□ 0.37
TNXAQ16473 AC080112.2-201ENST00000578774 2094 ntTSL 4 BASIC17.35■□□□□ 0.37
TNXAQ16473 SYF2-201ENST00000236273 1345 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.34■□□□□ 0.37
TNXAQ16473 TRH-201ENST00000302649 1978 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.34■□□□□ 0.37
TNXAQ16473 BRWD1-202ENST00000341322 2495 ntTSL 1 (best) BASIC17.34■□□□□ 0.37
TNXAQ16473 ITGB1BP1-203ENST00000359712 2126 ntTSL 2 BASIC17.34■□□□□ 0.37
TNXAQ16473 STX4-202ENST00000394998 1498 ntTSL 2 BASIC17.34■□□□□ 0.37
TNXAQ16473 MANEAL-203ENST00000397631 2327 ntTSL 1 (best) BASIC17.34■□□□□ 0.37
TNXAQ16473 KRTAP5-4-201ENST00000399682 1181 ntAPPRIS P5 BASIC17.34■□□□□ 0.37
TNXAQ16473 MRGPRF-203ENST00000441623 2282 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.34■□□□□ 0.37
TNXAQ16473 ATP6V0E2-204ENST00000464662 513 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.34■□□□□ 0.37
TNXAQ16473 PWWP2A-205ENST00000523662 1819 ntTSL 1 (best) BASIC17.34■□□□□ 0.37
TNXAQ16473 KCNQ5-207ENST00000403813 6539 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.34■□□□□ 0.37
TNXAQ16473 ICAM5-201ENST00000221980 3000 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.34■□□□□ 0.37
TNXAQ16473 RNF149-201ENST00000295317 2458 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.33■□□□□ 0.37
TNXAQ16473 IRX4-201ENST00000231357 2221 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.33■□□□□ 0.37
TNXAQ16473 AC133065.2-201ENST00000573379 2147 ntTSL 2 BASIC17.33■□□□□ 0.37
TNXAQ16473 FLT1-209ENST00000639477 6337 ntTSL 5 BASIC17.33■□□□□ 0.37
TNXAQ16473 PLPP7-202ENST00000372264 2095 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.33■□□□□ 0.37
TNXAQ16473 ADCK2-203ENST00000476491 2092 ntTSL 1 (best) BASIC17.33■□□□□ 0.37
TNXAQ16473 AC092490.1-203ENST00000514568 1972 ntTSL 1 (best) BASIC17.33■□□□□ 0.37
TNXAQ16473 POTED-202ENST00000620442 1988 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.33■□□□□ 0.37
TNXAQ16473 INPP1-201ENST00000322522 1919 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.33■□□□□ 0.37
TNXAQ16473 TRADD-202ENST00000486556 1833 ntTSL 2 BASIC17.33■□□□□ 0.37
TNXAQ16473 KPTN-201ENST00000338134 1691 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.33■□□□□ 0.37
TNXAQ16473 SNUPN-201ENST00000308588 1513 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.33■□□□□ 0.37
TNXAQ16473 MTMR14-206ENST00000420925 1427 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.33■□□□□ 0.36
TNXAQ16473 PLCL1-201ENST00000428675 5125 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.33■□□□□ 0.36
TNXAQ16473 YJEFN3-201ENST00000436027 878 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.33■□□□□ 0.36
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 55.9 ms