Protein–RNA interactions for Protein: Q16385

SSX2, Protein SSX2, humanhuman

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SSX2Q16385 KIAA0895-204ENST00000415803 2865 ntTSL 1 (best) BASIC17.95■□□□□ 0.46
SSX2Q16385 SDC3-202ENST00000339394 1580 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.95■□□□□ 0.46
SSX2Q16385 STOML1-201ENST00000316900 2169 ntTSL 2 BASIC17.94■□□□□ 0.46
SSX2Q16385 LLGL2-202ENST00000375227 1374 ntTSL 1 (best) BASIC17.94■□□□□ 0.46
SSX2Q16385 MIR222HG-201ENST00000602461 1379 ntTSL 5 BASIC17.94■□□□□ 0.46
SSX2Q16385 SHMT1-203ENST00000354098 1656 ntTSL 1 (best) BASIC17.94■□□□□ 0.46
SSX2Q16385 KLHL11-201ENST00000319121 2383 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.94■□□□□ 0.46
SSX2Q16385 C2orf82-201ENST00000331342 465 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.94■□□□□ 0.46
SSX2Q16385 WT1-204ENST00000448076 2114 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.94■□□□□ 0.46
SSX2Q16385 AP006621.1-201ENST00000532946 536 ntTSL 5 BASIC17.94■□□□□ 0.46
SSX2Q16385 AC142381.2-201ENST00000566120 298 ntBASIC17.94■□□□□ 0.46
SSX2Q16385 C17orf74-202ENST00000574034 1287 ntTSL 1 (best) BASIC17.94■□□□□ 0.46
SSX2Q16385 AC007448.3-201ENST00000585193 689 ntTSL 2 BASIC17.94■□□□□ 0.46
SSX2Q16385 BAG1-212ENST00000641048 1038 ntAPPRIS P3 BASIC17.94■□□□□ 0.46
SSX2Q16385 SLC22A17-201ENST00000206544 2284 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC17.94■□□□□ 0.46
SSX2Q16385 FRS3-202ENST00000373018 2174 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC17.94■□□□□ 0.46
SSX2Q16385 NKIRAS2-204ENST00000393880 1644 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.94■□□□□ 0.46
SSX2Q16385 POLD2-218ENST00000610533 1619 ntTSL 1 (best) BASIC17.94■□□□□ 0.46
SSX2Q16385 USP36-218ENST00000590546 1771 ntTSL 1 (best) BASIC17.94■□□□□ 0.46
SSX2Q16385 BAZ1B-202ENST00000404251 5428 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.93■□□□□ 0.46
SSX2Q16385 PKM-201ENST00000319622 2717 ntAPPRIS P5 TSL 2 BASIC17.93■□□□□ 0.46
SSX2Q16385 WRNIP1-203ENST00000380771 2595 ntTSL 1 (best) BASIC17.93■□□□□ 0.46
SSX2Q16385 AF117829.1-201ENST00000519655 1398 ntTSL 5 BASIC17.93■□□□□ 0.46
SSX2Q16385 D2HGDH-201ENST00000321264 2617 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.93■□□□□ 0.46
SSX2Q16385 NUDT16L1-204ENST00000586536 1406 ntTSL 2 BASIC17.93■□□□□ 0.46
SSX2Q16385 SH2B1-202ENST00000337120 6043 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.93■□□□□ 0.46
SSX2Q16385 HACD1-202ENST00000361271 2237 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.93■□□□□ 0.46
SSX2Q16385 TRIR-201ENST00000242784 970 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.93■□□□□ 0.46
SSX2Q16385 LKAAEAR1-201ENST00000302096 761 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.93■□□□□ 0.46
SSX2Q16385 LKAAEAR1-202ENST00000308906 868 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.93■□□□□ 0.46
SSX2Q16385 ZDHHC16-205ENST00000370846 1280 ntTSL 3 BASIC17.93■□□□□ 0.46
SSX2Q16385 LIN7B-202ENST00000391864 582 ntTSL 3 BASIC17.93■□□□□ 0.46
SSX2Q16385 SAP25-203ENST00000614631 987 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC17.93■□□□□ 0.46
SSX2Q16385 SCUBE1-208ENST00000615096 1119 ntTSL 2 BASIC17.93■□□□□ 0.46
SSX2Q16385 NEDD4L-237ENST00000617539 728 ntTSL 2 BASIC17.93■□□□□ 0.46
SSX2Q16385 PLCL1-201ENST00000428675 5125 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.93■□□□□ 0.46
SSX2Q16385 NKIRAS2-206ENST00000393885 1909 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.93■□□□□ 0.46
SSX2Q16385 NHLH1-201ENST00000302101 2563 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.93■□□□□ 0.46
SSX2Q16385 ACP4-201ENST00000270593 1347 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.93■□□□□ 0.46
SSX2Q16385 NFKBID-201ENST00000396901 1834 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.93■□□□□ 0.46
SSX2Q16385 NFKBID-211ENST00000641389 1834 ntAPPRIS ALT2 BASIC17.93■□□□□ 0.46
SSX2Q16385 TMEM200B-202ENST00000521452 2501 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.93■□□□□ 0.46
SSX2Q16385 EGR3-203ENST00000519492 1500 ntTSL 5 BASIC17.93■□□□□ 0.46
SSX2Q16385 AC092667.1-201ENST00000434301 2586 ntBASIC17.92■□□□□ 0.46
SSX2Q16385 SCAND1-202ENST00000373991 1727 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.92■□□□□ 0.46
SSX2Q16385 IGF2-AS-201ENST00000381361 2063 ntTSL 2 BASIC17.92■□□□□ 0.46
SSX2Q16385 ME2-208ENST00000638937 2471 ntTSL 5 BASIC17.92■□□□□ 0.46
SSX2Q16385 ASPSCR1-208ENST00000580534 1776 ntTSL 2 BASIC17.92■□□□□ 0.46
SSX2Q16385 HSPBP1-206ENST00000587922 1449 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.92■□□□□ 0.46
SSX2Q16385 AC004687.1-201ENST00000579003 1625 ntBASIC17.92■□□□□ 0.46
SSX2Q16385 IPO9-AS1-201ENST00000413035 839 ntTSL 3 BASIC17.92■□□□□ 0.46
SSX2Q16385 AC105935.1-201ENST00000424174 422 ntTSL 3 BASIC17.92■□□□□ 0.46
SSX2Q16385 C15orf61-202ENST00000557807 769 ntTSL 2 BASIC17.92■□□□□ 0.46
SSX2Q16385 UQCR11-202ENST00000589880 504 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC17.92■□□□□ 0.46
SSX2Q16385 AC008764.7-201ENST00000593779 1081 ntBASIC17.92■□□□□ 0.46
SSX2Q16385 SMARCD2-201ENST00000225742 1800 ntTSL 1 (best) BASIC17.92■□□□□ 0.46
SSX2Q16385 BTBD17-201ENST00000375366 1805 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.92■□□□□ 0.46
SSX2Q16385 C1orf198-201ENST00000366663 3858 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.92■□□□□ 0.46
SSX2Q16385 AMZ2-202ENST00000359904 2402 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.92■□□□□ 0.46
SSX2Q16385 LGALS9C-201ENST00000328114 1730 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.92■□□□□ 0.46
SSX2Q16385 NECTIN1-201ENST00000264025 5840 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.92■□□□□ 0.46
SSX2Q16385 AF106564.1-201ENST00000607058 2553 ntBASIC17.91■□□□□ 0.46
SSX2Q16385 DLL3-201ENST00000205143 2332 ntTSL 1 (best) BASIC17.91■□□□□ 0.46
SSX2Q16385 FGF8-204ENST00000347978 823 ntTSL 1 (best) BASIC17.91■□□□□ 0.46
SSX2Q16385 AC068580.1-201ENST00000446489 252 ntTSL 3 BASIC17.91■□□□□ 0.46
SSX2Q16385 SERGEF-219ENST00000532265 1124 ntTSL 2 BASIC17.91■□□□□ 0.46
SSX2Q16385 AC093249.6-202ENST00000568500 1142 ntTSL 2 BASIC17.91■□□□□ 0.46
SSX2Q16385 PON1-201ENST00000222381 2568 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.91■□□□□ 0.46
SSX2Q16385 MYH7B-201ENST00000262873 6293 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.91■□□□□ 0.46
SSX2Q16385 WNK2-204ENST00000427277 6108 ntTSL 5 BASIC17.91■□□□□ 0.46
SSX2Q16385 HOXB7-201ENST00000239165 1371 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.91■□□□□ 0.46
SSX2Q16385 SDSL-201ENST00000345635 1397 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.91■□□□□ 0.46
SSX2Q16385 C3orf58-207ENST00000495414 1876 ntTSL 2 BASIC17.9■□□□□ 0.46
SSX2Q16385 HOOK1-201ENST00000371208 5857 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.9■□□□□ 0.46
SSX2Q16385 SBK1-201ENST00000341901 4992 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.9■□□□□ 0.46
SSX2Q16385 NIPA2-205ENST00000539711 1412 ntTSL 2 BASIC17.9■□□□□ 0.46
SSX2Q16385 CTU2-201ENST00000312060 1672 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC17.9■□□□□ 0.46
SSX2Q16385 AP002761.3-201ENST00000546324 1695 ntTSL 2 BASIC17.9■□□□□ 0.46
SSX2Q16385 SPAG7-205ENST00000573366 1668 ntTSL 3 BASIC17.9■□□□□ 0.46
SSX2Q16385 AC007326.4-201ENST00000638240 1669 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.9■□□□□ 0.46
SSX2Q16385 KCNQ5-207ENST00000403813 6539 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.9■□□□□ 0.46
SSX2Q16385 MAPKAPK5-AS1-201ENST00000428207 2290 ntTSL 1 (best) BASIC17.9■□□□□ 0.46
SSX2Q16385 CBWD5-207ENST00000382405 1791 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.9■□□□□ 0.46
SSX2Q16385 FEZ1-205ENST00000524435 750 ntTSL 2 BASIC17.9■□□□□ 0.46
SSX2Q16385 AF213884.3-201ENST00000563833 479 ntBASIC17.9■□□□□ 0.46
SSX2Q16385 PPP1R14A-205ENST00000591585 949 ntTSL 2 BASIC17.9■□□□□ 0.46
SSX2Q16385 RASSF5-202ENST00000579436 2064 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.9■□□□□ 0.46
SSX2Q16385 MESP2-201ENST00000341735 1552 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.9■□□□□ 0.46
SSX2Q16385 SYT8-201ENST00000341958 1556 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.9■□□□□ 0.46
SSX2Q16385 CAPN12-201ENST00000328867 2762 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.9■□□□□ 0.46
SSX2Q16385 MARK1-203ENST00000402574 5273 ntTSL 1 (best) BASIC17.9■□□□□ 0.46
SSX2Q16385 CFP-202ENST00000377005 1435 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.89■□□□□ 0.46
SSX2Q16385 ST3GAL4-202ENST00000356132 1745 ntTSL 5 BASIC17.89■□□□□ 0.46
SSX2Q16385 AC093323.1-201ENST00000307533 2311 ntTSL 1 (best) BASIC17.89■□□□□ 0.46
SSX2Q16385 SRPK3-203ENST00000370104 1753 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.89■□□□□ 0.45
SSX2Q16385 AL121749.1-201ENST00000635993 1768 ntTSL 5 BASIC17.89■□□□□ 0.45
SSX2Q16385 ABHD6-201ENST00000295962 2393 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.89■□□□□ 0.45
SSX2Q16385 AC004980.1-201ENST00000418663 2667 ntTSL 1 (best) BASIC17.89■□□□□ 0.45
SSX2Q16385 SNUPN-201ENST00000308588 1513 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.89■□□□□ 0.45
SSX2Q16385 AL391422.3-201ENST00000603791 2761 ntBASIC17.89■□□□□ 0.45
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