Protein–RNA interactions for Protein: Q16254

E2F4, Transcription factor E2F4, humanhuman

Predictions only

Length 413 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
E2F4Q16254 GCH1-206ENST00000543643 1897 ntTSL 1 (best) BASIC24.28■■□□□ 1.48
E2F4Q16254 C11orf95-202ENST00000433688 5716 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.28■■□□□ 1.48
E2F4Q16254 MEF2A-207ENST00000558812 2186 ntTSL 2 BASIC24.28■■□□□ 1.48
E2F4Q16254 AC010141.3-201ENST00000456659 717 ntBASIC24.28■■□□□ 1.48
E2F4Q16254 RPRD1A-207ENST00000588737 1264 ntTSL 2 BASIC24.28■■□□□ 1.48
E2F4Q16254 MIR210HG-201ENST00000500447 1965 ntTSL 2 BASIC24.28■■□□□ 1.48
E2F4Q16254 EIF2B4-211ENST00000616081 1754 ntTSL 5 BASIC24.28■■□□□ 1.48
E2F4Q16254 ADAP2-204ENST00000580525 1598 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.28■■□□□ 1.48
E2F4Q16254 TMEM51-203ENST00000400796 1842 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.28■■□□□ 1.48
E2F4Q16254 ALDH6A1-201ENST00000350259 1869 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC24.28■■□□□ 1.48
E2F4Q16254 RBPJL-202ENST00000372741 1636 ntTSL 1 (best) BASIC24.28■■□□□ 1.48
E2F4Q16254 TMEM9B-201ENST00000309134 1659 ntTSL 1 (best) BASIC24.27■■□□□ 1.48
E2F4Q16254 LTK-202ENST00000355166 2940 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.27■■□□□ 1.48
E2F4Q16254 MESP1-201ENST00000300057 2369 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.27■■□□□ 1.48
E2F4Q16254 RHBDD2-201ENST00000006777 1802 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.27■■□□□ 1.48
E2F4Q16254 LGALS9B-201ENST00000324290 1243 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC24.27■■□□□ 1.48
E2F4Q16254 C19orf60-201ENST00000358607 839 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.27■■□□□ 1.48
E2F4Q16254 LYPD2-201ENST00000359228 594 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.27■■□□□ 1.48
E2F4Q16254 RALB-203ENST00000420510 1252 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.27■■□□□ 1.48
E2F4Q16254 C19orf60-202ENST00000450195 702 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.27■■□□□ 1.48
E2F4Q16254 SMIM29-205ENST00000468145 903 ntTSL 2 BASIC24.27■■□□□ 1.48
E2F4Q16254 SMIM29-207ENST00000481533 1053 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.27■■□□□ 1.48
E2F4Q16254 RAB6A-204ENST00000536566 1267 ntTSL 5 BASIC24.27■■□□□ 1.48
E2F4Q16254 C15orf61-202ENST00000557807 769 ntTSL 2 BASIC24.27■■□□□ 1.48
E2F4Q16254 PHLDB2-210ENST00000478922 1861 ntTSL 1 (best) BASIC24.27■■□□□ 1.48
E2F4Q16254 TSPAN3-202ENST00000346495 1647 ntTSL 2 BASIC24.27■■□□□ 1.48
E2F4Q16254 AC007375.3-201ENST00000600936 2314 ntBASIC24.27■■□□□ 1.48
E2F4Q16254 DUSP26-201ENST00000256261 1835 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.26■■□□□ 1.47
E2F4Q16254 RARG-201ENST00000338561 1836 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC24.26■■□□□ 1.47
E2F4Q16254 YWHAZ-205ENST00000395956 2974 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.26■■□□□ 1.47
E2F4Q16254 IKBKG-212ENST00000617207 1949 ntAPPRIS ALT1 TSL 3 BASIC24.26■■□□□ 1.47
E2F4Q16254 UNC93B3-201ENST00000308076 687 ntBASIC24.26■■□□□ 1.47
E2F4Q16254 KRTAP5-1-201ENST00000382171 942 ntAPPRIS P1 BASIC24.26■■□□□ 1.47
E2F4Q16254 MAST4-205ENST00000406039 717 ntTSL 1 (best) BASIC24.26■■□□□ 1.47
E2F4Q16254 PTMA-205ENST00000410064 814 ntTSL 2 BASIC24.26■■□□□ 1.47
E2F4Q16254 GFRA3-201ENST00000274721 2039 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.26■■□□□ 1.47
E2F4Q16254 OXCT2P1-201ENST00000447263 1535 ntBASIC24.25■■□□□ 1.47
E2F4Q16254 MFSD7-209ENST00000515118 1556 ntTSL 5 BASIC24.25■■□□□ 1.47
E2F4Q16254 FBXW11-203ENST00000393802 2181 ntTSL 1 (best) BASIC24.25■■□□□ 1.47
E2F4Q16254 SPAST-204ENST00000621856 1715 ntTSL 1 (best) BASIC24.25■■□□□ 1.47
E2F4Q16254 PABPC1L-202ENST00000217074 1263 ntTSL 5 BASIC24.25■■□□□ 1.47
E2F4Q16254 SERGEF-219ENST00000532265 1124 ntTSL 2 BASIC24.25■■□□□ 1.47
E2F4Q16254 SERTAD3-201ENST00000322354 1734 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.24■■□□□ 1.47
E2F4Q16254 BASP1-203ENST00000616743 1711 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC24.24■■□□□ 1.47
E2F4Q16254 ACAA1-202ENST00000333167 1785 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.24■■□□□ 1.47
E2F4Q16254 LHFPL3-202ENST00000424859 1852 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC24.24■■□□□ 1.47
E2F4Q16254 B4GAT1-201ENST00000311181 2072 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.24■■□□□ 1.47
E2F4Q16254 CDKN2B-202ENST00000380142 859 ntTSL 1 (best) BASIC24.24■■□□□ 1.47
E2F4Q16254 TOLLIP-208ENST00000527938 549 ntTSL 4 BASIC24.24■■□□□ 1.47
E2F4Q16254 AP005435.1-201ENST00000529293 1178 ntBASIC24.24■■□□□ 1.47
E2F4Q16254 MIR4767-201ENST00000582827 78 ntBASIC24.24■■□□□ 1.47
E2F4Q16254 ZNF584-205ENST00000596281 575 ntTSL 2 BASIC24.24■■□□□ 1.47
E2F4Q16254 C12orf75-208ENST00000612117 1329 ntTSL 1 (best) BASIC24.24■■□□□ 1.47
E2F4Q16254 SYNGR2-201ENST00000225777 2325 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.24■■□□□ 1.47
E2F4Q16254 OR7E47P-201ENST00000546390 1422 ntBASIC24.24■■□□□ 1.47
E2F4Q16254 PDE5A-201ENST00000264805 3020 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.24■■□□□ 1.47
E2F4Q16254 AC026471.6-201ENST00000622954 1905 ntBASIC24.23■■□□□ 1.47
E2F4Q16254 RBBP7-202ENST00000380084 2036 ntTSL 2 BASIC24.23■■□□□ 1.47
E2F4Q16254 RFLNA-201ENST00000324038 2148 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC24.23■■□□□ 1.47
E2F4Q16254 PRADC1-201ENST00000258083 1083 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.23■■□□□ 1.47
E2F4Q16254 NAA38-201ENST00000333775 999 ntTSL 1 (best) BASIC24.23■■□□□ 1.47
E2F4Q16254 CENPH-201ENST00000283006 1389 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.23■■□□□ 1.47
E2F4Q16254 HTATIP2-201ENST00000419348 1477 ntTSL 2 BASIC24.23■■□□□ 1.47
E2F4Q16254 LINC02175-201ENST00000571219 1875 ntTSL 1 (best) BASIC24.23■■□□□ 1.47
E2F4Q16254 NAGPA-202ENST00000381955 2100 ntTSL 5 BASIC24.23■■□□□ 1.47
E2F4Q16254 RNPEP-201ENST00000295640 2427 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.22■■□□□ 1.47
E2F4Q16254 ZSCAN18-217ENST00000601144 2190 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.22■■□□□ 1.47
E2F4Q16254 KRT18P55-201ENST00000577198 1950 ntTSL 1 (best) BASIC24.22■■□□□ 1.47
E2F4Q16254 VPS9D1-AS1-202ENST00000562866 1753 ntTSL 2 BASIC24.22■■□□□ 1.47
E2F4Q16254 IGHV3-20-201ENST00000390606 415 ntAPPRIS P1 BASIC24.22■■□□□ 1.47
E2F4Q16254 TYROBP-203ENST00000544690 522 ntTSL 1 (best) BASIC24.22■■□□□ 1.47
E2F4Q16254 AC024257.2-201ENST00000549699 147 ntBASIC24.22■■□□□ 1.47
E2F4Q16254 AC087239.1-201ENST00000622671 572 ntBASIC24.22■■□□□ 1.47
E2F4Q16254 PGRMC2-201ENST00000296425 2767 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.22■■□□□ 1.47
E2F4Q16254 YY1AP1-214ENST00000407221 2705 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC24.22■■□□□ 1.47
E2F4Q16254 GOLGA2P6-201ENST00000340929 2049 ntBASIC24.22■■□□□ 1.47
E2F4Q16254 FADS6-204ENST00000614223 2044 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.22■■□□□ 1.47
E2F4Q16254 LHPP-202ENST00000368842 1622 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.21■■□□□ 1.47
E2F4Q16254 MPPED1-203ENST00000443721 2507 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.21■■□□□ 1.47
E2F4Q16254 ILDR2-206ENST00000528703 2446 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.21■■□□□ 1.47
E2F4Q16254 RTL8C-201ENST00000257013 1181 ntAPPRIS P1 BASIC24.21■■□□□ 1.47
E2F4Q16254 MYL5-208ENST00000511290 781 ntTSL 1 (best) BASIC24.21■■□□□ 1.47
E2F4Q16254 GALNS-211ENST00000568311 703 ntTSL 1 (best) BASIC24.21■■□□□ 1.47
E2F4Q16254 NABP2-203ENST00000380198 1775 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.21■■□□□ 1.47
E2F4Q16254 PAQR6-202ENST00000335852 2117 ntTSL 2 BASIC24.2■■□□□ 1.47
E2F4Q16254 SMIM19-203ENST00000417410 1466 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.2■■□□□ 1.47
E2F4Q16254 LINC01140-202ENST00000467438 2375 ntTSL 2 BASIC24.2■■□□□ 1.46
E2F4Q16254 PHPT1-201ENST00000247665 890 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.2■■□□□ 1.46
E2F4Q16254 SPHK1-202ENST00000392496 1779 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.2■■□□□ 1.46
E2F4Q16254 ME2-206ENST00000638410 2289 ntTSL 5 BASIC24.2■■□□□ 1.46
E2F4Q16254 ME2-210ENST00000639255 2262 ntTSL 5 BASIC24.2■■□□□ 1.46
E2F4Q16254 SH2B2-202ENST00000536178 2113 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.2■■□□□ 1.46
E2F4Q16254 GRK4-201ENST00000345167 2013 ntTSL 1 (best) BASIC24.2■■□□□ 1.46
E2F4Q16254 SERPINB5-201ENST00000382771 2783 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.2■■□□□ 1.46
E2F4Q16254 TRIM14-202ENST00000342043 1479 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.19■■□□□ 1.46
E2F4Q16254 PDXK-205ENST00000398081 2251 ntTSL 2 BASIC24.19■■□□□ 1.46
E2F4Q16254 JUNB-201ENST00000302754 1820 ntAPPRIS P1 BASIC24.19■■□□□ 1.46
E2F4Q16254 SPIRE2-202ENST00000393062 2172 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.19■■□□□ 1.46
E2F4Q16254 ST3GAL4-201ENST00000227495 1790 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC24.19■■□□□ 1.46
E2F4Q16254 SMUG1-215ENST00000508394 1697 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.19■■□□□ 1.46
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 18.2 ms