Protein–RNA interactions for Protein: Q15858

SCN9A, Sodium channel protein type 9 subunit alpha, humanhuman

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Length 1,988 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SCN9AQ15858 FADS3-204ENST00000525588 1254 ntTSL 5 BASIC26.24■■□□□ 1.79
SCN9AQ15858 AC110285.4-201ENST00000572590 424 ntTSL 3 BASIC26.24■■□□□ 1.79
SCN9AQ15858 ELAC1-204ENST00000591429 975 ntTSL 1 (best) BASIC26.24■■□□□ 1.79
SCN9AQ15858 MBD3L1-202ENST00000595891 872 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC26.24■■□□□ 1.79
SCN9AQ15858 PICK1-202ENST00000404072 2164 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC26.23■■□□□ 1.79
SCN9AQ15858 PUS1-203ENST00000443358 1664 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.23■■□□□ 1.79
SCN9AQ15858 SPINT2-201ENST00000301244 1802 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC26.23■■□□□ 1.79
SCN9AQ15858 MSRB1-201ENST00000361871 1423 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC26.23■■□□□ 1.79
SCN9AQ15858 SLC29A4P1-201ENST00000398760 971 ntBASIC26.23■■□□□ 1.79
SCN9AQ15858 AC010141.2-201ENST00000452426 721 ntBASIC26.23■■□□□ 1.79
SCN9AQ15858 TPT1-AS1-211ENST00000520622 604 ntTSL 4 BASIC26.23■■□□□ 1.79
SCN9AQ15858 MVB12A-212ENST00000543795 1154 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26.23■■□□□ 1.79
SCN9AQ15858 LINC01960-201ENST00000563759 1884 ntBASIC26.23■■□□□ 1.79
SCN9AQ15858 SPRTN-201ENST00000008440 1667 ntTSL 2 BASIC26.23■■□□□ 1.79
SCN9AQ15858 CAMK2N1-201ENST00000375078 2336 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.23■■□□□ 1.79
SCN9AQ15858 GOLGA6L9-202ENST00000618348 1710 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26.22■■□□□ 1.79
SCN9AQ15858 SEPT4-205ENST00000426861 1906 ntTSL 1 (best) BASIC26.22■■□□□ 1.79
SCN9AQ15858 FNDC5-207ENST00000640867 639 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC26.22■■□□□ 1.79
SCN9AQ15858 ELOA3B-201ENST00000611323 1641 ntAPPRIS P1 BASIC26.22■■□□□ 1.79
SCN9AQ15858 ELOA3D-201ENST00000620881 1641 ntAPPRIS P1 BASIC26.22■■□□□ 1.79
SCN9AQ15858 GNB2-209ENST00000436220 1479 ntTSL 5 BASIC26.22■■□□□ 1.79
SCN9AQ15858 VIL1-204ENST00000440053 1454 ntTSL 1 (best) BASIC26.22■■□□□ 1.79
SCN9AQ15858 CLPTM1-201ENST00000337392 2604 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.22■■□□□ 1.79
SCN9AQ15858 TMEM185A-207ENST00000600449 2840 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.22■■□□□ 1.79
SCN9AQ15858 PURG-201ENST00000339382 2693 ntTSL 1 (best) BASIC26.22■■□□□ 1.79
SCN9AQ15858 HOXC8-201ENST00000040584 1889 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.22■■□□□ 1.79
SCN9AQ15858 RNF223-201ENST00000453464 1902 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC26.22■■□□□ 1.79
SCN9AQ15858 HMGA2-206ENST00000536545 1788 ntTSL 1 (best) BASIC26.21■■□□□ 1.79
SCN9AQ15858 AL731577.2-201ENST00000508096 555 ntTSL 2 BASIC26.21■■□□□ 1.79
SCN9AQ15858 FAHD1-201ENST00000382666 1964 ntTSL 2 BASIC26.21■■□□□ 1.79
SCN9AQ15858 TBC1D10A-201ENST00000215790 2077 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26.21■■□□□ 1.79
SCN9AQ15858 ZNF219-201ENST00000360947 3071 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.21■■□□□ 1.79
SCN9AQ15858 B3GALNT2-202ENST00000366600 2015 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.21■■□□□ 1.79
SCN9AQ15858 CACNB1-203ENST00000394310 1753 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC26.2■■□□□ 1.79
SCN9AQ15858 AC138907.5-202ENST00000569484 235 ntBASIC26.2■■□□□ 1.79
SCN9AQ15858 AC233992.2-201ENST00000531225 1596 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC26.2■■□□□ 1.79
SCN9AQ15858 KDF1-201ENST00000320567 1793 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC26.2■■□□□ 1.78
SCN9AQ15858 FOXA3-201ENST00000302177 1989 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.2■■□□□ 1.78
SCN9AQ15858 GGTLC1-202ENST00000286890 1028 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.2■■□□□ 1.78
SCN9AQ15858 AP001160.3-201ENST00000601484 763 ntBASIC26.2■■□□□ 1.78
SCN9AQ15858 REXO4-202ENST00000371942 2360 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.19■■□□□ 1.78
SCN9AQ15858 EGR3-203ENST00000519492 1500 ntTSL 5 BASIC26.19■■□□□ 1.78
SCN9AQ15858 SNX24-211ENST00000513881 1563 ntTSL 1 (best) BASIC26.19■■□□□ 1.78
SCN9AQ15858 FAM136A-201ENST00000037869 1810 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.19■■□□□ 1.78
SCN9AQ15858 SGMS1-210ENST00000619438 1680 ntTSL 5 BASIC26.19■■□□□ 1.78
SCN9AQ15858 SIX3-201ENST00000260653 2523 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.19■■□□□ 1.78
SCN9AQ15858 SH2D3A-202ENST00000437152 2013 ntTSL 2 BASIC26.18■■□□□ 1.78
SCN9AQ15858 DHRS4-207ENST00000559632 1003 ntTSL 1 (best) BASIC26.18■■□□□ 1.78
SCN9AQ15858 MAPK9-206ENST00000425491 2266 ntTSL 5 BASIC26.18■■□□□ 1.78
SCN9AQ15858 BX322557.1-202ENST00000400362 1460 ntTSL 1 (best) BASIC26.18■■□□□ 1.78
SCN9AQ15858 AC092068.2-201ENST00000590491 1708 ntBASIC26.18■■□□□ 1.78
SCN9AQ15858 CYP2T1P-201ENST00000432607 1285 ntBASIC26.18■■□□□ 1.78
SCN9AQ15858 WWTR1-AS1-203ENST00000495094 975 ntTSL 1 (best) BASIC26.18■■□□□ 1.78
SCN9AQ15858 STAP2-206ENST00000600324 1508 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC26.18■■□□□ 1.78
SCN9AQ15858 KLC3-204ENST00000585434 1764 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC26.18■■□□□ 1.78
SCN9AQ15858 RPIA-201ENST00000283646 1848 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.18■■□□□ 1.78
SCN9AQ15858 DDN-AS1-202ENST00000547866 2114 ntTSL 3 BASIC26.18■■□□□ 1.78
SCN9AQ15858 SPDYE2-201ENST00000341656 1219 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.17■■□□□ 1.78
SCN9AQ15858 ARL6IP4-205ENST00000412505 818 ntTSL 5 BASIC26.17■■□□□ 1.78
SCN9AQ15858 EIF5A-205ENST00000419711 1271 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.17■■□□□ 1.78
SCN9AQ15858 APTR-203ENST00000430801 583 ntTSL 5 BASIC26.17■■□□□ 1.78
SCN9AQ15858 SPDYE2B-202ENST00000455020 1219 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.17■■□□□ 1.78
SCN9AQ15858 HMX1-202ENST00000506970 651 ntTSL 1 (best) BASIC26.17■■□□□ 1.78
SCN9AQ15858 VGLL2-201ENST00000326274 2212 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.17■■□□□ 1.78
SCN9AQ15858 RAPSN-205ENST00000529341 1408 ntTSL 1 (best) BASIC26.17■■□□□ 1.78
SCN9AQ15858 CEACAM4-201ENST00000221954 1205 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC26.16■■□□□ 1.78
SCN9AQ15858 FMR1-202ENST00000334557 1295 ntTSL 1 (best) BASIC26.16■■□□□ 1.78
SCN9AQ15858 CHEK2P2-202ENST00000555186 864 ntTSL 2 BASIC26.16■■□□□ 1.78
SCN9AQ15858 CEACAM4-203ENST00000600925 899 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC26.16■■□□□ 1.78
SCN9AQ15858 AC010536.3-201ENST00000620306 533 ntBASIC26.16■■□□□ 1.78
SCN9AQ15858 NAT16-204ENST00000455377 1492 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC26.16■■□□□ 1.78
SCN9AQ15858 C19orf84-201ENST00000570516 788 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.16■■□□□ 1.78
SCN9AQ15858 PRMT1-221ENST00000610806 1192 ntTSL 3 BASIC26.16■■□□□ 1.78
SCN9AQ15858 IMPDH1-210ENST00000480861 1765 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC26.16■■□□□ 1.78
SCN9AQ15858 SLC41A3-201ENST00000315891 1797 ntTSL 1 (best) BASIC26.15■■□□□ 1.78
SCN9AQ15858 TRAPPC5-201ENST00000317378 790 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.15■■□□□ 1.78
SCN9AQ15858 AC073210.2-201ENST00000430369 194 ntBASIC26.15■■□□□ 1.78
SCN9AQ15858 ABCC6P2-202ENST00000542005 706 ntTSL 1 (best) BASIC26.15■■□□□ 1.78
SCN9AQ15858 AC133552.2-202ENST00000575694 574 ntBASIC26.15■■□□□ 1.78
SCN9AQ15858 ABCC6-204ENST00000575728 714 ntTSL 1 (best) BASIC26.15■■□□□ 1.78
SCN9AQ15858 FRMD8-203ENST00000416776 1818 ntTSL 2 BASIC26.15■■□□□ 1.78
SCN9AQ15858 AC099805.1-201ENST00000523987 1797 ntTSL 1 (best) BASIC26.15■■□□□ 1.78
SCN9AQ15858 ZNF837-202ENST00000597582 1969 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC26.15■■□□□ 1.78
SCN9AQ15858 TP53I11-215ENST00000531928 1078 ntTSL 3 BASIC26.15■■□□□ 1.78
SCN9AQ15858 SCO2-203ENST00000535425 1002 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC26.15■■□□□ 1.78
SCN9AQ15858 KRT18P20-201ENST00000548986 1279 ntBASIC26.15■■□□□ 1.78
SCN9AQ15858 CD99-212ENST00000624481 1089 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC26.15■■□□□ 1.78
SCN9AQ15858 HMBS-201ENST00000278715 1501 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.14■■□□□ 1.78
SCN9AQ15858 ZPBP2-201ENST00000348931 1543 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC26.14■■□□□ 1.78
SCN9AQ15858 SRI-201ENST00000265729 2010 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.14■■□□□ 1.78
SCN9AQ15858 ATG101-201ENST00000336854 1439 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.14■■□□□ 1.78
SCN9AQ15858 HRASLS5-201ENST00000301790 1166 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26.14■■□□□ 1.77
SCN9AQ15858 COA6-202ENST00000366613 641 ntTSL 1 (best) BASIC26.14■■□□□ 1.77
SCN9AQ15858 MRPL37-206ENST00000605337 1582 ntTSL 5 BASIC26.14■■□□□ 1.77
SCN9AQ15858 OTUD5-203ENST00000396743 2682 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC26.13■■□□□ 1.77
SCN9AQ15858 RGMA-211ENST00000557420 989 ntTSL 3 BASIC26.13■■□□□ 1.77
SCN9AQ15858 MARS-234ENST00000630571 216 ntTSL 5 BASIC26.13■■□□□ 1.77
SCN9AQ15858 MARS-235ENST00000630803 183 ntTSL 3 BASIC26.13■■□□□ 1.77
SCN9AQ15858 AC068987.5-201ENST00000642069 987 ntAPPRIS P1 BASIC26.13■■□□□ 1.77
SCN9AQ15858 NAPRT-204ENST00000449291 1965 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.13■■□□□ 1.77
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