Protein–RNA interactions for Protein: Q15825

CHRNA6, Neuronal acetylcholine receptor subunit alpha-6, humanhuman

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CHRNA6Q15825 TMCC2-209ENST00000637895 1455 ntTSL 1 (best) BASIC21.5■■□□□ 1.03
CHRNA6Q15825 SNRK-203ENST00000437827 1995 ntTSL 2 BASIC21.5■■□□□ 1.03
CHRNA6Q15825 HSPB2-201ENST00000304298 1335 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.5■■□□□ 1.03
CHRNA6Q15825 UCHL5-205ENST00000367454 1815 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.5■■□□□ 1.03
CHRNA6Q15825 TRADD-202ENST00000486556 1833 ntTSL 2 BASIC21.5■■□□□ 1.03
CHRNA6Q15825 DMRT1-201ENST00000382276 2222 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.49■■□□□ 1.03
CHRNA6Q15825 ITM2C-202ENST00000326427 2078 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.49■■□□□ 1.03
CHRNA6Q15825 GNB1-210ENST00000615252 3048 ntTSL 5 BASIC21.49■■□□□ 1.03
CHRNA6Q15825 MOSPD3-203ENST00000393950 1191 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.49■■□□□ 1.03
CHRNA6Q15825 HERC2P4-206ENST00000568097 1062 ntTSL 5 BASIC21.49■■□□□ 1.03
CHRNA6Q15825 PRSS22-203ENST00000571228 1037 ntTSL 2 BASIC21.49■■□□□ 1.03
CHRNA6Q15825 WDR86-201ENST00000334493 2023 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.49■■□□□ 1.03
CHRNA6Q15825 CEBPB-AS1-201ENST00000613921 2648 ntTSL 3 BASIC21.49■■□□□ 1.03
CHRNA6Q15825 GRAMD1A-201ENST00000317991 2695 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.49■■□□□ 1.03
CHRNA6Q15825 AC133065.2-201ENST00000573379 2147 ntTSL 2 BASIC21.49■■□□□ 1.03
CHRNA6Q15825 POTED-202ENST00000620442 1988 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.48■■□□□ 1.03
CHRNA6Q15825 CD6-203ENST00000352009 1809 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.48■■□□□ 1.03
CHRNA6Q15825 ANKRD53-204ENST00000457410 1671 ntTSL 5 BASIC21.48■■□□□ 1.03
CHRNA6Q15825 TESC-201ENST00000335209 1041 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.48■■□□□ 1.03
CHRNA6Q15825 FOXB2-201ENST00000376708 1299 ntAPPRIS P1 BASIC21.48■■□□□ 1.03
CHRNA6Q15825 AC005775.1-201ENST00000592413 850 ntTSL 5 BASIC21.48■■□□□ 1.03
CHRNA6Q15825 CTAG1A-201ENST00000593606 993 ntTSL 5 BASIC21.48■■□□□ 1.03
CHRNA6Q15825 NRSN1-204ENST00000378491 2354 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.48■■□□□ 1.03
CHRNA6Q15825 BIN1-203ENST00000346226 2401 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.48■■□□□ 1.03
CHRNA6Q15825 EP400NL-214ENST00000641289 2402 ntBASIC21.48■■□□□ 1.03
CHRNA6Q15825 AVPR2-203ENST00000370049 1307 ntTSL 1 (best) BASIC21.48■■□□□ 1.03
CHRNA6Q15825 GSR-204ENST00000537535 1323 ntTSL 1 (best) BASIC21.48■■□□□ 1.03
CHRNA6Q15825 NOX4-209ENST00000527626 1774 ntTSL 2 BASIC21.48■■□□□ 1.03
CHRNA6Q15825 SPHK1-201ENST00000323374 2138 ntTSL 1 (best) BASIC21.47■■□□□ 1.03
CHRNA6Q15825 PRKAA1-202ENST00000354209 1918 ntTSL 1 (best) BASIC21.47■■□□□ 1.03
CHRNA6Q15825 SH2D5-202ENST00000444387 1934 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.47■■□□□ 1.03
CHRNA6Q15825 ZNF568-208ENST00000586353 1902 ntTSL 1 (best) BASIC21.47■■□□□ 1.03
CHRNA6Q15825 IKBKG-212ENST00000617207 1949 ntAPPRIS ALT1 TSL 3 BASIC21.47■■□□□ 1.03
CHRNA6Q15825 ZNF584-203ENST00000593920 2187 ntTSL 2 BASIC21.47■■□□□ 1.03
CHRNA6Q15825 CREG1-201ENST00000370509 1974 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.47■■□□□ 1.03
CHRNA6Q15825 HMBS-201ENST00000278715 1501 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.47■■□□□ 1.03
CHRNA6Q15825 PRKCZ-AS1-201ENST00000333854 1253 ntTSL 2 BASIC21.47■■□□□ 1.03
CHRNA6Q15825 LINC01167-201ENST00000423232 604 ntTSL 3 BASIC21.47■■□□□ 1.03
CHRNA6Q15825 POLR2H-204ENST00000438240 994 ntTSL 3 BASIC21.47■■□□□ 1.03
CHRNA6Q15825 TUSC3-209ENST00000509380 1266 ntTSL 5 BASIC21.47■■□□□ 1.03
CHRNA6Q15825 HIST1H2AL-201ENST00000613174 393 ntAPPRIS P1 BASIC21.47■■□□□ 1.03
CHRNA6Q15825 AC010999.2-201ENST00000621974 596 ntTSL 2 BASIC21.47■■□□□ 1.03
CHRNA6Q15825 PHF10-202ENST00000366780 1589 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.47■■□□□ 1.03
CHRNA6Q15825 SNX21-212ENST00000491381 1607 ntTSL 1 (best) BASIC21.47■■□□□ 1.03
CHRNA6Q15825 CADPS-203ENST00000383710 5471 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.47■■□□□ 1.03
CHRNA6Q15825 NPTXR-201ENST00000333039 5784 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.47■■□□□ 1.03
CHRNA6Q15825 EYA2-203ENST00000357410 2465 ntTSL 1 (best) BASIC21.47■■□□□ 1.03
CHRNA6Q15825 ALKAL2-204ENST00000403610 1389 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.47■■□□□ 1.03
CHRNA6Q15825 GAS1-201ENST00000298743 2827 ntAPPRIS P1 BASIC21.47■■□□□ 1.03
CHRNA6Q15825 C11orf63-201ENST00000227349 3147 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.46■■□□□ 1.03
CHRNA6Q15825 SLC41A3-202ENST00000346785 1705 ntTSL 2 BASIC21.46■■□□□ 1.03
CHRNA6Q15825 PDK3-201ENST00000379162 1809 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.46■■□□□ 1.03
CHRNA6Q15825 DTNB-201ENST00000288642 2464 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.46■■□□□ 1.03
CHRNA6Q15825 MCMBP-202ENST00000369077 2465 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.46■■□□□ 1.03
CHRNA6Q15825 DTNB-208ENST00000406818 2474 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC21.46■■□□□ 1.03
CHRNA6Q15825 ARL13B-205ENST00000471138 2206 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.46■■□□□ 1.03
CHRNA6Q15825 LGALS9B-201ENST00000324290 1243 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC21.46■■□□□ 1.03
CHRNA6Q15825 TSPY4-201ENST00000383008 1143 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.46■■□□□ 1.03
CHRNA6Q15825 STOML2-202ENST00000452248 1296 ntTSL 2 BASIC21.46■■□□□ 1.03
CHRNA6Q15825 ZNF696-205ENST00000521537 705 ntTSL 2 BASIC21.46■■□□□ 1.03
CHRNA6Q15825 AC012414.1-201ENST00000556676 535 ntBASIC21.46■■□□□ 1.03
CHRNA6Q15825 STOML2-205ENST00000619795 1293 ntTSL 3 BASIC21.46■■□□□ 1.03
CHRNA6Q15825 TMEM5-201ENST00000261234 1918 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.46■■□□□ 1.03
CHRNA6Q15825 ZBTB46-202ENST00000302995 2335 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.46■■□□□ 1.03
CHRNA6Q15825 MTX2-201ENST00000249442 1364 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.46■■□□□ 1.03
CHRNA6Q15825 PRR16-202ENST00000407149 1747 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.46■■□□□ 1.03
CHRNA6Q15825 NABP2-202ENST00000341463 1411 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC21.46■■□□□ 1.03
CHRNA6Q15825 DUSP26-201ENST00000256261 1835 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.45■■□□□ 1.03
CHRNA6Q15825 CBWD6-213ENST00000613716 1820 ntTSL 1 (best) BASIC21.45■■□□□ 1.03
CHRNA6Q15825 TBR1-202ENST00000410035 1454 ntTSL 2 BASIC21.45■■□□□ 1.03
CHRNA6Q15825 CFAP99-206ENST00000616117 1941 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.45■■□□□ 1.02
CHRNA6Q15825 TRAM2-AS1-204ENST00000606714 2453 ntTSL 2 BASIC21.45■■□□□ 1.02
CHRNA6Q15825 PLPP7-202ENST00000372264 2095 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.45■■□□□ 1.02
CHRNA6Q15825 FOSL1-201ENST00000312562 1669 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.45■■□□□ 1.02
CHRNA6Q15825 TUNAR-203ENST00000554321 767 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC21.45■■□□□ 1.02
CHRNA6Q15825 MIR6084-201ENST00000622012 110 ntBASIC21.45■■□□□ 1.02
CHRNA6Q15825 EPS8L1-202ENST00000245618 2198 ntTSL 1 (best) BASIC21.45■■□□□ 1.02
CHRNA6Q15825 UQCR11-203ENST00000591899 1324 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.45■■□□□ 1.02
CHRNA6Q15825 ASL-203ENST00000380839 1765 ntTSL 5 BASIC21.45■■□□□ 1.02
CHRNA6Q15825 DUSP9-202ENST00000370167 2289 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.45■■□□□ 1.02
CHRNA6Q15825 ASRGL1-202ENST00000415229 2270 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.45■■□□□ 1.02
CHRNA6Q15825 AC092053.2-201ENST00000640557 1818 ntBASIC21.45■■□□□ 1.02
CHRNA6Q15825 AC025164.2-201ENST00000501008 1898 ntTSL 5 BASIC21.45■■□□□ 1.02
CHRNA6Q15825 MAPK8IP1P2-201ENST00000580257 1472 ntBASIC21.45■■□□□ 1.02
CHRNA6Q15825 ALDH5A1-204ENST00000491546 1699 ntTSL 5 BASIC21.44■■□□□ 1.02
CHRNA6Q15825 POU4F1-201ENST00000377208 4547 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.44■■□□□ 1.02
CHRNA6Q15825 ST7-201ENST00000265437 2899 ntTSL 1 (best) BASIC21.44■■□□□ 1.02
CHRNA6Q15825 SHMT1-201ENST00000316694 2464 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.44■■□□□ 1.02
CHRNA6Q15825 TSSK1B-201ENST00000390666 2478 ntAPPRIS P1 BASIC21.44■■□□□ 1.02
CHRNA6Q15825 NME4-201ENST00000219479 995 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.44■■□□□ 1.02
CHRNA6Q15825 NME4-202ENST00000382940 766 ntTSL 3 BASIC21.44■■□□□ 1.02
CHRNA6Q15825 ORMDL1-202ENST00000392349 1137 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.44■■□□□ 1.02
CHRNA6Q15825 C16orf86-201ENST00000403458 1267 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.44■■□□□ 1.02
CHRNA6Q15825 MFF-208ENST00000409616 1247 ntTSL 5 BASIC21.44■■□□□ 1.02
CHRNA6Q15825 RPUSD3-206ENST00000433535 1178 ntTSL 1 (best) BASIC21.44■■□□□ 1.02
CHRNA6Q15825 AL590128.2-201ENST00000442889 415 ntTSL 3 BASIC21.44■■□□□ 1.02
CHRNA6Q15825 PTGDR-202ENST00000553372 1216 ntTSL 3 BASIC21.44■■□□□ 1.02
CHRNA6Q15825 NME4-211ENST00000620944 1193 ntTSL 2 BASIC21.44■■□□□ 1.02
CHRNA6Q15825 AL358852.1-201ENST00000623174 1268 ntBASIC21.44■■□□□ 1.02
CHRNA6Q15825 RNF39-202ENST00000376751 1970 ntTSL 1 (best) BASIC21.44■■□□□ 1.02
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