Protein–RNA interactions for Protein: Q15645

TRIP13, Pachytene checkpoint protein 2 homolog, humanhuman

Predicted RBP Predictions only

Length 432 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
TRIP13Q15645 HNRNPUL2-201ENST00000301785 5106 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.33■■□□□ 1.16
TRIP13Q15645 GFRA4-201ENST00000290417 1427 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.32■■□□□ 1.16
TRIP13Q15645 FXYD3-201ENST00000344013 1404 ntTSL 5 BASIC22.32■■□□□ 1.16
TRIP13Q15645 THEM6-201ENST00000336138 2259 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.32■■□□□ 1.16
TRIP13Q15645 SERTAD3-201ENST00000322354 1734 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.32■■□□□ 1.16
TRIP13Q15645 HSPE1-201ENST00000233893 950 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.32■■□□□ 1.16
TRIP13Q15645 CLYBL-202ENST00000376354 1127 ntTSL 5 BASIC22.32■■□□□ 1.16
TRIP13Q15645 SLC25A39-203ENST00000537904 1274 ntTSL 2 BASIC22.32■■□□□ 1.16
TRIP13Q15645 MIR6724-1-201ENST00000616420 92 ntBASIC22.32■■□□□ 1.16
TRIP13Q15645 MIR6724-2-201ENST00000616483 92 ntBASIC22.32■■□□□ 1.16
TRIP13Q15645 MIR6724-4-201ENST00000617390 92 ntBASIC22.32■■□□□ 1.16
TRIP13Q15645 MIR6724-3-201ENST00000622482 92 ntBASIC22.32■■□□□ 1.16
TRIP13Q15645 CA9-204ENST00000617161 1374 ntTSL 1 (best) BASIC22.32■■□□□ 1.16
TRIP13Q15645 GTSE1-AS1-202ENST00000623117 1518 ntBASIC22.31■■□□□ 1.16
TRIP13Q15645 DPYS-201ENST00000351513 2127 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.31■■□□□ 1.16
TRIP13Q15645 ADCK2-201ENST00000072869 2377 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.31■■□□□ 1.16
TRIP13Q15645 MIR210HG-201ENST00000500447 1965 ntTSL 2 BASIC22.31■■□□□ 1.16
TRIP13Q15645 POTEC-204ENST00000620346 1988 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.31■■□□□ 1.16
TRIP13Q15645 MRPS34-202ENST00000397375 1024 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.31■■□□□ 1.16
TRIP13Q15645 AC006455.2-201ENST00000429931 906 ntBASIC22.31■■□□□ 1.16
TRIP13Q15645 PRELID1-203ENST00000503216 1171 ntTSL 1 (best) BASIC22.31■■□□□ 1.16
TRIP13Q15645 SLC16A10-206ENST00000612036 1231 ntTSL 5 BASIC22.31■■□□□ 1.16
TRIP13Q15645 AL606970.3-201ENST00000446811 2246 ntTSL 2 BASIC22.31■■□□□ 1.16
TRIP13Q15645 LONP1-203ENST00000585374 2882 ntTSL 5 BASIC22.31■■□□□ 1.16
TRIP13Q15645 FAM185A-201ENST00000409231 1446 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.31■■□□□ 1.16
TRIP13Q15645 SPRN-201ENST00000414069 3128 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.31■■□□□ 1.16
TRIP13Q15645 SHMT1-203ENST00000354098 1656 ntTSL 1 (best) BASIC22.3■■□□□ 1.16
TRIP13Q15645 ALDH5A1-204ENST00000491546 1699 ntTSL 5 BASIC22.3■■□□□ 1.16
TRIP13Q15645 ADRM1-205ENST00000620230 1361 ntTSL 5 BASIC22.3■■□□□ 1.16
TRIP13Q15645 IRX4-206ENST00000513692 2391 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.3■■□□□ 1.16
TRIP13Q15645 NDUFV2-201ENST00000318388 930 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.3■■□□□ 1.16
TRIP13Q15645 NAXE-202ENST00000368234 901 ntTSL 1 (best) BASIC22.3■■□□□ 1.16
TRIP13Q15645 HTATIP2-204ENST00000451739 1748 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.3■■□□□ 1.16
TRIP13Q15645 ATP6AP1-201ENST00000369762 2099 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.3■■□□□ 1.16
TRIP13Q15645 ECE2-203ENST00000359140 3147 ntTSL 1 (best) BASIC22.3■■□□□ 1.16
TRIP13Q15645 TRIB3-201ENST00000217233 2499 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.3■■□□□ 1.16
TRIP13Q15645 CENPB-201ENST00000379751 2840 ntAPPRIS P1 BASIC22.3■■□□□ 1.16
TRIP13Q15645 C1orf174-201ENST00000361605 1666 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.3■■□□□ 1.16
TRIP13Q15645 RBBP7-202ENST00000380084 2036 ntTSL 2 BASIC22.3■■□□□ 1.16
TRIP13Q15645 FMR1-204ENST00000370471 4125 ntTSL 5 BASIC22.29■■□□□ 1.16
TRIP13Q15645 PLPP1-201ENST00000264775 1550 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.29■■□□□ 1.16
TRIP13Q15645 STK19-202ENST00000375333 1557 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.29■■□□□ 1.16
TRIP13Q15645 PTPRJ-208ENST00000615445 4773 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.29■■□□□ 1.16
TRIP13Q15645 MCAT-201ENST00000290429 2056 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.29■■□□□ 1.16
TRIP13Q15645 PHOX2B-201ENST00000226382 3030 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.29■■□□□ 1.16
TRIP13Q15645 GOLGA6L9-202ENST00000618348 1710 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.29■■□□□ 1.16
TRIP13Q15645 CNR1-203ENST00000369501 6031 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.29■■□□□ 1.16
TRIP13Q15645 HOXB7-201ENST00000239165 1371 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.29■■□□□ 1.16
TRIP13Q15645 ARHGEF7-202ENST00000317133 4361 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.29■■□□□ 1.16
TRIP13Q15645 DTNBP1-201ENST00000338950 1880 ntTSL 1 (best) BASIC22.29■■□□□ 1.16
TRIP13Q15645 AC244015.2-201ENST00000616358 1861 ntBASIC22.29■■□□□ 1.16
TRIP13Q15645 SERP2-201ENST00000379179 784 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.29■■□□□ 1.16
TRIP13Q15645 C14orf80-211ENST00000450383 1107 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.29■■□□□ 1.16
TRIP13Q15645 LGR4-202ENST00000389858 5163 ntTSL 1 (best) BASIC22.29■■□□□ 1.16
TRIP13Q15645 ITGBL1-206ENST00000618057 2368 ntTSL 1 (best) BASIC22.29■■□□□ 1.16
TRIP13Q15645 FASTK-212ENST00000482571 1764 ntTSL 1 (best) BASIC22.29■■□□□ 1.16
TRIP13Q15645 C11orf63-201ENST00000227349 3147 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.29■■□□□ 1.16
TRIP13Q15645 PANK1-201ENST00000307534 6976 ntTSL 1 (best) BASIC22.29■■□□□ 1.16
TRIP13Q15645 THOC6-202ENST00000326266 1419 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.29■■□□□ 1.16
TRIP13Q15645 GNB3-201ENST00000229264 1923 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC22.29■■□□□ 1.16
TRIP13Q15645 ATG4D-201ENST00000309469 1949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.29■■□□□ 1.16
TRIP13Q15645 CD6-203ENST00000352009 1809 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.29■■□□□ 1.16
TRIP13Q15645 CBWD6-213ENST00000613716 1820 ntTSL 1 (best) BASIC22.29■■□□□ 1.16
TRIP13Q15645 MESP2-201ENST00000341735 1552 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.29■■□□□ 1.16
TRIP13Q15645 HES5-201ENST00000378453 1306 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.29■■□□□ 1.16
TRIP13Q15645 HOMEZ-201ENST00000357460 4971 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.28■■□□□ 1.16
TRIP13Q15645 TSPAN3-202ENST00000346495 1647 ntTSL 2 BASIC22.28■■□□□ 1.16
TRIP13Q15645 IGFBP1-202ENST00000457280 1601 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.28■■□□□ 1.16
TRIP13Q15645 AC243965.2-201ENST00000612576 2671 ntTSL 5 BASIC22.28■■□□□ 1.16
TRIP13Q15645 ACAA1-202ENST00000333167 1785 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.28■■□□□ 1.16
TRIP13Q15645 MGAT5B-209ENST00000569840 4492 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC22.28■■□□□ 1.16
TRIP13Q15645 C2orf82-201ENST00000331342 465 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.28■■□□□ 1.16
TRIP13Q15645 AK3-203ENST00000447596 705 ntTSL 2 BASIC22.28■■□□□ 1.16
TRIP13Q15645 TSPAN17-204ENST00000503045 1019 ntTSL 5 BASIC22.28■■□□□ 1.16
TRIP13Q15645 PICSAR-201ENST00000615826 733 ntTSL 1 (best) BASIC22.28■■□□□ 1.16
TRIP13Q15645 REV1-201ENST00000258428 4751 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.28■■□□□ 1.16
TRIP13Q15645 SCRT1-201ENST00000569446 3779 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.28■■□□□ 1.16
TRIP13Q15645 MAIP1-201ENST00000295079 1495 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC22.28■■□□□ 1.16
TRIP13Q15645 RBAK-202ENST00000396912 6551 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.28■■□□□ 1.16
TRIP13Q15645 SPHK1-202ENST00000392496 1779 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.27■■□□□ 1.16
TRIP13Q15645 INPP1-201ENST00000322522 1919 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.27■■□□□ 1.16
TRIP13Q15645 CASP9-203ENST00000375890 1351 ntTSL 2 BASIC22.27■■□□□ 1.16
TRIP13Q15645 PCSK6-217ENST00000618548 4269 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.27■■□□□ 1.16
TRIP13Q15645 ST3GAL5-222ENST00000638572 4431 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.27■■□□□ 1.16
TRIP13Q15645 EML2-201ENST00000245925 2264 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.27■■□□□ 1.16
TRIP13Q15645 TTC7A-201ENST00000319190 5157 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.27■■□□□ 1.16
TRIP13Q15645 MFSD6L-201ENST00000329805 2188 ntAPPRIS P1 BASIC22.27■■□□□ 1.16
TRIP13Q15645 CENPX-202ENST00000392359 805 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.27■■□□□ 1.16
TRIP13Q15645 BAD-203ENST00000394532 1157 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.27■■□□□ 1.16
TRIP13Q15645 ERRFI1-204ENST00000474874 479 ntTSL 3 BASIC22.27■■□□□ 1.16
TRIP13Q15645 NR2F1-AS1-210ENST00000606739 1431 ntTSL 2 BASIC22.27■■□□□ 1.16
TRIP13Q15645 SH3RF3-201ENST00000309415 5803 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.27■■□□□ 1.16
TRIP13Q15645 LPAR1-201ENST00000358883 2687 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC22.27■■□□□ 1.16
TRIP13Q15645 IKBKG-212ENST00000617207 1949 ntAPPRIS ALT1 TSL 3 BASIC22.27■■□□□ 1.16
TRIP13Q15645 AC026471.6-201ENST00000622954 1905 ntBASIC22.27■■□□□ 1.16
TRIP13Q15645 MEGF6-202ENST00000356575 5455 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.27■■□□□ 1.16
TRIP13Q15645 CMTM4-201ENST00000330687 3414 ntTSL 1 (best) BASIC22.27■■□□□ 1.15
TRIP13Q15645 HUNK-201ENST00000270112 7385 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.26■■□□□ 1.15
TRIP13Q15645 OSBPL5-208ENST00000478260 2653 ntTSL 2 BASIC22.26■■□□□ 1.15
TRIP13Q15645 B4GALNT1-202ENST00000418555 1861 ntTSL 2 BASIC22.26■■□□□ 1.15
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 387.2 ms