Protein–RNA interactions for Protein: Q15560

TCEA2, Transcription elongation factor A protein 2, humanhuman

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
TCEA2Q15560 RAB11FIP1-203ENST00000522727 1866 ntTSL 1 (best) BASIC21.29■■□□□ 1
TCEA2Q15560 RCN2-201ENST00000320963 1750 ntTSL 5 BASIC21.29■■□□□ 1
TCEA2Q15560 PEBP1-201ENST00000261313 1697 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.29■■□□□ 1
TCEA2Q15560 RAB28-208ENST00000630951 1679 ntTSL 5 BASIC21.29■■□□□ 1
TCEA2Q15560 NOXA1-202ENST00000392815 1464 ntTSL 1 (best) BASIC21.29■■□□□ 1
TCEA2Q15560 RPS6-203ENST00000380384 1355 ntTSL 1 (best) BASIC21.29■■□□□ 1
TCEA2Q15560 CIRBP-222ENST00000589235 1073 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC21.29■■□□□ 1
TCEA2Q15560 CTAG1A-201ENST00000593606 993 ntTSL 5 BASIC21.29■■□□□ 1
TCEA2Q15560 WDR86-208ENST00000628331 1905 ntTSL 5 BASIC21.29■■□□□ 1
TCEA2Q15560 TMEM121-201ENST00000392519 1532 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.29■■□□□ 1
TCEA2Q15560 NFE2L3P1-201ENST00000588207 1959 ntBASIC21.28■■□□□ 1
TCEA2Q15560 CACNB1-203ENST00000394310 1753 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.28■■□□□ 1
TCEA2Q15560 AL391650.1-201ENST00000448923 1468 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.28■■□□□ 1
TCEA2Q15560 MTCH2-201ENST00000302503 2587 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.28■■□□□ 1
TCEA2Q15560 SCRT2-201ENST00000246104 3577 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.28■■□□□ 1
TCEA2Q15560 UCHL1-201ENST00000284440 1172 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.28■■□□□ 1
TCEA2Q15560 LRRC3C-201ENST00000377924 891 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC21.28■■□□□ 1
TCEA2Q15560 AL590128.2-201ENST00000442889 415 ntTSL 3 BASIC21.28■■□□□ 1
TCEA2Q15560 NDUFB2-207ENST00000465506 1101 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.28■■□□□ 1
TCEA2Q15560 UCHL1-210ENST00000512788 785 ntTSL 3 BASIC21.28■■□□□ 1
TCEA2Q15560 AC137761.2-201ENST00000561729 223 ntBASIC21.28■■□□□ 1
TCEA2Q15560 AC145350.3-201ENST00000569033 163 ntBASIC21.28■■□□□ 1
TCEA2Q15560 AC011511.3-201ENST00000587088 355 ntTSL 2 BASIC21.28■■□□□ 1
TCEA2Q15560 AC243773.2-201ENST00000616341 490 ntTSL 2 BASIC21.28■■□□□ 1
TCEA2Q15560 FOXK2-201ENST00000335255 5265 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.28■■□□□ 1
TCEA2Q15560 LRP5-201ENST00000294304 5159 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.28■■□□□ 1
TCEA2Q15560 MBNL3-202ENST00000370844 1643 ntTSL 1 (best) BASIC21.28■■□□□ 1
TCEA2Q15560 AC025164.2-201ENST00000501008 1898 ntTSL 5 BASIC21.28■■□□□ 1
TCEA2Q15560 PCYT2-201ENST00000331285 2147 ntTSL 2 BASIC21.28■■□□□ 1
TCEA2Q15560 PHF2-201ENST00000359246 5569 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.28■■□□□ 1
TCEA2Q15560 ILKAP-211ENST00000612675 1335 ntTSL 1 (best) BASIC21.28■■□□□ 1
TCEA2Q15560 SPAG7-205ENST00000573366 1668 ntTSL 3 BASIC21.28■■□□□ 1
TCEA2Q15560 HYAL2-207ENST00000442581 2318 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.27■■□□□ 1
TCEA2Q15560 TUBG1-201ENST00000251413 1611 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.27■■□□□ 1
TCEA2Q15560 MAP6D1-201ENST00000318631 2111 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.27■■□□□ 1
TCEA2Q15560 ME3-201ENST00000323418 1068 ntTSL 5 BASIC21.27■■□□□ 1
TCEA2Q15560 AC062017.1-203ENST00000413029 455 ntTSL 2 BASIC21.27■■□□□ 1
TCEA2Q15560 VGLL4-208ENST00000424529 1025 ntTSL 1 (best) BASIC21.27■■□□□ 1
TCEA2Q15560 TMEM182-210ENST00000639249 1025 ntTSL 5 BASIC21.27■■□□□ 1
TCEA2Q15560 FMR1-AS1-201ENST00000594922 2005 ntTSL 1 (best) BASIC21.27■■□□□ 1
TCEA2Q15560 BARX2-201ENST00000281437 1813 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.27■□□□□ 0.99
TCEA2Q15560 AP004607.4-201ENST00000530158 1459 ntBASIC21.26■□□□□ 0.99
TCEA2Q15560 KCNS1-202ENST00000537075 2136 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.26■□□□□ 0.99
TCEA2Q15560 ARMC10-208ENST00000441711 2524 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.26■□□□□ 0.99
TCEA2Q15560 C7orf25-203ENST00000431882 1645 ntTSL 2 BASIC21.26■□□□□ 0.99
TCEA2Q15560 ATP5A1-220ENST00000593152 2258 ntTSL 2 BASIC21.26■□□□□ 0.99
TCEA2Q15560 NTN1-201ENST00000173229 5954 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.26■□□□□ 0.99
TCEA2Q15560 AC016769.1-201ENST00000409132 1010 ntBASIC21.26■□□□□ 0.99
TCEA2Q15560 DBI-210ENST00000542275 757 ntTSL 5 BASIC21.26■□□□□ 0.99
TCEA2Q15560 SEC11A-208ENST00000559729 1256 ntTSL 2 BASIC21.26■□□□□ 0.99
TCEA2Q15560 AC140479.5-201ENST00000568189 735 ntTSL 3 BASIC21.26■□□□□ 0.99
TCEA2Q15560 RNF114-202ENST00000622920 1284 ntTSL 5 BASIC21.26■□□□□ 0.99
TCEA2Q15560 MFSD7-203ENST00000404286 1826 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.26■□□□□ 0.99
TCEA2Q15560 NECTIN2-202ENST00000252485 2112 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.26■□□□□ 0.99
TCEA2Q15560 HMCES-203ENST00000417226 1490 ntTSL 1 (best) BASIC21.26■□□□□ 0.99
TCEA2Q15560 CACNG8-201ENST00000270458 8747 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.25■□□□□ 0.99
TCEA2Q15560 UTS2R-201ENST00000313135 1357 ntAPPRIS P1 BASIC21.25■□□□□ 0.99
TCEA2Q15560 DUSP8P5-201ENST00000422884 1815 ntBASIC21.25■□□□□ 0.99
TCEA2Q15560 PCSK1N-201ENST00000218230 1050 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.25■□□□□ 0.99
TCEA2Q15560 SUMF1-201ENST00000272902 2159 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.25■□□□□ 0.99
TCEA2Q15560 KCNIP1-201ENST00000328939 2014 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.25■□□□□ 0.99
TCEA2Q15560 SOCS1-201ENST00000332029 1225 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.25■□□□□ 0.99
TCEA2Q15560 BAZ1A-201ENST00000358716 5920 ntTSL 1 (best) BASIC21.25■□□□□ 0.99
TCEA2Q15560 BCKDHB-203ENST00000369760 743 ntTSL 3 BASIC21.25■□□□□ 0.99
TCEA2Q15560 SMIM12-202ENST00000423898 897 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.25■□□□□ 0.99
TCEA2Q15560 AC079140.4-201ENST00000507448 529 ntBASIC21.25■□□□□ 0.99
TCEA2Q15560 CPNE2-202ENST00000535318 2316 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.25■□□□□ 0.99
TCEA2Q15560 TRIM2-212ENST00000632856 656 ntTSL 3 BASIC21.25■□□□□ 0.99
TCEA2Q15560 KCNQ4-204ENST00000509682 1926 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.25■□□□□ 0.99
TCEA2Q15560 SKI-201ENST00000378536 5613 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.25■□□□□ 0.99
TCEA2Q15560 NOXO1-201ENST00000354249 1618 ntTSL 1 (best) BASIC21.25■□□□□ 0.99
TCEA2Q15560 ARMC10-204ENST00000425331 2443 ntTSL 2 BASIC21.25■□□□□ 0.99
TCEA2Q15560 OXCT2-201ENST00000327582 1826 ntAPPRIS P1 BASIC21.25■□□□□ 0.99
TCEA2Q15560 CACNB1-201ENST00000344140 1889 ntTSL 1 (best) BASIC21.24■□□□□ 0.99
TCEA2Q15560 DOC2A-218ENST00000616445 2065 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.24■□□□□ 0.99
TCEA2Q15560 CACNA1H-202ENST00000358590 8069 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.24■□□□□ 0.99
TCEA2Q15560 ZNF668-205ENST00000426488 2282 ntTSL 5 BASIC21.24■□□□□ 0.99
TCEA2Q15560 STYXL1-204ENST00000360591 1127 ntTSL 5 BASIC21.24■□□□□ 0.99
TCEA2Q15560 FAM66D-201ENST00000434078 918 ntTSL 5 BASIC21.24■□□□□ 0.99
TCEA2Q15560 FGF12-AS2-201ENST00000443165 580 ntTSL 4 BASIC21.24■□□□□ 0.99
TCEA2Q15560 AP001363.2-201ENST00000538101 391 ntTSL 3 BASIC21.24■□□□□ 0.99
TCEA2Q15560 AP003071.3-201ENST00000562506 366 ntTSL 3 BASIC21.24■□□□□ 0.99
TCEA2Q15560 SERBP1-202ENST00000370990 1621 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.24■□□□□ 0.99
TCEA2Q15560 SRPK3-202ENST00000370101 1958 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.24■□□□□ 0.99
TCEA2Q15560 WRNIP1-205ENST00000618555 2651 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.24■□□□□ 0.99
TCEA2Q15560 VPS53-211ENST00000571805 2356 ntTSL 1 (best) BASIC21.24■□□□□ 0.99
TCEA2Q15560 TTLL11-202ENST00000373776 2012 ntTSL 1 (best) BASIC21.24■□□□□ 0.99
TCEA2Q15560 CCDC96-201ENST00000310085 2091 ntAPPRIS P1 BASIC21.24■□□□□ 0.99
TCEA2Q15560 HIRA-201ENST00000263208 4053 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.24■□□□□ 0.99
TCEA2Q15560 HADH-201ENST00000309522 1912 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.23■□□□□ 0.99
TCEA2Q15560 MAPK12-211ENST00000622558 1779 ntTSL 1 (best) BASIC21.23■□□□□ 0.99
TCEA2Q15560 NRG2-201ENST00000289409 2535 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.23■□□□□ 0.99
TCEA2Q15560 SIAH2-201ENST00000312960 2517 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.23■□□□□ 0.99
TCEA2Q15560 HMGA2-203ENST00000393578 1993 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.23■□□□□ 0.99
TCEA2Q15560 STOML1-201ENST00000316900 2169 ntTSL 2 BASIC21.23■□□□□ 0.99
TCEA2Q15560 RBPMS2-201ENST00000300069 2008 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.23■□□□□ 0.99
TCEA2Q15560 AIDA-202ENST00000355727 1072 ntTSL 5 BASIC21.23■□□□□ 0.99
TCEA2Q15560 STX7-201ENST00000367937 1090 ntTSL 5 BASIC21.23■□□□□ 0.99
TCEA2Q15560 LTC4S-202ENST00000401985 486 ntTSL 3 BASIC21.23■□□□□ 0.99
TCEA2Q15560 AC073343.2-201ENST00000413182 548 ntTSL 4 BASIC21.23■□□□□ 0.99
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