Protein–RNA interactions for Protein: Q15054

POLD3, DNA polymerase delta subunit 3, humanhuman

Predicted RBP Predictions only

Length 466 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
POLD3Q15054 ACSF2-207ENST00000504392 1881 ntTSL 2 BASIC22.17■■□□□ 1.14
POLD3Q15054 C22orf34-203ENST00000405854 1593 ntTSL 5 BASIC22.16■■□□□ 1.14
POLD3Q15054 MFSD7-209ENST00000515118 1556 ntTSL 5 BASIC22.16■■□□□ 1.14
POLD3Q15054 CACNA1H-210ENST00000638323 8048 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.16■■□□□ 1.14
POLD3Q15054 SNHG7-201ENST00000414282 2357 ntTSL 2 BASIC22.16■■□□□ 1.14
POLD3Q15054 JTB-203ENST00000368589 1216 ntTSL 2 BASIC22.16■■□□□ 1.14
POLD3Q15054 RNF208-201ENST00000391553 1077 ntAPPRIS P1 BASIC22.16■■□□□ 1.14
POLD3Q15054 CNN3-201ENST00000370206 2165 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.16■■□□□ 1.14
POLD3Q15054 DPP7-201ENST00000371579 1590 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.16■■□□□ 1.14
POLD3Q15054 GUSBP5-202ENST00000510805 1989 ntBASIC22.16■■□□□ 1.14
POLD3Q15054 AC092490.1-203ENST00000514568 1972 ntTSL 1 (best) BASIC22.16■■□□□ 1.14
POLD3Q15054 TBC1D22A-206ENST00000407381 1949 ntTSL 5 BASIC22.16■■□□□ 1.14
POLD3Q15054 TBR1-202ENST00000410035 1454 ntTSL 2 BASIC22.15■■□□□ 1.14
POLD3Q15054 ADAD2-201ENST00000268624 2283 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC22.15■■□□□ 1.14
POLD3Q15054 NEK6-214ENST00000545174 2573 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.15■■□□□ 1.14
POLD3Q15054 KCNK13-201ENST00000282146 2522 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.15■■□□□ 1.14
POLD3Q15054 HSPB2-201ENST00000304298 1335 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.15■■□□□ 1.14
POLD3Q15054 MPST-204ENST00000404393 1329 ntTSL 5 BASIC22.15■■□□□ 1.14
POLD3Q15054 UQCR11-203ENST00000591899 1324 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.15■■□□□ 1.14
POLD3Q15054 CMPK2-202ENST00000404168 2042 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.15■■□□□ 1.14
POLD3Q15054 CYC1-201ENST00000318911 1240 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.15■■□□□ 1.14
POLD3Q15054 TESC-201ENST00000335209 1041 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.15■■□□□ 1.14
POLD3Q15054 FAM219A-202ENST00000379078 770 ntTSL 3 BASIC22.15■■□□□ 1.14
POLD3Q15054 MFF-208ENST00000409616 1247 ntTSL 5 BASIC22.15■■□□□ 1.14
POLD3Q15054 BCL11B-203ENST00000443726 2599 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.15■■□□□ 1.14
POLD3Q15054 MAPK8IP1P2-201ENST00000580257 1472 ntBASIC22.15■■□□□ 1.14
POLD3Q15054 VAV3-202ENST00000370056 4990 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.15■■□□□ 1.14
POLD3Q15054 CAPG-201ENST00000263867 1442 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.14■■□□□ 1.14
POLD3Q15054 MTX2-201ENST00000249442 1364 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.14■■□□□ 1.14
POLD3Q15054 AQP6-201ENST00000315520 1398 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.14■■□□□ 1.14
POLD3Q15054 AK1-201ENST00000223836 736 ntTSL 3 BASIC22.14■■□□□ 1.13
POLD3Q15054 CCDC160-201ENST00000370809 1299 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.14■■□□□ 1.13
POLD3Q15054 AL355877.1-204ENST00000451482 1078 ntTSL 1 (best) BASIC22.14■■□□□ 1.13
POLD3Q15054 ZNF696-205ENST00000521537 705 ntTSL 2 BASIC22.14■■□□□ 1.13
POLD3Q15054 AC012313.1-203ENST00000597980 570 ntTSL 4 BASIC22.14■■□□□ 1.13
POLD3Q15054 MIR6084-201ENST00000622012 110 ntBASIC22.14■■□□□ 1.13
POLD3Q15054 WDR86-207ENST00000621812 1542 ntTSL 5 BASIC22.14■■□□□ 1.13
POLD3Q15054 IER2-201ENST00000292433 2085 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.13■■□□□ 1.13
POLD3Q15054 GPRC5B-210ENST00000569847 1830 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC22.13■■□□□ 1.13
POLD3Q15054 CDIPT-210ENST00000570016 1346 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.13■■□□□ 1.13
POLD3Q15054 RDX-204ENST00000528498 2511 ntTSL 1 (best) BASIC22.13■■□□□ 1.13
POLD3Q15054 HMBS-201ENST00000278715 1501 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.13■■□□□ 1.13
POLD3Q15054 NIPSNAP1-201ENST00000216121 2237 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.13■■□□□ 1.13
POLD3Q15054 GAS2L1-206ENST00000610653 2238 ntTSL 1 (best) BASIC22.13■■□□□ 1.13
POLD3Q15054 PCSK1N-201ENST00000218230 1050 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.13■■□□□ 1.13
POLD3Q15054 URAD-201ENST00000332715 931 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.13■■□□□ 1.13
POLD3Q15054 ORMDL1-202ENST00000392349 1137 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.13■■□□□ 1.13
POLD3Q15054 JARID2-AS1-201ENST00000441978 455 ntTSL 1 (best) BASIC22.13■■□□□ 1.13
POLD3Q15054 PRKCQ-AS1-204ENST00000455810 920 ntTSL 2 BASIC22.13■■□□□ 1.13
POLD3Q15054 PTGDR-202ENST00000553372 1216 ntTSL 3 BASIC22.13■■□□□ 1.13
POLD3Q15054 TUNAR-203ENST00000554321 767 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC22.13■■□□□ 1.13
POLD3Q15054 SCRT2-201ENST00000246104 3577 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.13■■□□□ 1.13
POLD3Q15054 NEURL4-201ENST00000315614 5182 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.13■■□□□ 1.13
POLD3Q15054 ARL2BP-201ENST00000219204 2130 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.13■■□□□ 1.13
POLD3Q15054 CCM2-206ENST00000474617 1532 ntTSL 5 BASIC22.12■■□□□ 1.13
POLD3Q15054 CCKBR-206ENST00000532715 1734 ntTSL 3 BASIC22.12■■□□□ 1.13
POLD3Q15054 DPH1-203ENST00000570477 1747 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.12■■□□□ 1.13
POLD3Q15054 TPM4-201ENST00000300933 2666 ntTSL 1 (best) BASIC22.12■■□□□ 1.13
POLD3Q15054 CELF5-201ENST00000292672 1854 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.12■■□□□ 1.13
POLD3Q15054 AC074143.1-203ENST00000518227 1473 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.12■■□□□ 1.13
POLD3Q15054 C16orf86-201ENST00000403458 1267 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.12■■□□□ 1.13
POLD3Q15054 AC011446.1-201ENST00000591825 458 ntTSL 2 BASIC22.12■■□□□ 1.13
POLD3Q15054 PTPRJ-201ENST00000418331 5122 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.12■■□□□ 1.13
POLD3Q15054 AC242852.2-201ENST00000615738 1807 ntBASIC22.12■■□□□ 1.13
POLD3Q15054 STRBP-202ENST00000360998 2990 ntTSL 1 (best) BASIC22.12■■□□□ 1.13
POLD3Q15054 CNEP1R1-202ENST00000427478 2117 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.12■■□□□ 1.13
POLD3Q15054 FAM102B-201ENST00000370035 5600 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.12■■□□□ 1.13
POLD3Q15054 AVPR2-203ENST00000370049 1307 ntTSL 1 (best) BASIC22.11■■□□□ 1.13
POLD3Q15054 FOSL1-201ENST00000312562 1669 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.11■■□□□ 1.13
POLD3Q15054 CCDC28B-201ENST00000373602 1089 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.11■■□□□ 1.13
POLD3Q15054 NMRAL1-202ENST00000404295 1233 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.11■■□□□ 1.13
POLD3Q15054 AP2S1-203ENST00000593442 636 ntTSL 2 BASIC22.11■■□□□ 1.13
POLD3Q15054 MRM1-203ENST00000612760 1284 ntTSL 1 (best) BASIC22.11■■□□□ 1.13
POLD3Q15054 POLR2E-214ENST00000619917 932 ntTSL 5 BASIC22.11■■□□□ 1.13
POLD3Q15054 ASL-203ENST00000380839 1765 ntTSL 5 BASIC22.11■■□□□ 1.13
POLD3Q15054 ANKHD1-221ENST00000616482 2064 ntTSL 1 (best) BASIC22.11■■□□□ 1.13
POLD3Q15054 LGR4-201ENST00000379214 5206 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.11■■□□□ 1.13
POLD3Q15054 SOX18-201ENST00000340356 1864 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.11■■□□□ 1.13
POLD3Q15054 ALDH6A1-201ENST00000350259 1869 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.11■■□□□ 1.13
POLD3Q15054 SLC39A4-202ENST00000301305 2174 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.11■■□□□ 1.13
POLD3Q15054 ZNF511-202ENST00000361518 1520 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.11■■□□□ 1.13
POLD3Q15054 BX005040.4-201ENST00000637145 1518 ntBASIC22.11■■□□□ 1.13
POLD3Q15054 RALGPS1-207ENST00000394022 1672 ntTSL 2 BASIC22.11■■□□□ 1.13
POLD3Q15054 TRADD-202ENST00000486556 1833 ntTSL 2 BASIC22.1■■□□□ 1.13
POLD3Q15054 EFCAB1-202ENST00000433756 2286 ntTSL 2 BASIC22.1■■□□□ 1.13
POLD3Q15054 FHL3-201ENST00000373016 1647 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.1■■□□□ 1.13
POLD3Q15054 IGFBP1-202ENST00000457280 1601 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.1■■□□□ 1.13
POLD3Q15054 ELOA-201ENST00000418390 5154 ntTSL 1 (best) BASIC22.1■■□□□ 1.13
POLD3Q15054 GAL3ST1-202ENST00000401975 1791 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.1■■□□□ 1.13
POLD3Q15054 SLC30A2-201ENST00000374276 2494 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.1■■□□□ 1.13
POLD3Q15054 NT5C3AP1-201ENST00000394500 1012 ntBASIC22.1■■□□□ 1.13
POLD3Q15054 AC025164.2-201ENST00000501008 1898 ntTSL 5 BASIC22.1■■□□□ 1.13
POLD3Q15054 RITA1-202ENST00000549621 2041 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.1■■□□□ 1.13
POLD3Q15054 FAM222B-213ENST00000583522 556 ntTSL 2 BASIC22.1■■□□□ 1.13
POLD3Q15054 AL138963.3-201ENST00000610057 588 ntTSL 4 BASIC22.1■■□□□ 1.13
POLD3Q15054 TPRN-202ENST00000409012 2718 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.1■■□□□ 1.13
POLD3Q15054 SNRK-203ENST00000437827 1995 ntTSL 2 BASIC22.1■■□□□ 1.13
POLD3Q15054 FASTK-212ENST00000482571 1764 ntTSL 1 (best) BASIC22.1■■□□□ 1.13
POLD3Q15054 PRR16-202ENST00000407149 1747 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.09■■□□□ 1.13
POLD3Q15054 TMEM235-205ENST00000586400 2272 ntTSL 1 (best) BASIC22.09■■□□□ 1.13
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 23.3 ms