Protein–RNA interactions for Protein: Q15036

SNX17, Sorting nexin-17, humanhuman

Predictions only

Length 470 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SNX17Q15036 ID2-201ENST00000234091 2041 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.19■■□□□ 1.46
SNX17Q15036 C5orf49-201ENST00000399810 2385 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.19■■□□□ 1.46
SNX17Q15036 AC099522.1-201ENST00000505955 881 ntTSL 3 BASIC24.19■■□□□ 1.46
SNX17Q15036 AL731577.2-201ENST00000508096 555 ntTSL 2 BASIC24.19■■□□□ 1.46
SNX17Q15036 MYCNOS-205ENST00000641950 531 ntBASIC24.19■■□□□ 1.46
SNX17Q15036 SEPT4-205ENST00000426861 1906 ntTSL 1 (best) BASIC24.19■■□□□ 1.46
SNX17Q15036 ZC3H14-202ENST00000302216 2560 ntTSL 1 (best) BASIC24.19■■□□□ 1.46
SNX17Q15036 CNN2P6-201ENST00000439038 900 ntBASIC24.18■■□□□ 1.46
SNX17Q15036 AC108693.2-201ENST00000492981 303 ntTSL 3 BASIC24.18■■□□□ 1.46
SNX17Q15036 AC133552.2-202ENST00000575694 574 ntBASIC24.18■■□□□ 1.46
SNX17Q15036 ADARB2-202ENST00000381310 1810 ntTSL 1 (best) BASIC24.18■■□□□ 1.46
SNX17Q15036 EPCAM-202ENST00000405271 1530 ntTSL 5 BASIC24.18■■□□□ 1.46
SNX17Q15036 AC096677.1-201ENST00000454651 1516 ntTSL 2 BASIC24.18■■□□□ 1.46
SNX17Q15036 CAMK2N1-201ENST00000375078 2336 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.18■■□□□ 1.46
SNX17Q15036 NFKBIE-201ENST00000275015 2581 ntTSL 1 (best) BASIC24.18■■□□□ 1.46
SNX17Q15036 ZDHHC1-201ENST00000348579 2047 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.18■■□□□ 1.46
SNX17Q15036 RCC2-201ENST00000375433 2030 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.18■■□□□ 1.46
SNX17Q15036 GUK1-201ENST00000312726 1084 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.17■■□□□ 1.46
SNX17Q15036 KHDRBS1-204ENST00000492989 1215 ntTSL 1 (best) BASIC24.17■■□□□ 1.46
SNX17Q15036 ABCC6P2-202ENST00000542005 706 ntTSL 1 (best) BASIC24.17■■□□□ 1.46
SNX17Q15036 AC034102.6-201ENST00000550947 559 ntTSL 4 BASIC24.17■■□□□ 1.46
SNX17Q15036 NDUFB10-204ENST00000569148 628 ntTSL 2 BASIC24.17■■□□□ 1.46
SNX17Q15036 ABCC6-204ENST00000575728 714 ntTSL 1 (best) BASIC24.17■■□□□ 1.46
SNX17Q15036 FAM124A-204ENST00000615498 2383 ntTSL 1 (best) BASIC24.17■■□□□ 1.46
SNX17Q15036 AK8-201ENST00000298545 2072 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.17■■□□□ 1.46
SNX17Q15036 CORO1A-201ENST00000219150 1803 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.17■■□□□ 1.46
SNX17Q15036 SMOX-202ENST00000305958 2233 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.16■■□□□ 1.46
SNX17Q15036 TMEM185B-201ENST00000426077 2131 ntAPPRIS P1 BASIC24.16■■□□□ 1.46
SNX17Q15036 RORB-AS1-201ENST00000417576 1178 ntTSL 5 BASIC24.16■■□□□ 1.46
SNX17Q15036 AF201337.1-201ENST00000520239 748 ntBASIC24.16■■□□□ 1.46
SNX17Q15036 BRI3-207ENST00000539286 699 ntTSL 2 BASIC24.16■■□□□ 1.46
SNX17Q15036 AC098934.4-201ENST00000564127 592 ntBASIC24.16■■□□□ 1.46
SNX17Q15036 TRAPPC6A-205ENST00000592647 514 ntTSL 2 BASIC24.16■■□□□ 1.46
SNX17Q15036 RAPSN-205ENST00000529341 1408 ntTSL 1 (best) BASIC24.16■■□□□ 1.46
SNX17Q15036 MPND-202ENST00000359935 1475 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC24.15■■□□□ 1.46
SNX17Q15036 C19orf81-201ENST00000425202 765 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC24.15■■□□□ 1.46
SNX17Q15036 NMRAL1-212ENST00000574425 1240 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.15■■□□□ 1.46
SNX17Q15036 JADE2-211ENST00000612830 1251 ntTSL 1 (best) BASIC24.15■■□□□ 1.46
SNX17Q15036 ITM2C-210ENST00000620962 501 ntBASIC24.15■■□□□ 1.46
SNX17Q15036 PIP5K1C-203ENST00000539785 2289 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC24.15■■□□□ 1.46
SNX17Q15036 CENPN-201ENST00000299572 1398 ntTSL 1 (best) BASIC24.15■■□□□ 1.46
SNX17Q15036 RHOQ-201ENST00000238738 2975 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.15■■□□□ 1.46
SNX17Q15036 FMR1-AS1-202ENST00000596112 1845 ntTSL 1 (best) BASIC24.14■■□□□ 1.46
SNX17Q15036 STX4-201ENST00000313843 1481 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.14■■□□□ 1.46
SNX17Q15036 NPHS2-201ENST00000367615 1855 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.14■■□□□ 1.45
SNX17Q15036 AC009237.3-201ENST00000393279 1427 ntBASIC24.14■■□□□ 1.45
SNX17Q15036 POU5F1P3-201ENST00000428824 1078 ntBASIC24.14■■□□□ 1.45
SNX17Q15036 SNHG6-203ENST00000520944 638 ntTSL 1 (best) BASIC24.14■■□□□ 1.45
SNX17Q15036 COX6C-208ENST00000522940 694 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC24.14■■□□□ 1.45
SNX17Q15036 ZBTB42-202ENST00000555360 1411 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.14■■□□□ 1.45
SNX17Q15036 UBE3C-209ENST00000611269 1866 ntTSL 2 BASIC24.14■■□□□ 1.45
SNX17Q15036 CREB3L3-202ENST00000595923 1491 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.13■■□□□ 1.45
SNX17Q15036 HOXD9-201ENST00000249499 1870 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.13■■□□□ 1.45
SNX17Q15036 TSPAN4-206ENST00000397408 1430 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.13■■□□□ 1.45
SNX17Q15036 ACOT8-201ENST00000217455 1168 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.13■■□□□ 1.45
SNX17Q15036 CAPN10-202ENST00000270364 1267 ntTSL 2 BASIC24.13■■□□□ 1.45
SNX17Q15036 ARL6IP4-205ENST00000412505 818 ntTSL 5 BASIC24.13■■□□□ 1.45
SNX17Q15036 ZNF295-AS1-201ENST00000412906 952 ntTSL 1 (best) BASIC24.13■■□□□ 1.45
SNX17Q15036 FAM229A-204ENST00000432622 699 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC24.13■■□□□ 1.45
SNX17Q15036 ZSWIM7-205ENST00000472495 703 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.13■■□□□ 1.45
SNX17Q15036 OSR2-210ENST00000523368 1519 ntTSL 1 (best) BASIC24.13■■□□□ 1.45
SNX17Q15036 CASP9-203ENST00000375890 1351 ntTSL 2 BASIC24.13■■□□□ 1.45
SNX17Q15036 NOCT-201ENST00000280614 1952 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.12■■□□□ 1.45
SNX17Q15036 ZNF837-202ENST00000597582 1969 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.12■■□□□ 1.45
SNX17Q15036 MAP2K5-204ENST00000395476 1689 ntTSL 1 (best) BASIC24.12■■□□□ 1.45
SNX17Q15036 HMGA2-206ENST00000536545 1788 ntTSL 1 (best) BASIC24.12■■□□□ 1.45
SNX17Q15036 HRASLS5-201ENST00000301790 1166 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.12■■□□□ 1.45
SNX17Q15036 ULK4P1-204ENST00000565949 721 ntTSL 4 BASIC24.12■■□□□ 1.45
SNX17Q15036 AC068987.5-201ENST00000642069 987 ntAPPRIS P1 BASIC24.12■■□□□ 1.45
SNX17Q15036 USP45-205ENST00000472914 1617 ntTSL 5 BASIC24.12■■□□□ 1.45
SNX17Q15036 DACT2-203ENST00000607983 1620 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.12■■□□□ 1.45
SNX17Q15036 RAD9A-201ENST00000307980 2119 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.11■■□□□ 1.45
SNX17Q15036 GPR161-203ENST00000367836 1983 ntTSL 2 BASIC24.11■■□□□ 1.45
SNX17Q15036 HBM-201ENST00000356815 506 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.11■■□□□ 1.45
SNX17Q15036 APTR-203ENST00000430801 583 ntTSL 5 BASIC24.11■■□□□ 1.45
SNX17Q15036 AC105036.2-201ENST00000569468 176 ntBASIC24.11■■□□□ 1.45
SNX17Q15036 AP001160.3-201ENST00000601484 763 ntBASIC24.11■■□□□ 1.45
SNX17Q15036 CD99-212ENST00000624481 1089 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC24.11■■□□□ 1.45
SNX17Q15036 AGBL5-201ENST00000323064 2382 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.11■■□□□ 1.45
SNX17Q15036 DCPS-201ENST00000263579 1479 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.11■■□□□ 1.45
SNX17Q15036 TMCC2-209ENST00000637895 1455 ntTSL 1 (best) BASIC24.11■■□□□ 1.45
SNX17Q15036 ATG101-201ENST00000336854 1439 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.1■■□□□ 1.45
SNX17Q15036 IL15RA-204ENST00000379977 1626 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.1■■□□□ 1.45
SNX17Q15036 PTPN2-202ENST00000327283 1706 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.1■■□□□ 1.45
SNX17Q15036 NAE1-202ENST00000359087 1825 ntTSL 2 BASIC24.1■■□□□ 1.45
SNX17Q15036 BTBD7-201ENST00000298896 2621 ntTSL 1 (best) BASIC24.1■■□□□ 1.45
SNX17Q15036 CEACAM4-201ENST00000221954 1205 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.1■■□□□ 1.45
SNX17Q15036 CIRBP-214ENST00000587896 1081 ntTSL 2 BASIC24.1■■□□□ 1.45
SNX17Q15036 CEACAM4-203ENST00000600925 899 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC24.1■■□□□ 1.45
SNX17Q15036 SIRT3-202ENST00000524564 1395 ntTSL 2 BASIC24.1■■□□□ 1.45
SNX17Q15036 SGMS1-210ENST00000619438 1680 ntTSL 5 BASIC24.1■■□□□ 1.45
SNX17Q15036 AGTR1-203ENST00000404754 2252 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.1■■□□□ 1.45
SNX17Q15036 PINK1-201ENST00000321556 2660 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.1■■□□□ 1.45
SNX17Q15036 C12orf42-208ENST00000548883 1336 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.1■■□□□ 1.45
SNX17Q15036 KDF1-201ENST00000320567 1793 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.09■■□□□ 1.45
SNX17Q15036 ASPSCR1-208ENST00000580534 1776 ntTSL 2 BASIC24.09■■□□□ 1.45
SNX17Q15036 MRPL39-201ENST00000307301 1199 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.09■■□□□ 1.45
SNX17Q15036 MRPL39-202ENST00000352957 1110 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.09■■□□□ 1.45
SNX17Q15036 MDK-205ENST00000405308 1166 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC24.09■■□□□ 1.45
SNX17Q15036 C5orf58-204ENST00000521850 2113 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.09■■□□□ 1.45
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 38.9 ms