Protein–RNA interactions for Protein: Q15029

EFTUD2, 116 kDa U5 small nuclear ribonucleoprotein component, humanhuman

Known RBP eCLIP

Length 972 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
EFTUD2Q15029 TARBP2-219ENST00000552817 668 ntTSL 311.31□□□□□ -0.69e-8■■■■■ 44.4
EFTUD2Q15029 TARBP2-206ENST00000547064 759 ntTSL 310.65□□□□□ -0.79e-8■■■■■ 44.4
EFTUD2Q15029 TARBP2-208ENST00000547541 430 ntTSL 310.18□□□□□ -0.789e-8■■■■■ 44.4
EFTUD2Q15029 SLC25A10-204ENST00000570310 595 ntTSL 314□□□□□ -0.176e-9■■■■■ 44.4
EFTUD2Q15029 DNPEP-221ENST00000523527 565 ntTSL 215.21■□□□□ 0.032e-8■■■■■ 44.4
EFTUD2Q15029 DNPEP-207ENST00000430206 577 ntTSL 313.43□□□□□ -0.262e-8■■■■■ 44.4
EFTUD2Q15029 DNPEP-217ENST00000520694 673 ntTSL 312.26□□□□□ -0.452e-8■■■■■ 44.4
EFTUD2Q15029 PUF60-222ENST00000533362 616 ntTSL 521.76■■□□□ 1.072e-11■■■■■ 44.4
EFTUD2Q15029 TRIM28-205ENST00000595028 486 ntTSL 214.35□□□□□ -0.112e-15■■■■■ 44.3
EFTUD2Q15029 PTMA-206ENST00000412128 863 ntTSL 323.01■■□□□ 1.273e-7■■■■■ 44.3
EFTUD2Q15029 SNHG1-203ENST00000537024 532 ntTSL 53.34□□□□□ -1.872e-44■■■■■ 44.3
EFTUD2Q15029 DBN1-201ENST00000292385 3072 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC18.89■□□□□ 0.619e-7■■■■■ 44.3
EFTUD2Q15029 DBN1-206ENST00000472831 2667 ntTSL 217.21■□□□□ 0.359e-7■■■■■ 44.3
EFTUD2Q15029 DBN1-207ENST00000477391 1044 ntAPPRIS ALT2 TSL 316.85■□□□□ 0.299e-7■■■■■ 44.3
EFTUD2Q15029 DBN1-202ENST00000309007 2995 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.81■□□□□ 0.289e-7■■■■■ 44.3
EFTUD2Q15029 MED25-204ENST00000593636 1012 ntTSL 216.79■□□□□ 0.286e-8■■■■■ 44.3
EFTUD2Q15029 DBN1-209ENST00000506117 477 ntTSL 415.66■□□□□ 0.11e-6■■■■■ 44.3
EFTUD2Q15029 DBN1-203ENST00000393565 2701 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.02■□□□□ -09e-7■■■■■ 44.3
EFTUD2Q15029 RAD9A-203ENST00000530934 1256 ntTSL 213.58□□□□□ -0.244e-7■■■■■ 44.3
EFTUD2Q15029 DBN1-211ENST00000514833 456 ntAPPRIS ALT2 TSL 413.05□□□□□ -0.321e-6■■■■■ 44.3
EFTUD2Q15029 DBN1-208ENST00000505550 534 ntTSL 212.91□□□□□ -0.341e-6■■■■■ 44.3
EFTUD2Q15029 PHKG2-202ENST00000424889 1566 ntTSL 2 BASIC18.42■□□□□ 0.541e-8■■■■■ 44.3
EFTUD2Q15029 PHKG2-204ENST00000563588 5539 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.34■□□□□ 0.211e-8■■■■■ 44.3
EFTUD2Q15029 PHKG2-201ENST00000328273 1536 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC16.05■□□□□ 0.161e-8■■■■■ 44.3
EFTUD2Q15029 PHKG2-207ENST00000564838 1618 ntTSL 215.21■□□□□ 0.021e-8■■■■■ 44.3
EFTUD2Q15029 PHKG2-206ENST00000563913 1791 ntTSL 514.53□□□□□ -0.081e-8■■■■■ 44.3
EFTUD2Q15029 ULK1-206ENST00000542313 307 ntTSL 311.28□□□□□ -0.62e-10■■■■■ 44.3
EFTUD2Q15029 QARS-229ENST00000634473 643 ntTSL 510.25□□□□□ -0.772e-10■■■■■ 44.3
EFTUD2Q15029 SLC51A-205ENST00000442203 568 ntTSL 48.15□□□□□ -1.12e-10■■■■■ 44.3
EFTUD2Q15029 SCAF4-204ENST00000467731 2976 ntTSL 1 (best)6.83□□□□□ -1.322e-10■■■■■ 44.3
EFTUD2Q15029 QARS-210ENST00000466179 334 ntTSL 35.2□□□□□ -1.582e-10■■■■■ 44.3
EFTUD2Q15029 PHKG2-203ENST00000561712 621 ntTSL 38.24□□□□□ -1.091e-8■■■■■ 44.3
EFTUD2Q15029 ZC3H14-204ENST00000336693 2007 ntTSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.017e-8■■■■■ 44.3
EFTUD2Q15029 MRPL55-208ENST00000366734 990 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.49■□□□□ 0.076e-13■■■■■ 44.2
EFTUD2Q15029 CXXC1-202ENST00000412036 2280 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.43■□□□□ 0.542e-7■■■■■ 44.2
EFTUD2Q15029 CXXC1-212ENST00000589940 2242 ntTSL 1 (best) BASIC17.57■□□□□ 0.42e-7■■■■■ 44.2
EFTUD2Q15029 CXXC1-201ENST00000285106 2936 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.52■□□□□ 0.42e-7■■■■■ 44.2
EFTUD2Q15029 SF3A3-203ENST00000461869 776 ntTSL 315.3■□□□□ 0.041e-7■■■■■ 44.2
EFTUD2Q15029 SF3A3-201ENST00000373019 3673 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.07□□□□□ -0.81e-7■■■■■ 44.2
EFTUD2Q15029 SF3A3-204ENST00000462258 527 ntTSL 29.61□□□□□ -0.875e-8■■■■■ 44.2
EFTUD2Q15029 SF3A3-205ENST00000470585 704 ntTSL 36.29□□□□□ -1.41e-7■■■■■ 44.2
EFTUD2Q15029 EHBP1L1-207ENST00000531106 176 ntTSL 35.66□□□□□ -1.56e-11■■■■■ 44.2
EFTUD2Q15029 ZNF160-207ENST00000597112 1728 ntTSL 217■□□□□ 0.315e-29■■■■■ 44.2
EFTUD2Q15029 ZNF160-210ENST00000599637 565 ntTSL 415.56■□□□□ 0.085e-29■■■■■ 44.2
EFTUD2Q15029 ZNF160-216ENST00000602095 617 ntTSL 313.84□□□□□ -0.195e-29■■■■■ 44.2
EFTUD2Q15029 ZNF160-206ENST00000596966 583 ntTSL 312.65□□□□□ -0.385e-29■■■■■ 44.2
EFTUD2Q15029 ZNF160-213ENST00000600924 605 ntTSL 411.29□□□□□ -0.65e-29■■■■■ 44.2
EFTUD2Q15029 ZNF160-201ENST00000355147 1304 ntTSL 1 (best) BASIC8.85□□□□□ -0.995e-29■■■■■ 44.2
EFTUD2Q15029 ZNF160-209ENST00000599247 1926 ntTSL 1 (best)7.62□□□□□ -1.195e-29■■■■■ 44.2
EFTUD2Q15029 ZNF160-204ENST00000594760 549 ntTSL 47.42□□□□□ -1.225e-29■■■■■ 44.2
EFTUD2Q15029 ZNF160-208ENST00000599056 4229 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.22□□□□□ -1.255e-29■■■■■ 44.2
EFTUD2Q15029 ZNF160-202ENST00000418871 4219 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.62□□□□□ -1.355e-29■■■■■ 44.2
EFTUD2Q15029 ZNF160-203ENST00000429604 4336 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC6.15□□□□□ -1.425e-29■■■■■ 44.2
EFTUD2Q15029 LSM7-201ENST00000252622 529 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24■■□□□ 1.437e-16■■■■■ 44.2
EFTUD2Q15029 LSM7-205ENST00000589532 539 ntTSL 322.34■■□□□ 1.177e-16■■■■■ 44.2
EFTUD2Q15029 LSM7-202ENST00000585395 621 ntTSL 322.34■■□□□ 1.177e-16■■■■■ 44.2
EFTUD2Q15029 LSM7-206ENST00000591515 710 ntTSL 222.34■■□□□ 1.177e-16■■■■■ 44.2
EFTUD2Q15029 LSM7-203ENST00000585409 512 ntTSL 2 BASIC22.34■■□□□ 1.177e-16■■■■■ 44.2
EFTUD2Q15029 LSM7-204ENST00000587502 575 ntTSL 1 (best) BASIC21.98■■□□□ 1.117e-16■■■■■ 44.2
EFTUD2Q15029 SMTN-202ENST00000347557 3130 ntTSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.067e-8■■■■■ 44.2
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EFTUD2Q15029 SMTN-203ENST00000358743 3198 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC13.91□□□□□ -0.187e-8■■■■■ 44.2
EFTUD2Q15029 SMTN-218ENST00000489337 3560 ntTSL 212.21□□□□□ -0.467e-8■■■■■ 44.2
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EFTUD2Q15029 LLGL2-221ENST00000583514 409 ntTSL 314.83□□□□□ -0.045e-7■■■■■ 44.1
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EFTUD2Q15029 KRT8-204ENST00000546826 1165 ntTSL 517.04■□□□□ 0.327e-8■■■■■ 44
EFTUD2Q15029 KRT8-209ENST00000547176 250 ntTSL 512.97□□□□□ -0.337e-8■■■■■ 44
EFTUD2Q15029 KRT8-211ENST00000549176 770 ntTSL 210.6□□□□□ -0.717e-8■■■■■ 44
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EFTUD2Q15029 RALGDS-202ENST00000372050 3634 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.192e-7■■■■■ 44
EFTUD2Q15029 RALGDS-201ENST00000372047 3598 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.152e-7■■■■■ 44
EFTUD2Q15029 RALGDS-213ENST00000493438 4602 ntTSL 215.51■□□□□ 0.072e-7■■■■■ 44
EFTUD2Q15029 RALGDS-211ENST00000482648 5596 ntTSL 215.29■□□□□ 0.042e-7■■■■■ 44
EFTUD2Q15029 RALGDS-208ENST00000469972 5817 ntTSL 1 (best)14.79□□□□□ -0.042e-7■■■■■ 44
EFTUD2Q15029 RALGDS-203ENST00000372062 3596 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC13.81□□□□□ -0.22e-7■■■■■ 44
EFTUD2Q15029 RALGDS-204ENST00000393157 3689 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC10.46□□□□□ -0.732e-7■■■■■ 44
EFTUD2Q15029 PNKP-217ENST00000625216 629 ntTSL 512.49□□□□□ -0.411e-8■■■■■ 44
EFTUD2Q15029 HYOU1-207ENST00000530473 2023 ntTSL 514.16□□□□□ -0.144e-7■■■■■ 44
EFTUD2Q15029 ZNRF1-208ENST00000568494 2046 ntTSL 213.76□□□□□ -0.214e-7■■■■■ 44
EFTUD2Q15029 ZNRF1-207ENST00000568351 964 ntTSL 313.36□□□□□ -0.274e-7■■■■■ 44
EFTUD2Q15029 VARS-226ENST00000483275 450 ntTSL 312.83□□□□□ -0.364e-7■■■■■ 44
EFTUD2Q15029 ZNRF1-211ENST00000579084 571 ntTSL 511.74□□□□□ -0.534e-7■■■■■ 44
EFTUD2Q15029 ZNRF1-204ENST00000566244 3980 nt10.58□□□□□ -0.714e-7■■■■■ 44
EFTUD2Q15029 ZNRF1-203ENST00000564320 607 ntTSL 38.06□□□□□ -1.124e-7■■■■■ 44
EFTUD2Q15029 SHMT2-232ENST00000557487 1918 ntTSL 1 (best) BASIC17.03■□□□□ 0.324e-8■■■■■ 44
EFTUD2Q15029 SHMT2-231ENST00000557433 1904 ntTSL 1 (best)17.03■□□□□ 0.324e-8■■■■■ 44
EFTUD2Q15029 SHMT2-202ENST00000414700 2006 ntTSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.084e-8■■■■■ 44
EFTUD2Q15029 SHMT2-226ENST00000556825 2215 ntTSL 1 (best)14.51□□□□□ -0.094e-8■■■■■ 44
EFTUD2Q15029 SHMT2-222ENST00000555774 2311 ntTSL 1 (best)14.1□□□□□ -0.154e-8■■■■■ 44
EFTUD2Q15029 SHMT2-203ENST00000449049 2121 ntTSL 2 BASIC13.99□□□□□ -0.174e-8■■■■■ 44
EFTUD2Q15029 SHMT2-217ENST00000555116 1885 ntTSL 213.72□□□□□ -0.214e-8■■■■■ 44
EFTUD2Q15029 SHMT2-205ENST00000553474 1765 ntTSL 2 BASIC13.39□□□□□ -0.274e-8■■■■■ 44
EFTUD2Q15029 SHMT2-229ENST00000557348 1659 ntTSL 212.86□□□□□ -0.354e-8■■■■■ 44
EFTUD2Q15029 SHMT2-207ENST00000553837 2152 ntTSL 512.67□□□□□ -0.384e-8■■■■■ 44
EFTUD2Q15029 SHMT2-201ENST00000328923 2537 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.45□□□□□ -0.424e-8■■■■■ 44
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