Protein–RNA interactions for Protein: Q15021

NCAPD2, Condensin complex subunit 1, humanhuman

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Length 1,401 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
NCAPD2Q15021 PARP1-202ENST00000366792 553 ntTSL 3 BASIC28.58■■■□□ 2.17
NCAPD2Q15021 AL355802.2-201ENST00000402069 882 ntBASIC28.58■■■□□ 2.17
NCAPD2Q15021 MMP25-204ENST00000612971 1017 ntTSL 5 BASIC28.58■■■□□ 2.17
NCAPD2Q15021 CACNB1-201ENST00000344140 1889 ntTSL 1 (best) BASIC28.58■■■□□ 2.17
NCAPD2Q15021 NELFB-201ENST00000343053 2698 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.58■■■□□ 2.17
NCAPD2Q15021 WDR86-208ENST00000628331 1905 ntTSL 5 BASIC28.58■■■□□ 2.17
NCAPD2Q15021 MSANTD3-207ENST00000622639 1748 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC28.58■■■□□ 2.17
NCAPD2Q15021 UCHL5-204ENST00000367451 1346 ntTSL 5 BASIC28.58■■■□□ 2.17
NCAPD2Q15021 CBWD6-201ENST00000377391 1792 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.57■■■□□ 2.16
NCAPD2Q15021 MSRB1-201ENST00000361871 1423 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC28.57■■■□□ 2.16
NCAPD2Q15021 AC231657.2-201ENST00000624556 255 ntBASIC28.57■■■□□ 2.16
NCAPD2Q15021 MAP6D1-201ENST00000318631 2111 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC28.57■■■□□ 2.16
NCAPD2Q15021 HSD11B1L-217ENST00000581521 1884 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC28.57■■■□□ 2.16
NCAPD2Q15021 COX5B-201ENST00000258424 712 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.56■■■□□ 2.16
NCAPD2Q15021 SERP1-208ENST00000491660 830 ntTSL 2 BASIC28.56■■■□□ 2.16
NCAPD2Q15021 AL731577.2-201ENST00000508096 555 ntTSL 2 BASIC28.56■■■□□ 2.16
NCAPD2Q15021 CAMTA1-216ENST00000557126 486 ntTSL 2 BASIC28.56■■■□□ 2.16
NCAPD2Q15021 AC106820.5-201ENST00000566085 789 ntTSL 3 BASIC28.56■■■□□ 2.16
NCAPD2Q15021 HERC2P5-204ENST00000569697 1214 ntTSL 2 BASIC28.56■■■□□ 2.16
NCAPD2Q15021 AP001160.3-201ENST00000601484 763 ntBASIC28.56■■■□□ 2.16
NCAPD2Q15021 LINC00526-201ENST00000581067 1875 ntBASIC28.56■■■□□ 2.16
NCAPD2Q15021 TYMP-202ENST00000395678 1614 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC28.55■■■□□ 2.16
NCAPD2Q15021 ABHD17AP1-201ENST00000358206 933 ntBASIC28.55■■■□□ 2.16
NCAPD2Q15021 SLC22A15-201ENST00000369502 1230 ntTSL 2 BASIC28.55■■■□□ 2.16
NCAPD2Q15021 MAGI2-AS3-209ENST00000448195 774 ntTSL 3 BASIC28.55■■■□□ 2.16
NCAPD2Q15021 WT1-AS_3.1-201ENST00000613262 234 ntBASIC28.55■■■□□ 2.16
NCAPD2Q15021 VSX1-205ENST00000429762 1977 ntTSL 1 (best) BASIC28.55■■■□□ 2.16
NCAPD2Q15021 METTL15-202ENST00000403099 795 ntTSL 5 BASIC28.54■■■□□ 2.16
NCAPD2Q15021 ZNF717-203ENST00000477374 1169 ntTSL 2 BASIC28.54■■■□□ 2.16
NCAPD2Q15021 C19orf84-201ENST00000570516 788 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.54■■■□□ 2.16
NCAPD2Q15021 AP005205.2-201ENST00000577327 491 ntTSL 2 BASIC28.54■■■□□ 2.16
NCAPD2Q15021 AC005697.1-201ENST00000582441 582 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC28.54■■■□□ 2.16
NCAPD2Q15021 TRAPPC6A-205ENST00000592647 514 ntTSL 2 BASIC28.54■■■□□ 2.16
NCAPD2Q15021 MBOAT7-201ENST00000245615 2529 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.54■■■□□ 2.16
NCAPD2Q15021 TRABD2A-203ENST00000409520 1975 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.54■■■□□ 2.16
NCAPD2Q15021 ECHDC2-221ENST00000536120 1446 ntTSL 3 BASIC28.54■■■□□ 2.16
NCAPD2Q15021 CLPTM1-201ENST00000337392 2604 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.54■■■□□ 2.16
NCAPD2Q15021 CBWD3-202ENST00000377342 1665 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.54■■■□□ 2.16
NCAPD2Q15021 BRI3-207ENST00000539286 699 ntTSL 2 BASIC28.53■■■□□ 2.16
NCAPD2Q15021 MVB12A-212ENST00000543795 1154 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC28.53■■■□□ 2.16
NCAPD2Q15021 EEF1DP3-203ENST00000566025 782 ntBASIC28.53■■■□□ 2.16
NCAPD2Q15021 ARL6IP4-204ENST00000392435 1339 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.53■■■□□ 2.16
NCAPD2Q15021 C19orf67-203ENST00000548523 1427 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC28.53■■■□□ 2.16
NCAPD2Q15021 AC074143.1-203ENST00000518227 1473 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.53■■■□□ 2.16
NCAPD2Q15021 SMAD1-201ENST00000302085 1966 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.53■■■□□ 2.16
NCAPD2Q15021 GPX1P1-201ENST00000388829 606 ntBASIC28.52■■■□□ 2.16
NCAPD2Q15021 LINC01117-201ENST00000443670 699 ntTSL 5 BASIC28.52■■■□□ 2.16
NCAPD2Q15021 ABCC6P2-202ENST00000542005 706 ntTSL 1 (best) BASIC28.52■■■□□ 2.16
NCAPD2Q15021 ABCC6-204ENST00000575728 714 ntTSL 1 (best) BASIC28.52■■■□□ 2.16
NCAPD2Q15021 LHPP-202ENST00000368842 1622 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.52■■■□□ 2.16
NCAPD2Q15021 TGIF1-206ENST00000405385 1689 ntTSL 2 BASIC28.52■■■□□ 2.16
NCAPD2Q15021 GNB2-201ENST00000303210 1878 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.52■■■□□ 2.16
NCAPD2Q15021 TANGO2-210ENST00000432883 2084 ntTSL 2 BASIC28.52■■■□□ 2.16
NCAPD2Q15021 DBP-201ENST00000222122 2229 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.52■■■□□ 2.16
NCAPD2Q15021 PDLIM2-202ENST00000308354 2236 ntTSL 1 (best) BASIC28.52■■■□□ 2.16
NCAPD2Q15021 PDLIM2-203ENST00000339162 2226 ntTSL 1 (best) BASIC28.52■■■□□ 2.16
NCAPD2Q15021 POLDIP2-201ENST00000540200 2121 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.52■■■□□ 2.16
NCAPD2Q15021 AP006587.3-201ENST00000525742 1516 ntBASIC28.52■■■□□ 2.16
NCAPD2Q15021 CREB3L3-202ENST00000595923 1491 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.52■■■□□ 2.16
NCAPD2Q15021 TMPO-201ENST00000261210 820 ntTSL 1 (best) BASIC28.52■■■□□ 2.16
NCAPD2Q15021 TSPY6P-201ENST00000448518 926 ntBASIC28.52■■■□□ 2.16
NCAPD2Q15021 CD99-212ENST00000624481 1089 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC28.52■■■□□ 2.16
NCAPD2Q15021 ALDH6A1-201ENST00000350259 1869 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC28.51■■■□□ 2.15
NCAPD2Q15021 SYT6-209ENST00000610222 1707 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC28.51■■■□□ 2.15
NCAPD2Q15021 PUS1-203ENST00000443358 1664 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.51■■■□□ 2.15
NCAPD2Q15021 CITED1-201ENST00000246139 1231 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC28.51■■■□□ 2.15
NCAPD2Q15021 SMCO4-201ENST00000298966 1104 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.51■■■□□ 2.15
NCAPD2Q15021 KANSL1-AS1-201ENST00000398275 517 ntTSL 1 (best) BASIC28.51■■■□□ 2.15
NCAPD2Q15021 CMTM8-202ENST00000458535 996 ntTSL 1 (best) BASIC28.51■■■□□ 2.15
NCAPD2Q15021 KRT18P20-201ENST00000548986 1279 ntBASIC28.51■■■□□ 2.15
NCAPD2Q15021 ARFRP1-202ENST00000607873 1061 ntTSL 2 BASIC28.51■■■□□ 2.15
NCAPD2Q15021 PARP1-210ENST00000629232 477 ntTSL 5 BASIC28.51■■■□□ 2.15
NCAPD2Q15021 NKIRAS2-206ENST00000393885 1909 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.5■■■□□ 2.15
NCAPD2Q15021 RCN2-201ENST00000320963 1750 ntTSL 5 BASIC28.5■■■□□ 2.15
NCAPD2Q15021 ARMC10-205ENST00000428183 2445 ntTSL 1 (best) BASIC28.5■■■□□ 2.15
NCAPD2Q15021 SPRTN-201ENST00000008440 1667 ntTSL 2 BASIC28.5■■■□□ 2.15
NCAPD2Q15021 ARHGAP27-201ENST00000290470 1376 ntTSL 1 (best) BASIC28.5■■■□□ 2.15
NCAPD2Q15021 BX890604.1-207ENST00000486571 904 ntTSL 5 BASIC28.5■■■□□ 2.15
NCAPD2Q15021 NDUFS3-207ENST00000529276 558 ntTSL 2 BASIC28.5■■■□□ 2.15
NCAPD2Q15021 OAS3-207ENST00000551007 998 ntTSL 2 BASIC28.5■■■□□ 2.15
NCAPD2Q15021 NDUFV2-AS1-201ENST00000582375 770 ntTSL 2 BASIC28.5■■■□□ 2.15
NCAPD2Q15021 AL121832.2-201ENST00000610979 668 ntBASIC28.5■■■□□ 2.15
NCAPD2Q15021 PHLDB3-207ENST00000599242 2286 ntTSL 1 (best) BASIC28.5■■■□□ 2.15
NCAPD2Q15021 MTMR14-202ENST00000351233 2105 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.5■■■□□ 2.15
NCAPD2Q15021 IGF2-AS-201ENST00000381361 2063 ntTSL 2 BASIC28.5■■■□□ 2.15
NCAPD2Q15021 SLC26A5-209ENST00000393735 1947 ntTSL 1 (best) BASIC28.49■■■□□ 2.15
NCAPD2Q15021 AGTR1-203ENST00000404754 2252 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.49■■■□□ 2.15
NCAPD2Q15021 AP004607.7-201ENST00000527152 1677 ntBASIC28.49■■■□□ 2.15
NCAPD2Q15021 AGBL5-201ENST00000323064 2382 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.49■■■□□ 2.15
NCAPD2Q15021 APTR-203ENST00000430801 583 ntTSL 5 BASIC28.49■■■□□ 2.15
NCAPD2Q15021 LITAF-205ENST00000570904 1118 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.49■■■□□ 2.15
NCAPD2Q15021 FAM71E1-204ENST00000600100 1281 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.49■■■□□ 2.15
NCAPD2Q15021 SSUH2-217ENST00000544814 1636 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC28.49■■■□□ 2.15
NCAPD2Q15021 CDC16-206ENST00000375310 2156 ntTSL 1 (best) BASIC28.49■■■□□ 2.15
NCAPD2Q15021 SH3YL1-201ENST00000356150 1763 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.48■■■□□ 2.15
NCAPD2Q15021 EPO-201ENST00000252723 1330 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.48■■■□□ 2.15
NCAPD2Q15021 AL034346.1-201ENST00000568244 1277 ntBASIC28.48■■■□□ 2.15
NCAPD2Q15021 AC027307.1-201ENST00000590252 457 ntTSL 5 BASIC28.48■■■□□ 2.15
NCAPD2Q15021 ELAC1-204ENST00000591429 975 ntTSL 1 (best) BASIC28.48■■■□□ 2.15
NCAPD2Q15021 AC005181.1-201ENST00000604782 1256 ntBASIC28.48■■■□□ 2.15
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