Protein–RNA interactions for Protein: Q15011

HERPUD1, Homocysteine-responsive endoplasmic reticulum-resident ubiquitin-like domain member 1 protein, humanhuman

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Length 391 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
HERPUD1Q15011 MADCAM1-205ENST00000613880 1509 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.1■□□□□ 0.49
HERPUD1Q15011 HUNK-201ENST00000270112 7385 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.1■□□□□ 0.49
HERPUD1Q15011 IDH2-202ENST00000540499 1453 ntTSL 2 BASIC18.1■□□□□ 0.49
HERPUD1Q15011 CLYBL-202ENST00000376354 1127 ntTSL 5 BASIC18.1■□□□□ 0.49
HERPUD1Q15011 SRD5A1P1-201ENST00000442297 786 ntBASIC18.1■□□□□ 0.49
HERPUD1Q15011 AC136475.3-202ENST00000534742 812 ntTSL 2 BASIC18.1■□□□□ 0.49
HERPUD1Q15011 HOXA11-AS1_1.1-201ENST00000613939 98 ntBASIC18.1■□□□□ 0.49
HERPUD1Q15011 SRRM2-231ENST00000630499 1207 ntTSL 1 (best) BASIC18.1■□□□□ 0.49
HERPUD1Q15011 DACT1-204ENST00000541264 2610 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.1■□□□□ 0.49
HERPUD1Q15011 SP9-201ENST00000394967 2554 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.1■□□□□ 0.49
HERPUD1Q15011 KIF12-207ENST00000640217 2194 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC18.1■□□□□ 0.49
HERPUD1Q15011 C18orf8-214ENST00000615148 1958 ntTSL 5 BASIC18.1■□□□□ 0.49
HERPUD1Q15011 ARRB2-201ENST00000269260 1895 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.09■□□□□ 0.49
HERPUD1Q15011 SDC3-202ENST00000339394 1580 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.09■□□□□ 0.49
HERPUD1Q15011 FBXL19-205ENST00000562319 2462 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.09■□□□□ 0.49
HERPUD1Q15011 HOXD4-201ENST00000306324 1464 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.09■□□□□ 0.49
HERPUD1Q15011 ABHD16B-201ENST00000369916 1491 ntAPPRIS P1 BASIC18.09■□□□□ 0.49
HERPUD1Q15011 AQP6-201ENST00000315520 1398 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.09■□□□□ 0.49
HERPUD1Q15011 DAPK3-202ENST00000545797 2257 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.09■□□□□ 0.49
HERPUD1Q15011 DISC1-205ENST00000366636 2224 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC18.09■□□□□ 0.49
HERPUD1Q15011 PLEKHJ1-206ENST00000587962 1311 ntTSL 2 BASIC18.09■□□□□ 0.49
HERPUD1Q15011 NDUFS3-206ENST00000528192 561 ntTSL 5 BASIC18.09■□□□□ 0.49
HERPUD1Q15011 AL499627.2-201ENST00000606283 725 ntBASIC18.09■□□□□ 0.49
HERPUD1Q15011 ZNF784-201ENST00000325351 2021 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.09■□□□□ 0.49
HERPUD1Q15011 SPNS1-203ENST00000334536 2027 ntTSL 1 (best) BASIC18.09■□□□□ 0.49
HERPUD1Q15011 TMEFF1-201ENST00000374879 2611 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.09■□□□□ 0.49
HERPUD1Q15011 E2F1-201ENST00000343380 2503 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.09■□□□□ 0.49
HERPUD1Q15011 C19orf12-201ENST00000323670 2464 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.09■□□□□ 0.49
HERPUD1Q15011 PARD3-209ENST00000374790 5825 ntTSL 5 BASIC18.09■□□□□ 0.49
HERPUD1Q15011 ICAM5-201ENST00000221980 3000 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.09■□□□□ 0.49
HERPUD1Q15011 RASGRP1-201ENST00000310803 5023 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.09■□□□□ 0.49
HERPUD1Q15011 RASGRP1-204ENST00000539159 5021 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC18.09■□□□□ 0.49
HERPUD1Q15011 HAGHL-212ENST00000564537 1667 ntTSL 2 BASIC18.09■□□□□ 0.49
HERPUD1Q15011 RASGRP2-207ENST00000377497 2221 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.08■□□□□ 0.49
HERPUD1Q15011 GMPPB-202ENST00000308388 1582 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.08■□□□□ 0.49
HERPUD1Q15011 RFLNA-201ENST00000324038 2148 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC18.08■□□□□ 0.49
HERPUD1Q15011 NUDT18-201ENST00000611621 1497 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.08■□□□□ 0.49
HERPUD1Q15011 TFG-201ENST00000240851 1978 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.08■□□□□ 0.49
HERPUD1Q15011 SOHLH1-201ENST00000298466 1987 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.08■□□□□ 0.49
HERPUD1Q15011 UCHL5-205ENST00000367454 1815 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.08■□□□□ 0.48
HERPUD1Q15011 UNC93B3-201ENST00000308076 687 ntBASIC18.08■□□□□ 0.48
HERPUD1Q15011 PRELID1-203ENST00000503216 1171 ntTSL 1 (best) BASIC18.08■□□□□ 0.48
HERPUD1Q15011 PABPN1-207ENST00000556821 1220 ntTSL 2 BASIC18.08■□□□□ 0.48
HERPUD1Q15011 NRL-205ENST00000560550 788 ntTSL 1 (best) BASIC18.08■□□□□ 0.48
HERPUD1Q15011 OIP5-AS1-208ENST00000560706 473 ntTSL 5 BASIC18.08■□□□□ 0.48
HERPUD1Q15011 FBXO25-202ENST00000350302 2229 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.08■□□□□ 0.48
HERPUD1Q15011 ANAPC4-201ENST00000315368 2685 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.08■□□□□ 0.48
HERPUD1Q15011 KCNN1-204ENST00000615435 1691 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC18.08■□□□□ 0.48
HERPUD1Q15011 FBXO27-202ENST00000509137 2130 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.08■□□□□ 0.48
HERPUD1Q15011 ARHGEF25-201ENST00000286494 2552 ntTSL 1 (best) BASIC18.08■□□□□ 0.48
HERPUD1Q15011 SNX21-212ENST00000491381 1607 ntTSL 1 (best) BASIC18.08■□□□□ 0.48
HERPUD1Q15011 ZIM2-201ENST00000593711 2083 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.08■□□□□ 0.48
HERPUD1Q15011 SPTBN4-203ENST00000392023 2419 ntTSL 1 (best) BASIC18.08■□□□□ 0.48
HERPUD1Q15011 TLX3-201ENST00000296921 1493 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.07■□□□□ 0.48
HERPUD1Q15011 EEF1D-201ENST00000317198 1458 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.07■□□□□ 0.48
HERPUD1Q15011 ITGB1BP1-203ENST00000359712 2126 ntTSL 2 BASIC18.07■□□□□ 0.48
HERPUD1Q15011 SLC25A24-204ENST00000569674 2357 ntBASIC18.07■□□□□ 0.48
HERPUD1Q15011 CARD19-201ENST00000375464 855 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.07■□□□□ 0.48
HERPUD1Q15011 AC142381.2-201ENST00000566120 298 ntBASIC18.07■□□□□ 0.48
HERPUD1Q15011 NKIRAS2-204ENST00000393880 1644 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.07■□□□□ 0.48
HERPUD1Q15011 MXRA8-201ENST00000309212 2273 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.07■□□□□ 0.48
HERPUD1Q15011 LPCAT4-201ENST00000314891 2262 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.07■□□□□ 0.48
HERPUD1Q15011 ZYG11B-202ENST00000545132 2294 ntTSL 2 BASIC18.07■□□□□ 0.48
HERPUD1Q15011 GCH1-206ENST00000543643 1897 ntTSL 1 (best) BASIC18.07■□□□□ 0.48
HERPUD1Q15011 FMNL2-201ENST00000288670 5575 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.07■□□□□ 0.48
HERPUD1Q15011 PPP3CC-201ENST00000240139 2189 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.07■□□□□ 0.48
HERPUD1Q15011 PDK3-201ENST00000379162 1809 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.07■□□□□ 0.48
HERPUD1Q15011 FAM47E-201ENST00000424749 1484 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC18.07■□□□□ 0.48
HERPUD1Q15011 P4HTM-202ENST00000383729 2127 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.07■□□□□ 0.48
HERPUD1Q15011 IL15RA-206ENST00000397248 1799 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.07■□□□□ 0.48
HERPUD1Q15011 APLP1-203ENST00000586861 2052 ntTSL 2 BASIC18.07■□□□□ 0.48
HERPUD1Q15011 RNF180-201ENST00000296615 1727 ntTSL 1 (best) BASIC18.06■□□□□ 0.48
HERPUD1Q15011 MED17-221ENST00000639724 2317 ntTSL 5 BASIC18.06■□□□□ 0.48
HERPUD1Q15011 HOXB7-201ENST00000239165 1371 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.06■□□□□ 0.48
HERPUD1Q15011 ZNF37BP-201ENST00000435805 1695 ntTSL 5 BASIC18.06■□□□□ 0.48
HERPUD1Q15011 OAF-201ENST00000328965 2525 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.06■□□□□ 0.48
HERPUD1Q15011 NOXO1-201ENST00000354249 1618 ntTSL 1 (best) BASIC18.06■□□□□ 0.48
HERPUD1Q15011 RBAK-202ENST00000396912 6551 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.06■□□□□ 0.48
HERPUD1Q15011 EBPL-204ENST00000378272 766 ntTSL 3 BASIC18.06■□□□□ 0.48
HERPUD1Q15011 AL136162.1-201ENST00000607711 1078 ntBASIC18.06■□□□□ 0.48
HERPUD1Q15011 BARX2-201ENST00000281437 1813 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.06■□□□□ 0.48
HERPUD1Q15011 LENG1-201ENST00000222224 1542 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.06■□□□□ 0.48
HERPUD1Q15011 CMTM4-201ENST00000330687 3414 ntTSL 1 (best) BASIC18.06■□□□□ 0.48
HERPUD1Q15011 SOX17-201ENST00000297316 2342 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.06■□□□□ 0.48
HERPUD1Q15011 GFRA3-201ENST00000274721 2039 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.06■□□□□ 0.48
HERPUD1Q15011 STX4-201ENST00000313843 1481 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.06■□□□□ 0.48
HERPUD1Q15011 A1BG-201ENST00000263100 1722 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.06■□□□□ 0.48
HERPUD1Q15011 STK11-205ENST00000586243 2777 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.06■□□□□ 0.48
HERPUD1Q15011 PCP4L1-201ENST00000504449 1424 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.06■□□□□ 0.48
HERPUD1Q15011 CTCF-202ENST00000401394 2978 ntTSL 1 (best) BASIC18.06■□□□□ 0.48
HERPUD1Q15011 OAZ2-201ENST00000326005 1934 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.06■□□□□ 0.48
HERPUD1Q15011 FAH-202ENST00000407106 2152 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.06■□□□□ 0.48
HERPUD1Q15011 SH2B2-202ENST00000536178 2113 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.05■□□□□ 0.48
HERPUD1Q15011 SSUH2-217ENST00000544814 1636 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.05■□□□□ 0.48
HERPUD1Q15011 POLD2-218ENST00000610533 1619 ntTSL 1 (best) BASIC18.05■□□□□ 0.48
HERPUD1Q15011 IGDCC4-201ENST00000352385 6508 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.05■□□□□ 0.48
HERPUD1Q15011 NABP2-203ENST00000380198 1775 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.05■□□□□ 0.48
HERPUD1Q15011 AL359710.1-201ENST00000427039 1544 ntTSL 2 BASIC18.05■□□□□ 0.48
HERPUD1Q15011 KRT18P55-201ENST00000577198 1950 ntTSL 1 (best) BASIC18.05■□□□□ 0.48
HERPUD1Q15011 PRICKLE4-201ENST00000394259 939 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.05■□□□□ 0.48
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