Protein–RNA interactions for Protein: Q149N8

SHPRH, E3 ubiquitin-protein ligase SHPRH, humanhuman

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Length 1,683 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SHPRHQ149N8 AC012313.1-203ENST00000597980 570 ntTSL 4 BASIC30.15■■■□□ 2.42
SHPRHQ149N8 SAMD8-202ENST00000372690 1654 ntTSL 1 (best) BASIC30.15■■■□□ 2.42
SHPRHQ149N8 CAMK2N1-201ENST00000375078 2336 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.15■■■□□ 2.42
SHPRHQ149N8 SPRED3-204ENST00000587013 1539 ntTSL 5 BASIC30.15■■■□□ 2.42
SHPRHQ149N8 FP325331.1-202ENST00000623531 1380 ntBASIC30.15■■■□□ 2.42
SHPRHQ149N8 IRF3-228ENST00000601291 1556 ntTSL 1 (best) BASIC30.14■■■□□ 2.42
SHPRHQ149N8 TMEM9-209ENST00000485839 938 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC30.14■■■□□ 2.42
SHPRHQ149N8 AP006294.2-201ENST00000641667 209 ntBASIC30.14■■■□□ 2.42
SHPRHQ149N8 NIPSNAP2-201ENST00000322090 1999 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.14■■■□□ 2.42
SHPRHQ149N8 KRT87P-202ENST00000534226 1464 ntBASIC30.14■■■□□ 2.42
SHPRHQ149N8 GAS2L1-201ENST00000406549 1803 ntTSL 1 (best) BASIC30.14■■■□□ 2.42
SHPRHQ149N8 RABGGTA-202ENST00000399409 2265 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.14■■■□□ 2.42
SHPRHQ149N8 C2orf82-203ENST00000409533 561 ntAPPRIS P2 TSL 4 BASIC30.14■■■□□ 2.41
SHPRHQ149N8 C17orf107-202ENST00000521575 1275 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC30.14■■■□□ 2.41
SHPRHQ149N8 CTAG1A-201ENST00000593606 993 ntTSL 5 BASIC30.14■■■□□ 2.41
SHPRHQ149N8 NR2F6-201ENST00000291442 2404 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.13■■■□□ 2.41
SHPRHQ149N8 PEX26-203ENST00000428061 815 ntTSL 1 (best) BASIC30.13■■■□□ 2.41
SHPRHQ149N8 SNHG6-203ENST00000520944 638 ntTSL 1 (best) BASIC30.13■■■□□ 2.41
SHPRHQ149N8 C7orf25-203ENST00000431882 1645 ntTSL 2 BASIC30.13■■■□□ 2.41
SHPRHQ149N8 RAMP1-202ENST00000403885 650 ntTSL 3 BASIC30.12■■■□□ 2.41
SHPRHQ149N8 MMP21-201ENST00000368808 1919 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.12■■■□□ 2.41
SHPRHQ149N8 ADARB2-202ENST00000381310 1810 ntTSL 1 (best) BASIC30.12■■■□□ 2.41
SHPRHQ149N8 TMEM256-PLSCR3-204ENST00000573331 2557 ntAPPRIS P5 TSL 2 BASIC30.11■■■□□ 2.41
SHPRHQ149N8 ZC3H14-223ENST00000557607 1983 ntTSL 5 BASIC30.11■■■□□ 2.41
SHPRHQ149N8 MRPL39-201ENST00000307301 1199 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC30.11■■■□□ 2.41
SHPRHQ149N8 MRPL39-202ENST00000352957 1110 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC30.11■■■□□ 2.41
SHPRHQ149N8 APTR-203ENST00000430801 583 ntTSL 5 BASIC30.11■■■□□ 2.41
SHPRHQ149N8 P4HA3-201ENST00000331597 2274 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.11■■■□□ 2.41
SHPRHQ149N8 DXO-201ENST00000337523 1628 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.11■■■□□ 2.41
SHPRHQ149N8 FAM167A-204ENST00000528897 1620 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC30.11■■■□□ 2.41
SHPRHQ149N8 USF3-203ENST00000491165 2133 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC30.11■■■□□ 2.41
SHPRHQ149N8 GALNT12-201ENST00000375011 2735 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.11■■■□□ 2.41
SHPRHQ149N8 SLC35A2-202ENST00000376512 903 ntTSL 2 BASIC30.11■■■□□ 2.41
SHPRHQ149N8 ABHD14A-204ENST00000491470 674 ntTSL 3 BASIC30.11■■■□□ 2.41
SHPRHQ149N8 CASP6-205ENST00000505486 538 ntTSL 4 BASIC30.11■■■□□ 2.41
SHPRHQ149N8 LIMD2-206ENST00000578993 602 ntTSL 3 BASIC30.11■■■□□ 2.41
SHPRHQ149N8 FLOT1-201ENST00000376389 1912 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.1■■■□□ 2.41
SHPRHQ149N8 B3GALNT2-202ENST00000366600 2015 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.1■■■□□ 2.41
SHPRHQ149N8 B4GAT1-201ENST00000311181 2072 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.1■■■□□ 2.41
SHPRHQ149N8 OSR2-210ENST00000523368 1519 ntTSL 1 (best) BASIC30.1■■■□□ 2.41
SHPRHQ149N8 C7orf26-202ENST00000359073 1762 ntTSL 1 (best) BASIC30.1■■■□□ 2.41
SHPRHQ149N8 P2RX4-211ENST00000543171 1777 ntTSL 5 BASIC30.1■■■□□ 2.41
SHPRHQ149N8 ENTPD4-201ENST00000356206 2097 ntTSL 1 (best) BASIC30.1■■■□□ 2.41
SHPRHQ149N8 ENTPD4-203ENST00000417069 2063 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.1■■■□□ 2.41
SHPRHQ149N8 FNDC11-201ENST00000370097 1119 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC30.1■■■□□ 2.41
SHPRHQ149N8 AC100835.1-201ENST00000565737 498 ntTSL 5 BASIC30.1■■■□□ 2.41
SHPRHQ149N8 AC105036.2-201ENST00000569468 176 ntBASIC30.1■■■□□ 2.41
SHPRHQ149N8 AL160396.2-202ENST00000636692 566 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC30.1■■■□□ 2.41
SHPRHQ149N8 LRRC73-201ENST00000372441 2121 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.09■■■□□ 2.41
SHPRHQ149N8 GGTLC1-202ENST00000286890 1028 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.09■■■□□ 2.41
SHPRHQ149N8 NDUFB2-203ENST00000461457 559 ntTSL 3 BASIC30.09■■■□□ 2.41
SHPRHQ149N8 ADM-205ENST00000528544 586 ntTSL 2 BASIC30.09■■■□□ 2.41
SHPRHQ149N8 UCK2-201ENST00000367879 1375 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.09■■■□□ 2.41
SHPRHQ149N8 C1QTNF4-201ENST00000302514 1664 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.09■■■□□ 2.41
SHPRHQ149N8 CNTFR-201ENST00000351266 1910 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.09■■■□□ 2.41
SHPRHQ149N8 EEF1D-256ENST00000618139 2238 ntTSL 5 BASIC30.08■■■□□ 2.41
SHPRHQ149N8 PRR7-202ENST00000502922 1345 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC30.08■■■□□ 2.41
SHPRHQ149N8 DNPH1-202ENST00000393987 796 ntTSL 2 BASIC30.08■■■□□ 2.41
SHPRHQ149N8 C16orf86-201ENST00000403458 1267 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC30.08■■■□□ 2.41
SHPRHQ149N8 IRX5-204ENST00000560154 879 ntTSL 5 BASIC30.08■■■□□ 2.41
SHPRHQ149N8 AC106820.5-201ENST00000566085 789 ntTSL 3 BASIC30.08■■■□□ 2.41
SHPRHQ149N8 NMRAL1-212ENST00000574425 1240 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC30.08■■■□□ 2.41
SHPRHQ149N8 FAM32A-205ENST00000589852 1168 ntTSL 1 (best) BASIC30.08■■■□□ 2.41
SHPRHQ149N8 IRX5-205ENST00000620085 881 ntTSL 1 (best) BASIC30.08■■■□□ 2.41
SHPRHQ149N8 PTH1R-201ENST00000313049 2123 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.08■■■□□ 2.41
SHPRHQ149N8 TMED4-205ENST00000481238 1755 ntTSL 1 (best) BASIC30.08■■■□□ 2.41
SHPRHQ149N8 SIRT7-201ENST00000328666 1743 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.08■■■□□ 2.41
SHPRHQ149N8 GPS2-201ENST00000380728 1379 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.08■■■□□ 2.41
SHPRHQ149N8 EIF4E3-203ENST00000421769 777 ntTSL 1 (best) BASIC30.07■■■□□ 2.41
SHPRHQ149N8 GRK4-202ENST00000398051 2068 ntTSL 1 (best) BASIC30.07■■■□□ 2.4
SHPRHQ149N8 IQCJ-SCHIP1-202ENST00000460298 1884 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC30.07■■■□□ 2.4
SHPRHQ149N8 NMI-201ENST00000243346 1623 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.07■■■□□ 2.4
SHPRHQ149N8 SEPT4-205ENST00000426861 1906 ntTSL 1 (best) BASIC30.07■■■□□ 2.4
SHPRHQ149N8 KLHDC9-201ENST00000368011 1314 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.07■■■□□ 2.4
SHPRHQ149N8 EFNA2-201ENST00000215368 949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.07■■■□□ 2.4
SHPRHQ149N8 ARL6IP4-205ENST00000412505 818 ntTSL 5 BASIC30.07■■■□□ 2.4
SHPRHQ149N8 MARS-234ENST00000630571 216 ntTSL 5 BASIC30.07■■■□□ 2.4
SHPRHQ149N8 MARS-235ENST00000630803 183 ntTSL 3 BASIC30.07■■■□□ 2.4
SHPRHQ149N8 THRA-202ENST00000394121 2260 ntTSL 2 BASIC30.06■■■□□ 2.4
SHPRHQ149N8 CDC20-202ENST00000372462 1777 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.06■■■□□ 2.4
SHPRHQ149N8 CCDC157-202ENST00000399824 1759 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC30.06■■■□□ 2.4
SHPRHQ149N8 SDHC-201ENST00000342751 1127 ntTSL 1 (best) BASIC30.06■■■□□ 2.4
SHPRHQ149N8 INS-203ENST00000397262 639 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.06■■■□□ 2.4
SHPRHQ149N8 UQCRFS1P1-201ENST00000435169 820 ntBASIC30.06■■■□□ 2.4
SHPRHQ149N8 BRI3-207ENST00000539286 699 ntTSL 2 BASIC30.06■■■□□ 2.4
SHPRHQ149N8 ZBTB45-205ENST00000600990 2159 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC30.06■■■□□ 2.4
SHPRHQ149N8 AP004608.1-201ENST00000531319 1402 ntTSL 2 BASIC30.06■■■□□ 2.4
SHPRHQ149N8 DALRD3-206ENST00000441576 1706 ntTSL 1 (best) BASIC30.06■■■□□ 2.4
SHPRHQ149N8 AK2-201ENST00000354858 1021 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC30.05■■■□□ 2.4
SHPRHQ149N8 PTH1R-207ENST00000449590 2123 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.05■■■□□ 2.4
SHPRHQ149N8 CBFB-203ENST00000561924 584 ntTSL 5 BASIC30.05■■■□□ 2.4
SHPRHQ149N8 DIXDC1-205ENST00000529225 1945 ntTSL 5 BASIC30.05■■■□□ 2.4
SHPRHQ149N8 DYRK3-203ENST00000367109 2163 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.05■■■□□ 2.4
SHPRHQ149N8 TRAP1-202ENST00000538171 2052 ntTSL 2 BASIC30.05■■■□□ 2.4
SHPRHQ149N8 TSKU-201ENST00000333090 2712 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.05■■■□□ 2.4
SHPRHQ149N8 WIPF1-207ENST00000410117 777 ntTSL 3 BASIC30.04■■■□□ 2.4
SHPRHQ149N8 TMEM240-202ENST00000425828 717 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC30.04■■■□□ 2.4
SHPRHQ149N8 CRIP2-202ENST00000483017 1176 ntTSL 2 BASIC30.04■■■□□ 2.4
SHPRHQ149N8 DHRS4-207ENST00000559632 1003 ntTSL 1 (best) BASIC30.04■■■□□ 2.4
SHPRHQ149N8 AC044860.1-201ENST00000560756 1160 ntTSL 1 (best) BASIC30.04■■■□□ 2.4
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