Protein–RNA interactions for Protein: Q14990

ODF1, Outer dense fiber protein 1, humanhuman

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Length 250 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
ODF1Q14990 CENPB-201ENST00000379751 2840 ntAPPRIS P1 BASIC15.3■□□□□ 0.04
ODF1Q14990 WNT7B-202ENST00000409496 2285 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC15.3■□□□□ 0.04
ODF1Q14990 JMJD8-201ENST00000412368 2038 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
ODF1Q14990 AC012123.1-201ENST00000426194 1661 ntTSL 5 BASIC15.3■□□□□ 0.04
ODF1Q14990 SUMF2-208ENST00000434526 2052 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
ODF1Q14990 KLHL21-203ENST00000463043 667 ntTSL 5 BASIC15.3■□□□□ 0.04
ODF1Q14990 CEP120-209ENST00000515110 606 ntTSL 3 BASIC15.3■□□□□ 0.04
ODF1Q14990 TNIP1-205ENST00000518977 2200 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
ODF1Q14990 AC093536.1-201ENST00000569153 554 ntBASIC15.3■□□□□ 0.04
ODF1Q14990 AC144652.1-201ENST00000609974 1624 ntBASIC15.3■□□□□ 0.04
ODF1Q14990 AC007326.4-201ENST00000638240 1669 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.3■□□□□ 0.04
ODF1Q14990 KMT2B-201ENST00000420124 8469 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
ODF1Q14990 LONRF3-202ENST00000371628 2550 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
ODF1Q14990 LYSMD4-210ENST00000545021 2431 ntTSL 4 BASIC15.29■□□□□ 0.04
ODF1Q14990 ZNF385A-212ENST00000551109 2369 ntTSL 5 BASIC15.29■□□□□ 0.04
ODF1Q14990 KCNS3-201ENST00000304101 2333 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
ODF1Q14990 ME2-206ENST00000638410 2289 ntTSL 5 BASIC15.29■□□□□ 0.04
ODF1Q14990 ME2-210ENST00000639255 2262 ntTSL 5 BASIC15.29■□□□□ 0.04
ODF1Q14990 CASP9-210ENST00000546424 4463 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.29■□□□□ 0.04
ODF1Q14990 IRF7-205ENST00000397574 1968 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
ODF1Q14990 RLBP1-201ENST00000268125 1810 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
ODF1Q14990 RBMS1-205ENST00000409972 1815 ntTSL 5 BASIC15.29■□□□□ 0.04
ODF1Q14990 CCDC92-209ENST00000545891 1790 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.29■□□□□ 0.04
ODF1Q14990 HOMER3-205ENST00000542541 1607 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
ODF1Q14990 CCDC85B-201ENST00000312579 1524 ntAPPRIS P1 BASIC15.29■□□□□ 0.04
ODF1Q14990 REST-210ENST00000638187 1334 ntTSL 5 BASIC15.29■□□□□ 0.04
ODF1Q14990 SYT5-202ENST00000537500 2612 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.29■□□□□ 0.04
ODF1Q14990 MCCD1-201ENST00000376191 955 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
ODF1Q14990 ABHD17AP5-201ENST00000580133 923 ntBASIC15.29■□□□□ 0.04
ODF1Q14990 PTPA-204ENST00000355007 2515 ntTSL 5 BASIC15.29■□□□□ 0.04
ODF1Q14990 YTHDF3-213ENST00000621820 2363 ntTSL 2 BASIC15.29■□□□□ 0.04
ODF1Q14990 DNAAF3-207ENST00000527223 2228 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.29■□□□□ 0.04
ODF1Q14990 AP006284.1-201ENST00000527620 2210 ntTSL 2 BASIC15.29■□□□□ 0.04
ODF1Q14990 RBKS-201ENST00000302188 1973 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
ODF1Q14990 MOGS-201ENST00000233616 2895 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
ODF1Q14990 RAB11FIP4-211ENST00000621161 8628 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
ODF1Q14990 NAB2-201ENST00000300131 2711 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
ODF1Q14990 NOX4-209ENST00000527626 1774 ntTSL 2 BASIC15.29■□□□□ 0.04
ODF1Q14990 STK19-201ENST00000375331 1663 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
ODF1Q14990 SETD9-201ENST00000285947 1619 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
ODF1Q14990 DNAJB5-201ENST00000312316 2391 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
ODF1Q14990 MARK2-202ENST00000361128 3004 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
ODF1Q14990 FBXL14-201ENST00000339235 2111 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
ODF1Q14990 BACE2-201ENST00000328735 2824 ntTSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
ODF1Q14990 ZNF513-202ENST00000407879 2077 ntTSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
ODF1Q14990 ASCC1-205ENST00000394919 2683 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.28■□□□□ 0.04
ODF1Q14990 TPT1-202ENST00000379055 948 ntTSL 2 BASIC15.28■□□□□ 0.04
ODF1Q14990 AC068134.2-201ENST00000437095 576 ntTSL 3 BASIC15.28■□□□□ 0.04
ODF1Q14990 CDKN2A-214ENST00000579755 1283 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
ODF1Q14990 FA2H-201ENST00000219368 2424 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
ODF1Q14990 SNX7-201ENST00000306121 1734 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
ODF1Q14990 DMWD-202ENST00000377735 3292 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.28■□□□□ 0.04
ODF1Q14990 RABL2B-206ENST00000395598 2169 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
ODF1Q14990 FADS6-203ENST00000612771 2154 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
ODF1Q14990 HUNK-201ENST00000270112 7385 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
ODF1Q14990 ARIH2OS-201ENST00000408959 1598 ntAPPRIS P1 BASIC15.28■□□□□ 0.04
ODF1Q14990 TDRP-203ENST00000523656 2622 ntTSL 5 BASIC15.28■□□□□ 0.04
ODF1Q14990 EVX1-201ENST00000222761 1500 ntTSL 1 (best) BASIC15.27■□□□□ 0.04
ODF1Q14990 NIPA2-202ENST00000359727 1531 ntTSL 1 (best) BASIC15.27■□□□□ 0.04
ODF1Q14990 RHOBTB3-201ENST00000379982 5537 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.27■□□□□ 0.04
ODF1Q14990 CRLF3-201ENST00000324238 2957 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.27■□□□□ 0.04
ODF1Q14990 PSIP1-201ENST00000380715 1966 ntTSL 1 (best) BASIC15.27■□□□□ 0.04
ODF1Q14990 C16orf70-201ENST00000219139 2865 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.27■□□□□ 0.04
ODF1Q14990 FDFT1-226ENST00000623368 2368 ntTSL 2 BASIC15.27■□□□□ 0.04
ODF1Q14990 HOMER3-201ENST00000221222 1384 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.27■□□□□ 0.04
ODF1Q14990 SMTNL2-202ENST00000389313 2280 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.27■□□□□ 0.04
ODF1Q14990 POMGNT1-201ENST00000371984 2728 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.27■□□□□ 0.04
ODF1Q14990 KCTD13-202ENST00000561540 1773 ntTSL 1 (best) BASIC15.27■□□□□ 0.04
ODF1Q14990 HMGA1-205ENST00000447654 2159 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.27■□□□□ 0.04
ODF1Q14990 SPAST-204ENST00000621856 1715 ntTSL 1 (best) BASIC15.27■□□□□ 0.04
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ODF1Q14990 CPNE9-203ENST00000383832 2068 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.27■□□□□ 0.03
ODF1Q14990 CDKN2C-203ENST00000396148 2086 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.27■□□□□ 0.03
ODF1Q14990 BLOC1S4-201ENST00000320776 1617 ntAPPRIS P1 BASIC15.27■□□□□ 0.03
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ODF1Q14990 SMIM10L2A-201ENST00000417443 5230 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.27■□□□□ 0.03
ODF1Q14990 RNF32-207ENST00000405335 1938 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.27■□□□□ 0.03
ODF1Q14990 ASCC1-204ENST00000394915 1510 ntTSL 5 BASIC15.27■□□□□ 0.03
ODF1Q14990 NYX-202ENST00000378220 2297 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.27■□□□□ 0.03
ODF1Q14990 RASL10A-201ENST00000216101 1490 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.27■□□□□ 0.03
ODF1Q14990 GLT8D2-205ENST00000548660 1835 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.27■□□□□ 0.03
ODF1Q14990 TMEM235-202ENST00000421688 2490 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.26■□□□□ 0.03
ODF1Q14990 RAD51-210ENST00000557850 1397 ntTSL 2 BASIC15.26■□□□□ 0.03
ODF1Q14990 FAM129C-203ENST00000449408 2004 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.26■□□□□ 0.03
ODF1Q14990 IKBKG-206ENST00000594239 2299 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.26■□□□□ 0.03
ODF1Q14990 DOCK9-206ENST00000427887 4176 ntTSL 1 (best) BASIC15.26■□□□□ 0.03
ODF1Q14990 SNUPN-205ENST00000564644 1931 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.26■□□□□ 0.03
ODF1Q14990 FAM168B-201ENST00000389915 944 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.26■□□□□ 0.03
ODF1Q14990 MDFIC-203ENST00000423503 474 ntTSL 1 (best) BASIC15.26■□□□□ 0.03
ODF1Q14990 HES4-202ENST00000428771 1040 ntTSL 2 BASIC15.26■□□□□ 0.03
ODF1Q14990 FAM53B-201ENST00000280780 1568 ntTSL 1 (best) BASIC15.26■□□□□ 0.03
ODF1Q14990 DIO3-201ENST00000510508 2102 ntAPPRIS P1 BASIC15.26■□□□□ 0.03
ODF1Q14990 ARFRP1-210ENST00000614942 2554 ntTSL 5 BASIC15.26■□□□□ 0.03
ODF1Q14990 TMEM62-201ENST00000260403 2771 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.25■□□□□ 0.03
ODF1Q14990 SOCS2-201ENST00000340600 2761 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.25■□□□□ 0.03
ODF1Q14990 TUBGCP3-204ENST00000464139 2461 ntTSL 1 (best) BASIC15.25■□□□□ 0.03
ODF1Q14990 RBM42-203ENST00000588161 1609 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.25■□□□□ 0.03
ODF1Q14990 NOP56-201ENST00000329276 2400 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.25■□□□□ 0.03
ODF1Q14990 PCDHA13-203ENST00000617769 2427 ntAPPRIS ALT2 BASIC15.25■□□□□ 0.03
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