Protein–RNA interactions for Protein: Q147U7

SMCO1, Single-pass membrane and coiled-coil domain-containing protein 1, humanhuman

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Length 214 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SMCO1Q147U7 RELA-201ENST00000308639 2681 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.06■□□□□ 0.48
SMCO1Q147U7 SLC9A3-AS1-207ENST00000607286 1357 ntTSL 5 BASIC18.05■□□□□ 0.48
SMCO1Q147U7 SAMD13-205ENST00000370673 1567 ntTSL 2 BASIC18.05■□□□□ 0.48
SMCO1Q147U7 HYI-213ENST00000583037 1322 ntTSL 5 BASIC18.05■□□□□ 0.48
SMCO1Q147U7 AL136090.1-201ENST00000446849 366 ntTSL 3 BASIC18.05■□□□□ 0.48
SMCO1Q147U7 CARMIL1-202ENST00000461945 1290 ntTSL 1 (best) BASIC18.05■□□□□ 0.48
SMCO1Q147U7 ARID1B-203ENST00000350026 7962 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.05■□□□□ 0.48
SMCO1Q147U7 MARK3-206ENST00000440884 2643 ntTSL 1 (best) BASIC18.05■□□□□ 0.48
SMCO1Q147U7 SYNGR2-201ENST00000225777 2325 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.05■□□□□ 0.48
SMCO1Q147U7 CACNB1-201ENST00000344140 1889 ntTSL 1 (best) BASIC18.05■□□□□ 0.48
SMCO1Q147U7 C7orf43-201ENST00000316937 2520 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.05■□□□□ 0.48
SMCO1Q147U7 DISC1-212ENST00000535983 2505 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.05■□□□□ 0.48
SMCO1Q147U7 UTS2R-201ENST00000313135 1357 ntAPPRIS P1 BASIC18.04■□□□□ 0.48
SMCO1Q147U7 FLYWCH1-201ENST00000253928 5037 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.04■□□□□ 0.48
SMCO1Q147U7 P4HTM-202ENST00000383729 2127 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.04■□□□□ 0.48
SMCO1Q147U7 PRMT5-201ENST00000216350 2271 ntTSL 2 BASIC18.04■□□□□ 0.48
SMCO1Q147U7 LPCAT4-201ENST00000314891 2262 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.04■□□□□ 0.48
SMCO1Q147U7 AUH-201ENST00000303617 1490 ntTSL 1 (best) BASIC18.04■□□□□ 0.48
SMCO1Q147U7 ST3GAL4-215ENST00000532243 1825 ntTSL 1 (best) BASIC18.04■□□□□ 0.48
SMCO1Q147U7 AVPR1A-201ENST00000299178 5963 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.04■□□□□ 0.48
SMCO1Q147U7 PNCK-215ENST00000447676 1585 ntTSL 2 BASIC18.04■□□□□ 0.48
SMCO1Q147U7 TMEM161A-202ENST00000450333 1930 ntTSL 2 BASIC18.04■□□□□ 0.48
SMCO1Q147U7 AC010542.4-201ENST00000563151 1910 ntBASIC18.04■□□□□ 0.48
SMCO1Q147U7 CLK3-202ENST00000395066 2621 ntTSL 1 (best) BASIC18.03■□□□□ 0.48
SMCO1Q147U7 EGFL8-219ENST00000333845 1310 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.03■□□□□ 0.48
SMCO1Q147U7 MAFG-201ENST00000357736 5040 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.03■□□□□ 0.48
SMCO1Q147U7 POTED-202ENST00000620442 1988 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.03■□□□□ 0.48
SMCO1Q147U7 AOC1-202ENST00000416793 2453 ntTSL 1 (best) BASIC18.03■□□□□ 0.48
SMCO1Q147U7 PLEKHH3-201ENST00000293349 2987 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC18.03■□□□□ 0.48
SMCO1Q147U7 HYI-210ENST00000486909 905 ntTSL 5 BASIC18.03■□□□□ 0.48
SMCO1Q147U7 EPHA10-211ENST00000540011 720 ntTSL 5 BASIC18.03■□□□□ 0.48
SMCO1Q147U7 TCEA1-213ENST00000640041 1171 ntTSL 5 BASIC18.03■□□□□ 0.48
SMCO1Q147U7 RALY-203ENST00000375114 6430 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.03■□□□□ 0.48
SMCO1Q147U7 ARRB2-201ENST00000269260 1895 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.03■□□□□ 0.48
SMCO1Q147U7 KLHDC1-201ENST00000359332 2691 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.03■□□□□ 0.48
SMCO1Q147U7 TMEM250-205ENST00000561457 2804 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.03■□□□□ 0.48
SMCO1Q147U7 C7orf26-201ENST00000344417 2182 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.03■□□□□ 0.48
SMCO1Q147U7 PRMT5-204ENST00000397441 2418 ntTSL 2 BASIC18.02■□□□□ 0.48
SMCO1Q147U7 EIF2B4-211ENST00000616081 1754 ntTSL 5 BASIC18.02■□□□□ 0.48
SMCO1Q147U7 TRIM46-204ENST00000368385 1864 ntTSL 1 (best) BASIC18.02■□□□□ 0.48
SMCO1Q147U7 AP000911.3-201ENST00000526377 1130 ntTSL 3 BASIC18.02■□□□□ 0.48
SMCO1Q147U7 PAQR6-212ENST00000540423 1729 ntTSL 3 BASIC18.02■□□□□ 0.48
SMCO1Q147U7 UBALD1-203ENST00000587649 707 ntTSL 3 BASIC18.02■□□□□ 0.48
SMCO1Q147U7 AC005229.4-201ENST00000610085 2198 ntBASIC18.02■□□□□ 0.48
SMCO1Q147U7 BAG5-201ENST00000299204 4848 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.02■□□□□ 0.48
SMCO1Q147U7 C19orf35-201ENST00000342063 2574 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.02■□□□□ 0.47
SMCO1Q147U7 CDKN1C-204ENST00000440480 1811 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.02■□□□□ 0.47
SMCO1Q147U7 MCAT-201ENST00000290429 2056 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.02■□□□□ 0.47
SMCO1Q147U7 ZC3H14-219ENST00000556945 2075 ntTSL 5 BASIC18.02■□□□□ 0.47
SMCO1Q147U7 TMEM230-205ENST00000379279 1636 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.01■□□□□ 0.47
SMCO1Q147U7 SPIRE2-202ENST00000393062 2172 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
SMCO1Q147U7 SLC19A1-212ENST00000567670 2029 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
SMCO1Q147U7 SYNGR3-202ENST00000562045 1743 ntTSL 2 BASIC18.01■□□□□ 0.47
SMCO1Q147U7 PGAM5-203ENST00000498926 2834 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.01■□□□□ 0.47
SMCO1Q147U7 NOX4-204ENST00000393282 560 ntTSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
SMCO1Q147U7 AC104002.3-202ENST00000557170 1100 ntTSL 3 BASIC18.01■□□□□ 0.47
SMCO1Q147U7 FAM222B-205ENST00000577682 549 ntTSL 4 BASIC18.01■□□□□ 0.47
SMCO1Q147U7 GNAS-AS1_1.1-201ENST00000621898 103 ntBASIC18.01■□□□□ 0.47
SMCO1Q147U7 AC005551.1-201ENST00000641816 493 ntAPPRIS P1 BASIC18.01■□□□□ 0.47
SMCO1Q147U7 KIAA1522-204ENST00000401073 5438 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC18.01■□□□□ 0.47
SMCO1Q147U7 SNAP23-202ENST00000349777 2480 ntTSL 2 BASIC18.01■□□□□ 0.47
SMCO1Q147U7 CIZ1-206ENST00000372954 2731 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
SMCO1Q147U7 SPG21-202ENST00000416889 1533 ntTSL 2 BASIC18.01■□□□□ 0.47
SMCO1Q147U7 MIR222HG-201ENST00000602461 1379 ntTSL 5 BASIC18.01■□□□□ 0.47
SMCO1Q147U7 ANKRD44-204ENST00000409919 1622 ntTSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
SMCO1Q147U7 AL117348.2-201ENST00000432920 1625 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.01■□□□□ 0.47
SMCO1Q147U7 UBE2B-201ENST00000265339 2515 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
SMCO1Q147U7 IKBKG-211ENST00000615874 1460 ntTSL 5 BASIC18.01■□□□□ 0.47
SMCO1Q147U7 IKBKG-215ENST00000619941 1463 ntTSL 5 BASIC18.01■□□□□ 0.47
SMCO1Q147U7 TLE3-214ENST00000558939 6004 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.47
SMCO1Q147U7 PLCG1-202ENST00000373271 7395 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.47
SMCO1Q147U7 ARIH2OS-201ENST00000408959 1598 ntAPPRIS P1 BASIC18■□□□□ 0.47
SMCO1Q147U7 PLPP7-202ENST00000372264 2095 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.47
SMCO1Q147U7 SMOX-212ENST00000621355 2322 ntTSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.47
SMCO1Q147U7 ZNF467-201ENST00000302017 2553 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.47
SMCO1Q147U7 CDH23-212ENST00000616684 4814 ntTSL 5 BASIC18■□□□□ 0.47
SMCO1Q147U7 SPN-202ENST00000395389 1935 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.47
SMCO1Q147U7 NOS3-204ENST00000467517 2377 ntTSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.47
SMCO1Q147U7 ITGBL1-206ENST00000618057 2368 ntTSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.47
SMCO1Q147U7 C20orf24-201ENST00000342422 896 ntTSL 2 BASIC18■□□□□ 0.47
SMCO1Q147U7 C20orf24-202ENST00000344795 1114 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.47
SMCO1Q147U7 AL354928.1-201ENST00000438380 617 ntTSL 2 BASIC18■□□□□ 0.47
SMCO1Q147U7 UBE2I-213ENST00000566587 1098 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18■□□□□ 0.47
SMCO1Q147U7 FBXO25-202ENST00000350302 2229 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.47
SMCO1Q147U7 DNAJB5-203ENST00000453597 2589 ntTSL 2 BASIC18■□□□□ 0.47
SMCO1Q147U7 GALR2-201ENST00000329003 1364 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.47
SMCO1Q147U7 SLC41A3-202ENST00000346785 1705 ntTSL 2 BASIC18■□□□□ 0.47
SMCO1Q147U7 AC087742.1-201ENST00000575880 1738 ntBASIC18■□□□□ 0.47
SMCO1Q147U7 LAYN-201ENST00000375614 2066 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.47
SMCO1Q147U7 ZNF688-201ENST00000223459 2506 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.47
SMCO1Q147U7 KCTD13-207ENST00000568000 2528 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.47
SMCO1Q147U7 GRK3-203ENST00000619906 2873 ntTSL 5 BASIC18■□□□□ 0.47
SMCO1Q147U7 TMEM198B-205ENST00000487582 1581 ntTSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.47
SMCO1Q147U7 AC064853.3-201ENST00000641801 1658 ntAPPRIS P1 BASIC17.99■□□□□ 0.47
SMCO1Q147U7 UROS-204ENST00000368797 1313 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.99■□□□□ 0.47
SMCO1Q147U7 RAP2C-202ENST00000370874 2333 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.99■□□□□ 0.47
SMCO1Q147U7 MAP7-206ENST00000611373 2317 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.99■□□□□ 0.47
SMCO1Q147U7 TMEM44-211ENST00000473092 1508 ntTSL 1 (best) BASIC17.99■□□□□ 0.47
SMCO1Q147U7 LTBP4-201ENST00000204005 5032 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.99■□□□□ 0.47
SMCO1Q147U7 TSNARE1-208ENST00000524325 1963 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC17.99■□□□□ 0.47
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