Protein–RNA interactions for Protein: Q14108

SCARB2, Lysosome membrane protein 2, humanhuman

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Length 478 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SCARB2Q14108 IPO9-AS1-201ENST00000413035 839 ntTSL 3 BASIC20.2■□□□□ 0.82
SCARB2Q14108 AC006455.2-201ENST00000429931 906 ntBASIC20.2■□□□□ 0.82
SCARB2Q14108 FAM66C-205ENST00000456135 1216 ntTSL 5 BASIC20.2■□□□□ 0.82
SCARB2Q14108 ERRFI1-204ENST00000474874 479 ntTSL 3 BASIC20.2■□□□□ 0.82
SCARB2Q14108 KRT18P55-201ENST00000577198 1950 ntTSL 1 (best) BASIC20.2■□□□□ 0.82
SCARB2Q14108 UBE2J2-201ENST00000347370 2387 ntTSL 3 BASIC20.2■□□□□ 0.82
SCARB2Q14108 LHFPL3-202ENST00000424859 1852 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC20.2■□□□□ 0.82
SCARB2Q14108 IGFBP1-202ENST00000457280 1601 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.2■□□□□ 0.82
SCARB2Q14108 PMPCA-201ENST00000371717 2174 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.19■□□□□ 0.82
SCARB2Q14108 MIR210HG-201ENST00000500447 1965 ntTSL 2 BASIC20.19■□□□□ 0.82
SCARB2Q14108 CCDC189-206ENST00000543610 1967 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.19■□□□□ 0.82
SCARB2Q14108 ME2-206ENST00000638410 2289 ntTSL 5 BASIC20.19■□□□□ 0.82
SCARB2Q14108 ME2-210ENST00000639255 2262 ntTSL 5 BASIC20.19■□□□□ 0.82
SCARB2Q14108 PEX7-201ENST00000318471 1464 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.19■□□□□ 0.82
SCARB2Q14108 REV1-201ENST00000258428 4751 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.19■□□□□ 0.82
SCARB2Q14108 CDKN1C-204ENST00000440480 1811 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.19■□□□□ 0.82
SCARB2Q14108 PHF7-201ENST00000327906 2130 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.19■□□□□ 0.82
SCARB2Q14108 ATP11B-209ENST00000493826 963 ntTSL 1 (best) BASIC20.19■□□□□ 0.82
SCARB2Q14108 ACYP1-205ENST00000555463 789 ntTSL 2 BASIC20.19■□□□□ 0.82
SCARB2Q14108 STK11-205ENST00000586243 2777 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.19■□□□□ 0.82
SCARB2Q14108 LEFTY1-201ENST00000272134 1626 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.19■□□□□ 0.82
SCARB2Q14108 FAM167A-204ENST00000528897 1620 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.19■□□□□ 0.82
SCARB2Q14108 INPP1-201ENST00000322522 1919 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.19■□□□□ 0.82
SCARB2Q14108 EFHD1-201ENST00000264059 2259 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.19■□□□□ 0.82
SCARB2Q14108 RBBP7-202ENST00000380084 2036 ntTSL 2 BASIC20.19■□□□□ 0.82
SCARB2Q14108 NKX2-5-201ENST00000329198 1709 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.19■□□□□ 0.82
SCARB2Q14108 TTYH1-201ENST00000301194 2088 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC20.18■□□□□ 0.82
SCARB2Q14108 ITGB1BP1-203ENST00000359712 2126 ntTSL 2 BASIC20.18■□□□□ 0.82
SCARB2Q14108 AC074143.1-203ENST00000518227 1473 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.18■□□□□ 0.82
SCARB2Q14108 B4GALNT1-202ENST00000418555 1861 ntTSL 2 BASIC20.18■□□□□ 0.82
SCARB2Q14108 OBSL1-214ENST00000603926 5520 ntTSL 5 BASIC20.18■□□□□ 0.82
SCARB2Q14108 ANAPC4-201ENST00000315368 2685 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.18■□□□□ 0.82
SCARB2Q14108 OR2A1-AS1-204ENST00000470435 602 ntBASIC20.18■□□□□ 0.82
SCARB2Q14108 AC079089.2-201ENST00000531211 1277 ntBASIC20.18■□□□□ 0.82
SCARB2Q14108 TUB-201ENST00000299506 2019 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.18■□□□□ 0.82
SCARB2Q14108 CHRNA7-203ENST00000454250 2093 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC20.18■□□□□ 0.82
SCARB2Q14108 GLRX3-201ENST00000331244 1302 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.18■□□□□ 0.82
SCARB2Q14108 AP1S1-201ENST00000337619 1306 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.18■□□□□ 0.82
SCARB2Q14108 HTATIP2-204ENST00000451739 1748 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.18■□□□□ 0.82
SCARB2Q14108 OAF-201ENST00000328965 2525 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.18■□□□□ 0.82
SCARB2Q14108 E2F1-201ENST00000343380 2503 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.18■□□□□ 0.82
SCARB2Q14108 MFSD6L-201ENST00000329805 2188 ntAPPRIS P1 BASIC20.18■□□□□ 0.82
SCARB2Q14108 PPP2R5E-204ENST00000555899 2164 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC20.18■□□□□ 0.82
SCARB2Q14108 FBXW7-202ENST00000281708 4976 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC20.18■□□□□ 0.82
SCARB2Q14108 ATG4D-201ENST00000309469 1949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.17■□□□□ 0.82
SCARB2Q14108 FBXO17-201ENST00000292852 2386 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.17■□□□□ 0.82
SCARB2Q14108 TBL1Y-202ENST00000355162 2376 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.17■□□□□ 0.82
SCARB2Q14108 POTEC-204ENST00000620346 1988 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.17■□□□□ 0.82
SCARB2Q14108 SEC61A2-205ENST00000379033 2462 ntTSL 2 BASIC20.17■□□□□ 0.82
SCARB2Q14108 USP45-205ENST00000472914 1617 ntTSL 5 BASIC20.17■□□□□ 0.82
SCARB2Q14108 SGMS1-210ENST00000619438 1680 ntTSL 5 BASIC20.17■□□□□ 0.82
SCARB2Q14108 PARD3-208ENST00000374789 6005 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.17■□□□□ 0.82
SCARB2Q14108 KCNK12-201ENST00000327876 6227 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.17■□□□□ 0.82
SCARB2Q14108 CCDC130-201ENST00000221554 1792 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.17■□□□□ 0.82
SCARB2Q14108 ACAA1-202ENST00000333167 1785 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.17■□□□□ 0.82
SCARB2Q14108 FASTK-212ENST00000482571 1764 ntTSL 1 (best) BASIC20.17■□□□□ 0.82
SCARB2Q14108 TMEM54-201ENST00000329151 871 ntTSL 1 (best) BASIC20.17■□□□□ 0.82
SCARB2Q14108 C2orf82-201ENST00000331342 465 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.17■□□□□ 0.82
SCARB2Q14108 MYD88-205ENST00000424893 1279 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.17■□□□□ 0.82
SCARB2Q14108 PTPRJ-208ENST00000615445 4773 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.17■□□□□ 0.82
SCARB2Q14108 ATP6AP1-201ENST00000369762 2099 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.17■□□□□ 0.82
SCARB2Q14108 DECR2-201ENST00000219481 1615 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.16■□□□□ 0.82
SCARB2Q14108 PAQR6-212ENST00000540423 1729 ntTSL 3 BASIC20.16■□□□□ 0.82
SCARB2Q14108 LINC02175-201ENST00000571219 1875 ntTSL 1 (best) BASIC20.16■□□□□ 0.82
SCARB2Q14108 ATP9A-202ENST00000338821 8106 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.16■□□□□ 0.82
SCARB2Q14108 CCDC185-201ENST00000366875 2054 ntAPPRIS P1 BASIC20.16■□□□□ 0.82
SCARB2Q14108 PRSS21-201ENST00000005995 1101 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.16■□□□□ 0.82
SCARB2Q14108 AC099791.2-201ENST00000605725 427 ntBASIC20.16■□□□□ 0.82
SCARB2Q14108 PALM-208ENST00000592155 2272 ntTSL 4 BASIC20.16■□□□□ 0.82
SCARB2Q14108 RCE1-202ENST00000524506 1379 ntTSL 5 BASIC20.16■□□□□ 0.82
SCARB2Q14108 GOLGA6L9-202ENST00000618348 1710 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.16■□□□□ 0.82
SCARB2Q14108 DUSP26-201ENST00000256261 1835 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.16■□□□□ 0.82
SCARB2Q14108 IKBKG-212ENST00000617207 1949 ntAPPRIS ALT1 TSL 3 BASIC20.15■□□□□ 0.82
SCARB2Q14108 MEIS1-AS3-201ENST00000454167 707 ntTSL 4 BASIC20.15■□□□□ 0.82
SCARB2Q14108 AC084116.4-201ENST00000524320 484 ntTSL 2 BASIC20.15■□□□□ 0.82
SCARB2Q14108 ARFIP2-205ENST00000525235 852 ntTSL 2 BASIC20.15■□□□□ 0.82
SCARB2Q14108 TUBBP5-204ENST00000635438 565 ntTSL 4 BASIC20.15■□□□□ 0.82
SCARB2Q14108 MDFI-203ENST00000373051 1622 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.15■□□□□ 0.82
SCARB2Q14108 DTNBP1-201ENST00000338950 1880 ntTSL 1 (best) BASIC20.15■□□□□ 0.82
SCARB2Q14108 PHLDB2-210ENST00000478922 1861 ntTSL 1 (best) BASIC20.15■□□□□ 0.82
SCARB2Q14108 ITPKC-201ENST00000263370 3385 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.15■□□□□ 0.82
SCARB2Q14108 CENPB-201ENST00000379751 2840 ntAPPRIS P1 BASIC20.14■□□□□ 0.82
SCARB2Q14108 SRP68-201ENST00000307877 2649 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.14■□□□□ 0.82
SCARB2Q14108 LAYN-201ENST00000375614 2066 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.14■□□□□ 0.81
SCARB2Q14108 RARG-201ENST00000338561 1836 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC20.14■□□□□ 0.81
SCARB2Q14108 TMEM51-203ENST00000400796 1842 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.14■□□□□ 0.81
SCARB2Q14108 CTU2-202ENST00000453996 1751 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.14■□□□□ 0.81
SCARB2Q14108 TUB-203ENST00000534099 1759 ntTSL 2 BASIC20.14■□□□□ 0.81
SCARB2Q14108 AL121749.1-201ENST00000635993 1768 ntTSL 5 BASIC20.14■□□□□ 0.81
SCARB2Q14108 STX4-202ENST00000394998 1498 ntTSL 2 BASIC20.14■□□□□ 0.81
SCARB2Q14108 ZNRF1-205ENST00000566250 1069 ntTSL 1 (best) BASIC20.14■□□□□ 0.81
SCARB2Q14108 ZNRF1-206ENST00000567962 1234 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.14■□□□□ 0.81
SCARB2Q14108 AC010336.5-201ENST00000594308 317 ntTSL 3 BASIC20.14■□□□□ 0.81
SCARB2Q14108 AL356740.2-201ENST00000601559 647 ntBASIC20.14■□□□□ 0.81
SCARB2Q14108 COL23A1-201ENST00000390654 3061 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC20.14■□□□□ 0.81
SCARB2Q14108 GRIK4-205ENST00000527524 5861 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.14■□□□□ 0.81
SCARB2Q14108 FBRS-202ENST00000356166 5200 ntTSL 5 BASIC20.13■□□□□ 0.81
SCARB2Q14108 ERI3-201ENST00000372257 1684 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.13■□□□□ 0.81
SCARB2Q14108 MIS18A-201ENST00000290130 1575 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.13■□□□□ 0.81
SCARB2Q14108 D2HGDH-201ENST00000321264 2617 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.13■□□□□ 0.81
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