Protein–RNA interactions for Protein: Q14004

CDK13, Cyclin-dependent kinase 13, humanhuman

Known RBP Predictions only

Length 1,512 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CDK13Q14004 BID-202ENST00000342111 854 ntTSL 1 (best) BASIC33.86■■■■□ 3.01
CDK13Q14004 HIST1H2AM-201ENST00000359611 393 ntAPPRIS P1 BASIC33.86■■■■□ 3.01
CDK13Q14004 CT47A12-201ENST00000419982 1165 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.86■■■■□ 3.01
CDK13Q14004 APTR-203ENST00000430801 583 ntTSL 5 BASIC33.86■■■■□ 3.01
CDK13Q14004 AC099805.1-201ENST00000523987 1797 ntTSL 1 (best) BASIC33.86■■■■□ 3.01
CDK13Q14004 AC092068.2-201ENST00000590491 1708 ntBASIC33.86■■■■□ 3.01
CDK13Q14004 OTUD5-203ENST00000396743 2682 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC33.86■■■■□ 3.01
CDK13Q14004 RWDD4-206ENST00000512740 1393 ntTSL 5 BASIC33.86■■■■□ 3.01
CDK13Q14004 ANOS2P-203ENST00000472227 1816 ntBASIC33.85■■■■□ 3.01
CDK13Q14004 HSPB2-201ENST00000304298 1335 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.85■■■■□ 3.01
CDK13Q14004 EIF5A-205ENST00000419711 1271 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.85■■■■□ 3.01
CDK13Q14004 C19orf81-201ENST00000425202 765 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC33.85■■■■□ 3.01
CDK13Q14004 AC069152.1-201ENST00000438030 544 ntBASIC33.85■■■■□ 3.01
CDK13Q14004 SRI-201ENST00000265729 2010 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.85■■■■□ 3.01
CDK13Q14004 ZDHHC1-201ENST00000348579 2047 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC33.85■■■■□ 3.01
CDK13Q14004 LINC01960-201ENST00000563759 1884 ntBASIC33.84■■■■□ 3.01
CDK13Q14004 VIL1-204ENST00000440053 1454 ntTSL 1 (best) BASIC33.84■■■■□ 3.01
CDK13Q14004 MRPL39-201ENST00000307301 1199 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC33.84■■■■□ 3.01
CDK13Q14004 MRPL39-202ENST00000352957 1110 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC33.84■■■■□ 3.01
CDK13Q14004 AL731577.2-201ENST00000508096 555 ntTSL 2 BASIC33.84■■■■□ 3.01
CDK13Q14004 AC110285.4-201ENST00000572590 424 ntTSL 3 BASIC33.84■■■■□ 3.01
CDK13Q14004 GNB2-209ENST00000436220 1479 ntTSL 5 BASIC33.84■■■■□ 3.01
CDK13Q14004 FITM1-201ENST00000267426 1194 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.84■■■■□ 3.01
CDK13Q14004 TMEM218-201ENST00000279968 1034 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.84■■■■□ 3.01
CDK13Q14004 ELAC1-204ENST00000591429 975 ntTSL 1 (best) BASIC33.84■■■■□ 3.01
CDK13Q14004 CCDC47-204ENST00000582252 1719 ntTSL 2 BASIC33.83■■■■□ 3.01
CDK13Q14004 FAHD1-201ENST00000382666 1964 ntTSL 2 BASIC33.83■■■■□ 3.01
CDK13Q14004 VGLL2-201ENST00000326274 2212 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.83■■■■□ 3.01
CDK13Q14004 MSRB1-201ENST00000361871 1423 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC33.83■■■■□ 3.01
CDK13Q14004 CHPF-202ENST00000373891 1079 ntTSL 2 BASIC33.83■■■■□ 3.01
CDK13Q14004 NUDT8-202ENST00000376693 728 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC33.83■■■■□ 3.01
CDK13Q14004 MBD3L1-202ENST00000595891 872 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC33.83■■■■□ 3.01
CDK13Q14004 PRMT1-221ENST00000610806 1192 ntTSL 3 BASIC33.83■■■■□ 3.01
CDK13Q14004 FGFRL1-203ENST00000504138 1663 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.83■■■■□ 3.01
CDK13Q14004 KDF1-201ENST00000320567 1793 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC33.82■■■■□ 3.01
CDK13Q14004 BX322557.1-202ENST00000400362 1460 ntTSL 1 (best) BASIC33.82■■■■□ 3
CDK13Q14004 EPO-201ENST00000252723 1330 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.82■■■■□ 3
CDK13Q14004 XXYLT1-202ENST00000356740 564 ntTSL 2 BASIC33.82■■■■□ 3
CDK13Q14004 NCAPD3-204ENST00000526422 1060 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC33.82■■■■□ 3
CDK13Q14004 C19orf84-201ENST00000570516 788 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC33.82■■■■□ 3
CDK13Q14004 IGFBP3-211ENST00000615754 792 ntTSL 5 BASIC33.82■■■■□ 3
CDK13Q14004 PARP1-210ENST00000629232 477 ntTSL 5 BASIC33.82■■■■□ 3
CDK13Q14004 KLC3-204ENST00000585434 1764 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC33.82■■■■□ 3
CDK13Q14004 FAM136A-201ENST00000037869 1810 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.81■■■■□ 3
CDK13Q14004 TRAPPC6A-205ENST00000592647 514 ntTSL 2 BASIC33.81■■■■□ 3
CDK13Q14004 PLAGL1-207ENST00000417959 1645 ntTSL 1 (best) BASIC33.8■■■■□ 3
CDK13Q14004 TNFRSF10B-202ENST00000347739 1723 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC33.8■■■■□ 3
CDK13Q14004 AGAP1-IT1-201ENST00000440498 664 ntTSL 3 BASIC33.8■■■■□ 3
CDK13Q14004 SLC35A3-218ENST00000639994 1114 ntTSL 5 BASIC33.8■■■■□ 3
CDK13Q14004 PUS1-203ENST00000443358 1664 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC33.8■■■■□ 3
CDK13Q14004 NPY4R-201ENST00000374312 1956 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.8■■■■□ 3
CDK13Q14004 NPY4R2-201ENST00000576178 1956 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.8■■■■□ 3
CDK13Q14004 AP000282.1-201ENST00000454622 682 ntTSL 2 BASIC33.79■■■■□ 3
CDK13Q14004 MVB12A-212ENST00000543795 1154 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC33.79■■■■□ 3
CDK13Q14004 DHRS4-207ENST00000559632 1003 ntTSL 1 (best) BASIC33.79■■■■□ 3
CDK13Q14004 TMEM191A-211ENST00000637163 1067 ntBASIC33.79■■■■□ 3
CDK13Q14004 GGTLC1-202ENST00000286890 1028 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.79■■■■□ 3
CDK13Q14004 IL15RA-208ENST00000397251 1046 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC33.79■■■■□ 3
CDK13Q14004 AC138907.5-202ENST00000569484 235 ntBASIC33.79■■■■□ 3
CDK13Q14004 IL15RA-221ENST00000620865 1037 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC33.79■■■■□ 3
CDK13Q14004 IL15RA-222ENST00000622442 1160 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC33.79■■■■□ 3
CDK13Q14004 CD99-212ENST00000624481 1089 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC33.79■■■■□ 3
CDK13Q14004 DONSON-204ENST00000432378 1618 ntTSL 5 BASIC33.78■■■■□ 3
CDK13Q14004 FAM160B1-201ENST00000369246 666 ntTSL 2 BASIC33.78■■■■□ 3
CDK13Q14004 AC099522.1-201ENST00000505955 881 ntTSL 3 BASIC33.78■■■■□ 3
CDK13Q14004 AC010536.3-201ENST00000620306 533 ntBASIC33.78■■■■□ 3
CDK13Q14004 NOXO1-201ENST00000354249 1618 ntTSL 1 (best) BASIC33.78■■■■□ 3
CDK13Q14004 HMBS-201ENST00000278715 1501 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.78■■■■□ 3
CDK13Q14004 TLE6-201ENST00000246112 2100 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC33.78■■■■□ 3
CDK13Q14004 PIM3-201ENST00000360612 2369 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.77■■■■□ 3
CDK13Q14004 C3orf58-207ENST00000495414 1876 ntTSL 2 BASIC33.77■■■■□ 3
CDK13Q14004 ARL6IP4-205ENST00000412505 818 ntTSL 5 BASIC33.77■■■■□ 3
CDK13Q14004 CYP2T1P-201ENST00000432607 1285 ntBASIC33.77■■■■□ 3
CDK13Q14004 HMX1-202ENST00000506970 651 ntTSL 1 (best) BASIC33.77■■■■□ 3
CDK13Q14004 SNX24-211ENST00000513881 1563 ntTSL 1 (best) BASIC33.77■■■■□ 3
CDK13Q14004 SH2D3A-202ENST00000437152 2013 ntTSL 2 BASIC33.76■■■■□ 3
CDK13Q14004 SPRTN-201ENST00000008440 1667 ntTSL 2 BASIC33.76■■■■□ 3
CDK13Q14004 HRASLS5-201ENST00000301790 1166 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC33.76■■■■□ 3
CDK13Q14004 UBXN2B-206ENST00000638450 591 ntTSL 5 BASIC33.76■■■■□ 3
CDK13Q14004 SLC41A3-201ENST00000315891 1797 ntTSL 1 (best) BASIC33.76■■■□□ 2.99
CDK13Q14004 HOMER3-204ENST00000539827 1979 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC33.76■■■□□ 2.99
CDK13Q14004 FZD9-201ENST00000344575 2338 ntAPPRIS P1 BASIC33.75■■■□□ 2.99
CDK13Q14004 CEACAM4-201ENST00000221954 1205 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC33.75■■■□□ 2.99
CDK13Q14004 FADS3-204ENST00000525588 1254 ntTSL 5 BASIC33.75■■■□□ 2.99
CDK13Q14004 SCO2-203ENST00000535425 1002 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC33.75■■■□□ 2.99
CDK13Q14004 CEACAM4-203ENST00000600925 899 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC33.75■■■□□ 2.99
CDK13Q14004 TARDBP-228ENST00000629725 1031 ntTSL 5 BASIC33.75■■■□□ 2.99
CDK13Q14004 AC066615.1-201ENST00000640911 628 ntBASIC33.75■■■□□ 2.99
CDK13Q14004 MFSD7-203ENST00000404286 1826 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC33.75■■■□□ 2.99
CDK13Q14004 MAPK9-206ENST00000425491 2266 ntTSL 5 BASIC33.75■■■□□ 2.99
CDK13Q14004 TPM1-204ENST00000334895 1637 ntTSL 1 (best) BASIC33.74■■■□□ 2.99
CDK13Q14004 SLC29A4P1-201ENST00000398760 971 ntBASIC33.74■■■□□ 2.99
CDK13Q14004 ZNF213-208ENST00000576416 2240 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC33.74■■■□□ 2.99
CDK13Q14004 ZYX-201ENST00000322764 2493 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC33.74■■■□□ 2.99
CDK13Q14004 IGSF21-201ENST00000251296 1943 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.74■■■□□ 2.99
CDK13Q14004 MEIS3-212ENST00000561293 1918 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC33.74■■■□□ 2.99
CDK13Q14004 NELFB-201ENST00000343053 2698 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC33.74■■■□□ 2.99
CDK13Q14004 HOXD9-201ENST00000249499 1870 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.74■■■□□ 2.99
CDK13Q14004 FRMD8-203ENST00000416776 1818 ntTSL 2 BASIC33.73■■■□□ 2.99
CDK13Q14004 VSX1-205ENST00000429762 1977 ntTSL 1 (best) BASIC33.73■■■□□ 2.99
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