Protein–RNA interactions for Protein: Q13790

APOF, Apolipoprotein F, humanhuman

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Length 326 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
APOFQ13790 AC005551.1-201ENST00000641816 493 ntAPPRIS P1 BASIC20.04■□□□□ 0.8
APOFQ13790 UBTD2-201ENST00000393792 3301 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.04■□□□□ 0.8
APOFQ13790 SETD9-201ENST00000285947 1619 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.04■□□□□ 0.8
APOFQ13790 SH3D19-211ENST00000604030 5228 ntTSL 5 BASIC20.04■□□□□ 0.8
APOFQ13790 RBKS-201ENST00000302188 1973 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.04■□□□□ 0.8
APOFQ13790 ZC3H14-219ENST00000556945 2075 ntTSL 5 BASIC20.04■□□□□ 0.8
APOFQ13790 RHBDD2-201ENST00000006777 1802 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.04■□□□□ 0.8
APOFQ13790 GRB10-206ENST00000402497 2289 ntTSL 5 BASIC20.04■□□□□ 0.8
APOFQ13790 BACE2-201ENST00000328735 2824 ntTSL 1 (best) BASIC20.03■□□□□ 0.8
APOFQ13790 OSR2-203ENST00000457907 2126 ntTSL 2 BASIC20.03■□□□□ 0.8
APOFQ13790 TATDN2-201ENST00000287652 5342 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.03■□□□□ 0.8
APOFQ13790 SIMC1-203ENST00000429602 2694 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.03■□□□□ 0.8
APOFQ13790 IRF7-205ENST00000397574 1968 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.03■□□□□ 0.8
APOFQ13790 DGKZ-214ENST00000527911 3337 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.03■□□□□ 0.8
APOFQ13790 CDCA5-202ENST00000404147 1012 ntTSL 2 BASIC20.03■□□□□ 0.8
APOFQ13790 CT47A7-201ENST00000434883 1288 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.03■□□□□ 0.8
APOFQ13790 CLIC3-203ENST00000494426 1017 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.03■□□□□ 0.8
APOFQ13790 MIR4281-201ENST00000580852 62 ntBASIC20.03■□□□□ 0.8
APOFQ13790 LETM1-201ENST00000302787 5462 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.03■□□□□ 0.8
APOFQ13790 STEAP2-207ENST00000402625 1372 ntTSL 5 BASIC20.03■□□□□ 0.8
APOFQ13790 TMEM235-202ENST00000421688 2490 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.03■□□□□ 0.8
APOFQ13790 NDUFAF3-202ENST00000326925 2012 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.03■□□□□ 0.8
APOFQ13790 AC110285.2-201ENST00000571724 1565 ntTSL 2 BASIC20.03■□□□□ 0.8
APOFQ13790 NOP56-201ENST00000329276 2400 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.03■□□□□ 0.8
APOFQ13790 UAP1-201ENST00000271469 2377 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC20.02■□□□□ 0.8
APOFQ13790 KDM3B-201ENST00000314358 6813 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.02■□□□□ 0.8
APOFQ13790 HCN2-201ENST00000251287 3408 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.02■□□□□ 0.8
APOFQ13790 AC004448.1-201ENST00000458332 883 ntBASIC20.02■□□□□ 0.8
APOFQ13790 THA1P-201ENST00000590384 1145 ntBASIC20.02■□□□□ 0.8
APOFQ13790 PHF11-202ENST00000378319 1359 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.02■□□□□ 0.8
APOFQ13790 SPHK1-202ENST00000392496 1779 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.02■□□□□ 0.8
APOFQ13790 CACNB1-203ENST00000394310 1753 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC20.02■□□□□ 0.8
APOFQ13790 POLE2-202ENST00000539565 1792 ntTSL 1 (best) BASIC20.02■□□□□ 0.8
APOFQ13790 ST3GAL3-207ENST00000353126 1969 ntTSL 5 BASIC20.02■□□□□ 0.8
APOFQ13790 PSIP1-201ENST00000380715 1966 ntTSL 1 (best) BASIC20.02■□□□□ 0.8
APOFQ13790 AC016065.1-201ENST00000500118 2413 ntTSL 2 BASIC20.02■□□□□ 0.79
APOFQ13790 DNAAF3-207ENST00000527223 2228 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC20.02■□□□□ 0.79
APOFQ13790 LRP5-201ENST00000294304 5159 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.02■□□□□ 0.79
APOFQ13790 ZFAND2B-201ENST00000289528 1314 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.02■□□□□ 0.79
APOFQ13790 MMP24-201ENST00000246186 4414 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.01■□□□□ 0.79
APOFQ13790 RABL2B-206ENST00000395598 2169 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.01■□□□□ 0.79
APOFQ13790 SAP30L-201ENST00000297109 6226 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.01■□□□□ 0.79
APOFQ13790 AC064853.3-201ENST00000641801 1658 ntAPPRIS P1 BASIC20.01■□□□□ 0.79
APOFQ13790 IDNK-201ENST00000376417 511 ntTSL 5 BASIC20.01■□□□□ 0.79
APOFQ13790 IDNK-202ENST00000376419 692 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.01■□□□□ 0.79
APOFQ13790 FAM167A-204ENST00000528897 1620 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.01■□□□□ 0.79
APOFQ13790 FADS6-203ENST00000612771 2154 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.01■□□□□ 0.79
APOFQ13790 TOP1MT-201ENST00000329245 1958 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.01■□□□□ 0.79
APOFQ13790 TRMT2A-201ENST00000252136 2964 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.01■□□□□ 0.79
APOFQ13790 RASGRP2-211ENST00000394432 2304 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.01■□□□□ 0.79
APOFQ13790 CDK5-204ENST00000485972 1758 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20■□□□□ 0.79
APOFQ13790 FAM102B-201ENST00000370035 5600 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20■□□□□ 0.79
APOFQ13790 FAM129C-203ENST00000449408 2004 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC20■□□□□ 0.79
APOFQ13790 TMEM121B-201ENST00000331437 4954 ntAPPRIS P3 BASIC20■□□□□ 0.79
APOFQ13790 PDLIM3-212ENST00000620787 2352 ntTSL 4 BASIC20■□□□□ 0.79
APOFQ13790 SYNC-201ENST00000373484 1824 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC20■□□□□ 0.79
APOFQ13790 DNAAF3-201ENST00000391720 2169 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC20■□□□□ 0.79
APOFQ13790 YIPF2-201ENST00000253031 2087 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20■□□□□ 0.79
APOFQ13790 PRELID1-201ENST00000303204 1261 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20■□□□□ 0.79
APOFQ13790 KRT18P24-201ENST00000344739 1156 ntBASIC20■□□□□ 0.79
APOFQ13790 AC148477.1-201ENST00000537720 476 ntTSL 3 BASIC20■□□□□ 0.79
APOFQ13790 MCRIP1-210ENST00000576431 577 ntTSL 5 BASIC20■□□□□ 0.79
APOFQ13790 SSX2IP-209ENST00000603677 1149 ntTSL 1 (best) BASIC20■□□□□ 0.79
APOFQ13790 ARL6IP4-201ENST00000315580 1644 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20■□□□□ 0.79
APOFQ13790 USF2-207ENST00000595068 1612 ntTSL 5 BASIC20■□□□□ 0.79
APOFQ13790 TNIP1-205ENST00000518977 2200 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20■□□□□ 0.79
APOFQ13790 FBXL14-201ENST00000339235 2111 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20■□□□□ 0.79
APOFQ13790 POMGNT1-201ENST00000371984 2728 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20■□□□□ 0.79
APOFQ13790 NYX-202ENST00000378220 2297 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20■□□□□ 0.79
APOFQ13790 SOX2-201ENST00000325404 2513 ntAPPRIS P1 BASIC20■□□□□ 0.79
APOFQ13790 DHRS11-215ENST00000618403 1598 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20■□□□□ 0.79
APOFQ13790 SMURF1-201ENST00000361125 5737 ntTSL 1 (best) BASIC19.99■□□□□ 0.79
APOFQ13790 PLEKHO1-201ENST00000369124 2050 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.99■□□□□ 0.79
APOFQ13790 KCNS3-201ENST00000304101 2333 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.99■□□□□ 0.79
APOFQ13790 TSNAXIP1-202ENST00000415766 2338 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC19.99■□□□□ 0.79
APOFQ13790 AL117348.2-201ENST00000432920 1625 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.99■□□□□ 0.79
APOFQ13790 SPG21-202ENST00000416889 1533 ntTSL 2 BASIC19.99■□□□□ 0.79
APOFQ13790 AC116025.2-201ENST00000576632 443 ntTSL 3 BASIC19.99■□□□□ 0.79
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APOFQ13790 TBX2-AS1-203ENST00000590421 861 ntTSL 2 BASIC19.99■□□□□ 0.79
APOFQ13790 NTF6A-201ENST00000591175 560 ntBASIC19.99■□□□□ 0.79
APOFQ13790 AC064853.2-201ENST00000641246 144 ntAPPRIS P1 BASIC19.99■□□□□ 0.79
APOFQ13790 RLBP1-201ENST00000268125 1810 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.99■□□□□ 0.79
APOFQ13790 MAPRE3-203ENST00000405074 1801 ntTSL 3 BASIC19.99■□□□□ 0.79
APOFQ13790 CPXM2-204ENST00000615851 2512 ntTSL 5 BASIC19.99■□□□□ 0.79
APOFQ13790 AC145124.1-201ENST00000528514 1361 ntTSL 2 BASIC19.98■□□□□ 0.79
APOFQ13790 TMEM132A-202ENST00000453848 3346 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.98■□□□□ 0.79
APOFQ13790 JAGN1-201ENST00000307768 1693 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.98■□□□□ 0.79
APOFQ13790 COPRS-201ENST00000302362 968 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.98■□□□□ 0.79
APOFQ13790 NDUFA10-204ENST00000407129 699 ntTSL 1 (best) BASIC19.98■□□□□ 0.79
APOFQ13790 CPEB1-AS1-201ENST00000560650 2138 ntTSL 1 (best) BASIC19.98■□□□□ 0.79
APOFQ13790 H2AFB1-201ENST00000620016 587 ntAPPRIS P1 BASIC19.98■□□□□ 0.79
APOFQ13790 AL020996.1-203ENST00000536896 2307 ntBASIC19.98■□□□□ 0.79
APOFQ13790 POTEC-204ENST00000620346 1988 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.97■□□□□ 0.79
APOFQ13790 TRIM58-201ENST00000366481 3225 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.97■□□□□ 0.79
APOFQ13790 SOCS2-201ENST00000340600 2761 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.97■□□□□ 0.79
APOFQ13790 TDRP-203ENST00000523656 2622 ntTSL 5 BASIC19.97■□□□□ 0.79
APOFQ13790 EYA2-210ENST00000611592 2612 ntTSL 5 BASIC19.97■□□□□ 0.79
APOFQ13790 A1BG-201ENST00000263100 1722 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.97■□□□□ 0.79
APOFQ13790 LRRC34-201ENST00000446859 1718 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC19.97■□□□□ 0.79
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