Protein–RNA interactions for Protein: Q13573

SNW1, SNW domain-containing protein 1, humanhuman

Known RBP Predictions only

Length 536 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SNW1Q13573 LENG1-201ENST00000222224 1542 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.61■■□□□ 1.53
SNW1Q13573 ATP6AP1-201ENST00000369762 2099 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.6■■□□□ 1.53
SNW1Q13573 LAYN-201ENST00000375614 2066 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.6■■□□□ 1.53
SNW1Q13573 Z98883.1-202ENST00000635107 1289 ntTSL 5 BASIC24.6■■□□□ 1.53
SNW1Q13573 AC093762.1-201ENST00000641981 837 ntAPPRIS P1 BASIC24.6■■□□□ 1.53
SNW1Q13573 CHRNA7-203ENST00000454250 2093 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC24.6■■□□□ 1.53
SNW1Q13573 CPEB1-218ENST00000620182 2422 ntTSL 2 BASIC24.6■■□□□ 1.53
SNW1Q13573 KCNN4-201ENST00000262888 2240 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.59■■□□□ 1.53
SNW1Q13573 MEIS2-207ENST00000557796 2666 ntTSL 5 BASIC24.59■■□□□ 1.53
SNW1Q13573 PARD3-213ENST00000545260 5740 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.59■■□□□ 1.53
SNW1Q13573 MFSD6L-201ENST00000329805 2188 ntAPPRIS P1 BASIC24.59■■□□□ 1.53
SNW1Q13573 CRYAA-201ENST00000291554 1139 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.59■■□□□ 1.53
SNW1Q13573 IGFBP1-202ENST00000457280 1601 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.59■■□□□ 1.53
SNW1Q13573 AC244015.2-201ENST00000616358 1861 ntBASIC24.59■■□□□ 1.53
SNW1Q13573 STAP2-206ENST00000600324 1508 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC24.59■■□□□ 1.53
SNW1Q13573 THOC6-202ENST00000326266 1419 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.59■■□□□ 1.53
SNW1Q13573 FBXO25-203ENST00000352684 2360 ntTSL 5 BASIC24.59■■□□□ 1.53
SNW1Q13573 SGMS1-210ENST00000619438 1680 ntTSL 5 BASIC24.59■■□□□ 1.53
SNW1Q13573 PALM-208ENST00000592155 2272 ntTSL 4 BASIC24.59■■□□□ 1.53
SNW1Q13573 HTATIP2-204ENST00000451739 1748 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.58■■□□□ 1.53
SNW1Q13573 CASP9-203ENST00000375890 1351 ntTSL 2 BASIC24.58■■□□□ 1.53
SNW1Q13573 KCNT1-201ENST00000263604 5245 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.58■■□□□ 1.53
SNW1Q13573 AL357078.1-201ENST00000448344 310 ntTSL 4 BASIC24.58■■□□□ 1.53
SNW1Q13573 SLC16A10-206ENST00000612036 1231 ntTSL 5 BASIC24.58■■□□□ 1.53
SNW1Q13573 AL117332.1-201ENST00000622628 974 ntBASIC24.58■■□□□ 1.53
SNW1Q13573 COL23A1-201ENST00000390654 3061 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC24.58■■□□□ 1.53
SNW1Q13573 GNA11-201ENST00000078429 4147 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.58■■□□□ 1.53
SNW1Q13573 MCAT-201ENST00000290429 2056 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.58■■□□□ 1.53
SNW1Q13573 CCDC185-201ENST00000366875 2054 ntAPPRIS P1 BASIC24.58■■□□□ 1.53
SNW1Q13573 TRIM3-214ENST00000536344 2704 ntTSL 2 BASIC24.58■■□□□ 1.53
SNW1Q13573 STK19-202ENST00000375333 1557 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.58■■□□□ 1.52
SNW1Q13573 HNRNPAB-208ENST00000515193 1595 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.58■■□□□ 1.52
SNW1Q13573 TBL1Y-202ENST00000355162 2376 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.58■■□□□ 1.52
SNW1Q13573 SERTAD3-201ENST00000322354 1734 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.58■■□□□ 1.52
SNW1Q13573 SPAST-204ENST00000621856 1715 ntTSL 1 (best) BASIC24.58■■□□□ 1.52
SNW1Q13573 THEM6-201ENST00000336138 2259 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.58■■□□□ 1.52
SNW1Q13573 PTDSS2-201ENST00000308020 2445 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.57■■□□□ 1.52
SNW1Q13573 AC005229.4-201ENST00000610085 2198 ntBASIC24.57■■□□□ 1.52
SNW1Q13573 CD6-203ENST00000352009 1809 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.57■■□□□ 1.52
SNW1Q13573 FAM173A-201ENST00000219535 806 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC24.57■■□□□ 1.52
SNW1Q13573 IL15RA-209ENST00000397255 759 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.57■■□□□ 1.52
SNW1Q13573 TMEM80-201ENST00000397510 1094 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC24.57■■□□□ 1.52
SNW1Q13573 IL15RA-216ENST00000530685 660 ntTSL 5 BASIC24.57■■□□□ 1.52
SNW1Q13573 IRX4-207ENST00000613726 2403 ntTSL 1 (best) BASIC24.57■■□□□ 1.52
SNW1Q13573 PTPN18-202ENST00000347849 2472 ntTSL 1 (best) BASIC24.57■■□□□ 1.52
SNW1Q13573 AC074143.1-203ENST00000518227 1473 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.57■■□□□ 1.52
SNW1Q13573 HNRNPAB-201ENST00000355836 1602 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.57■■□□□ 1.52
SNW1Q13573 SPHK1-202ENST00000392496 1779 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.57■■□□□ 1.52
SNW1Q13573 TTYH1-201ENST00000301194 2088 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC24.57■■□□□ 1.52
SNW1Q13573 TFAP2A-202ENST00000379608 2576 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC24.56■■□□□ 1.52
SNW1Q13573 C1orf174-201ENST00000361605 1666 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.56■■□□□ 1.52
SNW1Q13573 FAM20C-201ENST00000313766 2751 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.56■■□□□ 1.52
SNW1Q13573 REXO1-201ENST00000170168 4591 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.56■■□□□ 1.52
SNW1Q13573 TNFRSF25-201ENST00000348333 1119 ntTSL 1 (best) BASIC24.56■■□□□ 1.52
SNW1Q13573 TNFRSF25-202ENST00000351748 705 ntTSL 1 (best) BASIC24.56■■□□□ 1.52
SNW1Q13573 ARPC4-208ENST00000498623 942 ntTSL 2 BASIC24.56■■□□□ 1.52
SNW1Q13573 AL031602.1-201ENST00000633169 911 ntBASIC24.56■■□□□ 1.52
SNW1Q13573 ACAA1-202ENST00000333167 1785 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.56■■□□□ 1.52
SNW1Q13573 HES5-201ENST00000378453 1306 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.56■■□□□ 1.52
SNW1Q13573 SHMT1-203ENST00000354098 1656 ntTSL 1 (best) BASIC24.56■■□□□ 1.52
SNW1Q13573 RBBP7-202ENST00000380084 2036 ntTSL 2 BASIC24.56■■□□□ 1.52
SNW1Q13573 TMC6-212ENST00000589553 2389 ntTSL 2 BASIC24.56■■□□□ 1.52
SNW1Q13573 PHLDB2-210ENST00000478922 1861 ntTSL 1 (best) BASIC24.55■■□□□ 1.52
SNW1Q13573 ATG4D-201ENST00000309469 1949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.55■■□□□ 1.52
SNW1Q13573 D2HGDH-201ENST00000321264 2617 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.55■■□□□ 1.52
SNW1Q13573 NAXE-201ENST00000368233 1012 ntTSL 2 BASIC24.55■■□□□ 1.52
SNW1Q13573 BAD-203ENST00000394532 1157 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.55■■□□□ 1.52
SNW1Q13573 TSPAN17-204ENST00000503045 1019 ntTSL 5 BASIC24.55■■□□□ 1.52
SNW1Q13573 MIR6724-1-201ENST00000616420 92 ntBASIC24.55■■□□□ 1.52
SNW1Q13573 MIR6724-2-201ENST00000616483 92 ntBASIC24.55■■□□□ 1.52
SNW1Q13573 MIR6724-4-201ENST00000617390 92 ntBASIC24.55■■□□□ 1.52
SNW1Q13573 AC110285.6-201ENST00000617652 491 ntBASIC24.55■■□□□ 1.52
SNW1Q13573 MIR6724-3-201ENST00000622482 92 ntBASIC24.55■■□□□ 1.52
SNW1Q13573 AC243965.2-201ENST00000612576 2671 ntTSL 5 BASIC24.55■■□□□ 1.52
SNW1Q13573 PLPP1-201ENST00000264775 1550 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC24.54■■□□□ 1.52
SNW1Q13573 MIR210HG-201ENST00000500447 1965 ntTSL 2 BASIC24.54■■□□□ 1.52
SNW1Q13573 ZDHHC5-204ENST00000527985 2817 ntTSL 1 (best) BASIC24.54■■□□□ 1.52
SNW1Q13573 AL606970.3-201ENST00000446811 2246 ntTSL 2 BASIC24.54■■□□□ 1.52
SNW1Q13573 TSPAN3-202ENST00000346495 1647 ntTSL 2 BASIC24.54■■□□□ 1.52
SNW1Q13573 DGKQ-201ENST00000273814 4636 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.54■■□□□ 1.52
SNW1Q13573 NDUFV2-201ENST00000318388 930 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.54■■□□□ 1.52
SNW1Q13573 LRRK1-208ENST00000532029 1241 ntTSL 1 (best) BASIC24.54■■□□□ 1.52
SNW1Q13573 NKX2-5-201ENST00000329198 1709 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.54■■□□□ 1.52
SNW1Q13573 PABPC1L2B-201ENST00000373521 2197 ntAPPRIS P1 BASIC24.54■■□□□ 1.52
SNW1Q13573 MESP2-201ENST00000341735 1552 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.54■■□□□ 1.52
SNW1Q13573 CACNA1H-202ENST00000358590 8069 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.54■■□□□ 1.52
SNW1Q13573 FBXL14-201ENST00000339235 2111 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.53■■□□□ 1.52
SNW1Q13573 ALDH5A1-204ENST00000491546 1699 ntTSL 5 BASIC24.53■■□□□ 1.52
SNW1Q13573 TRIP13-201ENST00000166345 2672 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.53■■□□□ 1.52
SNW1Q13573 POTEC-204ENST00000620346 1988 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.53■■□□□ 1.52
SNW1Q13573 CDKN2A-208ENST00000498124 880 ntTSL 1 (best) BASIC24.53■■□□□ 1.52
SNW1Q13573 MIR3621-201ENST00000580529 85 ntBASIC24.53■■□□□ 1.52
SNW1Q13573 TMC6-218ENST00000591436 1155 ntTSL 1 (best) BASIC24.53■■□□□ 1.52
SNW1Q13573 KLF9-201ENST00000377126 5175 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.53■■□□□ 1.52
SNW1Q13573 GNB3-201ENST00000229264 1923 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC24.53■■□□□ 1.52
SNW1Q13573 GFRA4-201ENST00000290417 1427 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.52■■□□□ 1.52
SNW1Q13573 FXYD3-201ENST00000344013 1404 ntTSL 5 BASIC24.52■■□□□ 1.52
SNW1Q13573 FAM185A-201ENST00000409231 1446 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC24.52■■□□□ 1.52
SNW1Q13573 NR2F1-AS1-210ENST00000606739 1431 ntTSL 2 BASIC24.52■■□□□ 1.52
SNW1Q13573 OSBPL10-204ENST00000438237 2624 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC24.52■■□□□ 1.52
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 39.1 ms