Protein–RNA interactions for Protein: Q13568

IRF5, Interferon regulatory factor 5, humanhuman

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
IRF5Q13568 UPK3B-203ENST00000394849 1041 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC24.63■■□□□ 1.53
IRF5Q13568 FAM71E1-204ENST00000600100 1281 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.63■■□□□ 1.53
IRF5Q13568 IGFBP3-211ENST00000615754 792 ntTSL 5 BASIC24.63■■□□□ 1.53
IRF5Q13568 GGTLC3-201ENST00000619998 968 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.63■■□□□ 1.53
IRF5Q13568 RWDD4-206ENST00000512740 1393 ntTSL 5 BASIC24.63■■□□□ 1.53
IRF5Q13568 VDAC1-203ENST00000395047 1873 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.62■■□□□ 1.53
IRF5Q13568 AC010141.2-201ENST00000452426 721 ntBASIC24.62■■□□□ 1.53
IRF5Q13568 PRMT1-221ENST00000610806 1192 ntTSL 3 BASIC24.62■■□□□ 1.53
IRF5Q13568 CBARP-202ENST00000382477 2453 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.62■■□□□ 1.53
IRF5Q13568 AVPI1-201ENST00000370626 1457 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.62■■□□□ 1.53
IRF5Q13568 SLC15A3-201ENST00000227880 2115 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.62■■□□□ 1.53
IRF5Q13568 CLPTM1L-201ENST00000320895 2500 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.62■■□□□ 1.53
IRF5Q13568 UBE2E3-201ENST00000392415 1347 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC24.61■■□□□ 1.53
IRF5Q13568 AHSA2-201ENST00000357022 2437 ntTSL 1 (best) BASIC24.61■■□□□ 1.53
IRF5Q13568 RNA5SP413-201ENST00000516373 109 ntBASIC24.61■■□□□ 1.53
IRF5Q13568 OVCH1-AS1-203ENST00000551108 963 ntTSL 2 BASIC24.61■■□□□ 1.53
IRF5Q13568 AC138907.5-202ENST00000569484 235 ntBASIC24.61■■□□□ 1.53
IRF5Q13568 PICALM-224ENST00000630913 2261 ntTSL 5 BASIC24.6■■□□□ 1.53
IRF5Q13568 PTPA-202ENST00000347048 1989 ntTSL 1 (best) BASIC24.6■■□□□ 1.53
IRF5Q13568 AC055733.4-201ENST00000638462 1354 ntBASIC24.6■■□□□ 1.53
IRF5Q13568 CUEDC2-201ENST00000369937 1191 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.6■■□□□ 1.53
IRF5Q13568 AC093833.1-201ENST00000442821 553 ntTSL 5 BASIC24.6■■□□□ 1.53
IRF5Q13568 TPT1-AS1-211ENST00000520622 604 ntTSL 4 BASIC24.6■■□□□ 1.53
IRF5Q13568 MARS-234ENST00000630571 216 ntTSL 5 BASIC24.6■■□□□ 1.53
IRF5Q13568 MARS-235ENST00000630803 183 ntTSL 3 BASIC24.6■■□□□ 1.53
IRF5Q13568 EN1-201ENST00000295206 2457 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.6■■□□□ 1.53
IRF5Q13568 BCL2L12-212ENST00000616144 1854 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.6■■□□□ 1.53
IRF5Q13568 NPAS1-208ENST00000602212 2117 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.59■■□□□ 1.53
IRF5Q13568 ADAP2-204ENST00000580525 1598 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.59■■□□□ 1.53
IRF5Q13568 H19-210ENST00000439725 1929 ntTSL 2 BASIC24.59■■□□□ 1.53
IRF5Q13568 ADIPOR1-201ENST00000340990 2177 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.59■■□□□ 1.53
IRF5Q13568 ABHD8-201ENST00000247706 2090 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.59■■□□□ 1.53
IRF5Q13568 COX5B-201ENST00000258424 712 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.59■■□□□ 1.53
IRF5Q13568 MAP1LC3A-202ENST00000374837 961 ntTSL 3 BASIC24.59■■□□□ 1.53
IRF5Q13568 EMC6-202ENST00000397133 762 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.59■■□□□ 1.53
IRF5Q13568 MIPEPP3-201ENST00000412105 444 ntBASIC24.59■■□□□ 1.53
IRF5Q13568 EIF4E3-203ENST00000421769 777 ntTSL 1 (best) BASIC24.59■■□□□ 1.53
IRF5Q13568 PPP1R14BP2-201ENST00000426284 444 ntBASIC24.59■■□□□ 1.53
IRF5Q13568 ZNF346-203ENST00000503425 1191 ntTSL 2 BASIC24.59■■□□□ 1.53
IRF5Q13568 MYO19-221ENST00000620640 1186 ntTSL 2 BASIC24.59■■□□□ 1.53
IRF5Q13568 AC013268.1-206ENST00000638368 961 ntBASIC24.59■■□□□ 1.53
IRF5Q13568 AC112229.1-201ENST00000639295 961 ntBASIC24.59■■□□□ 1.53
IRF5Q13568 PLEKHB1-201ENST00000227214 2016 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC24.59■■□□□ 1.53
IRF5Q13568 PPP1R12B-202ENST00000356764 1687 ntTSL 1 (best) BASIC24.59■■□□□ 1.53
IRF5Q13568 KLC3-202ENST00000470402 1820 ntTSL 1 (best) BASIC24.58■■□□□ 1.53
IRF5Q13568 GLT8D2-205ENST00000548660 1835 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.58■■□□□ 1.53
IRF5Q13568 KCNIP1-203ENST00000390656 2249 ntTSL 5 BASIC24.58■■□□□ 1.53
IRF5Q13568 HSF1-201ENST00000400780 2105 ntTSL 5 BASIC24.58■■□□□ 1.53
IRF5Q13568 CACNB1-203ENST00000394310 1753 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC24.58■■□□□ 1.53
IRF5Q13568 DUSP8P3-201ENST00000399571 1760 ntBASIC24.58■■□□□ 1.53
IRF5Q13568 MTHFS-201ENST00000258874 907 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.58■■□□□ 1.53
IRF5Q13568 WIPF1-207ENST00000410117 777 ntTSL 3 BASIC24.58■■□□□ 1.53
IRF5Q13568 ALKBH6-212ENST00000485128 959 ntTSL 5 BASIC24.58■■□□□ 1.53
IRF5Q13568 ST6GALNAC6-204ENST00000373144 2406 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC24.58■■□□□ 1.53
IRF5Q13568 AC083805.3-201ENST00000619560 1315 ntTSL 3 BASIC24.58■■□□□ 1.52
IRF5Q13568 DENND2D-202ENST00000369752 1894 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC24.58■■□□□ 1.52
IRF5Q13568 GNB2-209ENST00000436220 1479 ntTSL 5 BASIC24.58■■□□□ 1.52
IRF5Q13568 CPLX1-201ENST00000304062 2181 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.57■■□□□ 1.52
IRF5Q13568 PXK-203ENST00000383715 1756 ntTSL 5 BASIC24.57■■□□□ 1.52
IRF5Q13568 GRTP1-203ENST00000375431 1384 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.57■■□□□ 1.52
IRF5Q13568 LSM8-203ENST00000422760 1920 ntTSL 1 (best) BASIC24.57■■□□□ 1.52
IRF5Q13568 UXS1-201ENST00000283148 2099 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC24.57■■□□□ 1.52
IRF5Q13568 ZPBP2-201ENST00000348931 1543 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC24.57■■□□□ 1.52
IRF5Q13568 AMIGO1-201ENST00000369862 2229 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.57■■□□□ 1.52
IRF5Q13568 MAP2K5-204ENST00000395476 1689 ntTSL 1 (best) BASIC24.57■■□□□ 1.52
IRF5Q13568 LINC01816-201ENST00000414141 662 ntTSL 1 (best) BASIC24.57■■□□□ 1.52
IRF5Q13568 SLC7A5P1-201ENST00000568957 537 ntBASIC24.57■■□□□ 1.52
IRF5Q13568 AL160396.2-202ENST00000636692 566 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.57■■□□□ 1.52
IRF5Q13568 IL17RE-203ENST00000421412 2158 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.57■■□□□ 1.52
IRF5Q13568 RAB3A-201ENST00000222256 1528 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.56■■□□□ 1.52
IRF5Q13568 PYURF-201ENST00000273968 1361 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.56■■□□□ 1.52
IRF5Q13568 TAZ-205ENST00000475699 1862 ntTSL 1 (best) BASIC24.56■■□□□ 1.52
IRF5Q13568 MTAP-204ENST00000460874 1434 ntTSL 2 BASIC24.56■■□□□ 1.52
IRF5Q13568 SERF1A-201ENST00000317633 963 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.56■■□□□ 1.52
IRF5Q13568 LINC01637-201ENST00000444039 684 ntTSL 2 BASIC24.56■■□□□ 1.52
IRF5Q13568 AC099805.1-201ENST00000523987 1797 ntTSL 1 (best) BASIC24.56■■□□□ 1.52
IRF5Q13568 PLAGL1-207ENST00000417959 1645 ntTSL 1 (best) BASIC24.56■■□□□ 1.52
IRF5Q13568 CPNE1-202ENST00000352393 2147 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.56■■□□□ 1.52
IRF5Q13568 NAE1-202ENST00000359087 1825 ntTSL 2 BASIC24.56■■□□□ 1.52
IRF5Q13568 SNTA1-201ENST00000217381 2342 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.56■■□□□ 1.52
IRF5Q13568 SMOX-201ENST00000278795 2164 ntTSL 1 (best) BASIC24.56■■□□□ 1.52
IRF5Q13568 IGFBP1-201ENST00000275525 1653 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.56■■□□□ 1.52
IRF5Q13568 SNX24-211ENST00000513881 1563 ntTSL 1 (best) BASIC24.55■■□□□ 1.52
IRF5Q13568 NIPSNAP2-201ENST00000322090 1999 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.55■■□□□ 1.52
IRF5Q13568 MRPL12-201ENST00000333676 1028 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.55■■□□□ 1.52
IRF5Q13568 EFCAB6-202ENST00000356087 1129 ntTSL 5 BASIC24.55■■□□□ 1.52
IRF5Q13568 UQCRFS1P1-201ENST00000435169 820 ntBASIC24.55■■□□□ 1.52
IRF5Q13568 RPS2P52-201ENST00000469610 820 ntBASIC24.55■■□□□ 1.52
IRF5Q13568 NPHS2-201ENST00000367615 1855 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.55■■□□□ 1.52
IRF5Q13568 MKRN4P-201ENST00000444706 1521 ntBASIC24.55■■□□□ 1.52
IRF5Q13568 DECR2-201ENST00000219481 1615 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.54■■□□□ 1.52
IRF5Q13568 LACTBL1-201ENST00000426928 1641 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC24.54■■□□□ 1.52
IRF5Q13568 AC068338.2-201ENST00000563278 1430 ntBASIC24.54■■□□□ 1.52
IRF5Q13568 TTC39A-203ENST00000371747 1876 ntTSL 2 BASIC24.54■■□□□ 1.52
IRF5Q13568 PPP1CA-202ENST00000358239 1054 ntTSL 2 BASIC24.54■■□□□ 1.52
IRF5Q13568 SMNDC1-201ENST00000369592 1110 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC24.54■■□□□ 1.52
IRF5Q13568 BET1L-204ENST00000410108 637 ntTSL 3 BASIC24.54■■□□□ 1.52
IRF5Q13568 TERF1P5-201ENST00000477545 1207 ntBASIC24.54■■□□□ 1.52
IRF5Q13568 FAM219B-212ENST00000565772 1249 ntTSL 1 (best) BASIC24.54■■□□□ 1.52
IRF5Q13568 AC005786.3-201ENST00000589360 565 ntTSL 3 BASIC24.54■■□□□ 1.52
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