Protein–RNA interactions for Protein: Q13564

NAE1, NEDD8-activating enzyme E1 regulatory subunit, humanhuman

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Length 534 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
NAE1Q13564 CKLF-205ENST00000417030 628 ntAPPRIS ALT2 TSL 4 BASIC21.01■□□□□ 0.95
NAE1Q13564 AC133561.4-201ENST00000566112 224 ntBASIC21.01■□□□□ 0.95
NAE1Q13564 HOMER3-206ENST00000594439 982 ntTSL 1 (best) BASIC21.01■□□□□ 0.95
NAE1Q13564 MYDGF-203ENST00000599630 713 ntTSL 2 BASIC21.01■□□□□ 0.95
NAE1Q13564 SYNGR3-206ENST00000618464 1213 ntTSL 1 (best) BASIC21.01■□□□□ 0.95
NAE1Q13564 PAXBP1-201ENST00000290178 2564 ntTSL 1 (best) BASIC21.01■□□□□ 0.95
NAE1Q13564 OR7E47P-201ENST00000546390 1422 ntBASIC21.01■□□□□ 0.95
NAE1Q13564 DYRK1B-204ENST00000593685 2724 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC21.01■□□□□ 0.95
NAE1Q13564 SYT8-201ENST00000341958 1556 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.01■□□□□ 0.95
NAE1Q13564 IRX2-202ENST00000382611 2630 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.01■□□□□ 0.95
NAE1Q13564 DGKQ-201ENST00000273814 4636 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.01■□□□□ 0.95
NAE1Q13564 NEURL3-201ENST00000310865 1710 ntTSL 1 (best) BASIC21.01■□□□□ 0.95
NAE1Q13564 HOXA10-201ENST00000283921 2541 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.01■□□□□ 0.95
NAE1Q13564 TMEM25-205ENST00000411589 2442 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21■□□□□ 0.95
NAE1Q13564 ANKRD44-204ENST00000409919 1622 ntTSL 1 (best) BASIC21■□□□□ 0.95
NAE1Q13564 ZNF517-207ENST00000531720 1615 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21■□□□□ 0.95
NAE1Q13564 REPIN1-214ENST00000489432 2058 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21■□□□□ 0.95
NAE1Q13564 FAM129C-211ENST00000600871 1822 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21■□□□□ 0.95
NAE1Q13564 MIR939-201ENST00000401314 82 ntBASIC21■□□□□ 0.95
NAE1Q13564 GRAMD4P2-201ENST00000423297 1097 ntBASIC21■□□□□ 0.95
NAE1Q13564 XPA-201ENST00000375128 1417 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21■□□□□ 0.95
NAE1Q13564 LMLN-210ENST00000482695 2010 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21■□□□□ 0.95
NAE1Q13564 KCNAB3-201ENST00000303790 2458 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21■□□□□ 0.95
NAE1Q13564 UBALD1-208ENST00000591401 1305 ntTSL 5 BASIC21■□□□□ 0.95
NAE1Q13564 ZGPAT-201ENST00000328969 1945 ntTSL 2 BASIC21■□□□□ 0.95
NAE1Q13564 SH2D5-202ENST00000444387 1934 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21■□□□□ 0.95
NAE1Q13564 ZNF707-222ENST00000532158 2218 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21■□□□□ 0.95
NAE1Q13564 CAPN12-212ENST00000601953 2381 ntTSL 5 BASIC21■□□□□ 0.95
NAE1Q13564 PLEKHA8-208ENST00000622102 2140 ntTSL 5 BASIC20.99■□□□□ 0.95
NAE1Q13564 TMEM151B-202ENST00000451188 4895 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC20.99■□□□□ 0.95
NAE1Q13564 SDSL-201ENST00000345635 1397 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.99■□□□□ 0.95
NAE1Q13564 NOTUM-201ENST00000409678 2329 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.99■□□□□ 0.95
NAE1Q13564 C22orf34-203ENST00000405854 1593 ntTSL 5 BASIC20.99■□□□□ 0.95
NAE1Q13564 KDELR1-203ENST00000597017 1594 ntTSL 2 BASIC20.99■□□□□ 0.95
NAE1Q13564 MYB-221ENST00000527615 2381 ntTSL 5 BASIC20.99■□□□□ 0.95
NAE1Q13564 SSPN-204ENST00000535504 419 ntTSL 1 (best) BASIC20.99■□□□□ 0.95
NAE1Q13564 AL136967.2-201ENST00000623968 743 ntBASIC20.99■□□□□ 0.95
NAE1Q13564 MPST-208ENST00000628507 698 ntTSL 5 BASIC20.99■□□□□ 0.95
NAE1Q13564 SLC35A3-204ENST00000427993 2062 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.99■□□□□ 0.95
NAE1Q13564 GNG4-203ENST00000391854 5104 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.99■□□□□ 0.95
NAE1Q13564 PRKAA1-202ENST00000354209 1918 ntTSL 1 (best) BASIC20.99■□□□□ 0.95
NAE1Q13564 NIPA2-203ENST00000398013 2280 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.99■□□□□ 0.95
NAE1Q13564 IGFBP1-202ENST00000457280 1601 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.99■□□□□ 0.95
NAE1Q13564 SNX21-212ENST00000491381 1607 ntTSL 1 (best) BASIC20.99■□□□□ 0.95
NAE1Q13564 AC074143.1-203ENST00000518227 1473 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.99■□□□□ 0.95
NAE1Q13564 FDFT1-201ENST00000220584 2176 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.99■□□□□ 0.95
NAE1Q13564 NRG3-201ENST00000372141 2158 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.99■□□□□ 0.95
NAE1Q13564 DAZAP1-211ENST00000592522 2157 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC20.99■□□□□ 0.95
NAE1Q13564 ZSWIM7-201ENST00000399277 2008 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.99■□□□□ 0.95
NAE1Q13564 ANKRD19P-205ENST00000473204 2370 ntTSL 1 (best) BASIC20.99■□□□□ 0.95
NAE1Q13564 RYK-208ENST00000620660 2942 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.98■□□□□ 0.95
NAE1Q13564 PLK5-202ENST00000454744 1930 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC20.98■□□□□ 0.95
NAE1Q13564 MFSD7-209ENST00000515118 1556 ntTSL 5 BASIC20.98■□□□□ 0.95
NAE1Q13564 BRWD1-202ENST00000341322 2495 ntTSL 1 (best) BASIC20.98■□□□□ 0.95
NAE1Q13564 FASTK-212ENST00000482571 1764 ntTSL 1 (best) BASIC20.98■□□□□ 0.95
NAE1Q13564 UBALD1-201ENST00000283474 1413 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.98■□□□□ 0.95
NAE1Q13564 SUDS3P1-201ENST00000505831 966 ntBASIC20.98■□□□□ 0.95
NAE1Q13564 IGHV3-19-201ENST00000521488 291 ntBASIC20.98■□□□□ 0.95
NAE1Q13564 AC061979.1-201ENST00000532061 434 ntTSL 5 BASIC20.98■□□□□ 0.95
NAE1Q13564 CD6-203ENST00000352009 1809 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.98■□□□□ 0.95
NAE1Q13564 C11orf96-202ENST00000528572 1834 ntBASIC20.98■□□□□ 0.95
NAE1Q13564 RNF149-201ENST00000295317 2458 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.98■□□□□ 0.95
NAE1Q13564 CFAP99-206ENST00000616117 1941 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.98■□□□□ 0.95
NAE1Q13564 FPGS-202ENST00000373228 1383 ntTSL 5 BASIC20.97■□□□□ 0.95
NAE1Q13564 RASA4CP-201ENST00000424092 1398 ntBASIC20.97■□□□□ 0.95
NAE1Q13564 SNRK-203ENST00000437827 1995 ntTSL 2 BASIC20.97■□□□□ 0.95
NAE1Q13564 AZIN2-204ENST00000373443 2048 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.97■□□□□ 0.95
NAE1Q13564 CBWD6-213ENST00000613716 1820 ntTSL 1 (best) BASIC20.97■□□□□ 0.95
NAE1Q13564 CCNG2-204ENST00000502280 1459 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.97■□□□□ 0.95
NAE1Q13564 LAMTOR1-201ENST00000278671 1179 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.97■□□□□ 0.95
NAE1Q13564 YIF1B-202ENST00000337679 1257 ntTSL 1 (best) BASIC20.97■□□□□ 0.95
NAE1Q13564 AC091305.1-201ENST00000479476 895 ntBASIC20.97■□□□□ 0.95
NAE1Q13564 DIRAS1-202ENST00000585334 774 ntAPPRIS P1 BASIC20.97■□□□□ 0.95
NAE1Q13564 MADCAM1-208ENST00000621286 1203 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.97■□□□□ 0.95
NAE1Q13564 TATDN2-201ENST00000287652 5342 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.97■□□□□ 0.95
NAE1Q13564 TCF3-203ENST00000395423 2779 ntTSL 5 BASIC20.97■□□□□ 0.95
NAE1Q13564 BASP1-203ENST00000616743 1711 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC20.97■□□□□ 0.95
NAE1Q13564 MXRA8-203ENST00000445648 2001 ntTSL 2 BASIC20.97■□□□□ 0.95
NAE1Q13564 CACYBP-201ENST00000367679 2766 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.97■□□□□ 0.95
NAE1Q13564 MANEAL-203ENST00000397631 2327 ntTSL 1 (best) BASIC20.96■□□□□ 0.95
NAE1Q13564 IKBKG-212ENST00000617207 1949 ntAPPRIS ALT1 TSL 3 BASIC20.96■□□□□ 0.95
NAE1Q13564 SH3GLB2-203ENST00000372564 2982 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.96■□□□□ 0.95
NAE1Q13564 PHPT1-201ENST00000247665 890 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.96■□□□□ 0.95
NAE1Q13564 LGALS9B-201ENST00000324290 1243 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC20.96■□□□□ 0.95
NAE1Q13564 STX10-202ENST00000343587 1128 ntTSL 1 (best) BASIC20.96■□□□□ 0.95
NAE1Q13564 INS-202ENST00000381330 597 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.96■□□□□ 0.95
NAE1Q13564 POLR2F-203ENST00000407936 582 ntTSL 3 BASIC20.96■□□□□ 0.95
NAE1Q13564 MTURN-203ENST00000409688 843 ntTSL 2 BASIC20.96■□□□□ 0.95
NAE1Q13564 POLR2F-207ENST00000460648 518 ntTSL 4 BASIC20.96■□□□□ 0.95
NAE1Q13564 AICDA-202ENST00000537228 667 ntTSL 5 BASIC20.96■□□□□ 0.95
NAE1Q13564 MCRIP1-205ENST00000572645 1038 ntTSL 1 (best) BASIC20.96■□□□□ 0.95
NAE1Q13564 AC005837.3-201ENST00000612163 286 ntBASIC20.96■□□□□ 0.95
NAE1Q13564 PDK3-201ENST00000379162 1809 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.96■□□□□ 0.95
NAE1Q13564 SETD9-211ENST00000628593 1306 ntTSL 1 (best) BASIC20.96■□□□□ 0.95
NAE1Q13564 PLPP5-203ENST00000424479 2130 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.96■□□□□ 0.95
NAE1Q13564 ALDH5A1-204ENST00000491546 1699 ntTSL 5 BASIC20.96■□□□□ 0.95
NAE1Q13564 DNAJC25-201ENST00000313525 2268 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.95■□□□□ 0.95
NAE1Q13564 RNF180-201ENST00000296615 1727 ntTSL 1 (best) BASIC20.95■□□□□ 0.94
NAE1Q13564 DUX4-203ENST00000565211 1710 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.95■□□□□ 0.94
NAE1Q13564 LINC00565-201ENST00000562710 2331 ntBASIC20.95■□□□□ 0.94
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