Protein–RNA interactions for Protein: Q13319

CDK5R2, Cyclin-dependent kinase 5 activator 2, humanhuman

Predictions only

Length 367 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CDK5R2Q13319 MDK-203ENST00000395566 828 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.82■□□□□ 0.76
CDK5R2Q13319 EPHA10-211ENST00000540011 720 ntTSL 5 BASIC19.82■□□□□ 0.76
CDK5R2Q13319 CTDSP2-203ENST00000547701 988 ntTSL 1 (best) BASIC19.82■□□□□ 0.76
CDK5R2Q13319 Z92544.1-202ENST00000571933 1220 ntBASIC19.82■□□□□ 0.76
CDK5R2Q13319 AC138207.2-201ENST00000583377 492 ntTSL 2 BASIC19.82■□□□□ 0.76
CDK5R2Q13319 LSM7-204ENST00000587502 575 ntTSL 1 (best) BASIC19.82■□□□□ 0.76
CDK5R2Q13319 KREMEN2-201ENST00000303746 2326 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC19.82■□□□□ 0.76
CDK5R2Q13319 FBXL14-201ENST00000339235 2111 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.82■□□□□ 0.76
CDK5R2Q13319 NEURL3-201ENST00000310865 1710 ntTSL 1 (best) BASIC19.82■□□□□ 0.76
CDK5R2Q13319 ZNF668-207ENST00000535577 2396 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.81■□□□□ 0.76
CDK5R2Q13319 PPP1R12B-202ENST00000356764 1687 ntTSL 1 (best) BASIC19.81■□□□□ 0.76
CDK5R2Q13319 KRT3-201ENST00000417996 2319 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.81■□□□□ 0.76
CDK5R2Q13319 TRH-201ENST00000302649 1978 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.81■□□□□ 0.76
CDK5R2Q13319 WEE1-202ENST00000450114 2799 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.81■□□□□ 0.76
CDK5R2Q13319 GAS2-202ENST00000454584 2286 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.81■□□□□ 0.76
CDK5R2Q13319 SNX21-212ENST00000491381 1607 ntTSL 1 (best) BASIC19.81■□□□□ 0.76
CDK5R2Q13319 VSTM2L-201ENST00000373459 831 ntTSL 3 BASIC19.81■□□□□ 0.76
CDK5R2Q13319 AC105935.1-201ENST00000424174 422 ntTSL 3 BASIC19.81■□□□□ 0.76
CDK5R2Q13319 MYL12B-203ENST00000581193 1249 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC19.81■□□□□ 0.76
CDK5R2Q13319 FLT1-204ENST00000541932 2969 ntTSL 1 (best) BASIC19.81■□□□□ 0.76
CDK5R2Q13319 PPP1R3F-201ENST00000055335 3421 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.81■□□□□ 0.76
CDK5R2Q13319 HSF4-225ENST00000584272 1549 ntTSL 1 (best) BASIC19.81■□□□□ 0.76
CDK5R2Q13319 ZNF37BP-201ENST00000435805 1695 ntTSL 5 BASIC19.81■□□□□ 0.76
CDK5R2Q13319 ZFYVE9-201ENST00000287727 5194 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC19.81■□□□□ 0.76
CDK5R2Q13319 UCHL5-205ENST00000367454 1815 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC19.81■□□□□ 0.76
CDK5R2Q13319 TTC39C-202ENST00000317571 2442 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.81■□□□□ 0.76
CDK5R2Q13319 EYA2-202ENST00000327619 2702 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.81■□□□□ 0.76
CDK5R2Q13319 CENPB-201ENST00000379751 2840 ntAPPRIS P1 BASIC19.8■□□□□ 0.76
CDK5R2Q13319 AC010616.1-201ENST00000597630 2078 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.8■□□□□ 0.76
CDK5R2Q13319 FHL3-201ENST00000373016 1647 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.8■□□□□ 0.76
CDK5R2Q13319 SPPL2B-212ENST00000618220 2459 ntTSL 1 (best) BASIC19.8■□□□□ 0.76
CDK5R2Q13319 ERMP1-202ENST00000339450 5376 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.8■□□□□ 0.76
CDK5R2Q13319 HRK-201ENST00000257572 5789 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.8■□□□□ 0.76
CDK5R2Q13319 NRG2-204ENST00000358522 2559 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC19.8■□□□□ 0.76
CDK5R2Q13319 DNAJC25-GNG10-201ENST00000374294 1448 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.8■□□□□ 0.76
CDK5R2Q13319 TAF6L-201ENST00000294168 2116 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.8■□□□□ 0.76
CDK5R2Q13319 CNPY3-202ENST00000394142 954 ntTSL 5 BASIC19.8■□□□□ 0.76
CDK5R2Q13319 BX664725.1-201ENST00000438252 379 ntBASIC19.8■□□□□ 0.76
CDK5R2Q13319 MIR663AHG-227ENST00000608084 765 ntTSL 5 BASIC19.8■□□□□ 0.76
CDK5R2Q13319 PRMT5-228ENST00000627278 129 ntTSL 5 BASIC19.8■□□□□ 0.76
CDK5R2Q13319 KIRREL2-201ENST00000262625 1969 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.8■□□□□ 0.76
CDK5R2Q13319 ST3GAL3-207ENST00000353126 1969 ntTSL 5 BASIC19.8■□□□□ 0.76
CDK5R2Q13319 NPY4R-201ENST00000374312 1956 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.8■□□□□ 0.76
CDK5R2Q13319 NPY4R2-201ENST00000576178 1956 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.8■□□□□ 0.76
CDK5R2Q13319 HMOX1-201ENST00000216117 1822 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.8■□□□□ 0.76
CDK5R2Q13319 WNT10B-202ENST00000403957 1817 ntTSL 5 BASIC19.8■□□□□ 0.76
CDK5R2Q13319 POLD2-207ENST00000452185 1659 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.8■□□□□ 0.76
CDK5R2Q13319 METTL1-202ENST00000324871 2066 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.8■□□□□ 0.76
CDK5R2Q13319 FMR1-208ENST00000440235 4271 ntTSL 1 (best) BASIC19.8■□□□□ 0.76
CDK5R2Q13319 NEUROG3-201ENST00000242462 1376 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.8■□□□□ 0.76
CDK5R2Q13319 PHF11-202ENST00000378319 1359 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.8■□□□□ 0.76
CDK5R2Q13319 TTYH1-203ENST00000376531 1763 ntTSL 1 (best) BASIC19.8■□□□□ 0.76
CDK5R2Q13319 PHOSPHO1-202ENST00000413580 2173 ntTSL 2 BASIC19.8■□□□□ 0.76
CDK5R2Q13319 SPATA5L1-201ENST00000305560 2570 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.8■□□□□ 0.76
CDK5R2Q13319 ARL6IP4-201ENST00000315580 1644 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.8■□□□□ 0.76
CDK5R2Q13319 ASCL5-201ENST00000449188 2026 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC19.8■□□□□ 0.76
CDK5R2Q13319 SLC1A6-203ENST00000544886 2420 ntTSL 1 (best) BASIC19.8■□□□□ 0.76
CDK5R2Q13319 LINC01529-204ENST00000636474 1715 ntBASIC19.79■□□□□ 0.76
CDK5R2Q13319 PARD3-210ENST00000374794 5669 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.79■□□□□ 0.76
CDK5R2Q13319 SKI-201ENST00000378536 5613 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.79■□□□□ 0.76
CDK5R2Q13319 UNC119-201ENST00000301032 1653 ntTSL 1 (best) BASIC19.79■□□□□ 0.76
CDK5R2Q13319 CTU2-201ENST00000312060 1672 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC19.79■□□□□ 0.76
CDK5R2Q13319 HSPE1-201ENST00000233893 950 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.79■□□□□ 0.76
CDK5R2Q13319 EVA1B-201ENST00000270824 1054 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.79■□□□□ 0.76
CDK5R2Q13319 ZFAND5-202ENST00000343431 1073 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.79■□□□□ 0.76
CDK5R2Q13319 EBPL-205ENST00000378284 967 ntTSL 1 (best) BASIC19.79■□□□□ 0.76
CDK5R2Q13319 ARHGAP11A-205ENST00000563864 2279 ntTSL 5 BASIC19.79■□□□□ 0.76
CDK5R2Q13319 MARCH2-201ENST00000215555 1376 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.79■□□□□ 0.76
CDK5R2Q13319 INTS11-208ENST00000435064 2148 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.79■□□□□ 0.76
CDK5R2Q13319 LTBP3-201ENST00000301873 4443 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC19.79■□□□□ 0.76
CDK5R2Q13319 GATA4-207ENST00000532059 1459 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC19.79■□□□□ 0.76
CDK5R2Q13319 VEGFA-204ENST00000372064 2909 ntTSL 1 (best) BASIC19.79■□□□□ 0.76
CDK5R2Q13319 PKIG-206ENST00000372892 1338 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.78■□□□□ 0.76
CDK5R2Q13319 NTN1-201ENST00000173229 5954 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.78■□□□□ 0.76
CDK5R2Q13319 NF2-201ENST00000334961 2020 ntTSL 1 (best) BASIC19.78■□□□□ 0.76
CDK5R2Q13319 NRXN2-203ENST00000377551 6373 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.78■□□□□ 0.76
CDK5R2Q13319 PHF2-201ENST00000359246 5569 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.78■□□□□ 0.76
CDK5R2Q13319 NKX6-3-201ENST00000518699 1352 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.78■□□□□ 0.76
CDK5R2Q13319 SCRT1-201ENST00000569446 3779 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.78■□□□□ 0.76
CDK5R2Q13319 EDC4-201ENST00000358933 4800 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.78■□□□□ 0.76
CDK5R2Q13319 CPEB1-AS1-201ENST00000560650 2138 ntTSL 1 (best) BASIC19.78■□□□□ 0.76
CDK5R2Q13319 SEPT5-209ENST00000438754 2241 ntTSL 2 BASIC19.78■□□□□ 0.76
CDK5R2Q13319 DTNBP1-201ENST00000338950 1880 ntTSL 1 (best) BASIC19.77■□□□□ 0.76
CDK5R2Q13319 ZPBP2-201ENST00000348931 1543 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC19.77■□□□□ 0.76
CDK5R2Q13319 ODF3L2-201ENST00000315489 1604 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.77■□□□□ 0.76
CDK5R2Q13319 SNX7-201ENST00000306121 1734 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.77■□□□□ 0.76
CDK5R2Q13319 TIGD5-201ENST00000504548 5390 ntAPPRIS P1 BASIC19.77■□□□□ 0.76
CDK5R2Q13319 HOXC-AS1-201ENST00000505700 548 ntTSL 2 BASIC19.77■□□□□ 0.76
CDK5R2Q13319 PHLDB3-207ENST00000599242 2286 ntTSL 1 (best) BASIC19.77■□□□□ 0.75
CDK5R2Q13319 LRR1-201ENST00000298288 1745 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.76■□□□□ 0.75
CDK5R2Q13319 AC011498.4-201ENST00000586020 1803 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.76■□□□□ 0.75
CDK5R2Q13319 RBBP7-202ENST00000380084 2036 ntTSL 2 BASIC19.76■□□□□ 0.75
CDK5R2Q13319 IRX4-207ENST00000613726 2403 ntTSL 1 (best) BASIC19.76■□□□□ 0.75
CDK5R2Q13319 AGAP4-207ENST00000616763 2784 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.76■□□□□ 0.75
CDK5R2Q13319 CDKN2C-203ENST00000396148 2086 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.76■□□□□ 0.75
CDK5R2Q13319 SMIM11B-205ENST00000624304 1863 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.76■□□□□ 0.75
CDK5R2Q13319 ACAA1-202ENST00000333167 1785 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.76■□□□□ 0.75
CDK5R2Q13319 C1QTNF1-207ENST00000580454 1396 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.76■□□□□ 0.75
CDK5R2Q13319 AC021242.3-201ENST00000607598 1377 ntBASIC19.76■□□□□ 0.75
CDK5R2Q13319 MT2A-201ENST00000245185 786 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.76■□□□□ 0.75
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 19.9 ms