Protein–RNA interactions for Protein: Q13206

DDX10, Probable ATP-dependent RNA helicase DDX10, humanhuman

Known RBP Predictions only

Length 875 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
DDX10Q13206 C1orf174-201ENST00000361605 1666 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.14■■■□□ 2.42
DDX10Q13206 FAM20C-201ENST00000313766 2751 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.14■■■□□ 2.42
DDX10Q13206 SLC25A27-202ENST00000411689 2526 ntTSL 1 (best) BASIC30.14■■■□□ 2.42
DDX10Q13206 YJEFN3-201ENST00000436027 878 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.14■■■□□ 2.42
DDX10Q13206 SUMF1-205ENST00000458465 1102 ntTSL 2 BASIC30.14■■■□□ 2.42
DDX10Q13206 EHBP1L1-201ENST00000309295 5185 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.14■■■□□ 2.42
DDX10Q13206 FBXO27-202ENST00000509137 2130 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC30.14■■■□□ 2.42
DDX10Q13206 CIZ1-206ENST00000372954 2731 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC30.14■■■□□ 2.41
DDX10Q13206 AC084757.3-201ENST00000558061 1943 ntTSL 3 BASIC30.14■■■□□ 2.41
DDX10Q13206 PGRMC2-201ENST00000296425 2767 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.13■■■□□ 2.41
DDX10Q13206 LINC02175-201ENST00000571219 1875 ntTSL 1 (best) BASIC30.13■■■□□ 2.41
DDX10Q13206 FAM228B-208ENST00000613899 1238 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC30.13■■■□□ 2.41
DDX10Q13206 ZYG11B-202ENST00000545132 2294 ntTSL 2 BASIC30.13■■■□□ 2.41
DDX10Q13206 TUB-201ENST00000299506 2019 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.13■■■□□ 2.41
DDX10Q13206 TBL1Y-202ENST00000355162 2376 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.13■■■□□ 2.41
DDX10Q13206 AF117829.1-201ENST00000519655 1398 ntTSL 5 BASIC30.13■■■□□ 2.41
DDX10Q13206 NKX2-5-201ENST00000329198 1709 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.13■■■□□ 2.41
DDX10Q13206 SAXO1-201ENST00000380530 1727 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC30.13■■■□□ 2.41
DDX10Q13206 NABP2-203ENST00000380198 1775 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.13■■■□□ 2.41
DDX10Q13206 GSX2-201ENST00000326902 1812 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.12■■■□□ 2.41
DDX10Q13206 ARHGEF25-201ENST00000286494 2552 ntTSL 1 (best) BASIC30.12■■■□□ 2.41
DDX10Q13206 TSPAN3-202ENST00000346495 1647 ntTSL 2 BASIC30.12■■■□□ 2.41
DDX10Q13206 WISP2-203ENST00000372868 1600 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC30.12■■■□□ 2.41
DDX10Q13206 TCF7L1-201ENST00000282111 2968 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.12■■■□□ 2.41
DDX10Q13206 SERBP1P1-201ENST00000396021 1160 ntBASIC30.12■■■□□ 2.41
DDX10Q13206 HDHD5-203ENST00000399852 1118 ntTSL 3 BASIC30.12■■■□□ 2.41
DDX10Q13206 DPP10-AS1-201ENST00000432658 730 ntTSL 1 (best) BASIC30.12■■■□□ 2.41
DDX10Q13206 AC090241.2-201ENST00000602329 432 ntTSL 4 BASIC30.12■■■□□ 2.41
DDX10Q13206 DTNBP1-201ENST00000338950 1880 ntTSL 1 (best) BASIC30.12■■■□□ 2.41
DDX10Q13206 ALDH6A1-201ENST00000350259 1869 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC30.12■■■□□ 2.41
DDX10Q13206 TMEM9B-205ENST00000534025 2083 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.11■■■□□ 2.41
DDX10Q13206 SERTAD3-201ENST00000322354 1734 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.11■■■□□ 2.41
DDX10Q13206 ST3GAL4-201ENST00000227495 1790 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC30.11■■■□□ 2.41
DDX10Q13206 PTCHD3P2-201ENST00000424937 1205 ntBASIC30.11■■■□□ 2.41
DDX10Q13206 TMC6-218ENST00000591436 1155 ntTSL 1 (best) BASIC30.11■■■□□ 2.41
DDX10Q13206 NFS1-204ENST00000397425 1956 ntTSL 5 BASIC30.11■■■□□ 2.41
DDX10Q13206 ODC1-201ENST00000234111 2653 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.11■■■□□ 2.41
DDX10Q13206 CHRNA7-203ENST00000454250 2093 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC30.11■■■□□ 2.41
DDX10Q13206 PPP3CC-201ENST00000240139 2189 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC30.11■■■□□ 2.41
DDX10Q13206 AC009506.1-201ENST00000418474 1494 ntTSL 2 BASIC30.11■■■□□ 2.41
DDX10Q13206 TMEM51-203ENST00000400796 1842 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.1■■■□□ 2.41
DDX10Q13206 CADPS-219ENST00000612439 5455 ntTSL 1 (best) BASIC30.1■■■□□ 2.41
DDX10Q13206 ZNF669-201ENST00000343381 1951 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC30.1■■■□□ 2.41
DDX10Q13206 POTEC-204ENST00000620346 1988 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC30.1■■■□□ 2.41
DDX10Q13206 KIF12-207ENST00000640217 2194 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC30.1■■■□□ 2.41
DDX10Q13206 DNAJB11-202ENST00000439351 2398 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.1■■■□□ 2.41
DDX10Q13206 OR2I1P-207ENST00000453522 948 ntBASIC30.1■■■□□ 2.41
DDX10Q13206 AC131281.2-201ENST00000520478 145 ntBASIC30.1■■■□□ 2.41
DDX10Q13206 STARD3NL-202ENST00000396013 1365 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC30.1■■■□□ 2.41
DDX10Q13206 LHFPL3-202ENST00000424859 1852 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC30.1■■■□□ 2.41
DDX10Q13206 CCDC189-206ENST00000543610 1967 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.1■■■□□ 2.41
DDX10Q13206 COL8A2-203ENST00000481785 2036 ntTSL 1 (best) BASIC30.1■■■□□ 2.41
DDX10Q13206 TTC9-201ENST00000256367 5217 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.09■■■□□ 2.41
DDX10Q13206 DUSP26-201ENST00000256261 1835 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.09■■■□□ 2.41
DDX10Q13206 PUF60-203ENST00000453551 1842 ntTSL 1 (best) BASIC30.09■■■□□ 2.41
DDX10Q13206 LEF1-AS1-207ENST00000512637 1675 ntTSL 1 (best) BASIC30.09■■■□□ 2.41
DDX10Q13206 PLEKHF1-204ENST00000592810 1357 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.09■■■□□ 2.41
DDX10Q13206 ANAPC4-201ENST00000315368 2685 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC30.09■■■□□ 2.41
DDX10Q13206 TFAP2A-202ENST00000379608 2576 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC30.09■■■□□ 2.41
DDX10Q13206 UPF3A-202ENST00000375299 2387 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.08■■■□□ 2.41
DDX10Q13206 ACHE-201ENST00000241069 2172 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.08■■■□□ 2.41
DDX10Q13206 FBXL14-201ENST00000339235 2111 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.08■■■□□ 2.41
DDX10Q13206 TFG-201ENST00000240851 1978 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC30.08■■■□□ 2.41
DDX10Q13206 SPHK1-202ENST00000392496 1779 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC30.08■■■□□ 2.41
DDX10Q13206 PYGO2-201ENST00000368456 1306 ntTSL 2 BASIC30.08■■■□□ 2.41
DDX10Q13206 HES6-206ENST00000409574 738 ntTSL 2 BASIC30.08■■■□□ 2.41
DDX10Q13206 MAGI2-217ENST00000629359 6704 ntTSL 5 BASIC30.08■■■□□ 2.41
DDX10Q13206 TTYH1-201ENST00000301194 2088 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC30.07■■■□□ 2.4
DDX10Q13206 ZIM2-201ENST00000593711 2083 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.07■■■□□ 2.4
DDX10Q13206 PYCR1-203ENST00000402252 1346 ntTSL 2 BASIC30.07■■■□□ 2.4
DDX10Q13206 ATG4D-201ENST00000309469 1949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.07■■■□□ 2.4
DDX10Q13206 AC007448.3-201ENST00000585193 689 ntTSL 2 BASIC30.07■■■□□ 2.4
DDX10Q13206 TCEA1-214ENST00000640382 1234 ntTSL 5 BASIC30.07■■■□□ 2.4
DDX10Q13206 C22orf34-203ENST00000405854 1593 ntTSL 5 BASIC30.07■■■□□ 2.4
DDX10Q13206 PHLDB2-210ENST00000478922 1861 ntTSL 1 (best) BASIC30.06■■■□□ 2.4
DDX10Q13206 SLC35A3-210ENST00000638371 2298 ntTSL 5 BASIC30.06■■■□□ 2.4
DDX10Q13206 AC005229.4-201ENST00000610085 2198 ntBASIC30.06■■■□□ 2.4
DDX10Q13206 RBM38-205ENST00000440234 686 ntTSL 2 BASIC30.06■■■□□ 2.4
DDX10Q13206 KRTAP5-4-202ENST00000616115 660 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC30.06■■■□□ 2.4
DDX10Q13206 GOLGA2P6-201ENST00000340929 2049 ntBASIC30.06■■■□□ 2.4
DDX10Q13206 RARG-201ENST00000338561 1836 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC30.06■■■□□ 2.4
DDX10Q13206 AP1S1-201ENST00000337619 1306 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.05■■■□□ 2.4
DDX10Q13206 CARD19-201ENST00000375464 855 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.05■■■□□ 2.4
DDX10Q13206 OAF-201ENST00000328965 2525 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC30.05■■■□□ 2.4
DDX10Q13206 FAM102B-202ENST00000405454 1585 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC30.05■■■□□ 2.4
DDX10Q13206 ADAP2-204ENST00000580525 1598 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC30.05■■■□□ 2.4
DDX10Q13206 CENPB-201ENST00000379751 2840 ntAPPRIS P1 BASIC30.05■■■□□ 2.4
DDX10Q13206 PTPN18-202ENST00000347849 2472 ntTSL 1 (best) BASIC30.05■■■□□ 2.4
DDX10Q13206 CACNA1H-201ENST00000348261 8208 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC30.05■■■□□ 2.4
DDX10Q13206 RSPO1-201ENST00000356545 2621 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.05■■■□□ 2.4
DDX10Q13206 AP000662.2-202ENST00000530595 2790 ntTSL 2 BASIC30.04■■■□□ 2.4
DDX10Q13206 MFSD7-209ENST00000515118 1556 ntTSL 5 BASIC30.04■■■□□ 2.4
DDX10Q13206 LGALS9B-201ENST00000324290 1243 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC30.04■■■□□ 2.4
DDX10Q13206 POLR3GL-201ENST00000369313 818 ntTSL 2 BASIC30.04■■■□□ 2.4
DDX10Q13206 VAMP2-204ENST00000488857 874 ntAPPRIS ALT1 TSL 3 BASIC30.04■■■□□ 2.4
DDX10Q13206 DRAM2-201ENST00000286692 2246 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.04■■■□□ 2.4
DDX10Q13206 PSIP1-201ENST00000380715 1966 ntTSL 1 (best) BASIC30.04■■■□□ 2.4
DDX10Q13206 RAB11FIP3-201ENST00000262305 4831 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC30.04■■■□□ 2.4
DDX10Q13206 HOMER3-203ENST00000433218 1418 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC30.04■■■□□ 2.4
DDX10Q13206 ZDHHC5-204ENST00000527985 2817 ntTSL 1 (best) BASIC30.04■■■□□ 2.4
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 21.3 ms