Protein–RNA interactions for Protein: Q13111

CHAF1A, Chromatin assembly factor 1 subunit A, humanhuman

Predicted RBP Predictions only

Length 956 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CHAF1AQ13111 EGR3-203ENST00000519492 1500 ntTSL 5 BASIC26.5■■□□□ 1.83
CHAF1AQ13111 AC004854.2-201ENST00000608450 1441 ntBASIC26.5■■□□□ 1.83
CHAF1AQ13111 RAB24-202ENST00000303270 1385 ntTSL 2 BASIC26.5■■□□□ 1.83
CHAF1AQ13111 AIDA-202ENST00000355727 1072 ntTSL 5 BASIC26.5■■□□□ 1.83
CHAF1AQ13111 PPA1-202ENST00000373232 1295 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.5■■□□□ 1.83
CHAF1AQ13111 C16orf86-201ENST00000403458 1267 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC26.5■■□□□ 1.83
CHAF1AQ13111 AC073343.2-201ENST00000413182 548 ntTSL 4 BASIC26.5■■□□□ 1.83
CHAF1AQ13111 CTAG1A-201ENST00000593606 993 ntTSL 5 BASIC26.5■■□□□ 1.83
CHAF1AQ13111 TNFRSF10B-202ENST00000347739 1723 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.5■■□□□ 1.83
CHAF1AQ13111 AC092068.2-201ENST00000590491 1708 ntBASIC26.5■■□□□ 1.83
CHAF1AQ13111 RASL12-202ENST00000421977 1523 ntTSL 2 BASIC26.49■■□□□ 1.83
CHAF1AQ13111 CASK-201ENST00000378154 2494 ntTSL 5 BASIC26.49■■□□□ 1.83
CHAF1AQ13111 PRR7-201ENST00000323249 1480 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.49■■□□□ 1.83
CHAF1AQ13111 C3orf58-207ENST00000495414 1876 ntTSL 2 BASIC26.49■■□□□ 1.83
CHAF1AQ13111 HRH3-202ENST00000340177 2659 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC26.49■■□□□ 1.83
CHAF1AQ13111 SNX10-207ENST00000446848 2613 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC26.49■■□□□ 1.83
CHAF1AQ13111 FRS3-202ENST00000373018 2174 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC26.49■■□□□ 1.83
CHAF1AQ13111 JSRP1-201ENST00000300961 1138 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC26.49■■□□□ 1.83
CHAF1AQ13111 AC140479.5-201ENST00000568189 735 ntTSL 3 BASIC26.49■■□□□ 1.83
CHAF1AQ13111 TRIM2-212ENST00000632856 656 ntTSL 3 BASIC26.49■■□□□ 1.83
CHAF1AQ13111 SAMD4B-208ENST00000598913 2877 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC26.49■■□□□ 1.83
CHAF1AQ13111 BTBD7-205ENST00000554565 2697 ntTSL 1 (best) BASIC26.49■■□□□ 1.83
CHAF1AQ13111 GATA1-202ENST00000376670 1497 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.49■■□□□ 1.83
CHAF1AQ13111 RPS6-203ENST00000380384 1355 ntTSL 1 (best) BASIC26.48■■□□□ 1.83
CHAF1AQ13111 TTLL11-202ENST00000373776 2012 ntTSL 1 (best) BASIC26.48■■□□□ 1.83
CHAF1AQ13111 HOXD1-201ENST00000331462 1975 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.48■■□□□ 1.83
CHAF1AQ13111 UBE2D3-201ENST00000321805 1087 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC26.48■■□□□ 1.83
CHAF1AQ13111 COX4I1-216ENST00000568794 794 ntTSL 5 BASIC26.48■■□□□ 1.83
CHAF1AQ13111 CDC16-203ENST00000356221 2203 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26.48■■□□□ 1.83
CHAF1AQ13111 ADD1-202ENST00000355842 4743 ntTSL 1 (best) BASIC26.48■■□□□ 1.83
CHAF1AQ13111 CNTD2-202ENST00000430325 1817 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC26.48■■□□□ 1.83
CHAF1AQ13111 ASL-203ENST00000380839 1765 ntTSL 5 BASIC26.48■■□□□ 1.83
CHAF1AQ13111 AC090377.1-201ENST00000585691 1762 ntTSL 3 BASIC26.48■■□□□ 1.83
CHAF1AQ13111 AP004607.4-201ENST00000530158 1459 ntBASIC26.48■■□□□ 1.83
CHAF1AQ13111 TIGD5-201ENST00000504548 5390 ntAPPRIS P1 BASIC26.47■■□□□ 1.83
CHAF1AQ13111 VGLL2-201ENST00000326274 2212 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.47■■□□□ 1.83
CHAF1AQ13111 STIM2-204ENST00000467087 5154 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.47■■□□□ 1.83
CHAF1AQ13111 TUBG1-201ENST00000251413 1611 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.47■■□□□ 1.83
CHAF1AQ13111 SPINT2-201ENST00000301244 1802 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC26.47■■□□□ 1.83
CHAF1AQ13111 PCSK6-215ENST00000611967 3336 ntTSL 1 (best) BASIC26.47■■□□□ 1.83
CHAF1AQ13111 SCRT2-201ENST00000246104 3577 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.47■■□□□ 1.83
CHAF1AQ13111 SOCS1-201ENST00000332029 1225 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.47■■□□□ 1.83
CHAF1AQ13111 VPS53-216ENST00000574029 585 ntTSL 4 BASIC26.47■■□□□ 1.83
CHAF1AQ13111 ZPBP2-201ENST00000348931 1543 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC26.47■■□□□ 1.83
CHAF1AQ13111 DDN-AS1-202ENST00000547866 2114 ntTSL 3 BASIC26.47■■□□□ 1.83
CHAF1AQ13111 ARSB-201ENST00000264914 5327 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.46■■□□□ 1.83
CHAF1AQ13111 PITX1-201ENST00000265340 2406 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.46■■□□□ 1.83
CHAF1AQ13111 CACTIN-AS1-201ENST00000592274 1913 ntTSL 2 BASIC26.46■■□□□ 1.83
CHAF1AQ13111 AC137761.2-201ENST00000561729 223 ntBASIC26.46■■□□□ 1.83
CHAF1AQ13111 AC145350.3-201ENST00000569033 163 ntBASIC26.46■■□□□ 1.83
CHAF1AQ13111 MPND-202ENST00000359935 1475 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC26.46■■□□□ 1.83
CHAF1AQ13111 CERS4-205ENST00000558331 1803 ntTSL 5 BASIC26.46■■□□□ 1.83
CHAF1AQ13111 ACTL10-201ENST00000330271 2028 ntAPPRIS P1 BASIC26.46■■□□□ 1.83
CHAF1AQ13111 GOLGA6L9-202ENST00000618348 1710 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26.45■■□□□ 1.83
CHAF1AQ13111 ILKAP-211ENST00000612675 1335 ntTSL 1 (best) BASIC26.45■■□□□ 1.83
CHAF1AQ13111 C18orf65-201ENST00000622985 2076 ntTSL 2 BASIC26.45■■□□□ 1.83
CHAF1AQ13111 FOSL1-201ENST00000312562 1669 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.45■■□□□ 1.82
CHAF1AQ13111 CLDND1-202ENST00000394180 2228 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.45■■□□□ 1.82
CHAF1AQ13111 BCKDHB-203ENST00000369760 743 ntTSL 3 BASIC26.45■■□□□ 1.82
CHAF1AQ13111 AL590128.2-201ENST00000442889 415 ntTSL 3 BASIC26.45■■□□□ 1.82
CHAF1AQ13111 FGF12-AS2-201ENST00000443165 580 ntTSL 4 BASIC26.45■■□□□ 1.82
CHAF1AQ13111 CDC16-206ENST00000375310 2156 ntTSL 1 (best) BASIC26.45■■□□□ 1.82
CHAF1AQ13111 MBNL3-202ENST00000370844 1643 ntTSL 1 (best) BASIC26.45■■□□□ 1.82
CHAF1AQ13111 MEIOB-202ENST00000397344 1792 ntTSL 5 BASIC26.45■■□□□ 1.82
CHAF1AQ13111 ADAP2-204ENST00000580525 1598 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.45■■□□□ 1.82
CHAF1AQ13111 CNPY3-201ENST00000372836 1704 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.45■■□□□ 1.82
CHAF1AQ13111 HOXC8-201ENST00000040584 1889 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.45■■□□□ 1.82
CHAF1AQ13111 ZDHHC7-203ENST00000564466 1488 ntTSL 5 BASIC26.44■■□□□ 1.82
CHAF1AQ13111 POLDIP2-201ENST00000540200 2121 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.44■■□□□ 1.82
CHAF1AQ13111 DECR2-201ENST00000219481 1615 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.44■■□□□ 1.82
CHAF1AQ13111 UCHL1-201ENST00000284440 1172 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.44■■□□□ 1.82
CHAF1AQ13111 AC092468.1-201ENST00000491321 562 ntTSL 4 BASIC26.44■■□□□ 1.82
CHAF1AQ13111 UCHL1-210ENST00000512788 785 ntTSL 3 BASIC26.44■■□□□ 1.82
CHAF1AQ13111 CCDC47-204ENST00000582252 1719 ntTSL 2 BASIC26.44■■□□□ 1.82
CHAF1AQ13111 SDK1-201ENST00000389531 7606 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC26.44■■□□□ 1.82
CHAF1AQ13111 ARID1B-220ENST00000636930 8246 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC26.44■■□□□ 1.82
CHAF1AQ13111 SRSF11-203ENST00000370951 2385 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.43■■□□□ 1.82
CHAF1AQ13111 TMCC2-209ENST00000637895 1455 ntTSL 1 (best) BASIC26.43■■□□□ 1.82
CHAF1AQ13111 HORMAD2-201ENST00000336726 2187 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.43■■□□□ 1.82
CHAF1AQ13111 LRRC3C-201ENST00000377924 891 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC26.43■■□□□ 1.82
CHAF1AQ13111 AC016769.1-201ENST00000409132 1010 ntBASIC26.43■■□□□ 1.82
CHAF1AQ13111 AC099681.3-201ENST00000421500 939 ntTSL 4 BASIC26.43■■□□□ 1.82
CHAF1AQ13111 FAM66D-201ENST00000434078 918 ntTSL 5 BASIC26.43■■□□□ 1.82
CHAF1AQ13111 DBI-210ENST00000542275 757 ntTSL 5 BASIC26.43■■□□□ 1.82
CHAF1AQ13111 SEC11A-208ENST00000559729 1256 ntTSL 2 BASIC26.43■■□□□ 1.82
CHAF1AQ13111 AP003071.3-201ENST00000562506 366 ntTSL 3 BASIC26.43■■□□□ 1.82
CHAF1AQ13111 PEX5-205ENST00000420616 2477 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.43■■□□□ 1.82
CHAF1AQ13111 LSR-201ENST00000347609 1880 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.42■■□□□ 1.82
CHAF1AQ13111 LSR-213ENST00000605618 1885 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.42■■□□□ 1.82
CHAF1AQ13111 HOXA4-201ENST00000360046 1747 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.42■■□□□ 1.82
CHAF1AQ13111 BASP1-203ENST00000616743 1711 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC26.42■■□□□ 1.82
CHAF1AQ13111 IKZF1-207ENST00000413698 1808 ntTSL 1 (best) BASIC26.42■■□□□ 1.82
CHAF1AQ13111 ARSB-202ENST00000396151 2316 ntTSL 1 (best) BASIC26.42■■□□□ 1.82
CHAF1AQ13111 STX7-201ENST00000367937 1090 ntTSL 5 BASIC26.42■■□□□ 1.82
CHAF1AQ13111 SMIM12-202ENST00000423898 897 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC26.42■■□□□ 1.82
CHAF1AQ13111 AP001363.2-201ENST00000538101 391 ntTSL 3 BASIC26.42■■□□□ 1.82
CHAF1AQ13111 MFSD7-201ENST00000322224 2123 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26.42■■□□□ 1.82
CHAF1AQ13111 MTMR14-202ENST00000351233 2105 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.42■■□□□ 1.82
CHAF1AQ13111 VSX1-205ENST00000429762 1977 ntTSL 1 (best) BASIC26.42■■□□□ 1.82
CHAF1AQ13111 NOXA1-202ENST00000392815 1464 ntTSL 1 (best) BASIC26.42■■□□□ 1.82
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