Protein–RNA interactions for Protein: Q13061

TRDN, Triadin, humanhuman

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Length 729 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
TRDNQ13061 TRIM28-202ENST00000341753 2709 ntTSL 1 (best) BASIC25.62■■□□□ 1.69
TRDNQ13061 CERS5-201ENST00000317551 2051 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC25.62■■□□□ 1.69
TRDNQ13061 RELL2-205ENST00000518856 1419 ntTSL 5 BASIC25.62■■□□□ 1.69
TRDNQ13061 PDLIM2-216ENST00000464275 1995 ntTSL 2 BASIC25.62■■□□□ 1.69
TRDNQ13061 MFSD7-209ENST00000515118 1556 ntTSL 5 BASIC25.61■■□□□ 1.69
TRDNQ13061 POMZP3-202ENST00000310842 1490 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.61■■□□□ 1.69
TRDNQ13061 TMCC2-209ENST00000637895 1455 ntTSL 1 (best) BASIC25.61■■□□□ 1.69
TRDNQ13061 P4HTM-201ENST00000343546 2268 ntTSL 1 (best) BASIC25.61■■□□□ 1.69
TRDNQ13061 NBL1-202ENST00000375136 2172 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.61■■□□□ 1.69
TRDNQ13061 SLC41A3-202ENST00000346785 1705 ntTSL 2 BASIC25.61■■□□□ 1.69
TRDNQ13061 TUSC3-209ENST00000509380 1266 ntTSL 5 BASIC25.61■■□□□ 1.69
TRDNQ13061 CDKN2A-210ENST00000530628 748 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.61■■□□□ 1.69
TRDNQ13061 NKX2-4-201ENST00000351817 2238 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.61■■□□□ 1.69
TRDNQ13061 NEURL4-202ENST00000399464 5200 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC25.61■■□□□ 1.69
TRDNQ13061 ST7-201ENST00000265437 2899 ntTSL 1 (best) BASIC25.61■■□□□ 1.69
TRDNQ13061 HSPB2-201ENST00000304298 1335 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.61■■□□□ 1.69
TRDNQ13061 AC005906.2-202ENST00000638821 2168 ntTSL 5 BASIC25.61■■□□□ 1.69
TRDNQ13061 NDUFAF1-201ENST00000260361 1461 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.6■■□□□ 1.69
TRDNQ13061 TRAF4-205ENST00000444415 1456 ntTSL 5 BASIC25.6■■□□□ 1.69
TRDNQ13061 STRBP-202ENST00000360998 2990 ntTSL 1 (best) BASIC25.6■■□□□ 1.69
TRDNQ13061 SCN1B-206ENST00000638536 1600 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.6■■□□□ 1.69
TRDNQ13061 TRAF4-217ENST00000618771 543 ntTSL 5 BASIC25.6■■□□□ 1.69
TRDNQ13061 AC105233.4-201ENST00000642045 216 ntBASIC25.6■■□□□ 1.69
TRDNQ13061 BIN1-203ENST00000346226 2401 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.6■■□□□ 1.69
TRDNQ13061 CCZ1B-201ENST00000316731 2885 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.6■■□□□ 1.69
TRDNQ13061 LINC00454-202ENST00000430978 1327 ntTSL 5 BASIC25.6■■□□□ 1.69
TRDNQ13061 ZNF410-206ENST00000540593 1722 ntTSL 2 BASIC25.6■■□□□ 1.69
TRDNQ13061 TMEM165-201ENST00000381334 1928 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.59■■□□□ 1.69
TRDNQ13061 C8orf82-202ENST00000524821 2476 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.59■■□□□ 1.69
TRDNQ13061 RBM38-203ENST00000356208 2382 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.59■■□□□ 1.69
TRDNQ13061 UCHL5-205ENST00000367454 1815 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC25.59■■□□□ 1.69
TRDNQ13061 NINJ1-201ENST00000375446 1281 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.59■■□□□ 1.69
TRDNQ13061 RHOF-204ENST00000537265 699 ntTSL 2 BASIC25.59■■□□□ 1.69
TRDNQ13061 FHL3-201ENST00000373016 1647 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.59■■□□□ 1.69
TRDNQ13061 WDR86-201ENST00000334493 2023 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.58■■□□□ 1.69
TRDNQ13061 CLN3-207ENST00000395653 1430 ntTSL 5 BASIC25.58■■□□□ 1.69
TRDNQ13061 IRS3P-201ENST00000223076 1006 ntBASIC25.58■■□□□ 1.69
TRDNQ13061 GLTPD2-201ENST00000331264 1023 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.58■■□□□ 1.69
TRDNQ13061 CROT-202ENST00000412227 1213 ntTSL 1 (best) BASIC25.58■■□□□ 1.69
TRDNQ13061 CTAG1A-201ENST00000593606 993 ntTSL 5 BASIC25.58■■□□□ 1.69
TRDNQ13061 RNF40-201ENST00000324685 5634 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.58■■□□□ 1.69
TRDNQ13061 NOX4-209ENST00000527626 1774 ntTSL 2 BASIC25.58■■□□□ 1.69
TRDNQ13061 MIR222HG-202ENST00000602507 1758 ntTSL 5 BASIC25.58■■□□□ 1.69
TRDNQ13061 AC074143.1-203ENST00000518227 1473 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.58■■□□□ 1.69
TRDNQ13061 AC092053.2-201ENST00000640557 1818 ntBASIC25.58■■□□□ 1.68
TRDNQ13061 CYHR1-201ENST00000306145 1409 ntTSL 1 (best) BASIC25.57■■□□□ 1.68
TRDNQ13061 CACNA1H-202ENST00000358590 8069 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.57■■□□□ 1.68
TRDNQ13061 CXCL14-201ENST00000337225 1971 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.57■■□□□ 1.68
TRDNQ13061 SNX21-212ENST00000491381 1607 ntTSL 1 (best) BASIC25.57■■□□□ 1.68
TRDNQ13061 LGALS9B-201ENST00000324290 1243 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC25.57■■□□□ 1.68
TRDNQ13061 SMUG1P1-201ENST00000590640 811 ntBASIC25.57■■□□□ 1.68
TRDNQ13061 SEC22C-207ENST00000423701 1458 ntTSL 1 (best) BASIC25.57■■□□□ 1.68
TRDNQ13061 ITM2C-202ENST00000326427 2078 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.57■■□□□ 1.68
TRDNQ13061 SPHK1-201ENST00000323374 2138 ntTSL 1 (best) BASIC25.57■■□□□ 1.68
TRDNQ13061 ANKRD11-217ENST00000613312 1584 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.56■■□□□ 1.68
TRDNQ13061 HTATSF1-201ENST00000218364 2775 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.56■■□□□ 1.68
TRDNQ13061 G6PD-202ENST00000393562 2631 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.56■■□□□ 1.68
TRDNQ13061 G6PD-211ENST00000621232 2631 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.56■■□□□ 1.68
TRDNQ13061 EEFSEC-201ENST00000254730 2232 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.56■■□□□ 1.68
TRDNQ13061 ANKHD1-204ENST00000394722 2035 ntTSL 1 (best) BASIC25.56■■□□□ 1.68
TRDNQ13061 SOX18-201ENST00000340356 1864 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.56■■□□□ 1.68
TRDNQ13061 RNF208-201ENST00000391553 1077 ntAPPRIS P1 BASIC25.56■■□□□ 1.68
TRDNQ13061 LMF1-202ENST00000543238 2103 ntTSL 2 BASIC25.56■■□□□ 1.68
TRDNQ13061 HMBS-201ENST00000278715 1501 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.56■■□□□ 1.68
TRDNQ13061 SNRK-203ENST00000437827 1995 ntTSL 2 BASIC25.56■■□□□ 1.68
TRDNQ13061 CPE-201ENST00000402744 2421 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.56■■□□□ 1.68
TRDNQ13061 UQCR11-203ENST00000591899 1324 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.56■■□□□ 1.68
TRDNQ13061 CBWD6-213ENST00000613716 1820 ntTSL 1 (best) BASIC25.56■■□□□ 1.68
TRDNQ13061 IGFBP1-202ENST00000457280 1601 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.55■■□□□ 1.68
TRDNQ13061 CFAP99-206ENST00000616117 1941 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.55■■□□□ 1.68
TRDNQ13061 NEURL3-201ENST00000310865 1710 ntTSL 1 (best) BASIC25.55■■□□□ 1.68
TRDNQ13061 LSR-203ENST00000360798 1963 ntTSL 2 BASIC25.55■■□□□ 1.68
TRDNQ13061 POTED-202ENST00000620442 1988 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.55■■□□□ 1.68
TRDNQ13061 PRDX4-202ENST00000379341 1005 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.55■■□□□ 1.68
TRDNQ13061 ZFAS1-206ENST00000450535 1075 ntTSL 3 BASIC25.55■■□□□ 1.68
TRDNQ13061 CD6-203ENST00000352009 1809 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.55■■□□□ 1.68
TRDNQ13061 FAM107B-211ENST00000468747 2633 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.55■■□□□ 1.68
TRDNQ13061 GSR-204ENST00000537535 1323 ntTSL 1 (best) BASIC25.55■■□□□ 1.68
TRDNQ13061 TLX2-201ENST00000233638 2136 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.55■■□□□ 1.68
TRDNQ13061 ZNF584-203ENST00000593920 2187 ntTSL 2 BASIC25.55■■□□□ 1.68
TRDNQ13061 SMOX-212ENST00000621355 2322 ntTSL 1 (best) BASIC25.54■■□□□ 1.68
TRDNQ13061 HIRA-201ENST00000263208 4053 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.54■■□□□ 1.68
TRDNQ13061 FASTK-212ENST00000482571 1764 ntTSL 1 (best) BASIC25.54■■□□□ 1.68
TRDNQ13061 REPIN1-214ENST00000489432 2058 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC25.54■■□□□ 1.68
TRDNQ13061 DUSP26-201ENST00000256261 1835 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.54■■□□□ 1.68
TRDNQ13061 EYA2-203ENST00000357410 2465 ntTSL 1 (best) BASIC25.54■■□□□ 1.68
TRDNQ13061 EPS8L1-202ENST00000245618 2198 ntTSL 1 (best) BASIC25.54■■□□□ 1.68
TRDNQ13061 TESC-201ENST00000335209 1041 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.54■■□□□ 1.68
TRDNQ13061 STOML2-202ENST00000452248 1296 ntTSL 2 BASIC25.54■■□□□ 1.68
TRDNQ13061 STOML2-205ENST00000619795 1293 ntTSL 3 BASIC25.54■■□□□ 1.68
TRDNQ13061 ATP10A-207ENST00000619904 988 ntTSL 5 BASIC25.54■■□□□ 1.68
TRDNQ13061 PRKAA1-202ENST00000354209 1918 ntTSL 1 (best) BASIC25.54■■□□□ 1.68
TRDNQ13061 ANKRD44-204ENST00000409919 1622 ntTSL 1 (best) BASIC25.54■■□□□ 1.68
TRDNQ13061 SH3D19-211ENST00000604030 5228 ntTSL 5 BASIC25.54■■□□□ 1.68
TRDNQ13061 AC133065.2-201ENST00000573379 2147 ntTSL 2 BASIC25.54■■□□□ 1.68
TRDNQ13061 ARL13B-205ENST00000471138 2206 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.53■■□□□ 1.68
TRDNQ13061 SH2D5-202ENST00000444387 1934 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.53■■□□□ 1.68
TRDNQ13061 NRSN1-204ENST00000378491 2354 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.53■■□□□ 1.68
TRDNQ13061 PLPP7-202ENST00000372264 2095 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.53■■□□□ 1.68
TRDNQ13061 PRKCZ-AS1-201ENST00000333854 1253 ntTSL 2 BASIC25.53■■□□□ 1.68
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