Protein–RNA interactions for Protein: Q13002

GRIK2, Glutamate receptor ionotropic, kainate 2, humanhuman

Predictions only

Length 908 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
GRIK2Q13002 RAP2A-201ENST00000245304 5487 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.78■■□□□ 1.08
GRIK2Q13002 PDIA6-207ENST00000540494 2509 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC21.77■■□□□ 1.08
GRIK2Q13002 GAS2L1P2-201ENST00000436355 1356 ntBASIC21.77■■□□□ 1.08
GRIK2Q13002 C16orf72-201ENST00000327827 5953 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.77■■□□□ 1.08
GRIK2Q13002 UCHL5-201ENST00000367448 1534 ntTSL 1 (best) BASIC21.77■■□□□ 1.08
GRIK2Q13002 TBX1-202ENST00000332710 2084 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC21.77■■□□□ 1.08
GRIK2Q13002 NXT1-201ENST00000254998 1123 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.77■■□□□ 1.08
GRIK2Q13002 COX20-201ENST00000366528 568 ntTSL 2 BASIC21.77■■□□□ 1.08
GRIK2Q13002 IZUMO4-203ENST00000395307 944 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.77■■□□□ 1.08
GRIK2Q13002 HSCB-202ENST00000398941 955 ntTSL 2 BASIC21.77■■□□□ 1.08
GRIK2Q13002 POLE4-205ENST00000483063 1248 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.77■■□□□ 1.08
GRIK2Q13002 RNF114-202ENST00000622920 1284 ntTSL 5 BASIC21.77■■□□□ 1.08
GRIK2Q13002 CAPN12-212ENST00000601953 2381 ntTSL 5 BASIC21.77■■□□□ 1.08
GRIK2Q13002 STK19-202ENST00000375333 1557 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.77■■□□□ 1.08
GRIK2Q13002 AC073188.6-202ENST00000616616 2281 ntTSL 1 (best) BASIC21.77■■□□□ 1.08
GRIK2Q13002 C1orf229-201ENST00000623686 2258 ntBASIC21.77■■□□□ 1.08
GRIK2Q13002 SCAND1-202ENST00000373991 1727 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.77■■□□□ 1.08
GRIK2Q13002 MSANTD3-207ENST00000622639 1748 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC21.77■■□□□ 1.08
GRIK2Q13002 TBC1D22A-202ENST00000355704 1886 ntTSL 1 (best) BASIC21.77■■□□□ 1.08
GRIK2Q13002 SRI-201ENST00000265729 2010 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.77■■□□□ 1.07
GRIK2Q13002 WT1-210ENST00000639563 1494 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.77■■□□□ 1.07
GRIK2Q13002 GRK4-206ENST00000504933 1971 ntTSL 1 (best) BASIC21.76■■□□□ 1.07
GRIK2Q13002 FZD8-201ENST00000374694 4030 ntAPPRIS P1 BASIC21.76■■□□□ 1.07
GRIK2Q13002 SHMT1-201ENST00000316694 2464 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.76■■□□□ 1.07
GRIK2Q13002 UBE2J2-203ENST00000360466 1047 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.76■■□□□ 1.07
GRIK2Q13002 AC073343.2-201ENST00000413182 548 ntTSL 4 BASIC21.76■■□□□ 1.07
GRIK2Q13002 FNDC3B-204ENST00000421757 946 ntTSL 1 (best) BASIC21.76■■□□□ 1.07
GRIK2Q13002 ABHD14A-202ENST00000458031 1113 ntTSL 5 BASIC21.76■■□□□ 1.07
GRIK2Q13002 H19-210ENST00000439725 1929 ntTSL 2 BASIC21.76■■□□□ 1.07
GRIK2Q13002 CADM1-201ENST00000331581 1766 ntTSL 1 (best) BASIC21.76■■□□□ 1.07
GRIK2Q13002 ZNF668-205ENST00000426488 2282 ntTSL 5 BASIC21.76■■□□□ 1.07
GRIK2Q13002 HIRA-202ENST00000340170 3395 ntTSL 1 (best) BASIC21.75■■□□□ 1.07
GRIK2Q13002 OSCAR-201ENST00000284648 2055 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.75■■□□□ 1.07
GRIK2Q13002 LSR-202ENST00000354900 2105 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.75■■□□□ 1.07
GRIK2Q13002 NUDT14-202ENST00000392568 845 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.75■■□□□ 1.07
GRIK2Q13002 YIF1A-205ENST00000471387 854 ntTSL 5 BASIC21.75■■□□□ 1.07
GRIK2Q13002 AC092468.1-201ENST00000491321 562 ntTSL 4 BASIC21.75■■□□□ 1.07
GRIK2Q13002 C11orf24-209ENST00000533310 980 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.75■■□□□ 1.07
GRIK2Q13002 FIZ1-205ENST00000592585 489 ntTSL 5 BASIC21.75■■□□□ 1.07
GRIK2Q13002 KCNAB3-201ENST00000303790 2458 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.75■■□□□ 1.07
GRIK2Q13002 NMI-201ENST00000243346 1623 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.75■■□□□ 1.07
GRIK2Q13002 FAIM-201ENST00000338446 1622 ntTSL 5 BASIC21.75■■□□□ 1.07
GRIK2Q13002 RASSF10-201ENST00000529419 2530 ntAPPRIS P1 BASIC21.75■■□□□ 1.07
GRIK2Q13002 GCA-201ENST00000233612 1694 ntTSL 2 BASIC21.75■■□□□ 1.07
GRIK2Q13002 SPRED3-204ENST00000587013 1539 ntTSL 5 BASIC21.75■■□□□ 1.07
GRIK2Q13002 AC004854.2-201ENST00000608450 1441 ntBASIC21.74■■□□□ 1.07
GRIK2Q13002 TCF3-203ENST00000395423 2779 ntTSL 5 BASIC21.74■■□□□ 1.07
GRIK2Q13002 AC011498.4-201ENST00000586020 1803 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.74■■□□□ 1.07
GRIK2Q13002 ACTL10-201ENST00000330271 2028 ntAPPRIS P1 BASIC21.74■■□□□ 1.07
GRIK2Q13002 NT5C-201ENST00000245552 954 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.74■■□□□ 1.07
GRIK2Q13002 URAD-201ENST00000332715 931 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.74■■□□□ 1.07
GRIK2Q13002 ORMDL1-202ENST00000392349 1137 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.74■■□□□ 1.07
GRIK2Q13002 ZNF696-205ENST00000521537 705 ntTSL 2 BASIC21.74■■□□□ 1.07
GRIK2Q13002 RPS15-210ENST00000592623 873 ntTSL 1 (best) BASIC21.74■■□□□ 1.07
GRIK2Q13002 AP004607.4-201ENST00000530158 1459 ntBASIC21.74■■□□□ 1.07
GRIK2Q13002 ACAA1-219ENST00000625927 1760 ntTSL 5 BASIC21.74■■□□□ 1.07
GRIK2Q13002 C19orf68-201ENST00000328759 2277 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.73■■□□□ 1.07
GRIK2Q13002 FAM167A-204ENST00000528897 1620 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.73■■□□□ 1.07
GRIK2Q13002 PTH1R-202ENST00000418619 2070 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.73■■□□□ 1.07
GRIK2Q13002 TOP2B-204ENST00000435706 5389 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.73■■□□□ 1.07
GRIK2Q13002 PHACTR2-208ENST00000440869 2569 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.73■■□□□ 1.07
GRIK2Q13002 EGR4-202ENST00000545030 2372 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.73■■□□□ 1.07
GRIK2Q13002 UCHL1-201ENST00000284440 1172 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.73■■□□□ 1.07
GRIK2Q13002 AC026185.1-201ENST00000445748 174 ntBASIC21.73■■□□□ 1.07
GRIK2Q13002 ARHGAP24-206ENST00000503995 1273 ntTSL 1 (best) BASIC21.73■■□□□ 1.07
GRIK2Q13002 UCHL1-210ENST00000512788 785 ntTSL 3 BASIC21.73■■□□□ 1.07
GRIK2Q13002 AC092368.3-201ENST00000562549 1107 ntTSL 5 BASIC21.73■■□□□ 1.07
GRIK2Q13002 BID-214ENST00000617586 542 ntTSL 5 BASIC21.73■■□□□ 1.07
GRIK2Q13002 IMPA2-201ENST00000269159 1534 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.73■■□□□ 1.07
GRIK2Q13002 EGR3-203ENST00000519492 1500 ntTSL 5 BASIC21.73■■□□□ 1.07
GRIK2Q13002 FAM193A-211ENST00000637812 4885 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.73■■□□□ 1.07
GRIK2Q13002 CHODL-201ENST00000299295 2548 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.73■■□□□ 1.07
GRIK2Q13002 ANKRD11-217ENST00000613312 1584 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.73■■□□□ 1.07
GRIK2Q13002 CACNA1H-201ENST00000348261 8208 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC21.73■■□□□ 1.07
GRIK2Q13002 MRPS2-202ENST00000371785 1640 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC21.73■■□□□ 1.07
GRIK2Q13002 HAS1-202ENST00000540069 2110 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.73■■□□□ 1.07
GRIK2Q13002 PPP2R3B-202ENST00000390665 2151 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.72■■□□□ 1.07
GRIK2Q13002 SYNDIG1-201ENST00000376862 2522 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.72■■□□□ 1.07
GRIK2Q13002 B3GNT6-202ENST00000622824 2503 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.72■■□□□ 1.07
GRIK2Q13002 MVD-201ENST00000301012 1823 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.72■■□□□ 1.07
GRIK2Q13002 EFCC1-201ENST00000436022 2691 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.72■■□□□ 1.07
GRIK2Q13002 SMCO4-201ENST00000298966 1104 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.72■■□□□ 1.07
GRIK2Q13002 PPT2-248ENST00000395523 2111 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.72■■□□□ 1.07
GRIK2Q13002 SLC25A29-212ENST00000555927 960 ntTSL 2 BASIC21.72■■□□□ 1.07
GRIK2Q13002 LINC02091-201ENST00000576171 1185 ntTSL 5 BASIC21.72■■□□□ 1.07
GRIK2Q13002 HNF4A-205ENST00000443598 1603 ntTSL 1 (best) BASIC21.72■■□□□ 1.07
GRIK2Q13002 SMAD1-201ENST00000302085 1966 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.72■■□□□ 1.07
GRIK2Q13002 ECEL1P1-201ENST00000373592 1742 ntBASIC21.72■■□□□ 1.07
GRIK2Q13002 DALRD3-206ENST00000441576 1706 ntTSL 1 (best) BASIC21.72■■□□□ 1.07
GRIK2Q13002 ENTPD4-201ENST00000356206 2097 ntTSL 1 (best) BASIC21.71■■□□□ 1.07
GRIK2Q13002 ENTPD4-203ENST00000417069 2063 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.71■■□□□ 1.07
GRIK2Q13002 JSRP1-201ENST00000300961 1138 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.71■■□□□ 1.07
GRIK2Q13002 POLR3GL-201ENST00000369313 818 ntTSL 2 BASIC21.71■■□□□ 1.07
GRIK2Q13002 AC092171.1-201ENST00000455866 753 ntTSL 2 BASIC21.71■■□□□ 1.07
GRIK2Q13002 IDH2-203ENST00000559482 1278 ntTSL 5 BASIC21.71■■□□□ 1.07
GRIK2Q13002 EMC9-206ENST00000560403 872 ntTSL 2 BASIC21.71■■□□□ 1.07
GRIK2Q13002 SLC35A2-211ENST00000634461 533 ntTSL 4 BASIC21.71■■□□□ 1.07
GRIK2Q13002 PXK-202ENST00000356151 2037 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.71■■□□□ 1.07
GRIK2Q13002 CKMT1B-207ENST00000441322 1747 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.71■■□□□ 1.07
GRIK2Q13002 IMPDH1-210ENST00000480861 1765 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC21.71■■□□□ 1.07
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 30.9 ms