Protein–RNA interactions for Protein: Q12983

BNIP3, BCL2/adenovirus E1B 19 kDa protein-interacting protein 3, humanhuman

Predictions only

Length 259 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
BNIP3Q12983 NKX6-3-202ENST00000524115 1683 ntTSL 2 BASIC21.51■■□□□ 1.03
BNIP3Q12983 SLC25A27-202ENST00000411689 2526 ntTSL 1 (best) BASIC21.51■■□□□ 1.03
BNIP3Q12983 AL590128.2-201ENST00000442889 415 ntTSL 3 BASIC21.51■■□□□ 1.03
BNIP3Q12983 DENND3-207ENST00000518347 850 ntTSL 2 BASIC21.51■■□□□ 1.03
BNIP3Q12983 CFP-202ENST00000377005 1435 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.51■■□□□ 1.03
BNIP3Q12983 PPP2R2D-201ENST00000455566 5738 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.51■■□□□ 1.03
BNIP3Q12983 PON2-217ENST00000633192 1876 ntTSL 1 (best) BASIC21.51■■□□□ 1.03
BNIP3Q12983 PNKP-201ENST00000322344 2041 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.51■■□□□ 1.03
BNIP3Q12983 SPOCK3-222ENST00000512681 1457 ntTSL 2 BASIC21.51■■□□□ 1.03
BNIP3Q12983 BLOC1S4-201ENST00000320776 1617 ntAPPRIS P1 BASIC21.51■■□□□ 1.03
BNIP3Q12983 CABLES1-201ENST00000256925 5002 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC21.51■■□□□ 1.03
BNIP3Q12983 LINGO3-201ENST00000585527 2241 ntAPPRIS P1 BASIC21.51■■□□□ 1.03
BNIP3Q12983 RUFY1-201ENST00000319449 2646 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.5■■□□□ 1.03
BNIP3Q12983 STOML1-201ENST00000316900 2169 ntTSL 2 BASIC21.5■■□□□ 1.03
BNIP3Q12983 SLC2A8-203ENST00000373371 2172 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.5■■□□□ 1.03
BNIP3Q12983 DMRT2-209ENST00000635183 2190 ntTSL 5 BASIC21.5■■□□□ 1.03
BNIP3Q12983 IQCJ-SCHIP1-202ENST00000460298 1884 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.5■■□□□ 1.03
BNIP3Q12983 EFCC1-201ENST00000436022 2691 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.5■■□□□ 1.03
BNIP3Q12983 ZNF419-203ENST00000354197 1569 ntTSL 5 BASIC21.5■■□□□ 1.03
BNIP3Q12983 AC004854.2-201ENST00000608450 1441 ntBASIC21.5■■□□□ 1.03
BNIP3Q12983 NAT8L-202ENST00000423729 5870 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.5■■□□□ 1.03
BNIP3Q12983 STX7-201ENST00000367937 1090 ntTSL 5 BASIC21.5■■□□□ 1.03
BNIP3Q12983 PLAC9-202ENST00000372267 472 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC21.5■■□□□ 1.03
BNIP3Q12983 VSX1-201ENST00000376707 943 ntTSL 1 (best) BASIC21.5■■□□□ 1.03
BNIP3Q12983 VGLL4-208ENST00000424529 1025 ntTSL 1 (best) BASIC21.5■■□□□ 1.03
BNIP3Q12983 VSX1-206ENST00000444511 1197 ntTSL 1 (best) BASIC21.5■■□□□ 1.03
BNIP3Q12983 TMEM191B-201ENST00000612978 1220 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC21.5■■□□□ 1.03
BNIP3Q12983 USP12-201ENST00000282344 4511 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.5■■□□□ 1.03
BNIP3Q12983 DTNB-210ENST00000407186 2275 ntTSL 5 BASIC21.5■■□□□ 1.03
BNIP3Q12983 TBL1X-201ENST00000217964 5871 ntTSL 1 (best) BASIC21.5■■□□□ 1.03
BNIP3Q12983 POU2F3-206ENST00000543440 1953 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.5■■□□□ 1.03
BNIP3Q12983 EXOSC6-201ENST00000435634 5153 ntAPPRIS P1 BASIC21.5■■□□□ 1.03
BNIP3Q12983 SLC10A3-201ENST00000263512 2161 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC21.5■■□□□ 1.03
BNIP3Q12983 SPRED3-202ENST00000586301 1366 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.49■■□□□ 1.03
BNIP3Q12983 MIS18A-201ENST00000290130 1575 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.49■■□□□ 1.03
BNIP3Q12983 WRNIP1-204ENST00000380773 2670 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.49■■□□□ 1.03
BNIP3Q12983 PHPT1-201ENST00000247665 890 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.49■■□□□ 1.03
BNIP3Q12983 JSRP1-201ENST00000300961 1138 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.49■■□□□ 1.03
BNIP3Q12983 DBI-210ENST00000542275 757 ntTSL 5 BASIC21.49■■□□□ 1.03
BNIP3Q12983 TK2-208ENST00000545043 1120 ntTSL 2 BASIC21.49■■□□□ 1.03
BNIP3Q12983 AC092368.3-201ENST00000562549 1107 ntTSL 5 BASIC21.49■■□□□ 1.03
BNIP3Q12983 AC012313.1-203ENST00000597980 570 ntTSL 4 BASIC21.49■■□□□ 1.03
BNIP3Q12983 CTU2-201ENST00000312060 1672 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC21.49■■□□□ 1.03
BNIP3Q12983 AC073188.6-202ENST00000616616 2281 ntTSL 1 (best) BASIC21.49■■□□□ 1.03
BNIP3Q12983 TM9SF3-201ENST00000371142 6141 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.49■■□□□ 1.03
BNIP3Q12983 PTP4A3-204ENST00000521578 1717 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.49■■□□□ 1.03
BNIP3Q12983 HSD11B2-201ENST00000326152 1900 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.49■■□□□ 1.03
BNIP3Q12983 AL117328.2-201ENST00000624617 1940 ntBASIC21.49■■□□□ 1.03
BNIP3Q12983 FAM120B-204ENST00000625626 1794 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.48■■□□□ 1.03
BNIP3Q12983 ARRDC1-AS1-201ENST00000371417 1409 ntTSL 1 (best) BASIC21.48■■□□□ 1.03
BNIP3Q12983 GSN-204ENST00000373818 2657 ntTSL 1 (best) BASIC21.48■■□□□ 1.03
BNIP3Q12983 PCSK1N-201ENST00000218230 1050 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.48■■□□□ 1.03
BNIP3Q12983 UCHL1-201ENST00000284440 1172 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.48■■□□□ 1.03
BNIP3Q12983 IZUMO4-203ENST00000395307 944 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.48■■□□□ 1.03
BNIP3Q12983 YWHAZ-205ENST00000395956 2974 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.48■■□□□ 1.03
BNIP3Q12983 CDCA4P2-201ENST00000441182 718 ntBASIC21.48■■□□□ 1.03
BNIP3Q12983 YIF1A-205ENST00000471387 854 ntTSL 5 BASIC21.48■■□□□ 1.03
BNIP3Q12983 UCHL1-210ENST00000512788 785 ntTSL 3 BASIC21.48■■□□□ 1.03
BNIP3Q12983 AC068587.7-201ENST00000641602 218 ntBASIC21.48■■□□□ 1.03
BNIP3Q12983 HTATIP2-204ENST00000451739 1748 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.48■■□□□ 1.03
BNIP3Q12983 SLC25A29-201ENST00000359232 2385 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.48■■□□□ 1.03
BNIP3Q12983 MATK-203ENST00000395045 2073 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC21.48■■□□□ 1.03
BNIP3Q12983 KISS1R-201ENST00000234371 1625 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.47■■□□□ 1.03
BNIP3Q12983 TMEM230-205ENST00000379279 1636 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.47■■□□□ 1.03
BNIP3Q12983 AC009506.1-201ENST00000418474 1494 ntTSL 2 BASIC21.47■■□□□ 1.03
BNIP3Q12983 POU4F1-201ENST00000377208 4547 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.47■■□□□ 1.03
BNIP3Q12983 MPV17L-202ENST00000396385 1037 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.47■■□□□ 1.03
BNIP3Q12983 AC010141.3-201ENST00000456659 717 ntBASIC21.47■■□□□ 1.03
BNIP3Q12983 AC092468.1-201ENST00000491321 562 ntTSL 4 BASIC21.47■■□□□ 1.03
BNIP3Q12983 IDH2-203ENST00000559482 1278 ntTSL 5 BASIC21.47■■□□□ 1.03
BNIP3Q12983 SMUG1P1-201ENST00000590640 811 ntBASIC21.47■■□□□ 1.03
BNIP3Q12983 ZFP91-CNTF-201ENST00000389919 2319 ntAPPRIS P5 TSL 2 BASIC21.47■■□□□ 1.03
BNIP3Q12983 MALT1-201ENST00000345724 2866 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.47■■□□□ 1.03
BNIP3Q12983 IRX2-201ENST00000302057 2456 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.47■■□□□ 1.03
BNIP3Q12983 RPS6-203ENST00000380384 1355 ntTSL 1 (best) BASIC21.47■■□□□ 1.03
BNIP3Q12983 HOMER2-201ENST00000304231 1990 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC21.47■■□□□ 1.03
BNIP3Q12983 GAS1-201ENST00000298743 2827 ntAPPRIS P1 BASIC21.47■■□□□ 1.03
BNIP3Q12983 CYHR1-201ENST00000306145 1409 ntTSL 1 (best) BASIC21.46■■□□□ 1.03
BNIP3Q12983 GATA1-202ENST00000376670 1497 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.46■■□□□ 1.03
BNIP3Q12983 AC004980.1-201ENST00000418663 2667 ntTSL 1 (best) BASIC21.46■■□□□ 1.03
BNIP3Q12983 ZNF511-202ENST00000361518 1520 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.46■■□□□ 1.03
BNIP3Q12983 ASCC1-204ENST00000394915 1510 ntTSL 5 BASIC21.46■■□□□ 1.03
BNIP3Q12983 ADAMTS13-204ENST00000371911 1155 ntTSL 1 (best) BASIC21.46■■□□□ 1.03
BNIP3Q12983 NXNL2-201ENST00000375854 805 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.46■■□□□ 1.03
BNIP3Q12983 TNFRSF18-203ENST00000379268 1179 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.46■■□□□ 1.03
BNIP3Q12983 HSCB-202ENST00000398941 955 ntTSL 2 BASIC21.46■■□□□ 1.03
BNIP3Q12983 RPS15-210ENST00000592623 873 ntTSL 1 (best) BASIC21.46■■□□□ 1.03
BNIP3Q12983 RAP2CP1-201ENST00000605103 478 ntBASIC21.46■■□□□ 1.03
BNIP3Q12983 AC073111.5-205ENST00000641717 521 ntBASIC21.46■■□□□ 1.03
BNIP3Q12983 C7orf26-202ENST00000359073 1762 ntTSL 1 (best) BASIC21.46■■□□□ 1.03
BNIP3Q12983 MAGI2-201ENST00000354212 6880 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.46■■□□□ 1.03
BNIP3Q12983 ABCB10P4-201ENST00000566803 2184 ntBASIC21.46■■□□□ 1.03
BNIP3Q12983 FLOT1-201ENST00000376389 1912 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.45■■□□□ 1.02
BNIP3Q12983 H19-210ENST00000439725 1929 ntTSL 2 BASIC21.45■■□□□ 1.02
BNIP3Q12983 LINC00565-201ENST00000562710 2331 ntBASIC21.45■■□□□ 1.02
BNIP3Q12983 TRIM3-214ENST00000536344 2704 ntTSL 2 BASIC21.45■■□□□ 1.02
BNIP3Q12983 STK25-234ENST00000535007 2459 ntTSL 2 BASIC21.45■■□□□ 1.02
BNIP3Q12983 SMUG1-215ENST00000508394 1697 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.45■■□□□ 1.02
BNIP3Q12983 AC005410.1-201ENST00000579522 462 ntTSL 3 BASIC21.45■■□□□ 1.02
BNIP3Q12983 GXYLT1P5-201ENST00000614548 1189 ntBASIC21.45■■□□□ 1.02
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