Protein–RNA interactions for Protein: Q12950

FOXD4, Forkhead box protein D4, humanhuman

Predicted RBP Predictions only

Length 439 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
FOXD4Q12950 PLPP1-202ENST00000307259 1597 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC20.34■□□□□ 0.85
FOXD4Q12950 NR0B1-202ENST00000378970 2021 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.34■□□□□ 0.85
FOXD4Q12950 EEFSEC-201ENST00000254730 2232 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.34■□□□□ 0.85
FOXD4Q12950 ZXDB-201ENST00000374888 5894 ntAPPRIS P1 BASIC20.34■□□□□ 0.85
FOXD4Q12950 MYBL1-201ENST00000517885 1714 ntTSL 5 BASIC20.34■□□□□ 0.85
FOXD4Q12950 CERS1-205ENST00000623927 2558 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.34■□□□□ 0.85
FOXD4Q12950 RAB33A-201ENST00000257017 1258 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.34■□□□□ 0.85
FOXD4Q12950 GUK1-205ENST00000366722 850 ntTSL 3 BASIC20.34■□□□□ 0.85
FOXD4Q12950 LIN7B-202ENST00000391864 582 ntTSL 3 BASIC20.34■□□□□ 0.85
FOXD4Q12950 AC137630.3-201ENST00000607245 391 ntBASIC20.34■□□□□ 0.85
FOXD4Q12950 SNRNP70-201ENST00000221448 1603 ntTSL 2 BASIC20.34■□□□□ 0.85
FOXD4Q12950 BLOC1S4-201ENST00000320776 1617 ntAPPRIS P1 BASIC20.34■□□□□ 0.85
FOXD4Q12950 CBWD3-213ENST00000618217 1611 ntTSL 1 (best) BASIC20.34■□□□□ 0.85
FOXD4Q12950 AC092053.2-201ENST00000640557 1818 ntBASIC20.34■□□□□ 0.85
FOXD4Q12950 CD2AP-201ENST00000359314 5412 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.34■□□□□ 0.85
FOXD4Q12950 TRIM3-214ENST00000536344 2704 ntTSL 2 BASIC20.33■□□□□ 0.85
FOXD4Q12950 AC087742.1-201ENST00000575880 1738 ntBASIC20.33■□□□□ 0.85
FOXD4Q12950 MAP2K5-204ENST00000395476 1689 ntTSL 1 (best) BASIC20.33■□□□□ 0.85
FOXD4Q12950 RPP38-201ENST00000378197 1457 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.33■□□□□ 0.85
FOXD4Q12950 C11orf96-202ENST00000528572 1834 ntBASIC20.33■□□□□ 0.85
FOXD4Q12950 GLT8D2-205ENST00000548660 1835 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.33■□□□□ 0.85
FOXD4Q12950 NPW-201ENST00000329610 498 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.33■□□□□ 0.85
FOXD4Q12950 HMGA2-202ENST00000393577 611 ntTSL 3 BASIC20.33■□□□□ 0.85
FOXD4Q12950 RARRES2P6-201ENST00000567333 442 ntBASIC20.33■□□□□ 0.85
FOXD4Q12950 TBC1D4-201ENST00000377625 6182 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.33■□□□□ 0.85
FOXD4Q12950 PSPH-202ENST00000395471 2178 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.33■□□□□ 0.85
FOXD4Q12950 MEF2A-207ENST00000558812 2186 ntTSL 2 BASIC20.33■□□□□ 0.85
FOXD4Q12950 LACTBL1-201ENST00000426928 1641 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC20.33■□□□□ 0.84
FOXD4Q12950 MPST-202ENST00000397225 2116 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.33■□□□□ 0.84
FOXD4Q12950 DDN-AS1-202ENST00000547866 2114 ntTSL 3 BASIC20.33■□□□□ 0.84
FOXD4Q12950 IGSF21-201ENST00000251296 1943 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.33■□□□□ 0.84
FOXD4Q12950 PACRGL-201ENST00000295290 1937 ntTSL 5 BASIC20.33■□□□□ 0.84
FOXD4Q12950 APAF1-210ENST00000551964 5444 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC20.33■□□□□ 0.84
FOXD4Q12950 SPTBN4-203ENST00000392023 2419 ntTSL 1 (best) BASIC20.33■□□□□ 0.84
FOXD4Q12950 AC021242.3-201ENST00000607598 1377 ntBASIC20.33■□□□□ 0.84
FOXD4Q12950 GRK4-201ENST00000345167 2013 ntTSL 1 (best) BASIC20.32■□□□□ 0.84
FOXD4Q12950 PICK1-202ENST00000404072 2164 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.32■□□□□ 0.84
FOXD4Q12950 AC005703.6-201ENST00000623265 1329 ntBASIC20.32■□□□□ 0.84
FOXD4Q12950 EHBP1-209ENST00000431489 5076 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.32■□□□□ 0.84
FOXD4Q12950 CERS5-201ENST00000317551 2051 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC20.32■□□□□ 0.84
FOXD4Q12950 FAM173A-201ENST00000219535 806 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC20.32■□□□□ 0.84
FOXD4Q12950 POLR2F-211ENST00000488684 564 ntTSL 2 BASIC20.32■□□□□ 0.84
FOXD4Q12950 CHTF8-208ENST00000522091 863 ntTSL 2 BASIC20.32■□□□□ 0.84
FOXD4Q12950 TOLLIP-208ENST00000527938 549 ntTSL 4 BASIC20.32■□□□□ 0.84
FOXD4Q12950 GPR137B-202ENST00000366592 2042 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.32■□□□□ 0.84
FOXD4Q12950 STK19-201ENST00000375331 1663 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.32■□□□□ 0.84
FOXD4Q12950 AC011498.4-201ENST00000586020 1803 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.32■□□□□ 0.84
FOXD4Q12950 WWC1-201ENST00000265293 7130 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.32■□□□□ 0.84
FOXD4Q12950 SLC16A10-202ENST00000368851 2508 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.31■□□□□ 0.84
FOXD4Q12950 CACNB1-201ENST00000344140 1889 ntTSL 1 (best) BASIC20.31■□□□□ 0.84
FOXD4Q12950 C20orf27-202ENST00000379772 1886 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.31■□□□□ 0.84
FOXD4Q12950 GUCD1-202ENST00000402766 865 ntTSL 2 BASIC20.31■□□□□ 0.84
FOXD4Q12950 PDLIM2-216ENST00000464275 1995 ntTSL 2 BASIC20.31■□□□□ 0.84
FOXD4Q12950 SLC12A5-AS1-202ENST00000535913 1957 ntTSL 2 BASIC20.31■□□□□ 0.84
FOXD4Q12950 SHANK1-203ENST00000391813 4785 ntTSL 1 (best) BASIC20.31■□□□□ 0.84
FOXD4Q12950 E2F1-201ENST00000343380 2503 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.31■□□□□ 0.84
FOXD4Q12950 ASCC1-204ENST00000394915 1510 ntTSL 5 BASIC20.31■□□□□ 0.84
FOXD4Q12950 MIR222HG-201ENST00000602461 1379 ntTSL 5 BASIC20.31■□□□□ 0.84
FOXD4Q12950 DTWD2-203ENST00000510708 2307 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.31■□□□□ 0.84
FOXD4Q12950 ZNF584-203ENST00000593920 2187 ntTSL 2 BASIC20.31■□□□□ 0.84
FOXD4Q12950 SNUPN-207ENST00000567134 1641 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.31■□□□□ 0.84
FOXD4Q12950 SNX8-201ENST00000222990 4727 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.31■□□□□ 0.84
FOXD4Q12950 RAP1B-207ENST00000450214 1466 ntTSL 2 BASIC20.3■□□□□ 0.84
FOXD4Q12950 AMZ2-219ENST00000612294 1498 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.3■□□□□ 0.84
FOXD4Q12950 KLHDC10-201ENST00000335420 6437 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.3■□□□□ 0.84
FOXD4Q12950 PAXIP1-202ENST00000404141 3827 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.3■□□□□ 0.84
FOXD4Q12950 SMARCC1-201ENST00000254480 6375 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.3■□□□□ 0.84
FOXD4Q12950 ARHGEF25-201ENST00000286494 2552 ntTSL 1 (best) BASIC20.3■□□□□ 0.84
FOXD4Q12950 AL117332.1-201ENST00000622628 974 ntBASIC20.3■□□□□ 0.84
FOXD4Q12950 SRRM2-231ENST00000630499 1207 ntTSL 1 (best) BASIC20.3■□□□□ 0.84
FOXD4Q12950 CIZ1-203ENST00000357558 2907 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.3■□□□□ 0.84
FOXD4Q12950 CIZ1-204ENST00000372938 2984 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.3■□□□□ 0.84
FOXD4Q12950 LINC01529-204ENST00000636474 1715 ntBASIC20.3■□□□□ 0.84
FOXD4Q12950 ILDR2-206ENST00000528703 2446 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.29■□□□□ 0.84
FOXD4Q12950 TMEM165-201ENST00000381334 1928 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.29■□□□□ 0.84
FOXD4Q12950 AC137767.1-201ENST00000602918 1920 ntBASIC20.29■□□□□ 0.84
FOXD4Q12950 MYH14-208ENST00000598205 6137 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC20.29■□□□□ 0.84
FOXD4Q12950 UNC5B-201ENST00000335350 6841 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.29■□□□□ 0.84
FOXD4Q12950 MSL1-204ENST00000578648 2267 ntTSL 5 BASIC20.29■□□□□ 0.84
FOXD4Q12950 GRB10-201ENST00000335866 5032 ntTSL 1 (best) BASIC20.29■□□□□ 0.84
FOXD4Q12950 CTGF-201ENST00000367976 2339 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.29■□□□□ 0.84
FOXD4Q12950 TNFRSF25-201ENST00000348333 1119 ntTSL 1 (best) BASIC20.29■□□□□ 0.84
FOXD4Q12950 TNFRSF25-202ENST00000351748 705 ntTSL 1 (best) BASIC20.29■□□□□ 0.84
FOXD4Q12950 ASB1-202ENST00000409297 878 ntTSL 5 BASIC20.29■□□□□ 0.84
FOXD4Q12950 IGFBP7-203ENST00000514062 1251 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC20.29■□□□□ 0.84
FOXD4Q12950 TMC6-218ENST00000591436 1155 ntTSL 1 (best) BASIC20.29■□□□□ 0.84
FOXD4Q12950 AC092028.1-203ENST00000608262 953 ntBASIC20.29■□□□□ 0.84
FOXD4Q12950 MMEL1-206ENST00000502556 1943 ntTSL 1 (best) BASIC20.29■□□□□ 0.84
FOXD4Q12950 CFAP97-205ENST00000514798 2895 ntTSL 1 (best) BASIC20.28■□□□□ 0.84
FOXD4Q12950 PTP4A3-204ENST00000521578 1717 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.28■□□□□ 0.84
FOXD4Q12950 FSTL1-201ENST00000295633 5943 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.28■□□□□ 0.84
FOXD4Q12950 FAM228B-208ENST00000613899 1238 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.28■□□□□ 0.84
FOXD4Q12950 KLC2-207ENST00000421552 2721 ntTSL 5 BASIC20.28■□□□□ 0.84
FOXD4Q12950 FNDC4-201ENST00000264703 1657 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.28■□□□□ 0.84
FOXD4Q12950 BID-212ENST00000614949 1988 ntTSL 5 BASIC20.28■□□□□ 0.84
FOXD4Q12950 CPAMD8-202ENST00000388925 5355 ntTSL 5 BASIC20.27■□□□□ 0.84
FOXD4Q12950 DPH7-201ENST00000277540 1847 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.27■□□□□ 0.84
FOXD4Q12950 DCTD-201ENST00000357067 1931 ntTSL 1 (best) BASIC20.27■□□□□ 0.84
FOXD4Q12950 RANBP10-202ENST00000448631 2232 ntTSL 2 BASIC20.27■□□□□ 0.84
FOXD4Q12950 RBM38-203ENST00000356208 2382 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.27■□□□□ 0.84
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