Protein–RNA interactions for Protein: Q12948

FOXC1, Forkhead box protein C1, humanhuman

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Length 553 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
FOXC1Q12948 UBALD1-209ENST00000591897 1275 ntTSL 2 BASIC20.69■□□□□ 0.9
FOXC1Q12948 CD151-213ENST00000528011 1369 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC20.69■□□□□ 0.9
FOXC1Q12948 PXK-203ENST00000383715 1756 ntTSL 5 BASIC20.69■□□□□ 0.9
FOXC1Q12948 MFSD7-209ENST00000515118 1556 ntTSL 5 BASIC20.68■□□□□ 0.9
FOXC1Q12948 AC135731.1-201ENST00000569415 2548 ntBASIC20.68■□□□□ 0.9
FOXC1Q12948 AP2M1-202ENST00000382456 2091 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC20.68■□□□□ 0.9
FOXC1Q12948 RPUSD1-201ENST00000007264 2050 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.68■□□□□ 0.9
FOXC1Q12948 SLC22A18-201ENST00000312221 1628 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.68■□□□□ 0.9
FOXC1Q12948 EFCAB6-202ENST00000356087 1129 ntTSL 5 BASIC20.68■□□□□ 0.9
FOXC1Q12948 FAM47E-204ENST00000510328 1002 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC20.68■□□□□ 0.9
FOXC1Q12948 CFL1-211ENST00000531407 1062 ntTSL 2 BASIC20.68■□□□□ 0.9
FOXC1Q12948 INO80E-214ENST00000620599 515 ntTSL 2 BASIC20.68■□□□□ 0.9
FOXC1Q12948 METTL9-202ENST00000396014 1817 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC20.68■□□□□ 0.9
FOXC1Q12948 TLX1-203ENST00000467928 1838 ntTSL 1 (best) BASIC20.68■□□□□ 0.9
FOXC1Q12948 SNCB-201ENST00000310112 1383 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.68■□□□□ 0.9
FOXC1Q12948 UBA5-208ENST00000473651 1513 ntTSL 5 BASIC20.68■□□□□ 0.9
FOXC1Q12948 SNX24-201ENST00000261369 2158 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.68■□□□□ 0.9
FOXC1Q12948 DYRK2-203ENST00000393555 2209 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC20.68■□□□□ 0.9
FOXC1Q12948 STMN4-204ENST00000519997 1623 ntTSL 2 BASIC20.67■□□□□ 0.9
FOXC1Q12948 THAP7-201ENST00000215742 1213 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.67■□□□□ 0.9
FOXC1Q12948 SYNE2-201ENST00000341472 1132 ntTSL 1 (best) BASIC20.67■□□□□ 0.9
FOXC1Q12948 MIR718-201ENST00000390190 70 ntBASIC20.67■□□□□ 0.9
FOXC1Q12948 AC211429.1-201ENST00000415277 523 ntBASIC20.67■□□□□ 0.9
FOXC1Q12948 AC026366.1-201ENST00000488803 879 ntBASIC20.67■□□□□ 0.9
FOXC1Q12948 JOSD2-202ENST00000595669 733 ntTSL 2 BASIC20.67■□□□□ 0.9
FOXC1Q12948 F2RL3-202ENST00000599210 613 ntTSL 2 BASIC20.67■□□□□ 0.9
FOXC1Q12948 AC027682.4-201ENST00000605277 798 ntTSL 5 BASIC20.67■□□□□ 0.9
FOXC1Q12948 PLA2G15-202ENST00000413021 1346 ntTSL 2 BASIC20.67■□□□□ 0.9
FOXC1Q12948 ELOA3B-201ENST00000611323 1641 ntAPPRIS P1 BASIC20.67■□□□□ 0.9
FOXC1Q12948 ELOA3D-201ENST00000620881 1641 ntAPPRIS P1 BASIC20.67■□□□□ 0.9
FOXC1Q12948 VIPR2-203ENST00000402066 1926 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.66■□□□□ 0.9
FOXC1Q12948 AC105219.1-201ENST00000531565 1963 ntTSL 1 (best) BASIC20.66■□□□□ 0.9
FOXC1Q12948 IGFBP3-201ENST00000275521 2262 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.66■□□□□ 0.9
FOXC1Q12948 FAM207A-201ENST00000291634 927 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.66■□□□□ 0.9
FOXC1Q12948 PUSL1-201ENST00000379031 1287 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.66■□□□□ 0.9
FOXC1Q12948 AL512625.2-201ENST00000417533 625 ntBASIC20.66■□□□□ 0.9
FOXC1Q12948 AC009086.2-201ENST00000449759 610 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC20.66■□□□□ 0.9
FOXC1Q12948 LCN6-203ENST00000476567 1015 ntTSL 1 (best) BASIC20.66■□□□□ 0.9
FOXC1Q12948 KRT18P21-201ENST00000515767 1272 ntBASIC20.66■□□□□ 0.9
FOXC1Q12948 SMARCB1-201ENST00000263121 1690 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.66■□□□□ 0.9
FOXC1Q12948 CPLX1-201ENST00000304062 2181 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.65■□□□□ 0.9
FOXC1Q12948 TSPAN13-201ENST00000262067 2093 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.65■□□□□ 0.9
FOXC1Q12948 SPINT2-202ENST00000454580 1367 ntTSL 1 (best) BASIC20.65■□□□□ 0.9
FOXC1Q12948 PRAF2-202ENST00000553851 1334 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.65■□□□□ 0.9
FOXC1Q12948 CFC1-201ENST00000259216 1046 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.65■□□□□ 0.9
FOXC1Q12948 CFC1B-201ENST00000281882 1071 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.65■□□□□ 0.9
FOXC1Q12948 C10orf91-201ENST00000321248 1257 ntTSL 1 (best) BASIC20.65■□□□□ 0.9
FOXC1Q12948 AK2-201ENST00000354858 1021 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC20.65■□□□□ 0.9
FOXC1Q12948 ANKRD65-202ENST00000442470 876 ntTSL 2 BASIC20.65■□□□□ 0.9
FOXC1Q12948 AC091874.3-201ENST00000512672 1195 ntBASIC20.65■□□□□ 0.9
FOXC1Q12948 E2F5-203ENST00000418930 1890 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.64■□□□□ 0.9
FOXC1Q12948 RAB28-201ENST00000288723 1810 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.64■□□□□ 0.9
FOXC1Q12948 USP45-205ENST00000472914 1617 ntTSL 5 BASIC20.64■□□□□ 0.9
FOXC1Q12948 CAPN10-203ENST00000352879 862 ntTSL 1 (best) BASIC20.64■□□□□ 0.89
FOXC1Q12948 GPR35-203ENST00000407714 1258 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.64■□□□□ 0.89
FOXC1Q12948 C4orf48-201ENST00000409248 433 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.64■□□□□ 0.89
FOXC1Q12948 NT5C3B-203ENST00000435506 975 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.64■□□□□ 0.89
FOXC1Q12948 CERNA3-201ENST00000521403 557 ntTSL 3 BASIC20.64■□□□□ 0.89
FOXC1Q12948 AP003097.1-201ENST00000530657 1135 ntBASIC20.64■□□□□ 0.89
FOXC1Q12948 TNFRSF1B-204ENST00000536782 557 ntTSL 1 (best) BASIC20.64■□□□□ 0.89
FOXC1Q12948 AC007493.2-201ENST00000568427 478 ntTSL 3 BASIC20.64■□□□□ 0.89
FOXC1Q12948 AC138907.5-202ENST00000569484 235 ntBASIC20.64■□□□□ 0.89
FOXC1Q12948 AF274858.3-202ENST00000569906 755 ntTSL 3 BASIC20.64■□□□□ 0.89
FOXC1Q12948 AC110285.4-201ENST00000572590 424 ntTSL 3 BASIC20.64■□□□□ 0.89
FOXC1Q12948 AP005205.2-201ENST00000577327 491 ntTSL 2 BASIC20.64■□□□□ 0.89
FOXC1Q12948 MIR4497-201ENST00000583208 89 ntBASIC20.64■□□□□ 0.89
FOXC1Q12948 MAGIX-206ENST00000615626 1057 ntTSL 1 (best) BASIC20.64■□□□□ 0.89
FOXC1Q12948 REXO1L12P-201ENST00000622156 912 ntBASIC20.64■□□□□ 0.89
FOXC1Q12948 PXK-202ENST00000356151 2037 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.64■□□□□ 0.89
FOXC1Q12948 TAZ-205ENST00000475699 1862 ntTSL 1 (best) BASIC20.64■□□□□ 0.89
FOXC1Q12948 UBE3C-209ENST00000611269 1866 ntTSL 2 BASIC20.64■□□□□ 0.89
FOXC1Q12948 BOP1-205ENST00000569669 2303 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.64■□□□□ 0.89
FOXC1Q12948 DNAH17-AS1-202ENST00000591373 1453 ntTSL 5 BASIC20.63■□□□□ 0.89
FOXC1Q12948 MREG-201ENST00000263268 1314 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.63■□□□□ 0.89
FOXC1Q12948 AL360181.5-201ENST00000368554 1044 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.63■□□□□ 0.89
FOXC1Q12948 DUSP15-205ENST00000398084 1256 ntTSL 5 BASIC20.63■□□□□ 0.89
FOXC1Q12948 AL390719.1-201ENST00000427998 977 ntTSL 1 (best) BASIC20.63■□□□□ 0.89
FOXC1Q12948 TPT1-AS1-211ENST00000520622 604 ntTSL 4 BASIC20.63■□□□□ 0.89
FOXC1Q12948 SPI1-204ENST00000533968 1290 ntTSL 1 (best) BASIC20.63■□□□□ 0.89
FOXC1Q12948 AC106738.2-202ENST00000558156 533 ntTSL 4 BASIC20.63■□□□□ 0.89
FOXC1Q12948 TIMM50-213ENST00000599794 786 ntTSL 2 BASIC20.63■□□□□ 0.89
FOXC1Q12948 C17orf50-201ENST00000603305 569 ntTSL 3 BASIC20.63■□□□□ 0.89
FOXC1Q12948 C17orf50-203ENST00000605587 1018 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.63■□□□□ 0.89
FOXC1Q12948 AL359736.2-201ENST00000621992 437 ntBASIC20.63■□□□□ 0.89
FOXC1Q12948 EI24-213ENST00000618552 1747 ntTSL 5 BASIC20.63■□□□□ 0.89
FOXC1Q12948 NKX6-3-202ENST00000524115 1683 ntTSL 2 BASIC20.63■□□□□ 0.89
FOXC1Q12948 LRRC73-201ENST00000372441 2121 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.63■□□□□ 0.89
FOXC1Q12948 BDH1-207ENST00000441275 1605 ntTSL 5 BASIC20.63■□□□□ 0.89
FOXC1Q12948 SHF-206ENST00000560471 2499 ntTSL 5 BASIC20.62■□□□□ 0.89
FOXC1Q12948 PPP1R12B-202ENST00000356764 1687 ntTSL 1 (best) BASIC20.62■□□□□ 0.89
FOXC1Q12948 BOLA1-203ENST00000369153 1096 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC20.62■□□□□ 0.89
FOXC1Q12948 AVP-201ENST00000380293 619 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.62■□□□□ 0.89
FOXC1Q12948 AC007322.4-201ENST00000509611 723 ntBASIC20.62■□□□□ 0.89
FOXC1Q12948 ISCU-212ENST00000547005 795 ntTSL 3 BASIC20.62■□□□□ 0.89
FOXC1Q12948 GDF6-203ENST00000621429 1179 ntTSL 5 BASIC20.62■□□□□ 0.89
FOXC1Q12948 FAM197Y4-202ENST00000622692 608 ntBASIC20.62■□□□□ 0.89
FOXC1Q12948 FEZF2-202ENST00000475839 1918 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.62■□□□□ 0.89
FOXC1Q12948 CHSY1-201ENST00000254190 4550 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.62■□□□□ 0.89
FOXC1Q12948 TTC34-202ENST00000637179 1775 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC20.62■□□□□ 0.89
FOXC1Q12948 CARM1-202ENST00000344150 2722 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.62■□□□□ 0.89
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