Protein–RNA interactions for Protein: Q12829

RAB40B, Ras-related protein Rab-40B, humanhuman

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
RAB40BQ12829 TMC7-205ENST00000569532 2738 ntTSL 2 BASIC19.34■□□□□ 0.69
RAB40BQ12829 RBM34-201ENST00000408888 2054 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.34■□□□□ 0.69
RAB40BQ12829 OLA1-204ENST00000409546 2071 ntTSL 5 BASIC19.34■□□□□ 0.69
RAB40BQ12829 PXK-211ENST00000484288 2031 ntTSL 1 (best) BASIC19.34■□□□□ 0.69
RAB40BQ12829 T-202ENST00000366871 2250 ntTSL 1 (best) BASIC19.34■□□□□ 0.69
RAB40BQ12829 GNB1-209ENST00000610897 3145 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.34■□□□□ 0.69
RAB40BQ12829 CBWD2-203ENST00000416503 1665 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.33■□□□□ 0.69
RAB40BQ12829 SIMC1-204ENST00000430704 1925 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC19.33■□□□□ 0.69
RAB40BQ12829 LINC01521-201ENST00000504184 1943 ntBASIC19.33■□□□□ 0.69
RAB40BQ12829 IRX4-207ENST00000613726 2403 ntTSL 1 (best) BASIC19.33■□□□□ 0.69
RAB40BQ12829 LINC02175-201ENST00000571219 1875 ntTSL 1 (best) BASIC19.33■□□□□ 0.69
RAB40BQ12829 TMEM206-205ENST00000535273 2119 ntTSL 2 BASIC19.33■□□□□ 0.69
RAB40BQ12829 KLHDC9-203ENST00000392192 1333 ntTSL 1 (best) BASIC19.33■□□□□ 0.69
RAB40BQ12829 SAV1-201ENST00000324679 3063 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.33■□□□□ 0.69
RAB40BQ12829 VSTM2L-201ENST00000373459 831 ntTSL 3 BASIC19.33■□□□□ 0.68
RAB40BQ12829 CLTA-204ENST00000433436 1235 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC19.33■□□□□ 0.68
RAB40BQ12829 CLTA-209ENST00000538225 1181 ntTSL 2 BASIC19.33■□□□□ 0.68
RAB40BQ12829 CLTA-210ENST00000540080 989 ntTSL 2 BASIC19.33■□□□□ 0.68
RAB40BQ12829 SNX3-201ENST00000230085 1755 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.33■□□□□ 0.68
RAB40BQ12829 ENTPD6-203ENST00000376652 2750 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.33■□□□□ 0.68
RAB40BQ12829 PSIP1-201ENST00000380715 1966 ntTSL 1 (best) BASIC19.33■□□□□ 0.68
RAB40BQ12829 SCAND1-202ENST00000373991 1727 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.33■□□□□ 0.68
RAB40BQ12829 LAYN-209ENST00000533265 1703 ntTSL 5 BASIC19.33■□□□□ 0.68
RAB40BQ12829 AC074143.1-203ENST00000518227 1473 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.33■□□□□ 0.68
RAB40BQ12829 SH3RF3-201ENST00000309415 5803 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.33■□□□□ 0.68
RAB40BQ12829 LAMP5-AS1-201ENST00000443469 1928 ntTSL 2 BASIC19.33■□□□□ 0.68
RAB40BQ12829 OBSL1-214ENST00000603926 5520 ntTSL 5 BASIC19.33■□□□□ 0.68
RAB40BQ12829 SOX3-201ENST00000370536 2132 ntAPPRIS P1 BASIC19.33■□□□□ 0.68
RAB40BQ12829 CNR1-203ENST00000369501 6031 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.33■□□□□ 0.68
RAB40BQ12829 DTX4-201ENST00000227451 5642 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.32■□□□□ 0.68
RAB40BQ12829 TUB-201ENST00000299506 2019 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.32■□□□□ 0.68
RAB40BQ12829 RAB1B-201ENST00000311481 2007 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.32■□□□□ 0.68
RAB40BQ12829 E4F1-204ENST00000564139 2493 ntTSL 1 (best) BASIC19.32■□□□□ 0.68
RAB40BQ12829 STAP2-206ENST00000600324 1508 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC19.32■□□□□ 0.68
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RAB40BQ12829 PKNOX2-AS1-201ENST00000532316 586 ntTSL 3 BASIC19.32■□□□□ 0.68
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RAB40BQ12829 CHRAC1-203ENST00000519533 1678 ntTSL 1 (best) BASIC19.32■□□□□ 0.68
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RAB40BQ12829 CLK3-202ENST00000395066 2621 ntTSL 1 (best) BASIC19.32■□□□□ 0.68
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RAB40BQ12829 NPW-201ENST00000329610 498 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.31■□□□□ 0.68
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RAB40BQ12829 AC064853.4-201ENST00000641394 363 ntAPPRIS P1 BASIC19.31■□□□□ 0.68
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RAB40BQ12829 UBL7-202ENST00000395081 1427 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.31■□□□□ 0.68
RAB40BQ12829 PARD3-208ENST00000374789 6005 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.31■□□□□ 0.68
RAB40BQ12829 MAG-201ENST00000361922 2426 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.31■□□□□ 0.68
RAB40BQ12829 EPDR1-201ENST00000199448 2599 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.31■□□□□ 0.68
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RAB40BQ12829 SGTA-201ENST00000221566 2330 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.29■□□□□ 0.68
RAB40BQ12829 FMR1-204ENST00000370471 4125 ntTSL 5 BASIC19.29■□□□□ 0.68
RAB40BQ12829 NAXE-203ENST00000368235 1125 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.29■□□□□ 0.68
RAB40BQ12829 AC092849.1-201ENST00000475250 303 ntTSL 4 BASIC19.29■□□□□ 0.68
RAB40BQ12829 ST3GAL6-AS1-203ENST00000488132 769 ntTSL 3 BASIC19.29■□□□□ 0.68
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RAB40BQ12829 AC009102.2-201ENST00000606772 1639 ntBASIC19.29■□□□□ 0.68
RAB40BQ12829 ZNF316-201ENST00000382252 5392 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.28■□□□□ 0.68
RAB40BQ12829 FBXW7-202ENST00000281708 4976 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC19.28■□□□□ 0.68
RAB40BQ12829 MAPRE3-203ENST00000405074 1801 ntTSL 3 BASIC19.28■□□□□ 0.68
RAB40BQ12829 AL157384.1-201ENST00000445995 2473 ntBASIC19.28■□□□□ 0.68
RAB40BQ12829 DISC1-213ENST00000537876 2349 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC19.28■□□□□ 0.68
RAB40BQ12829 GPR162-201ENST00000311268 2768 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.28■□□□□ 0.68
RAB40BQ12829 HSF2BP-201ENST00000291560 1899 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.28■□□□□ 0.68
RAB40BQ12829 IDH2-202ENST00000540499 1453 ntTSL 2 BASIC19.28■□□□□ 0.68
RAB40BQ12829 DUSP26-201ENST00000256261 1835 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.28■□□□□ 0.68
RAB40BQ12829 TMED4-201ENST00000289577 2203 ntTSL 2 BASIC19.27■□□□□ 0.68
RAB40BQ12829 UNC93B1-201ENST00000227471 2316 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.27■□□□□ 0.68
RAB40BQ12829 ZNF584-201ENST00000306910 2332 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.27■□□□□ 0.68
RAB40BQ12829 CD63-201ENST00000257857 1070 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.27■□□□□ 0.68
RAB40BQ12829 CLTA-206ENST00000466396 695 ntTSL 2 BASIC19.27■□□□□ 0.68
RAB40BQ12829 AC103724.3-201ENST00000564481 992 ntBASIC19.27■□□□□ 0.68
RAB40BQ12829 AC104564.3-201ENST00000582367 638 ntBASIC19.27■□□□□ 0.68
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