Protein–RNA interactions for Protein: Q12809

KCNH2, Potassium voltage-gated channel subfamily H member 2, humanhuman

Predictions only

Length 1,159 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
KCNH2Q12809 TGFBR3L-202ENST00000565886 1260 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.53■■□□□ 1.36
KCNH2Q12809 AC087239.1-201ENST00000622671 572 ntBASIC23.53■■□□□ 1.36
KCNH2Q12809 MESP1-201ENST00000300057 2369 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.53■■□□□ 1.36
KCNH2Q12809 C1orf174-201ENST00000361605 1666 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.53■■□□□ 1.36
KCNH2Q12809 C12orf75-208ENST00000612117 1329 ntTSL 1 (best) BASIC23.53■■□□□ 1.36
KCNH2Q12809 FAM83D-201ENST00000619304 2475 ntTSL 1 (best) BASIC23.53■■□□□ 1.36
KCNH2Q12809 PSKH1-202ENST00000570631 1509 ntTSL 1 (best) BASIC23.53■■□□□ 1.36
KCNH2Q12809 MOGS-202ENST00000409065 2668 ntTSL 5 BASIC23.53■■□□□ 1.36
KCNH2Q12809 NKX2-5-201ENST00000329198 1709 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.53■■□□□ 1.36
KCNH2Q12809 IKBKG-212ENST00000617207 1949 ntAPPRIS ALT1 TSL 3 BASIC23.53■■□□□ 1.36
KCNH2Q12809 EIF2B4-211ENST00000616081 1754 ntTSL 5 BASIC23.52■■□□□ 1.36
KCNH2Q12809 TUB-201ENST00000299506 2019 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.52■■□□□ 1.36
KCNH2Q12809 HMGA2-205ENST00000425208 1444 ntTSL 1 (best) BASIC23.52■■□□□ 1.36
KCNH2Q12809 LGALS9B-201ENST00000324290 1243 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC23.52■■□□□ 1.36
KCNH2Q12809 POLR3GL-201ENST00000369313 818 ntTSL 2 BASIC23.52■■□□□ 1.36
KCNH2Q12809 C17orf74-202ENST00000574034 1287 ntTSL 1 (best) BASIC23.52■■□□□ 1.36
KCNH2Q12809 SPAST-204ENST00000621856 1715 ntTSL 1 (best) BASIC23.52■■□□□ 1.36
KCNH2Q12809 ADAP2-204ENST00000580525 1598 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.52■■□□□ 1.36
KCNH2Q12809 DUSP26-201ENST00000256261 1835 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.52■■□□□ 1.36
KCNH2Q12809 RHBDD2-201ENST00000006777 1802 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.52■■□□□ 1.36
KCNH2Q12809 NPTXR-201ENST00000333039 5784 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.52■■□□□ 1.35
KCNH2Q12809 TSPAN3-202ENST00000346495 1647 ntTSL 2 BASIC23.51■■□□□ 1.35
KCNH2Q12809 FAM110A-206ENST00000541082 1614 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC23.51■■□□□ 1.35
KCNH2Q12809 AC007375.3-201ENST00000600936 2314 ntBASIC23.51■■□□□ 1.35
KCNH2Q12809 B4GALNT1-202ENST00000418555 1861 ntTSL 2 BASIC23.51■■□□□ 1.35
KCNH2Q12809 OR7E47P-201ENST00000546390 1422 ntBASIC23.51■■□□□ 1.35
KCNH2Q12809 MFSD6L-201ENST00000329805 2188 ntAPPRIS P1 BASIC23.51■■□□□ 1.35
KCNH2Q12809 MYH7B-209ENST00000618182 6197 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.51■■□□□ 1.35
KCNH2Q12809 UNC93B3-201ENST00000308076 687 ntBASIC23.51■■□□□ 1.35
KCNH2Q12809 SNX3-202ENST00000349379 890 ntTSL 2 BASIC23.51■■□□□ 1.35
KCNH2Q12809 PTMA-205ENST00000410064 814 ntTSL 2 BASIC23.51■■□□□ 1.35
KCNH2Q12809 GCH1-206ENST00000543643 1897 ntTSL 1 (best) BASIC23.51■■□□□ 1.35
KCNH2Q12809 RNPEP-201ENST00000295640 2427 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.5■■□□□ 1.35
KCNH2Q12809 TMEM51-203ENST00000400796 1842 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.5■■□□□ 1.35
KCNH2Q12809 LHFPL3-202ENST00000424859 1852 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC23.5■■□□□ 1.35
KCNH2Q12809 RHBDL3-204ENST00000538145 1338 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.5■■□□□ 1.35
KCNH2Q12809 CENPH-201ENST00000283006 1389 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.5■■□□□ 1.35
KCNH2Q12809 MPPED1-203ENST00000443721 2507 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.5■■□□□ 1.35
KCNH2Q12809 ALDH6A1-201ENST00000350259 1869 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.49■■□□□ 1.35
KCNH2Q12809 TMEM121-202ENST00000431372 1519 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.49■■□□□ 1.35
KCNH2Q12809 OXCT2P1-201ENST00000447263 1535 ntBASIC23.49■■□□□ 1.35
KCNH2Q12809 IQSEC3-201ENST00000382841 2701 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC23.49■■□□□ 1.35
KCNH2Q12809 MFSD7-209ENST00000515118 1556 ntTSL 5 BASIC23.49■■□□□ 1.35
KCNH2Q12809 GRK3-203ENST00000619906 2873 ntTSL 5 BASIC23.49■■□□□ 1.35
KCNH2Q12809 TMEM9B-201ENST00000309134 1659 ntTSL 1 (best) BASIC23.49■■□□□ 1.35
KCNH2Q12809 LYPD2-201ENST00000359228 594 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.49■■□□□ 1.35
KCNH2Q12809 KRTAP5-1-201ENST00000382171 942 ntAPPRIS P1 BASIC23.49■■□□□ 1.35
KCNH2Q12809 MIR935-201ENST00000401179 91 ntBASIC23.49■■□□□ 1.35
KCNH2Q12809 SERTAD4-AS1-202ENST00000475406 591 ntTSL 2 BASIC23.49■■□□□ 1.35
KCNH2Q12809 TYROBP-203ENST00000544690 522 ntTSL 1 (best) BASIC23.49■■□□□ 1.35
KCNH2Q12809 C15orf61-202ENST00000557807 769 ntTSL 2 BASIC23.49■■□□□ 1.35
KCNH2Q12809 CADPS-219ENST00000612439 5455 ntTSL 1 (best) BASIC23.49■■□□□ 1.35
KCNH2Q12809 FBXW11-203ENST00000393802 2181 ntTSL 1 (best) BASIC23.48■■□□□ 1.35
KCNH2Q12809 VPS9D1-AS1-202ENST00000562866 1753 ntTSL 2 BASIC23.48■■□□□ 1.35
KCNH2Q12809 LINC01140-202ENST00000467438 2375 ntTSL 2 BASIC23.48■■□□□ 1.35
KCNH2Q12809 RARG-201ENST00000338561 1836 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.48■■□□□ 1.35
KCNH2Q12809 LINC02175-201ENST00000571219 1875 ntTSL 1 (best) BASIC23.48■■□□□ 1.35
KCNH2Q12809 AP005435.1-201ENST00000529293 1178 ntBASIC23.48■■□□□ 1.35
KCNH2Q12809 NRIP3-203ENST00000531090 980 ntTSL 2 BASIC23.48■■□□□ 1.35
KCNH2Q12809 RAB6A-204ENST00000536566 1267 ntTSL 5 BASIC23.48■■□□□ 1.35
KCNH2Q12809 TRIM28-201ENST00000253024 2960 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.48■■□□□ 1.35
KCNH2Q12809 NEURL4-201ENST00000315614 5182 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.47■■□□□ 1.35
KCNH2Q12809 GFRA3-201ENST00000274721 2039 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.47■■□□□ 1.35
KCNH2Q12809 ZSCAN18-217ENST00000601144 2190 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.47■■□□□ 1.35
KCNH2Q12809 DNPH1-201ENST00000230431 657 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.47■■□□□ 1.35
KCNH2Q12809 TOLLIP-208ENST00000527938 549 ntTSL 4 BASIC23.47■■□□□ 1.35
KCNH2Q12809 ZNF584-205ENST00000596281 575 ntTSL 2 BASIC23.47■■□□□ 1.35
KCNH2Q12809 HTATIP2-201ENST00000419348 1477 ntTSL 2 BASIC23.47■■□□□ 1.35
KCNH2Q12809 CADPS-203ENST00000383710 5471 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.47■■□□□ 1.35
KCNH2Q12809 RBBP7-202ENST00000380084 2036 ntTSL 2 BASIC23.47■■□□□ 1.35
KCNH2Q12809 PGRMC2-201ENST00000296425 2767 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.46■■□□□ 1.35
KCNH2Q12809 SYNGR2-201ENST00000225777 2325 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.46■■□□□ 1.35
KCNH2Q12809 PDE5A-201ENST00000264805 3020 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.46■■□□□ 1.35
KCNH2Q12809 RFLNA-201ENST00000324038 2148 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC23.46■■□□□ 1.35
KCNH2Q12809 PAQR6-202ENST00000335852 2117 ntTSL 2 BASIC23.46■■□□□ 1.35
KCNH2Q12809 SERPINB5-201ENST00000382771 2783 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.46■■□□□ 1.35
KCNH2Q12809 ILDR2-206ENST00000528703 2446 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.46■■□□□ 1.35
KCNH2Q12809 MIR4767-201ENST00000582827 78 ntBASIC23.46■■□□□ 1.35
KCNH2Q12809 ME2-206ENST00000638410 2289 ntTSL 5 BASIC23.46■■□□□ 1.35
KCNH2Q12809 ME2-210ENST00000639255 2262 ntTSL 5 BASIC23.46■■□□□ 1.35
KCNH2Q12809 OPN3-201ENST00000366554 2620 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.46■■□□□ 1.35
KCNH2Q12809 NAGPA-202ENST00000381955 2100 ntTSL 5 BASIC23.45■■□□□ 1.35
KCNH2Q12809 B4GAT1-201ENST00000311181 2072 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.45■■□□□ 1.35
KCNH2Q12809 PHLDB2-210ENST00000478922 1861 ntTSL 1 (best) BASIC23.45■■□□□ 1.35
KCNH2Q12809 BASP1-203ENST00000616743 1711 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC23.45■■□□□ 1.34
KCNH2Q12809 SMIM19-203ENST00000417410 1466 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.45■■□□□ 1.34
KCNH2Q12809 AC008406.3-201ENST00000620001 1374 ntBASIC23.45■■□□□ 1.34
KCNH2Q12809 PABPC1L-202ENST00000217074 1263 ntTSL 5 BASIC23.45■■□□□ 1.34
KCNH2Q12809 RTL8C-201ENST00000257013 1181 ntAPPRIS P1 BASIC23.45■■□□□ 1.34
KCNH2Q12809 ZNF32-202ENST00000395797 1201 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.45■■□□□ 1.34
KCNH2Q12809 MYL5-208ENST00000511290 781 ntTSL 1 (best) BASIC23.45■■□□□ 1.34
KCNH2Q12809 AC024257.2-201ENST00000549699 147 ntBASIC23.45■■□□□ 1.34
KCNH2Q12809 GOLGA2P6-201ENST00000340929 2049 ntBASIC23.45■■□□□ 1.34
KCNH2Q12809 NR5A1-204ENST00000620110 2975 ntTSL 5 BASIC23.45■■□□□ 1.34
KCNH2Q12809 ACAA1-202ENST00000333167 1785 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.45■■□□□ 1.34
KCNH2Q12809 SPIRE2-202ENST00000393062 2172 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.44■■□□□ 1.34
KCNH2Q12809 GRK4-201ENST00000345167 2013 ntTSL 1 (best) BASIC23.44■■□□□ 1.34
KCNH2Q12809 AC026471.6-201ENST00000622954 1905 ntBASIC23.44■■□□□ 1.34
KCNH2Q12809 NAA38-201ENST00000333775 999 ntTSL 1 (best) BASIC23.44■■□□□ 1.34
KCNH2Q12809 SERGEF-219ENST00000532265 1124 ntTSL 2 BASIC23.44■■□□□ 1.34
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