Protein–RNA interactions for Protein: Q12277

RRP42, Exosome complex component RRP42, yeastyeast

Predicted RBP Predictions only

Length 265 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (RIP-Chip)
Gene UniProt Accession Gene Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score Detected Interaction
RRP42Q12277 YLR177WYLR177W 1887 nt3.33□□□□□ -1.88
RRP42Q12277 VPS27YNR006W 1869 nt3.33□□□□□ -1.88
RRP42Q12277 MSA1YOR066W 1890 nt3.33□□□□□ -1.88
RRP42Q12277 YDR161WYDR161W 1164 nt3.33□□□□□ -1.88
RRP42Q12277 MTR2YKL186C 555 nt3.33□□□□□ -1.88
RRP42Q12277 HRT3YLR097C 1035 nt3.33□□□□□ -1.88
RRP42Q12277 TIF34YMR146C 1044 nt3.33□□□□□ -1.88
RRP42Q12277 YNL144W-AYNL144W-A 84 nt3.33□□□□□ -1.88
RRP42Q12277 YBL094CYBL094C 333 nt3.33□□□□□ -1.88
RRP42Q12277 PRS5YOL061W 1491 nt3.33□□□□□ -1.88
RRP42Q12277 MGR3YMR115W 1506 nt3.33□□□□□ -1.88
RRP42Q12277 CTK1YKL139W 1587 nt3.33□□□□□ -1.88
RRP42Q12277 URC2YDR520C 2319 nt3.32□□□□□ -1.88
RRP42Q12277 SIP1YDR422C 2448 nt3.32□□□□□ -1.88
RRP42Q12277 GRX6YDL010W 696 nt3.32□□□□□ -1.88
RRP42Q12277 BMH1YER177W 804 nt3.32□□□□□ -1.88
RRP42Q12277 AIM26YKL037W 357 nt3.32□□□□□ -1.88
RRP42Q12277 MCM16YPR046W 546 nt3.32□□□□□ -1.88
RRP42Q12277 MRPL37YBR268W 318 nt3.32□□□□□ -1.88
RRP42Q12277 ORC4YPR162C 1590 nt3.32□□□□□ -1.88
RRP42Q12277 TDA1YMR291W 1761 nt3.32□□□□□ -1.88
RRP42Q12277 YCL076WYCL076W 744 nt3.31□□□□□ -1.88
RRP42Q12277 HIM1YDR317W 1245 nt3.31□□□□□ -1.88
RRP42Q12277 YDR391CYDR391C 699 nt3.31□□□□□ -1.88
RRP42Q12277 MIG3YER028C 1185 nt3.31□□□□□ -1.88
RRP42Q12277 YGR126WYGR126W 693 nt3.31□□□□□ -1.88
RRP42Q12277 BCD1YHR040W 1101 nt3.31□□□□□ -1.88
RRP42Q12277 tV(CAC)DtV(CAC)D 73 nt3.31□□□□□ -1.88
RRP42Q12277 tV(CAC)HtV(CAC)H 73 nt3.31□□□□□ -1.88
RRP42Q12277 YIL025CYIL025C 375 nt3.31□□□□□ -1.88
RRP42Q12277 ANB1YJR047C 474 nt3.31□□□□□ -1.88
RRP42Q12277 SSO2YMR183C 888 nt3.31□□□□□ -1.88
RRP42Q12277 YNR068CYNR068C 819 nt3.31□□□□□ -1.88
RRP42Q12277 SEA4YBL104C 3117 nt3.31□□□□□ -1.88
RRP42Q12277 AGA1YNR044W 2178 nt3.31□□□□□ -1.88
RRP42Q12277 STU1YBL034C 4542 nt3.31□□□□□ -1.88
RRP42Q12277 BYE1YKL005C 1785 nt3.3□□□□□ -1.88
RRP42Q12277 ZDS2YML109W 2829 nt3.3□□□□□ -1.88
RRP42Q12277 CHK1YBR274W 1584 nt3.3□□□□□ -1.88
RRP42Q12277 KAP95YLR347C 2586 nt3.3□□□□□ -1.88
RRP42Q12277 VID27YNL212W 2349 nt3.3□□□□□ -1.88
RRP42Q12277 YDL241WYDL241W 372 nt3.3□□□□□ -1.88
RRP42Q12277 YOS1YER074W-A 258 nt3.3□□□□□ -1.88
RRP42Q12277 SPT4YGR063C 309 nt3.3□□□□□ -1.88
RRP42Q12277 REE1YJL217W 597 nt3.3□□□□□ -1.88
RRP42Q12277 MRP8YKL142W 660 nt3.3□□□□□ -1.88
RRP42Q12277 ALA1YOR335C 2877 nt3.3□□□□□ -1.88
RRP42Q12277 EPO1YMR124W 2832 nt3.3□□□□□ -1.88
RRP42Q12277 PRP22YER013W 3438 nt3.3□□□□□ -1.88
RRP42Q12277 GSC2YGR032W 5688 nt3.3□□□□□ -1.88
RRP42Q12277 HFD1YMR110C 1599 nt3.29□□□□□ -1.88
RRP42Q12277 SOD1YJR104C 465 nt3.29□□□□□ -1.88
RRP42Q12277 RPL22AYLR061W 366 nt3.29□□□□□ -1.88
RRP42Q12277 RFC3YNL290W 1023 nt3.29□□□□□ -1.88
RRP42Q12277 IMD4YML056C 1575 nt3.29□□□□□ -1.88
RRP42Q12277 YLR352WYLR352W 2424 nt3.29□□□□□ -1.88
RRP42Q12277 RRN7YJL025W 1545 nt3.29□□□□□ -1.88
RRP42Q12277 FLO5YHR211W 3228 nt3.28□□□□□ -1.88
RRP42Q12277 YDR431WYDR431W 312 nt3.28□□□□□ -1.88
RRP42Q12277 SHH3YMR118C 591 nt3.28□□□□□ -1.88
RRP42Q12277 IMP4YNL075W 873 nt3.28□□□□□ -1.88
RRP42Q12277 DDP1YOR163W 567 nt3.28□□□□□ -1.88
RRP42Q12277 YOR338WYOR338W 1092 nt3.28□□□□□ -1.88
RRP42Q12277 FDH2YPL275W 711 nt3.28□□□□□ -1.88
RRP42Q12277 RSF2YJR127C 4143 nt3.28□□□□□ -1.88
RRP42Q12277 YVC1YOR087W 2028 nt3.27□□□□□ -1.89
RRP42Q12277 ARO1YDR127W 4767 nt3.27□□□□□ -1.89
RRP42Q12277 AKR1YDR264C 2295 nt3.27□□□□□ -1.89
RRP42Q12277 YGR027W-BYGR027W-B 5268 nt3.27□□□□□ -1.89
RRP42Q12277 YLR227W-BYLR227W-B 5268 nt3.27□□□□□ -1.89
RRP42Q12277 YPR158C-DYPR158C-D 5268 nt3.27□□□□□ -1.89
RRP42Q12277 NUP60YAR002W 1620 nt3.27□□□□□ -1.89
RRP42Q12277 SHU2YDR078C 672 nt3.27□□□□□ -1.89
RRP42Q12277 OKP1YGR179C 1221 nt3.27□□□□□ -1.89
RRP42Q12277 YHL026CYHL026C 948 nt3.27□□□□□ -1.89
RRP42Q12277 YHR214C-EYHR214C-E 300 nt3.27□□□□□ -1.89
RRP42Q12277 POG1YIL122W 1056 nt3.27□□□□□ -1.89
RRP42Q12277 ENT3YJR125C 1227 nt3.27□□□□□ -1.89
RRP42Q12277 YAR070CYAR070C 300 nt3.27□□□□□ -1.89
RRP42Q12277 THR4YCR053W 1545 nt3.27□□□□□ -1.89
RRP42Q12277 MEF1YLR069C 2286 nt3.27□□□□□ -1.89
RRP42Q12277 PWP2YCR057C 2772 nt3.26□□□□□ -1.89
RRP42Q12277 MTH1YDR277C 1302 nt3.26□□□□□ -1.89
RRP42Q12277 NSP1YJL041W 2472 nt3.26□□□□□ -1.89
RRP42Q12277 RMD5YDR255C 1266 nt3.26□□□□□ -1.89
RRP42Q12277 FCF1YDR339C 570 nt3.26□□□□□ -1.89
RRP42Q12277 VFA1YER128W 612 nt3.26□□□□□ -1.89
RRP42Q12277 SAY1YGR263C 1275 nt3.26□□□□□ -1.89
RRP42Q12277 YMR122W-AYMR122W-A 255 nt3.26□□□□□ -1.89
RRP42Q12277 HRT1YOL133W 366 nt3.26□□□□□ -1.89
RRP42Q12277 RFM1YOR279C 933 nt3.26□□□□□ -1.89
RRP42Q12277 POS5YPL188W 1245 nt3.26□□□□□ -1.89
RRP42Q12277 DSN1YIR010W 1731 nt3.26□□□□□ -1.89
RRP42Q12277 RAD4YER162C 2265 nt3.26□□□□□ -1.89
RRP42Q12277 NEM1YHR004C 1341 nt3.25□□□□□ -1.89
RRP42Q12277 FMP32YFL046W 624 nt3.25□□□□□ -1.89
RRP42Q12277 TOS8YGL096W 831 nt3.25□□□□□ -1.89
RRP42Q12277 MRPS35YGR165W 1038 nt3.25□□□□□ -1.89
RRP42Q12277 YHL045WYHL045W 348 nt3.25□□□□□ -1.89
RRP42Q12277 MBR1YKL093W 1020 nt3.25□□□□□ -1.89
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