Protein–RNA interactions for Protein: Q09161

NCBP1, Nuclear cap-binding protein subunit 1, humanhuman

Known RBP Predictions only

Length 790 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
NCBP1Q09161 SDC3-202ENST00000339394 1580 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.35■■□□□ 1.49
NCBP1Q09161 KBTBD13-201ENST00000432196 1377 ntAPPRIS P1 BASIC24.35■■□□□ 1.49
NCBP1Q09161 IRS3P-201ENST00000223076 1006 ntBASIC24.35■■□□□ 1.49
NCBP1Q09161 PHLPP1-201ENST00000262719 6390 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.35■■□□□ 1.49
NCBP1Q09161 LBX2-202ENST00000377566 1186 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.35■■□□□ 1.49
NCBP1Q09161 MYD88-205ENST00000424893 1279 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.35■■□□□ 1.49
NCBP1Q09161 LINC00472-204ENST00000436803 667 ntTSL 5 BASIC24.35■■□□□ 1.49
NCBP1Q09161 AC008443.4-201ENST00000503314 456 ntTSL 4 BASIC24.35■■□□□ 1.49
NCBP1Q09161 CAV2-201ENST00000222693 3301 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.35■■□□□ 1.49
NCBP1Q09161 FFAR1-201ENST00000246553 2311 ntAPPRIS P1 BASIC24.35■■□□□ 1.49
NCBP1Q09161 ADORA2A-AS1-203ENST00000427813 2027 ntTSL 1 (best) BASIC24.35■■□□□ 1.49
NCBP1Q09161 SIRT7-201ENST00000328666 1743 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.35■■□□□ 1.49
NCBP1Q09161 SLC35A2-210ENST00000616181 1614 ntTSL 2 BASIC24.35■■□□□ 1.49
NCBP1Q09161 DUSP5-201ENST00000369583 2557 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.35■■□□□ 1.49
NCBP1Q09161 PYCARD-201ENST00000247470 990 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.34■■□□□ 1.49
NCBP1Q09161 NGEF-203ENST00000409079 1022 ntTSL 1 (best) BASIC24.34■■□□□ 1.49
NCBP1Q09161 AICDA-202ENST00000537228 667 ntTSL 5 BASIC24.34■■□□□ 1.49
NCBP1Q09161 PRSS22-203ENST00000571228 1037 ntTSL 2 BASIC24.34■■□□□ 1.49
NCBP1Q09161 RNASEH2B-201ENST00000336617 1629 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.34■■□□□ 1.49
NCBP1Q09161 POLD2-218ENST00000610533 1619 ntTSL 1 (best) BASIC24.34■■□□□ 1.49
NCBP1Q09161 LINC01123-202ENST00000419296 2436 ntTSL 2 BASIC24.34■■□□□ 1.49
NCBP1Q09161 MRPL38-201ENST00000309352 1888 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.34■■□□□ 1.49
NCBP1Q09161 HSPBP1-206ENST00000587922 1449 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.34■■□□□ 1.49
NCBP1Q09161 TRIM3-202ENST00000359518 3042 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.34■■□□□ 1.49
NCBP1Q09161 C7orf26-202ENST00000359073 1762 ntTSL 1 (best) BASIC24.34■■□□□ 1.49
NCBP1Q09161 LPAR1-201ENST00000358883 2687 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC24.33■■□□□ 1.49
NCBP1Q09161 EED-201ENST00000263360 2223 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.33■■□□□ 1.49
NCBP1Q09161 C2orf82-201ENST00000331342 465 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.33■■□□□ 1.49
NCBP1Q09161 IGHV3-20-201ENST00000390606 415 ntAPPRIS P1 BASIC24.33■■□□□ 1.49
NCBP1Q09161 CCDC115-202ENST00000409127 1247 ntTSL 2 BASIC24.33■■□□□ 1.49
NCBP1Q09161 SLC47A1P1-202ENST00000449666 945 ntBASIC24.33■■□□□ 1.49
NCBP1Q09161 PPM1N-207ENST00000451287 1293 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.33■■□□□ 1.49
NCBP1Q09161 CAPNS1-205ENST00000588780 1035 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.33■■□□□ 1.49
NCBP1Q09161 MADCAM1-208ENST00000621286 1203 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.33■■□□□ 1.49
NCBP1Q09161 SNCB-206ENST00000614675 1407 ntTSL 1 (best) BASIC24.33■■□□□ 1.49
NCBP1Q09161 FDFT1-201ENST00000220584 2176 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.33■■□□□ 1.48
NCBP1Q09161 AC011498.4-201ENST00000586020 1803 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.33■■□□□ 1.48
NCBP1Q09161 AC079630.1-202ENST00000618127 1840 ntBASIC24.33■■□□□ 1.48
NCBP1Q09161 ARPC5L-201ENST00000259477 1325 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.33■■□□□ 1.48
NCBP1Q09161 DYRK1B-204ENST00000593685 2724 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC24.33■■□□□ 1.48
NCBP1Q09161 EN1-201ENST00000295206 2457 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.33■■□□□ 1.48
NCBP1Q09161 NSUN2-206ENST00000506139 2619 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC24.32■■□□□ 1.48
NCBP1Q09161 RCN2-202ENST00000394883 1366 ntTSL 5 BASIC24.32■■□□□ 1.48
NCBP1Q09161 SPON2-222ENST00000617421 2156 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.32■■□□□ 1.48
NCBP1Q09161 NKIRAS2-206ENST00000393885 1909 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.32■■□□□ 1.48
NCBP1Q09161 UBE2E2-203ENST00000425792 1248 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.32■■□□□ 1.48
NCBP1Q09161 SIRT3-215ENST00000532956 1235 ntTSL 2 BASIC24.32■■□□□ 1.48
NCBP1Q09161 AC242852.2-201ENST00000615738 1807 ntBASIC24.32■■□□□ 1.48
NCBP1Q09161 MTMR14-206ENST00000420925 1427 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC24.32■■□□□ 1.48
NCBP1Q09161 HOMER3-204ENST00000539827 1979 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.32■■□□□ 1.48
NCBP1Q09161 MESP2-201ENST00000341735 1552 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.32■■□□□ 1.48
NCBP1Q09161 DXO-201ENST00000337523 1628 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.32■■□□□ 1.48
NCBP1Q09161 NKIRAS2-204ENST00000393880 1644 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.32■■□□□ 1.48
NCBP1Q09161 USP36-218ENST00000590546 1771 ntTSL 1 (best) BASIC24.31■■□□□ 1.48
NCBP1Q09161 GPR162-201ENST00000311268 2768 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.31■■□□□ 1.48
NCBP1Q09161 LRRC4B-201ENST00000389201 2958 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.31■■□□□ 1.48
NCBP1Q09161 KCNT1-201ENST00000263604 5245 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.31■■□□□ 1.48
NCBP1Q09161 YY1AP1-214ENST00000407221 2705 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC24.31■■□□□ 1.48
NCBP1Q09161 ANKRD28-201ENST00000399451 6564 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.31■■□□□ 1.48
NCBP1Q09161 FAM53B-201ENST00000280780 1568 ntTSL 1 (best) BASIC24.31■■□□□ 1.48
NCBP1Q09161 FRS3-202ENST00000373018 2174 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC24.31■■□□□ 1.48
NCBP1Q09161 FOXB2-201ENST00000376708 1299 ntAPPRIS P1 BASIC24.31■■□□□ 1.48
NCBP1Q09161 OR2I1P-207ENST00000453522 948 ntBASIC24.31■■□□□ 1.48
NCBP1Q09161 AP001107.5-202ENST00000533759 948 ntTSL 5 BASIC24.31■■□□□ 1.48
NCBP1Q09161 HIST1H2AL-201ENST00000613174 393 ntAPPRIS P1 BASIC24.31■■□□□ 1.48
NCBP1Q09161 ACBD4-216ENST00000619916 1276 ntTSL 5 BASIC24.31■■□□□ 1.48
NCBP1Q09161 PARD3-202ENST00000346874 5894 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.31■■□□□ 1.48
NCBP1Q09161 PARD3-203ENST00000350537 5867 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.31■■□□□ 1.48
NCBP1Q09161 ASRGL1-201ENST00000301776 2182 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.3■■□□□ 1.48
NCBP1Q09161 DISC1-212ENST00000535983 2505 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.3■■□□□ 1.48
NCBP1Q09161 HOMER1-202ENST00000334082 5881 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.3■■□□□ 1.48
NCBP1Q09161 P2RX4-211ENST00000543171 1777 ntTSL 5 BASIC24.3■■□□□ 1.48
NCBP1Q09161 CDC37L1-202ENST00000381858 1244 ntTSL 5 BASIC24.3■■□□□ 1.48
NCBP1Q09161 SSPN-204ENST00000535504 419 ntTSL 1 (best) BASIC24.3■■□□□ 1.48
NCBP1Q09161 GPRC5B-210ENST00000569847 1830 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC24.3■■□□□ 1.48
NCBP1Q09161 TSKS-202ENST00000358830 1367 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.29■■□□□ 1.48
NCBP1Q09161 IQCJ-SCHIP1-203ENST00000476809 1780 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.29■■□□□ 1.48
NCBP1Q09161 KRTAP5-7-201ENST00000398536 1408 ntAPPRIS P1 BASIC24.29■■□□□ 1.48
NCBP1Q09161 AC096541.1-201ENST00000445070 1807 ntTSL 2 BASIC24.29■■□□□ 1.48
NCBP1Q09161 MYH7B-209ENST00000618182 6197 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.29■■□□□ 1.48
NCBP1Q09161 RHOF-204ENST00000537265 699 ntTSL 2 BASIC24.29■■□□□ 1.48
NCBP1Q09161 HOXC8-201ENST00000040584 1889 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.29■■□□□ 1.48
NCBP1Q09161 ZIM2-201ENST00000593711 2083 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.29■■□□□ 1.48
NCBP1Q09161 RNF149-201ENST00000295317 2458 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.29■■□□□ 1.48
NCBP1Q09161 PEX6-201ENST00000244546 2696 ntTSL 1 (best) BASIC24.29■■□□□ 1.48
NCBP1Q09161 GNA11-201ENST00000078429 4147 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.29■■□□□ 1.48
NCBP1Q09161 AL121749.1-201ENST00000635993 1768 ntTSL 5 BASIC24.29■■□□□ 1.48
NCBP1Q09161 LYRM1-201ENST00000219168 1626 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.28■■□□□ 1.48
NCBP1Q09161 UBA5-211ENST00000493720 2058 ntTSL 5 BASIC24.28■■□□□ 1.48
NCBP1Q09161 SOX21-201ENST00000376945 2778 ntAPPRIS P1 BASIC24.28■■□□□ 1.48
NCBP1Q09161 POLD2-207ENST00000452185 1659 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.28■■□□□ 1.48
NCBP1Q09161 SCAND1-202ENST00000373991 1727 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.28■■□□□ 1.48
NCBP1Q09161 MOSPD3-203ENST00000393950 1191 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.28■■□□□ 1.48
NCBP1Q09161 KAT2B-201ENST00000263754 4833 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.28■■□□□ 1.48
NCBP1Q09161 TEAD2-201ENST00000311227 2164 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.27■■□□□ 1.48
NCBP1Q09161 PACRGL-201ENST00000295290 1937 ntTSL 5 BASIC24.27■■□□□ 1.48
NCBP1Q09161 MMP21-201ENST00000368808 1919 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.27■■□□□ 1.48
NCBP1Q09161 FLOT1-201ENST00000376389 1912 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.27■■□□□ 1.48
NCBP1Q09161 PRRT4-207ENST00000535159 2897 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.27■■□□□ 1.48
NCBP1Q09161 SOS2-201ENST00000216373 5498 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.27■■□□□ 1.48
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 21.7 ms