Protein–RNA interactions for Protein: Q07864

POLE, DNA polymerase epsilon catalytic subunit A, humanhuman

Predictions only

Length 2,286 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
POLEQ07864 CNTD2-202ENST00000430325 1817 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC19.3■□□□□ 0.68
POLEQ07864 CCDC151-202ENST00000586836 1867 ntTSL 2 BASIC19.3■□□□□ 0.68
POLEQ07864 CCDC47-204ENST00000582252 1719 ntTSL 2 BASIC19.29■□□□□ 0.68
POLEQ07864 DECR2-201ENST00000219481 1615 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.29■□□□□ 0.68
POLEQ07864 RWDD4-206ENST00000512740 1393 ntTSL 5 BASIC19.29■□□□□ 0.68
POLEQ07864 ANTXR2-202ENST00000346652 1343 ntTSL 1 (best) BASIC19.29■□□□□ 0.68
POLEQ07864 CAPN10-202ENST00000270364 1267 ntTSL 2 BASIC19.29■□□□□ 0.68
POLEQ07864 SRXN1-201ENST00000381962 2698 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.29■□□□□ 0.68
POLEQ07864 SLC25A29-201ENST00000359232 2385 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.29■□□□□ 0.68
POLEQ07864 KRT10-201ENST00000269576 2124 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.29■□□□□ 0.68
POLEQ07864 CPNE1-202ENST00000352393 2147 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.29■□□□□ 0.68
POLEQ07864 CENPN-201ENST00000299572 1398 ntTSL 1 (best) BASIC19.29■□□□□ 0.68
POLEQ07864 ACOT8-201ENST00000217455 1168 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.28■□□□□ 0.68
POLEQ07864 SNAP23-210ENST00000564153 775 ntTSL 2 BASIC19.28■□□□□ 0.68
POLEQ07864 ALDH16A1-203ENST00000540132 2174 ntTSL 2 BASIC19.28■□□□□ 0.68
POLEQ07864 Z92544.1-201ENST00000567091 730 ntTSL 3 BASIC19.28■□□□□ 0.68
POLEQ07864 AC105036.2-201ENST00000569468 176 ntBASIC19.28■□□□□ 0.68
POLEQ07864 AC110285.4-201ENST00000572590 424 ntTSL 3 BASIC19.28■□□□□ 0.68
POLEQ07864 AC010536.3-201ENST00000620306 533 ntBASIC19.28■□□□□ 0.68
POLEQ07864 MAP2K5-204ENST00000395476 1689 ntTSL 1 (best) BASIC19.28■□□□□ 0.68
POLEQ07864 AC142381.3-201ENST00000568208 1670 ntBASIC19.28■□□□□ 0.68
POLEQ07864 AC025164.2-201ENST00000501008 1898 ntTSL 5 BASIC19.28■□□□□ 0.68
POLEQ07864 SIRT3-202ENST00000524564 1395 ntTSL 2 BASIC19.27■□□□□ 0.68
POLEQ07864 MTHFS-201ENST00000258874 907 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.27■□□□□ 0.68
POLEQ07864 ZCCHC9-204ENST00000438268 1248 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.27■□□□□ 0.68
POLEQ07864 TPT1-AS1-211ENST00000520622 604 ntTSL 4 BASIC19.27■□□□□ 0.68
POLEQ07864 ELAC1-204ENST00000591429 975 ntTSL 1 (best) BASIC19.27■□□□□ 0.68
POLEQ07864 SLC2A11-202ENST00000316185 1555 ntTSL 1 (best) BASIC19.27■□□□□ 0.68
POLEQ07864 ANKRD53-201ENST00000272421 2185 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.27■□□□□ 0.68
POLEQ07864 MSX2-201ENST00000239243 2241 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.27■□□□□ 0.68
POLEQ07864 SUGCT-209ENST00000628514 1591 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC19.27■□□□□ 0.68
POLEQ07864 ZNF346-203ENST00000503425 1191 ntTSL 2 BASIC19.27■□□□□ 0.68
POLEQ07864 CD99-212ENST00000624481 1089 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC19.27■□□□□ 0.68
POLEQ07864 UBXN2B-206ENST00000638450 591 ntTSL 5 BASIC19.27■□□□□ 0.68
POLEQ07864 SCAMP3-202ENST00000355379 1537 ntTSL 1 (best) BASIC19.27■□□□□ 0.67
POLEQ07864 IGFBP1-201ENST00000275525 1653 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.27■□□□□ 0.67
POLEQ07864 DHH-201ENST00000266991 1936 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.27■□□□□ 0.67
POLEQ07864 TYMP-202ENST00000395678 1614 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.26■□□□□ 0.67
POLEQ07864 PCYT2-203ENST00000538936 5147 ntTSL 1 (best) BASIC19.26■□□□□ 0.67
POLEQ07864 HMBS-201ENST00000278715 1501 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.26■□□□□ 0.67
POLEQ07864 RIMKLB-205ENST00000535829 2236 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.26■□□□□ 0.67
POLEQ07864 CEACAM4-201ENST00000221954 1205 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.26■□□□□ 0.67
POLEQ07864 ANKRD10-202ENST00000310847 1193 ntTSL 1 (best) BASIC19.26■□□□□ 0.67
POLEQ07864 NDUFB10-204ENST00000569148 628 ntTSL 2 BASIC19.26■□□□□ 0.67
POLEQ07864 PET100-202ENST00000594797 719 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.26■□□□□ 0.67
POLEQ07864 CEACAM4-203ENST00000600925 899 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC19.26■□□□□ 0.67
POLEQ07864 CREB3L3-202ENST00000595923 1491 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.26■□□□□ 0.67
POLEQ07864 AL139125.2-201ENST00000623134 1869 ntBASIC19.26■□□□□ 0.67
POLEQ07864 SH3GL1-201ENST00000269886 2516 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.26■□□□□ 0.67
POLEQ07864 TBX1-202ENST00000332710 2084 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC19.26■□□□□ 0.67
POLEQ07864 GLT8D2-205ENST00000548660 1835 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.26■□□□□ 0.67
POLEQ07864 DUSP8P3-201ENST00000399571 1760 ntBASIC19.26■□□□□ 0.67
POLEQ07864 ATMIN-201ENST00000299575 4884 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.26■□□□□ 0.67
POLEQ07864 GPR150-201ENST00000380007 2065 ntAPPRIS P1 BASIC19.26■□□□□ 0.67
POLEQ07864 AC010141.2-201ENST00000452426 721 ntBASIC19.26■□□□□ 0.67
POLEQ07864 RAB6B-203ENST00000469959 500 ntTSL 3 BASIC19.26■□□□□ 0.67
POLEQ07864 AC138907.5-202ENST00000569484 235 ntBASIC19.26■□□□□ 0.67
POLEQ07864 ACTL10-201ENST00000330271 2028 ntAPPRIS P1 BASIC19.26■□□□□ 0.67
POLEQ07864 PCOLCE2-201ENST00000295992 2021 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.25■□□□□ 0.67
POLEQ07864 GPR137-201ENST00000313074 1485 ntTSL 5 BASIC19.25■□□□□ 0.67
POLEQ07864 GPR137-203ENST00000411458 1495 ntTSL 2 BASIC19.25■□□□□ 0.67
POLEQ07864 COX5B-201ENST00000258424 712 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.25■□□□□ 0.67
POLEQ07864 AC068987.5-201ENST00000642069 987 ntAPPRIS P1 BASIC19.25■□□□□ 0.67
POLEQ07864 C7orf26-202ENST00000359073 1762 ntTSL 1 (best) BASIC19.25■□□□□ 0.67
POLEQ07864 LSM8-203ENST00000422760 1920 ntTSL 1 (best) BASIC19.25■□□□□ 0.67
POLEQ07864 HAS1-205ENST00000601714 2086 ntTSL 1 (best) BASIC19.25■□□□□ 0.67
POLEQ07864 SPON2-222ENST00000617421 2156 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.25■□□□□ 0.67
POLEQ07864 CACNA1H-202ENST00000358590 8069 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.25■□□□□ 0.67
POLEQ07864 MRPL39-201ENST00000307301 1199 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.25■□□□□ 0.67
POLEQ07864 ATG101-201ENST00000336854 1439 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.25■□□□□ 0.67
POLEQ07864 MRPL39-202ENST00000352957 1110 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.25■□□□□ 0.67
POLEQ07864 UPK3B-203ENST00000394849 1041 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC19.25■□□□□ 0.67
POLEQ07864 EIF4E3-203ENST00000421769 777 ntTSL 1 (best) BASIC19.25■□□□□ 0.67
POLEQ07864 SLC7A5P1-201ENST00000568957 537 ntBASIC19.25■□□□□ 0.67
POLEQ07864 NMRAL1-212ENST00000574425 1240 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.25■□□□□ 0.67
POLEQ07864 FAM71E1-204ENST00000600100 1281 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.25■□□□□ 0.67
POLEQ07864 HACD3-205ENST00000562901 1797 ntTSL 5 BASIC19.24■□□□□ 0.67
POLEQ07864 ABCB10P4-201ENST00000566803 2184 ntBASIC19.24■□□□□ 0.67
POLEQ07864 RAMP1-202ENST00000403885 650 ntTSL 3 BASIC19.24■□□□□ 0.67
POLEQ07864 NAA60-204ENST00000421765 1045 ntTSL 2 BASIC19.24■□□□□ 0.67
POLEQ07864 PPP1R14BP2-201ENST00000426284 444 ntBASIC19.24■□□□□ 0.67
POLEQ07864 APTR-203ENST00000430801 583 ntTSL 5 BASIC19.24■□□□□ 0.67
POLEQ07864 OVCH1-AS1-203ENST00000551108 963 ntTSL 2 BASIC19.24■□□□□ 0.67
POLEQ07864 DHRS4-207ENST00000559632 1003 ntTSL 1 (best) BASIC19.24■□□□□ 0.67
POLEQ07864 AP005205.2-201ENST00000577327 491 ntTSL 2 BASIC19.24■□□□□ 0.67
POLEQ07864 IGFBP3-211ENST00000615754 792 ntTSL 5 BASIC19.24■□□□□ 0.67
POLEQ07864 ANO1-202ENST00000355303 4790 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.24■□□□□ 0.67
POLEQ07864 AC083805.3-201ENST00000619560 1315 ntTSL 3 BASIC19.24■□□□□ 0.67
POLEQ07864 SNTA1-201ENST00000217381 2342 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.24■□□□□ 0.67
POLEQ07864 SKOR2-203ENST00000620245 3048 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.24■□□□□ 0.67
POLEQ07864 DHRS4-202ENST00000397074 785 ntTSL 5 BASIC19.23■□□□□ 0.67
POLEQ07864 BET1L-204ENST00000410108 637 ntTSL 3 BASIC19.23■□□□□ 0.67
POLEQ07864 EDA-210ENST00000527388 927 ntTSL 1 (best) BASIC19.23■□□□□ 0.67
POLEQ07864 KRT18P20-201ENST00000548986 1279 ntBASIC19.23■□□□□ 0.67
POLEQ07864 MIR4758-201ENST00000577688 71 ntBASIC19.23■□□□□ 0.67
POLEQ07864 FGF13-208ENST00000626909 1039 ntTSL 2 BASIC19.23■□□□□ 0.67
POLEQ07864 NPHS2-201ENST00000367615 1855 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.23■□□□□ 0.67
POLEQ07864 ELOA3B-201ENST00000611323 1641 ntAPPRIS P1 BASIC19.23■□□□□ 0.67
POLEQ07864 ELOA3D-201ENST00000620881 1641 ntAPPRIS P1 BASIC19.23■□□□□ 0.67
POLEQ07864 JAG2-201ENST00000331782 5835 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.23■□□□□ 0.67
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 23.2 ms