Protein–RNA interactions for Protein: Q06546

GABPA, GA-binding protein alpha chain, humanhuman

Predictions only

Length 454 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
GABPAQ06546 ASPSCR1-202ENST00000306739 1843 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.49■■□□□ 1.67
GABPAQ06546 TPM1-204ENST00000334895 1637 ntTSL 1 (best) BASIC25.49■■□□□ 1.67
GABPAQ06546 PITX1-205ENST00000506438 1305 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.49■■□□□ 1.67
GABPAQ06546 TESC-206ENST00000541210 936 ntTSL 3 BASIC25.49■■□□□ 1.67
GABPAQ06546 RAP2CP1-201ENST00000605103 478 ntBASIC25.49■■□□□ 1.67
GABPAQ06546 WWOX-218ENST00000627394 894 ntTSL 5 BASIC25.49■■□□□ 1.67
GABPAQ06546 MBOAT7-205ENST00000431666 2471 ntTSL 1 (best) BASIC25.48■■□□□ 1.67
GABPAQ06546 MXI1-201ENST00000239007 2424 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC25.48■■□□□ 1.67
GABPAQ06546 AL359710.1-201ENST00000427039 1544 ntTSL 2 BASIC25.48■■□□□ 1.67
GABPAQ06546 PFKFB3-201ENST00000317350 1999 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC25.48■■□□□ 1.67
GABPAQ06546 UTF1-201ENST00000304477 1157 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.48■■□□□ 1.67
GABPAQ06546 LARP6-202ENST00000344870 527 ntTSL 1 (best) BASIC25.48■■□□□ 1.67
GABPAQ06546 RAMP1-203ENST00000404910 857 ntTSL 2 BASIC25.48■■□□□ 1.67
GABPAQ06546 SMIM12-202ENST00000423898 897 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.48■■□□□ 1.67
GABPAQ06546 ANKRD63-201ENST00000434396 1143 ntAPPRIS P1 BASIC25.48■■□□□ 1.67
GABPAQ06546 COG8-201ENST00000562081 1731 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.48■■□□□ 1.67
GABPAQ06546 WRAP73-201ENST00000270708 1665 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.48■■□□□ 1.67
GABPAQ06546 IRX5-201ENST00000320990 2061 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC25.48■■□□□ 1.67
GABPAQ06546 PNRC1-201ENST00000336032 2065 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.48■■□□□ 1.67
GABPAQ06546 KRT87P-202ENST00000534226 1464 ntBASIC25.47■■□□□ 1.67
GABPAQ06546 SLC25A11-201ENST00000225665 1897 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.47■■□□□ 1.67
GABPAQ06546 OLIG1-201ENST00000382348 2277 ntAPPRIS P1 BASIC25.47■■□□□ 1.67
GABPAQ06546 PTPN13-205ENST00000502971 1708 ntTSL 1 (best) BASIC25.47■■□□□ 1.67
GABPAQ06546 NEDD8-201ENST00000250495 708 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.47■■□□□ 1.67
GABPAQ06546 OLFM1-206ENST00000371799 961 ntTSL 1 (best) BASIC25.47■■□□□ 1.67
GABPAQ06546 ABHD14A-202ENST00000458031 1113 ntTSL 5 BASIC25.47■■□□□ 1.67
GABPAQ06546 MCRIP1-204ENST00000570507 765 ntTSL 2 BASIC25.47■■□□□ 1.67
GABPAQ06546 MCRIP1-208ENST00000575061 618 ntTSL 5 BASIC25.47■■□□□ 1.67
GABPAQ06546 TRAPPC6A-205ENST00000592647 514 ntTSL 2 BASIC25.47■■□□□ 1.67
GABPAQ06546 CCNE1-201ENST00000262643 2043 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.47■■□□□ 1.67
GABPAQ06546 GMPPA-201ENST00000313597 1544 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.47■■□□□ 1.67
GABPAQ06546 AC074143.1-203ENST00000518227 1473 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.47■■□□□ 1.67
GABPAQ06546 SIAH2-201ENST00000312960 2517 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.46■■□□□ 1.67
GABPAQ06546 OR7E47P-201ENST00000546390 1422 ntBASIC25.46■■□□□ 1.67
GABPAQ06546 TGFBRAP1-202ENST00000393359 5979 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.46■■□□□ 1.67
GABPAQ06546 NKX2-3-201ENST00000344586 2097 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.46■■□□□ 1.67
GABPAQ06546 PLEKHO1-201ENST00000369124 2050 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.46■■□□□ 1.67
GABPAQ06546 RNF4-207ENST00000506706 2098 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.46■■□□□ 1.67
GABPAQ06546 AP004607.7-201ENST00000527152 1677 ntBASIC25.46■■□□□ 1.67
GABPAQ06546 ROR1-202ENST00000371080 2305 ntTSL 1 (best) BASIC25.46■■□□□ 1.67
GABPAQ06546 ANTXR2-202ENST00000346652 1343 ntTSL 1 (best) BASIC25.46■■□□□ 1.67
GABPAQ06546 TRABD2A-203ENST00000409520 1975 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.46■■□□□ 1.67
GABPAQ06546 AC093627.4-202ENST00000479592 591 ntTSL 4 BASIC25.46■■□□□ 1.67
GABPAQ06546 AC080038.1-201ENST00000611274 1154 ntBASIC25.46■■□□□ 1.67
GABPAQ06546 PWWP2A-205ENST00000523662 1819 ntTSL 1 (best) BASIC25.46■■□□□ 1.67
GABPAQ06546 AMZ2-202ENST00000359904 2402 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.46■■□□□ 1.67
GABPAQ06546 CRTAC1-202ENST00000370591 2348 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC25.46■■□□□ 1.67
GABPAQ06546 TMEM41B-207ENST00000611268 1440 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.46■■□□□ 1.67
GABPAQ06546 C11orf63-201ENST00000227349 3147 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.46■■□□□ 1.67
GABPAQ06546 RASGRP2-207ENST00000377497 2221 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.45■■□□□ 1.67
GABPAQ06546 GAS2L1P2-201ENST00000436355 1356 ntBASIC25.45■■□□□ 1.67
GABPAQ06546 P3H3-201ENST00000290510 2632 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.45■■□□□ 1.66
GABPAQ06546 HBM-201ENST00000356815 506 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.45■■□□□ 1.66
GABPAQ06546 RASGRP2-209ENST00000394429 453 ntTSL 3 BASIC25.45■■□□□ 1.66
GABPAQ06546 AC016769.1-201ENST00000409132 1010 ntBASIC25.45■■□□□ 1.66
GABPAQ06546 LINC01976-201ENST00000565120 434 ntTSL 2 BASIC25.45■■□□□ 1.66
GABPAQ06546 ESRRAP2-201ENST00000418437 1549 ntBASIC25.45■■□□□ 1.66
GABPAQ06546 AKR7A2-201ENST00000235835 1362 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.44■■□□□ 1.66
GABPAQ06546 RBMS1-205ENST00000409972 1815 ntTSL 5 BASIC25.44■■□□□ 1.66
GABPAQ06546 MAPK12-211ENST00000622558 1779 ntTSL 1 (best) BASIC25.44■■□□□ 1.66
GABPAQ06546 PREB-201ENST00000260643 2166 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.44■■□□□ 1.66
GABPAQ06546 CACNG2-201ENST00000300105 2384 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.44■■□□□ 1.66
GABPAQ06546 VPS53-211ENST00000571805 2356 ntTSL 1 (best) BASIC25.44■■□□□ 1.66
GABPAQ06546 SHD-201ENST00000543264 2577 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.44■■□□□ 1.66
GABPAQ06546 TMEM5-201ENST00000261234 1918 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.44■■□□□ 1.66
GABPAQ06546 MLLT10-204ENST00000377091 905 ntTSL 1 (best) BASIC25.44■■□□□ 1.66
GABPAQ06546 TNFRSF18-203ENST00000379268 1179 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.44■■□□□ 1.66
GABPAQ06546 ZNF292-204ENST00000392985 1096 ntTSL 1 (best) BASIC25.44■■□□□ 1.66
GABPAQ06546 CDCA4P2-201ENST00000441182 718 ntBASIC25.44■■□□□ 1.66
GABPAQ06546 YIF1A-205ENST00000471387 854 ntTSL 5 BASIC25.44■■□□□ 1.66
GABPAQ06546 EXD3-208ENST00000479452 962 ntTSL 1 (best) BASIC25.44■■□□□ 1.66
GABPAQ06546 AP006621.1-202ENST00000528982 464 ntTSL 2 BASIC25.44■■□□□ 1.66
GABPAQ06546 IGFALS-203ENST00000568221 730 ntTSL 4 BASIC25.44■■□□□ 1.66
GABPAQ06546 TANGO2-201ENST00000327374 2273 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.44■■□□□ 1.66
GABPAQ06546 PPP1R26-201ENST00000356818 4932 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.44■■□□□ 1.66
GABPAQ06546 CBWD6-201ENST00000377391 1792 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.44■■□□□ 1.66
GABPAQ06546 AQP6-201ENST00000315520 1398 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.44■■□□□ 1.66
GABPAQ06546 BRD3-202ENST00000371834 2529 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.43■■□□□ 1.66
GABPAQ06546 SLC22A31-201ENST00000562855 1909 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.43■■□□□ 1.66
GABPAQ06546 PRR16-202ENST00000407149 1747 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.43■■□□□ 1.66
GABPAQ06546 RAB1A-202ENST00000409751 1333 ntTSL 5 BASIC25.43■■□□□ 1.66
GABPAQ06546 COMT-203ENST00000403184 2217 ntTSL 2 BASIC25.43■■□□□ 1.66
GABPAQ06546 NHLH1-201ENST00000302101 2563 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.43■■□□□ 1.66
GABPAQ06546 KCTD8-201ENST00000360029 2587 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.43■■□□□ 1.66
GABPAQ06546 FMR1-AS1-202ENST00000596112 1845 ntTSL 1 (best) BASIC25.43■■□□□ 1.66
GABPAQ06546 HCFC1R1-201ENST00000248089 965 ntTSL 1 (best) BASIC25.43■■□□□ 1.66
GABPAQ06546 RAMP2-201ENST00000253796 780 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.43■■□□□ 1.66
GABPAQ06546 STYXL1-204ENST00000360591 1127 ntTSL 5 BASIC25.43■■□□□ 1.66
GABPAQ06546 PLAC9-202ENST00000372267 472 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC25.43■■□□□ 1.66
GABPAQ06546 HCFC1R1-207ENST00000574980 845 ntTSL 5 BASIC25.43■■□□□ 1.66
GABPAQ06546 AC104187.1-201ENST00000607510 612 ntBASIC25.43■■□□□ 1.66
GABPAQ06546 LHPP-202ENST00000368842 1622 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.43■■□□□ 1.66
GABPAQ06546 DACT2-203ENST00000607983 1620 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.43■■□□□ 1.66
GABPAQ06546 TOX2-201ENST00000341197 1880 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.43■■□□□ 1.66
GABPAQ06546 MFF-207ENST00000409565 1548 ntTSL 2 BASIC25.42■■□□□ 1.66
GABPAQ06546 RGS6-209ENST00000553525 2005 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC25.42■■□□□ 1.66
GABPAQ06546 GPR143-203ENST00000467482 1762 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.42■■□□□ 1.66
GABPAQ06546 LIN7B-201ENST00000221459 755 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.42■■□□□ 1.66
GABPAQ06546 VSX1-201ENST00000376707 943 ntTSL 1 (best) BASIC25.42■■□□□ 1.66
GABPAQ06546 VSX1-206ENST00000444511 1197 ntTSL 1 (best) BASIC25.42■■□□□ 1.66
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 20.9 ms