Protein–RNA interactions for Protein: Q06149

PDR8, Transcription factor PDR8, yeastyeast

Predictions only

Length 701 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (RIP-Chip)
Gene UniProt Accession Gene Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score Detected Interaction
PDR8Q06149 YOL075CYOL075C 3885 nt4.04□□□□□ -1.76
PDR8Q06149 PMS1YNL082W 2622 nt4.04□□□□□ -1.76
PDR8Q06149 NUF2YOL069W 1356 nt4.03□□□□□ -1.76
PDR8Q06149 ECM22YLR228C 2445 nt4.03□□□□□ -1.76
PDR8Q06149 PHO13YDL236W 939 nt4.03□□□□□ -1.76
PDR8Q06149 RPS11AYDR025W 471 nt4.03□□□□□ -1.76
PDR8Q06149 YHR173CYHR173C 339 nt4.03□□□□□ -1.76
PDR8Q06149 YIL171WYIL171W 330 nt4.03□□□□□ -1.76
PDR8Q06149 YIR023C-AYIR023C-A 324 nt4.03□□□□□ -1.76
PDR8Q06149 CTK2YJL006C 972 nt4.03□□□□□ -1.76
PDR8Q06149 CDC8YJR057W 651 nt4.03□□□□□ -1.76
PDR8Q06149 YLR407WYLR407W 687 nt4.03□□□□□ -1.76
PDR8Q06149 YNL050CYNL050C 813 nt4.03□□□□□ -1.76
PDR8Q06149 MCK1YNL307C 1128 nt4.03□□□□□ -1.76
PDR8Q06149 VPS73YGL104C 1461 nt4.03□□□□□ -1.76
PDR8Q06149 GDH2YDL215C 3279 nt4.03□□□□□ -1.77
PDR8Q06149 ESC2YDR363W 1371 nt4.02□□□□□ -1.77
PDR8Q06149 PTR3YFR029W 2037 nt4.02□□□□□ -1.77
PDR8Q06149 TAF7YMR227C 1773 nt4.02□□□□□ -1.77
PDR8Q06149 TRF5YNL299W 1929 nt4.02□□□□□ -1.77
PDR8Q06149 BNA6YFR047C 888 nt4.02□□□□□ -1.77
PDR8Q06149 DAL2YIR029W 1032 nt4.02□□□□□ -1.77
PDR8Q06149 RNA1YMR235C 1224 nt4.02□□□□□ -1.77
PDR8Q06149 YOR152CYOR152C 771 nt4.02□□□□□ -1.77
PDR8Q06149 YBR141W-AYBR141W-A 96 nt4.02□□□□□ -1.77
PDR8Q06149 RNA14YMR061W 2034 nt4.02□□□□□ -1.77
PDR8Q06149 UGA3YDL170W 1587 nt4.02□□□□□ -1.77
PDR8Q06149 FOX2YKR009C 2703 nt4.01□□□□□ -1.77
PDR8Q06149 NOC2YOR206W 2133 nt4.01□□□□□ -1.77
PDR8Q06149 HAP4YKL109W 1665 nt4.01□□□□□ -1.77
PDR8Q06149 YDL162CYDL162C 357 nt4.01□□□□□ -1.77
PDR8Q06149 YDR029WYDR029W 315 nt4.01□□□□□ -1.77
PDR8Q06149 SPI1YER150W 447 nt4.01□□□□□ -1.77
PDR8Q06149 tQ(UUG)CtQ(UUG)C 72 nt4.01□□□□□ -1.77
PDR8Q06149 tQ(UUG)D1tQ(UUG)D1 72 nt4.01□□□□□ -1.77
PDR8Q06149 tQ(UUG)D2tQ(UUG)D2 72 nt4.01□□□□□ -1.77
PDR8Q06149 tQ(UUG)D3tQ(UUG)D3 72 nt4.01□□□□□ -1.77
PDR8Q06149 tQ(UUG)E1tQ(UUG)E1 72 nt4.01□□□□□ -1.77
PDR8Q06149 tQ(UUG)HtQ(UUG)H 72 nt4.01□□□□□ -1.77
PDR8Q06149 tQ(UUG)LtQ(UUG)L 72 nt4.01□□□□□ -1.77
PDR8Q06149 YML031C-AYML031C-A 336 nt4.01□□□□□ -1.77
PDR8Q06149 SAM37YMR060C 984 nt4.01□□□□□ -1.77
PDR8Q06149 YMR158C-AYMR158C-A 138 nt4.01□□□□□ -1.77
PDR8Q06149 snR11snR11 258 nt4.01□□□□□ -1.77
PDR8Q06149 RRP15YPR143W 753 nt4.01□□□□□ -1.77
PDR8Q06149 snR37snR37 386 nt4.01□□□□□ -1.77
PDR8Q06149 YBR287WYBR287W 1284 nt4.01□□□□□ -1.77
PDR8Q06149 ATG2YNL242W 4779 nt4.01□□□□□ -1.77
PDR8Q06149 SRS2YJL092W 3525 nt4.01□□□□□ -1.77
PDR8Q06149 MGA1YGR249W 1371 nt4.01□□□□□ -1.77
PDR8Q06149 YDR261W-AYDR261W-A 1317 nt4□□□□□ -1.77
PDR8Q06149 POL1YNL102W 4407 nt4□□□□□ -1.77
PDR8Q06149 YCF1YDR135C 4548 nt4□□□□□ -1.77
PDR8Q06149 YGL006W-AYGL006W-A 111 nt4□□□□□ -1.77
PDR8Q06149 YLR202CYLR202C 327 nt4□□□□□ -1.77
PDR8Q06149 REH1YLR387C 1299 nt4□□□□□ -1.77
PDR8Q06149 DUG3YNL191W 1074 nt4□□□□□ -1.77
PDR8Q06149 YPL025CYPL025C 558 nt4□□□□□ -1.77
PDR8Q06149 CLG1YGL215W 1359 nt4□□□□□ -1.77
PDR8Q06149 TAF8YML114C 1533 nt4□□□□□ -1.77
PDR8Q06149 MEF1YLR069C 2286 nt4□□□□□ -1.77
PDR8Q06149 BOI2YER114C 3123 nt3.99□□□□□ -1.77
PDR8Q06149 KRE5YOR336W 4098 nt3.99□□□□□ -1.77
PDR8Q06149 BCH2YKR027W 2298 nt3.99□□□□□ -1.77
PDR8Q06149 YGL041W-AYGL041W-A 465 nt3.99□□□□□ -1.77
PDR8Q06149 YKL123WYKL123W 381 nt3.99□□□□□ -1.77
PDR8Q06149 YAR030CYAR030C 342 nt3.99□□□□□ -1.77
PDR8Q06149 VMA6YLR447C 1038 nt3.99□□□□□ -1.77
PDR8Q06149 MGE1YOR232W 687 nt3.99□□□□□ -1.77
PDR8Q06149 LOA1YPR139C 903 nt3.99□□□□□ -1.77
PDR8Q06149 LAS1YKR063C 1509 nt3.99□□□□□ -1.77
PDR8Q06149 NHX1YDR456W 1902 nt3.99□□□□□ -1.77
PDR8Q06149 SYF1YDR416W 2580 nt3.99□□□□□ -1.77
PDR8Q06149 ALR2YFL050C 2577 nt3.99□□□□□ -1.77
PDR8Q06149 STV1YMR054W 2673 nt3.98□□□□□ -1.77
PDR8Q06149 SNF2YOR290C 5112 nt3.98□□□□□ -1.77
PDR8Q06149 APN2YBL019W 1563 nt3.98□□□□□ -1.77
PDR8Q06149 SPB4YFL002C 1821 nt3.98□□□□□ -1.77
PDR8Q06149 CYM1YDR430C 2970 nt3.98□□□□□ -1.77
PDR8Q06149 FAS2YPL231W 5664 nt3.98□□□□□ -1.77
PDR8Q06149 CDC14YFR028C 1656 nt3.98□□□□□ -1.77
PDR8Q06149 HTB1YDR224C 396 nt3.98□□□□□ -1.77
PDR8Q06149 PRE9YGR135W 777 nt3.98□□□□□ -1.77
PDR8Q06149 ECM34YHL043W 513 nt3.98□□□□□ -1.77
PDR8Q06149 MMM1YLL006W 1281 nt3.98□□□□□ -1.77
PDR8Q06149 YLR347W-AYLR347W-A 141 nt3.98□□□□□ -1.77
PDR8Q06149 MCM1YMR043W 861 nt3.98□□□□□ -1.77
PDR8Q06149 IBD2YNL164C 1056 nt3.98□□□□□ -1.77
PDR8Q06149 FMP41YNL168C 780 nt3.98□□□□□ -1.77
PDR8Q06149 VPS69YPR087W 321 nt3.98□□□□□ -1.77
PDR8Q06149 OPY1YBR129C 987 nt3.98□□□□□ -1.77
PDR8Q06149 FRT2YAL028W 1587 nt3.97□□□□□ -1.77
PDR8Q06149 TRM11YOL124C 1302 nt3.97□□□□□ -1.77
PDR8Q06149 UTP5YDR398W 1932 nt3.97□□□□□ -1.77
PDR8Q06149 CET1YPL228W 1650 nt3.97□□□□□ -1.77
PDR8Q06149 VMA1YDL185W 3216 nt3.97□□□□□ -1.77
PDR8Q06149 GRS2YPR081C 1857 nt3.97□□□□□ -1.77
PDR8Q06149 NAM2YLR382C 2685 nt3.97□□□□□ -1.77
PDR8Q06149 YCR007CYCR007C 720 nt3.97□□□□□ -1.77
PDR8Q06149 UBC9YDL064W 474 nt3.97□□□□□ -1.77
Retrieved 100 of 7,029 protein–RNA pairs in 14.1 ms