Protein–RNA interactions for Protein: Q05940

SLC18A2, Synaptic vesicular amine transporter, humanhuman

Predictions only

Length 514 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SLC18A2Q05940 MADCAM1-205ENST00000613880 1509 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.48■■□□□ 1.03
SLC18A2Q05940 MAFF-204ENST00000426621 2216 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC21.48■■□□□ 1.03
SLC18A2Q05940 PRMT5-201ENST00000216350 2271 ntTSL 2 BASIC21.48■■□□□ 1.03
SLC18A2Q05940 DOK3-201ENST00000312943 2292 ntTSL 1 (best) BASIC21.48■■□□□ 1.03
SLC18A2Q05940 DUSP26-201ENST00000256261 1835 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.48■■□□□ 1.03
SLC18A2Q05940 SOX3-201ENST00000370536 2132 ntAPPRIS P1 BASIC21.47■■□□□ 1.03
SLC18A2Q05940 TMEM206-205ENST00000535273 2119 ntTSL 2 BASIC21.47■■□□□ 1.03
SLC18A2Q05940 MAIP1-201ENST00000295079 1495 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC21.47■■□□□ 1.03
SLC18A2Q05940 NARF-202ENST00000345415 1487 ntTSL 1 (best) BASIC21.47■■□□□ 1.03
SLC18A2Q05940 ERLEC1-202ENST00000378239 2271 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.47■■□□□ 1.03
SLC18A2Q05940 HMGA2-202ENST00000393577 611 ntTSL 3 BASIC21.47■■□□□ 1.03
SLC18A2Q05940 AC079089.2-201ENST00000531211 1277 ntBASIC21.47■■□□□ 1.03
SLC18A2Q05940 PRRT4-207ENST00000535159 2897 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.47■■□□□ 1.03
SLC18A2Q05940 CCDC106-207ENST00000591578 1592 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.47■■□□□ 1.03
SLC18A2Q05940 TPST1-201ENST00000304842 2116 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.47■■□□□ 1.03
SLC18A2Q05940 TMC7-205ENST00000569532 2738 ntTSL 2 BASIC21.47■■□□□ 1.03
SLC18A2Q05940 ZNF688-201ENST00000223459 2506 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.46■■□□□ 1.03
SLC18A2Q05940 METTL24-201ENST00000338882 1119 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.46■■□□□ 1.03
SLC18A2Q05940 SDHAP1-204ENST00000427415 559 ntTSL 4 BASIC21.46■■□□□ 1.03
SLC18A2Q05940 PTRH1-208ENST00000543175 814 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.46■■□□□ 1.03
SLC18A2Q05940 ACOT1-202ENST00000557556 1271 ntTSL 1 (best) BASIC21.46■■□□□ 1.03
SLC18A2Q05940 IKBKG-212ENST00000617207 1949 ntAPPRIS ALT1 TSL 3 BASIC21.46■■□□□ 1.03
SLC18A2Q05940 DNAJB5-203ENST00000453597 2589 ntTSL 2 BASIC21.46■■□□□ 1.03
SLC18A2Q05940 SOHLH1-201ENST00000298466 1987 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.46■■□□□ 1.03
SLC18A2Q05940 HAGHL-212ENST00000564537 1667 ntTSL 2 BASIC21.46■■□□□ 1.03
SLC18A2Q05940 FAM72B-202ENST00000369390 2396 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.46■■□□□ 1.03
SLC18A2Q05940 NAT8L-202ENST00000423729 5870 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.46■■□□□ 1.03
SLC18A2Q05940 OLA1-204ENST00000409546 2071 ntTSL 5 BASIC21.46■■□□□ 1.03
SLC18A2Q05940 PFKFB3-216ENST00000625260 1752 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC21.46■■□□□ 1.03
SLC18A2Q05940 TLX3-201ENST00000296921 1493 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.45■■□□□ 1.03
SLC18A2Q05940 HOXD4-201ENST00000306324 1464 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.45■■□□□ 1.03
SLC18A2Q05940 ZDHHC20-203ENST00000400590 1869 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.45■■□□□ 1.02
SLC18A2Q05940 SGTA-201ENST00000221566 2330 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.45■■□□□ 1.02
SLC18A2Q05940 POLD2-218ENST00000610533 1619 ntTSL 1 (best) BASIC21.45■■□□□ 1.02
SLC18A2Q05940 CCDC102A-201ENST00000258214 2463 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.45■■□□□ 1.02
SLC18A2Q05940 HES6-204ENST00000409182 863 ntTSL 2 BASIC21.45■■□□□ 1.02
SLC18A2Q05940 GDF6-202ENST00000620978 973 ntTSL 1 (best) BASIC21.45■■□□□ 1.02
SLC18A2Q05940 AP1S1-201ENST00000337619 1306 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.45■■□□□ 1.02
SLC18A2Q05940 SEPT5-209ENST00000438754 2241 ntTSL 2 BASIC21.45■■□□□ 1.02
SLC18A2Q05940 ENTPD6-203ENST00000376652 2750 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.45■■□□□ 1.02
SLC18A2Q05940 RAB1B-201ENST00000311481 2007 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.45■■□□□ 1.02
SLC18A2Q05940 NAA35-202ENST00000376040 1797 ntTSL 2 BASIC21.44■■□□□ 1.02
SLC18A2Q05940 UBE2J2-203ENST00000360466 1047 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.44■■□□□ 1.02
SLC18A2Q05940 SMUG1-203ENST00000401977 1082 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.44■■□□□ 1.02
SLC18A2Q05940 FAM72B-203ENST00000452190 748 ntTSL 3 BASIC21.44■■□□□ 1.02
SLC18A2Q05940 PRTG-204ENST00000561292 833 ntTSL 3 BASIC21.44■■□□□ 1.02
SLC18A2Q05940 THOC6-202ENST00000326266 1419 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.44■■□□□ 1.02
SLC18A2Q05940 FAM185A-201ENST00000409231 1446 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.44■■□□□ 1.02
SLC18A2Q05940 LENG1-201ENST00000222224 1542 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.44■■□□□ 1.02
SLC18A2Q05940 SLC9A3R1-201ENST00000262613 1969 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.43■■□□□ 1.02
SLC18A2Q05940 CD72-202ENST00000378430 585 ntTSL 3 BASIC21.43■■□□□ 1.02
SLC18A2Q05940 PRMT5-228ENST00000627278 129 ntTSL 5 BASIC21.43■■□□□ 1.02
SLC18A2Q05940 FAM47E-201ENST00000424749 1484 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC21.43■■□□□ 1.02
SLC18A2Q05940 MTNR1B-201ENST00000257068 1565 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.43■■□□□ 1.02
SLC18A2Q05940 C22orf34-203ENST00000405854 1593 ntTSL 5 BASIC21.43■■□□□ 1.02
SLC18A2Q05940 APPL2-201ENST00000258530 3239 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.43■■□□□ 1.02
SLC18A2Q05940 DECR2-201ENST00000219481 1615 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.43■■□□□ 1.02
SLC18A2Q05940 PPP1R3F-203ENST00000466508 1885 ntTSL 2 BASIC21.43■■□□□ 1.02
SLC18A2Q05940 OAZ2-201ENST00000326005 1934 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.43■■□□□ 1.02
SLC18A2Q05940 FAM118B-209ENST00000533050 2402 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.43■■□□□ 1.02
SLC18A2Q05940 PMS1-222ENST00000639501 2506 ntTSL 5 BASIC21.43■■□□□ 1.02
SLC18A2Q05940 EPDR1-201ENST00000199448 2599 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.43■■□□□ 1.02
SLC18A2Q05940 CLK3-202ENST00000395066 2621 ntTSL 1 (best) BASIC21.42■■□□□ 1.02
SLC18A2Q05940 CAMK2N2-201ENST00000296238 1362 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.42■■□□□ 1.02
SLC18A2Q05940 MFF-203ENST00000349901 1716 ntTSL 2 BASIC21.42■■□□□ 1.02
SLC18A2Q05940 RASGEF1C-201ENST00000361132 2243 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.42■■□□□ 1.02
SLC18A2Q05940 TM9SF3-201ENST00000371142 6141 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.42■■□□□ 1.02
SLC18A2Q05940 TMEFF1-201ENST00000374879 2611 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.42■■□□□ 1.02
SLC18A2Q05940 FRMD3-204ENST00000376438 2198 ntTSL 2 BASIC21.42■■□□□ 1.02
SLC18A2Q05940 ACHE-203ENST00000411582 2179 ntTSL 1 (best) BASIC21.42■■□□□ 1.02
SLC18A2Q05940 HTATIP2-204ENST00000451739 1748 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.42■■□□□ 1.02
SLC18A2Q05940 LRRC61-205ENST00000493307 1456 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.42■■□□□ 1.02
SLC18A2Q05940 PRELID1-203ENST00000503216 1171 ntTSL 1 (best) BASIC21.42■■□□□ 1.02
SLC18A2Q05940 RITA1-201ENST00000548278 2053 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.42■■□□□ 1.02
SLC18A2Q05940 NAA30-203ENST00000555166 1294 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.42■■□□□ 1.02
SLC18A2Q05940 BID-215ENST00000622694 2199 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.42■■□□□ 1.02
SLC18A2Q05940 CITED2-203ENST00000537332 1780 ntTSL 3 BASIC21.41■■□□□ 1.02
SLC18A2Q05940 PGF-201ENST00000238607 1693 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC21.41■■□□□ 1.02
SLC18A2Q05940 USP45-205ENST00000472914 1617 ntTSL 5 BASIC21.41■■□□□ 1.02
SLC18A2Q05940 MESP2-201ENST00000341735 1552 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.41■■□□□ 1.02
SLC18A2Q05940 NDUFV2-201ENST00000318388 930 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.41■■□□□ 1.02
SLC18A2Q05940 NOS3-204ENST00000467517 2377 ntTSL 1 (best) BASIC21.41■■□□□ 1.02
SLC18A2Q05940 NPTXR-201ENST00000333039 5784 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.41■■□□□ 1.02
SLC18A2Q05940 T-202ENST00000366871 2250 ntTSL 1 (best) BASIC21.41■■□□□ 1.02
SLC18A2Q05940 SLC22A17-202ENST00000354772 2238 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.41■■□□□ 1.02
SLC18A2Q05940 INPP1-201ENST00000322522 1919 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.41■■□□□ 1.02
SLC18A2Q05940 HSF2BP-201ENST00000291560 1899 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.41■■□□□ 1.02
SLC18A2Q05940 SPOP-206ENST00000504102 1865 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.41■■□□□ 1.02
SLC18A2Q05940 AL157384.1-201ENST00000445995 2473 ntBASIC21.4■■□□□ 1.02
SLC18A2Q05940 GTSE1-AS1-202ENST00000623117 1518 ntBASIC21.4■■□□□ 1.02
SLC18A2Q05940 GPSM1-201ENST00000291775 2114 ntTSL 1 (best) BASIC21.4■■□□□ 1.02
SLC18A2Q05940 CPNE9-203ENST00000383832 2068 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.4■■□□□ 1.02
SLC18A2Q05940 RASSF1-203ENST00000359365 1923 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.4■■□□□ 1.02
SLC18A2Q05940 TFPT-201ENST00000391757 774 ntTSL 5 BASIC21.4■■□□□ 1.02
SLC18A2Q05940 TFPT-202ENST00000391758 804 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.4■■□□□ 1.02
SLC18A2Q05940 AC092343.1-201ENST00000500224 729 ntTSL 3 BASIC21.4■■□□□ 1.02
SLC18A2Q05940 LRRK1-208ENST00000532029 1241 ntTSL 1 (best) BASIC21.4■■□□□ 1.02
SLC18A2Q05940 AC104564.3-201ENST00000582367 638 ntBASIC21.4■■□□□ 1.02
SLC18A2Q05940 UQCR11-202ENST00000589880 504 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC21.4■■□□□ 1.02
SLC18A2Q05940 ARHGEF4-202ENST00000355771 1872 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.4■■□□□ 1.02
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 21 ms