Protein–RNA interactions for Protein: Q05901

CHRNB3, Neuronal acetylcholine receptor subunit beta-3, humanhuman

Predictions only

Length 458 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CHRNB3Q05901 UBE2H-201ENST00000355621 5151 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.37■□□□□ 0.85
CHRNB3Q05901 TEX22-201ENST00000451127 2571 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.37■□□□□ 0.85
CHRNB3Q05901 TMEM179-204ENST00000556573 1430 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC20.36■□□□□ 0.85
CHRNB3Q05901 TMEM44-204ENST00000392432 2490 ntTSL 1 (best) BASIC20.36■□□□□ 0.85
CHRNB3Q05901 RAP2C-202ENST00000370874 2333 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.36■□□□□ 0.85
CHRNB3Q05901 PPP4C-214ENST00000627746 1301 ntTSL 5 BASIC20.36■□□□□ 0.85
CHRNB3Q05901 KRT18P55-201ENST00000577198 1950 ntTSL 1 (best) BASIC20.36■□□□□ 0.85
CHRNB3Q05901 TMEFF1-201ENST00000374879 2611 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.36■□□□□ 0.85
CHRNB3Q05901 MDFI-203ENST00000373051 1622 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.36■□□□□ 0.85
CHRNB3Q05901 MDK-203ENST00000395566 828 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.36■□□□□ 0.85
CHRNB3Q05901 BX664725.1-201ENST00000438252 379 ntBASIC20.36■□□□□ 0.85
CHRNB3Q05901 AC239859.2-201ENST00000444165 318 ntBASIC20.36■□□□□ 0.85
CHRNB3Q05901 HOXC-AS1-201ENST00000505700 548 ntTSL 2 BASIC20.36■□□□□ 0.85
CHRNB3Q05901 KRT125P-201ENST00000546827 989 ntBASIC20.36■□□□□ 0.85
CHRNB3Q05901 LSM7-204ENST00000587502 575 ntTSL 1 (best) BASIC20.36■□□□□ 0.85
CHRNB3Q05901 SNX5-217ENST00000606557 1087 ntBASIC20.36■□□□□ 0.85
CHRNB3Q05901 PLPP1-202ENST00000307259 1597 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC20.36■□□□□ 0.85
CHRNB3Q05901 S1PR5-202ENST00000439028 2191 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.36■□□□□ 0.85
CHRNB3Q05901 CPNE7-202ENST00000319518 2409 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.36■□□□□ 0.85
CHRNB3Q05901 PKIB-205ENST00000368452 1398 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.35■□□□□ 0.85
CHRNB3Q05901 DAZAP2-201ENST00000412716 2598 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.35■□□□□ 0.85
CHRNB3Q05901 SOX4-201ENST00000244745 5852 ntAPPRIS P1 BASIC20.35■□□□□ 0.85
CHRNB3Q05901 GUSBP5-201ENST00000418136 578 ntBASIC20.35■□□□□ 0.85
CHRNB3Q05901 SNAP23-202ENST00000349777 2480 ntTSL 2 BASIC20.35■□□□□ 0.85
CHRNB3Q05901 KLHDC1-201ENST00000359332 2691 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.35■□□□□ 0.85
CHRNB3Q05901 EEF1D-204ENST00000423316 2378 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC20.35■□□□□ 0.85
CHRNB3Q05901 TMEM250-205ENST00000561457 2804 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.35■□□□□ 0.85
CHRNB3Q05901 DNAJB5-203ENST00000453597 2589 ntTSL 2 BASIC20.35■□□□□ 0.85
CHRNB3Q05901 NES-201ENST00000368223 5558 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.35■□□□□ 0.85
CHRNB3Q05901 SNX21-212ENST00000491381 1607 ntTSL 1 (best) BASIC20.35■□□□□ 0.85
CHRNB3Q05901 GSPT1-203ENST00000439887 2509 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.34■□□□□ 0.85
CHRNB3Q05901 UCHL5-205ENST00000367454 1815 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC20.34■□□□□ 0.85
CHRNB3Q05901 AC073130.3-201ENST00000624389 2278 ntBASIC20.34■□□□□ 0.85
CHRNB3Q05901 RPP38-207ENST00000616640 1537 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.34■□□□□ 0.85
CHRNB3Q05901 A1BG-201ENST00000263100 1722 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.34■□□□□ 0.85
CHRNB3Q05901 SPAST-204ENST00000621856 1715 ntTSL 1 (best) BASIC20.34■□□□□ 0.85
CHRNB3Q05901 ATG4D-201ENST00000309469 1949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.34■□□□□ 0.85
CHRNB3Q05901 PRKAA1-202ENST00000354209 1918 ntTSL 1 (best) BASIC20.34■□□□□ 0.85
CHRNB3Q05901 AP000662.2-202ENST00000530595 2790 ntTSL 2 BASIC20.34■□□□□ 0.85
CHRNB3Q05901 DPYS-201ENST00000351513 2127 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.34■□□□□ 0.85
CHRNB3Q05901 CENPX-202ENST00000392359 805 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.34■□□□□ 0.85
CHRNB3Q05901 SCRT1-201ENST00000569446 3779 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.34■□□□□ 0.85
CHRNB3Q05901 USP21-202ENST00000368001 2095 ntTSL 1 (best) BASIC20.34■□□□□ 0.85
CHRNB3Q05901 ARL6IP4-201ENST00000315580 1644 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.34■□□□□ 0.85
CHRNB3Q05901 USP36-203ENST00000542802 6063 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.34■□□□□ 0.85
CHRNB3Q05901 SHANK1-203ENST00000391813 4785 ntTSL 1 (best) BASIC20.34■□□□□ 0.85
CHRNB3Q05901 PPP2R5E-204ENST00000555899 2164 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC20.34■□□□□ 0.85
CHRNB3Q05901 KCNK6-201ENST00000263372 5722 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.34■□□□□ 0.85
CHRNB3Q05901 SPHK1-202ENST00000392496 1779 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.34■□□□□ 0.85
CHRNB3Q05901 TUB-203ENST00000534099 1759 ntTSL 2 BASIC20.34■□□□□ 0.85
CHRNB3Q05901 SH2D5-202ENST00000444387 1934 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.33■□□□□ 0.85
CHRNB3Q05901 RNF180-201ENST00000296615 1727 ntTSL 1 (best) BASIC20.33■□□□□ 0.85
CHRNB3Q05901 DOK3-202ENST00000357198 1729 ntTSL 2 BASIC20.33■□□□□ 0.85
CHRNB3Q05901 BOK-201ENST00000318407 2657 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.33■□□□□ 0.85
CHRNB3Q05901 HTRA3-202ENST00000382512 2023 ntTSL 1 (best) BASIC20.33■□□□□ 0.85
CHRNB3Q05901 STMN4-201ENST00000265770 1250 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.33■□□□□ 0.85
CHRNB3Q05901 TRH-201ENST00000302649 1978 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.33■□□□□ 0.84
CHRNB3Q05901 PILRB-207ENST00000448382 2314 ntTSL 2 BASIC20.33■□□□□ 0.84
CHRNB3Q05901 CBWD5-207ENST00000382405 1791 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.33■□□□□ 0.84
CHRNB3Q05901 CHN1-203ENST00000409156 1761 ntTSL 2 BASIC20.33■□□□□ 0.84
CHRNB3Q05901 DOC2A-218ENST00000616445 2065 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.33■□□□□ 0.84
CHRNB3Q05901 ARHGEF4-202ENST00000355771 1872 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.33■□□□□ 0.84
CHRNB3Q05901 AC096677.1-201ENST00000454651 1516 ntTSL 2 BASIC20.32■□□□□ 0.84
CHRNB3Q05901 C6orf89-201ENST00000355190 1309 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.32■□□□□ 0.84
CHRNB3Q05901 AOC1-202ENST00000416793 2453 ntTSL 1 (best) BASIC20.32■□□□□ 0.84
CHRNB3Q05901 FHL3-201ENST00000373016 1647 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.32■□□□□ 0.84
CHRNB3Q05901 DCK-201ENST00000286648 2716 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.32■□□□□ 0.84
CHRNB3Q05901 ST3GAL6-AS1-203ENST00000488132 769 ntTSL 3 BASIC20.32■□□□□ 0.84
CHRNB3Q05901 DUX4L4-201ENST00000566884 1269 ntBASIC20.32■□□□□ 0.84
CHRNB3Q05901 CA15P2-201ENST00000611168 834 ntBASIC20.32■□□□□ 0.84
CHRNB3Q05901 ZNF446-208ENST00000622313 1884 ntTSL 1 (best) BASIC20.32■□□□□ 0.84
CHRNB3Q05901 ZNF37BP-201ENST00000435805 1695 ntTSL 5 BASIC20.32■□□□□ 0.84
CHRNB3Q05901 Z98882.1-201ENST00000622160 2253 ntBASIC20.32■□□□□ 0.84
CHRNB3Q05901 MAP7-206ENST00000611373 2317 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.31■□□□□ 0.84
CHRNB3Q05901 NEURL3-201ENST00000310865 1710 ntTSL 1 (best) BASIC20.31■□□□□ 0.84
CHRNB3Q05901 CFAP97-205ENST00000514798 2895 ntTSL 1 (best) BASIC20.31■□□□□ 0.84
CHRNB3Q05901 ZNF503-AS2-202ENST00000466942 1430 ntTSL 2 BASIC20.31■□□□□ 0.84
CHRNB3Q05901 BRI3-201ENST00000297290 780 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.31■□□□□ 0.84
CHRNB3Q05901 ASB1-202ENST00000409297 878 ntTSL 5 BASIC20.31■□□□□ 0.84
CHRNB3Q05901 ST20-MTHFS-201ENST00000479961 859 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC20.31■□□□□ 0.84
CHRNB3Q05901 LINC01925-201ENST00000579492 500 ntTSL 5 BASIC20.31■□□□□ 0.84
CHRNB3Q05901 CERS4-205ENST00000558331 1803 ntTSL 5 BASIC20.31■□□□□ 0.84
CHRNB3Q05901 CAMK2N2-201ENST00000296238 1362 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.31■□□□□ 0.84
CHRNB3Q05901 TMEM161A-202ENST00000450333 1930 ntTSL 2 BASIC20.31■□□□□ 0.84
CHRNB3Q05901 CCDC88B-203ENST00000359902 2326 ntTSL 1 (best) BASIC20.31■□□□□ 0.84
CHRNB3Q05901 CBWD1-203ENST00000377400 1792 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.31■□□□□ 0.84
CHRNB3Q05901 IL15RA-206ENST00000397248 1799 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.31■□□□□ 0.84
CHRNB3Q05901 RMND5A-201ENST00000283632 6301 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.31■□□□□ 0.84
CHRNB3Q05901 EPHA10-202ENST00000373048 5425 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC20.3■□□□□ 0.84
CHRNB3Q05901 DNAAF4-201ENST00000321149 1993 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.3■□□□□ 0.84
CHRNB3Q05901 MFSD7-202ENST00000347950 1599 ntTSL 2 BASIC20.3■□□□□ 0.84
CHRNB3Q05901 ESR2-204ENST00000353772 2454 ntTSL 1 (best) BASIC20.3■□□□□ 0.84
CHRNB3Q05901 LINC01116-201ENST00000295549 1407 ntTSL 2 BASIC20.3■□□□□ 0.84
CHRNB3Q05901 CFP-202ENST00000377005 1435 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.3■□□□□ 0.84
CHRNB3Q05901 C14orf80-211ENST00000450383 1107 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.3■□□□□ 0.84
CHRNB3Q05901 MCRIP1-202ENST00000457257 942 ntTSL 3 BASIC20.3■□□□□ 0.84
CHRNB3Q05901 PRR7-204ENST00000510492 1285 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.3■□□□□ 0.84
CHRNB3Q05901 DUSP22-214ENST00000605315 867 ntTSL 5 BASIC20.3■□□□□ 0.84
CHRNB3Q05901 UBA5-208ENST00000473651 1513 ntTSL 5 BASIC20.3■□□□□ 0.84
CHRNB3Q05901 PHLDB3-207ENST00000599242 2286 ntTSL 1 (best) BASIC20.3■□□□□ 0.84
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 21.7 ms